Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 405,239 (bp)   Positions: 723
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.001
0
0
.01
.994
.003
.001
.002
.822
.001
.987
.627
.055
.988
.065
0
.166
0
.006
.005
.032
0
.95
.998
.009
0
.003
.012
.028
.035
.022
.003
.005
0
.002
0
.027
.015
.001
.002
0
.007
.001
.001
.392
0
.044
.001
.002
.001
.108
--
.001
.004
.012
.015
0
.001
.001
0
.017
.003
.004
.215
.162
0
.006
.029
.001
.039
.241
.657
0
0
.047
0
.003
.008
.025
0
0
0
.176
.067
.289
.216
.053
.004
0
0
.002
.002
.005
.114
.004
.016
.002
.037
.001
0
.107
.049
.056
.27
.391
.163
.001
.007
.007
0
.006
.057
.006
.992
0
.004
.053
.068
.052
.201
.002
--
.003
.018
.249
.032
0
.002
--
--
.426
0
.002
.001
0
.001
0
.001
.721
.003
.001
.309
0
.004
.004
.004
.002
.021
.078
.957
.003
.001
.151
.024
.268
--
.001
.002
.001
--
--
.018
.01
.073
.438
.001
.052
.009
.074
0
.039
.028
.038
.002
.021
.032
0
.009
.006
.147
.015
--
.049
.004
.092
.11
.009
.048
.001
.037
.001
.032
.005
.085
0
.026
.001
.071
.002
.004
.002
.023
.002
.002
0
0
0
0
.01
.009
0
0
.109
.182
.009
.026
.032
.016
.041
.003
.046
.12
.003
.018
.007
.174
.009
0
0
0
.002
.001
0
.001
.014
.263
.005
.032
.084
.089
.009
.038
.018
.001
.011
.005
.039
0
.129
.976
.059
.05
.012
.005
.158
.002
.03
0
.361
.007
.005
.006
.001
.032
.003
.116
.076
.043
.837
.994
.083
0
0
.008
.007
0
.062
.004
.002
1
0
.09
.078
0
.001
.001
.001
.034
.003
.005
.021
0
.001
0
.001
.132
0
.006
0
.001
.013
0
.003
.361
.001
.018
.016
.073
.845
--
--
.031
.011
.001
.001
--
--
.06
.154
.003
.012
.027
.122
.002
0
0
.002
.005
.023
0
.004
.541
.081
.006
.015
.002
.001
0
.216
0
.002
.039
0
.032
.033
.013
.001
.004
1
.994
0
.001
.003
0
.003
0
.048
.253
.006
.002
.329
.997
.561
.001
.329
.02
.001
0
.002
.005
.017
.145
.019
0
.001
.032
.111
.038
.002
.001
.012
.006
.001
.001
.071
.026
.154
.456
.009
.03
.001
0
.129
0
.001
.009
0
.024
.019
.034
.163
.041
.01
0
.004
.012
.002
.002
0
.015
.003
.008
.003
.005
.005
.005
.001
.001
.052
.008
0
.002
.001
.018
.003
.999
.023
.002
.033
.017
.002
.257
.002
.001
.024
0
0
.008
.014
0
.027
.09
.013
0
.013
.001
.005
.007
0
.004
.434
0
.043
.002
0
.001
.015
.001
--
--
--
.195
.191
.013
.018
.037
.008
.002
.008
.004
.01
.286
.003
.005
.005
.027
.007
.06
--
.008
0
.023
.18
0
.002
.147
.161
--
.006
.005
.005
0
.001
.999
.791
0
.002
0
0
0
.001
.007
.003
0
0
.006
.004
.027
.046
.004
.982
.974
.08
.202
.016
.009
.088
.081
.03
.049
.018
.065
.016
0
0
0
.002
.025
.021
.018
.004
.025
.271
.116
.016
.007
.006
.004
.005
.035
.067
.268
.038
.005
.003
.001
.046
.001
.001
.002
.96
.998
.008
.002
.002
--
--
--
--
--
.113
.001
0
.005
.013
.002
.004
.013
.001
.019
0
0
0
.021
.09
.001
.002
.001
.007
.548
.682
.608
.162
.001
.002
.016
.149
0
.001
.002
.002
.003
0
0
0
.002
.001
.063
.009
.167
.017
.986
.099
.002
.002
.015
.018
.063
.061
.009
--
--
--
--
--
.291
.029
.248
.137
.196
.164
.02
.077
.001
.022
.103
0
.009
0
.029
.096
.003
.001
0
.003
0
.002
.62
.002
.001
0
.001
.009
.002
.015
.015
.997
.384
.023
.004
.249
--
.299
.019
.932
.001
.002
--
--
--
--
--
--
--
.021
.002
.03
.02
.001
--
--
.001
.001
.004
.018
.026
.008
.024
0
.003
.006
--
.033
.039
.196
.01
.044
.019
--
--
--
--
--
--
.245
.075
.08
.005
.142
.217
.601
.145
.036
.045
.031
0
.002
.003
0
.015
.005
.002
.098
--
--
.072
.008
.069
.008
.03
.002
.004
.489
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
G
C
A
A
A
T
A
4
A
A
C
G
G
T
A
T
C
T
T
C
T
C
G
G
A
G
T
A
C
C
T
T
G
A
T
T
G
G
G
A
T
C
G
A
A
A
A
C
G
C
T
G
T
C
C
G
A
C
C
A
T
A
C
G
C
G
2
C
11
T
T
A
A
G
T
A
T
T
C
T
G
G
2
A
A
C
C
A
T
T
C
G
T
A
A
G
A
C
A
C
T
A
G
C
G
T
G
C
T
T
A
T
C
A
G
C
T
T
A
G
G
T
T
C
A
A
18
C
C
A
T
G
C
T
A
G
G
T
C
A
T
G
G
G
C
A
C
T
C
G
C
C
C
T
A
C
A
T
C
T
C
A
T
G
T
T
G
T
C
C
A
C
T
G
G
T
C
C
T
A
C
G
G
T
T
G
A
T
81
A
A
A
G
C
G
A
C
T
C
G
C
C
A
T
T
C
C
T
4
T
T
G
T
A
A
G
A
A
C
C
G
A
T
C
A
C
A
G
A
G
C
G
T
G
T
C
A
A
A
T
G
T
C
A
G
C
T
G
C
C
T
A
A
A
G
G
A
G
C
A
G
C
C
T
G
A
2
G
C
G
7
T
A
T
G
C
T
T
A
A
T
T
T
C
C
T
G
C
C
G
C
A
T
A
G
A
A
C
G
T
T
C
T
T
T
A
C
A
G
C
T
G
C
C
C
G
G
C
T
A
G
T
C
T
T
G
A
C
T
A
A
C
G
8
G
T
A
C
A
G
T
T
A
15
A
G
A
T
C
T
A
C
A
G
G
C
A
G
G
T
A
G
T
T
C
G
C
21
G
A
4
3
A
A
T
C
A
C
G
C
G
T
T
T
C
G
G
9
A
G
T
T
C
T
T
T
T
C
A
G
A
C
T
T
C
C
C
T
2
A
A
A
A
T
A
G
G
A
T
T
T
T
G
T
T
G
A
A
T
A
G
T
G
C
A
C
A
G
C
C
A
G
C
G
A
A
G
T
A
G
G
A
T
A
C
A
G
T
A
T
C
A
G
T
C
T
C
T
T
A
A
C
A
C
A
T
A
C
G
T
A
G
C
C
G
T
2
G
T
G
G
T
T
A
A
C
C
C
T
C
G
32
T
G
A
5
7
C
G
G
A
C
G
A
G
C
A
T
G
G
C
A
G
T
T
G
C
T
A
G
A
T
A
A
3
G
A
G
G
G
G
C
A
G
G
14
T
T
T
A
A
A
A
C
T
G
G
G
C
G
G
T
A
T
C
C
G
C
G
G
T
C
8
38
A
A
T
C
2
G
C
T
T
T
T
A
G
G
A
C
C
C
G
G
G
T
G
T
G
G
G
G
T
G
A
G
G
A
T
C
A
C
C
G
C
T
C
A
A
G
A
G
G
T
T
C
A
A
A
T
G
G
C
A
G
G
C
A
G
G
A
G
C
G
G
A
T
C
T
A
C
C
T
C
G
T
98
C
G
G
G
G
T
A
C
G
T
T
G
G
G
G
A
G
T
T
T
C
A
T
A
C
T
G
T
T
G
A
G
C
16
A
C
G
T
T
A
3
G
A
T
C
A
T
C
A
G
C
G
C
T
A
G
26
A
3
A
A
G
C
C
A
  31,668,985
  31,669,042
  31,669,085
  31,669,141
  31,669,522
  31,669,750
  31,669,872
  31,669,909
  31,670,383
  31,670,702
  31,671,160
  31,672,156
  31,672,458
  31,675,855
  31,677,236
  31,677,437
  31,678,170
  31,678,540
  31,681,027
  31,681,451
  31,686,508
  31,686,977
  31,687,836
  31,687,854
  31,688,663
  31,689,155
  31,689,166
  31,689,839
  31,691,457
  31,692,942
  31,693,023
  31,693,311
  31,693,596
  31,693,606
  31,694,029
  31,695,073
  31,695,701
  31,695,708
  31,697,345
  31,699,108
  31,701,466
  31,703,622
  31,704,293
  31,704,726
  31,705,838
  31,711,412
  31,712,535
  31,714,300
  31,715,490
  31,717,356
  31,718,111
  31,718,712
  31,719,730
  31,720,659
  31,721,048
  31,721,049
  31,721,295
  31,721,501
  31,721,883
  31,722,004
  31,724,136
  31,724,189
  31,724,249
  31,724,875
  31,724,947
  31,725,166
  31,726,504
  31,727,831
  31,727,938
  31,727,957
  31,728,336
  31,728,914
  31,729,403
  31,730,124
  31,730,800
  31,730,871
  31,731,286
  31,731,964
  31,732,505
  31,732,953
  31,733,101
  31,733,102
  31,734,093
  31,734,261
  31,739,099
  31,739,298
  31,739,542
  31,740,185
  31,740,520
  31,741,188
  31,742,286
  31,742,439
  31,742,516
  31,742,701
  31,742,789
  31,743,116
  31,743,212
  31,743,408
  31,743,512
  31,743,811
  31,744,899
  31,745,020
  31,745,269
  31,745,368
  31,745,592
  31,745,635
  31,746,471
  31,747,420
  31,748,208
  31,749,672
  31,749,783
  31,750,286
  31,750,504
  31,752,266
  31,753,821
  31,754,045
  31,754,378
  31,755,827
  31,755,986
  31,757,711
  31,757,859
  31,757,995
  31,758,286
  31,758,519
  31,759,237
  31,764,157
  31,766,733
  31,766,973
  31,768,782
  31,769,159
  31,771,664
  31,771,929
  31,771,941
  31,772,888
  31,775,462
  31,776,653
  31,777,928
  31,779,349
  31,779,722
  31,779,790
  31,781,110
  31,785,513
  31,785,841
  31,785,895
  31,785,897
  31,786,369
  31,812,876
  31,813,007
  31,813,070
  31,813,242
  31,839,863
  31,840,411
  31,840,882
  31,840,994
  31,841,097
  31,841,785
  31,842,374
  31,842,721
  31,843,032
  31,843,495
  31,843,498
  31,844,249
  31,844,302
  31,844,545
  31,844,600
  31,844,887
  31,844,982
  31,845,069
  31,845,907
  31,846,292
  31,846,476
  31,846,816
  31,846,840
  31,847,084
  31,847,278
  31,847,304
  31,847,328
  31,847,540
  31,847,631
  31,847,939
  31,848,140
  31,848,301
  31,848,514
  31,848,805
  31,848,975
  31,849,073
  31,849,943
  31,850,289
  31,851,074
  31,851,122
  31,851,334
  31,851,417
  31,851,501
  31,851,566
  31,851,582
  31,851,606
  31,851,824
  31,851,905
  31,852,168
  31,852,392
  31,852,411
  31,852,613
  31,852,645
  31,852,668
  31,853,227
  31,853,346
  31,853,431
  31,853,520
  31,853,767
  31,854,327
  31,855,527
  31,855,569
  31,856,402
  31,856,442
  31,856,694
  31,856,890
  31,857,005
  31,857,117
  31,857,488
  31,857,557
  31,857,877
  31,858,286
  31,858,515
  31,859,034
  31,860,095
  31,861,189
  31,861,269
  31,861,743
  31,861,897
  31,861,903
  31,861,909
  31,862,039
  31,862,257
  31,862,376
  31,862,776
  31,862,810
  31,862,947
  31,863,038
  31,863,235
  31,863,915
  31,864,385
  31,864,530
  31,864,557
  31,864,675
  31,864,912
  31,865,103
  31,865,392
  31,865,667
  31,866,551
  31,867,211
  31,867,905
  31,867,953
  31,868,650
  31,868,914
  31,869,020
  31,869,471
  31,869,517
  31,870,057
  31,870,576
  31,870,652
  31,871,280
  31,871,612
  31,872,126
  31,872,146
  31,872,161
  31,872,817
  31,873,036
  31,873,165
  31,873,372
  31,873,545
  31,873,838
  31,874,490
  31,875,206
  31,876,341
  31,877,385
  31,878,205
  31,878,258
  31,878,302
  31,880,227
  31,881,341
  31,881,393
  31,881,423
  31,881,427
  31,881,447
  31,882,453
  31,882,969
  31,883,066
  31,884,252
  31,884,287
  31,884,417
  31,885,191
  31,885,893
  31,886,050
  31,886,626
  31,887,057
  31,887,911
  31,888,125
  31,889,449
  31,889,560
  31,892,198
  31,893,470
  31,894,064
  31,894,653
  31,894,750
  31,895,283
  31,895,296
  31,895,540
  31,896,042
  31,896,321
  31,897,519
  31,898,029
  31,898,250
  31,898,708
  31,898,950
  31,898,992
  31,901,809
  31,901,862
  31,902,038
  31,902,222
  31,903,751
  31,905,147
  31,909,836
  31,910,844
  31,911,054
  31,913,297
  31,913,664
  31,914,732
  31,916,601
  31,919,476
  31,920,517
  31,925,849
  31,926,277
  31,927,886
  31,928,315
  31,929,311
  31,929,490
  31,931,847
  31,933,151
  31,934,069
  31,934,273
  31,934,554
  31,934,606
  31,934,667
  31,934,692
  31,934,694
  31,934,722
  31,934,789
  31,934,894
  31,935,302
  31,935,331
  31,935,486
  31,944,125
  31,945,624
  31,947,397
  31,950,213
  31,954,205
  31,954,495
  31,954,980
  31,955,116
  31,955,117
  31,955,509
  31,956,037
  31,956,612
  31,956,686
  31,956,846
  31,957,006
  31,957,979
  31,958,881
  31,959,106
  31,959,590
  31,960,030
  31,960,692
  31,960,897
  31,961,018
  31,961,079
  31,961,613
  31,962,035
  31,962,055
  31,962,103
  31,962,119
  31,962,447
  31,962,478
  31,963,562
  31,963,565
  31,964,499
  31,964,500
  31,964,878
  31,965,050
  31,965,609
  31,965,704
  31,965,837
  31,965,906
  31,965,937
  31,966,044
  31,966,856
  31,966,964
  31,967,007
  31,967,099
  31,967,146
  31,967,153
  31,967,504
  31,967,557
  31,967,840
  31,968,236
  31,968,464
  31,968,657
  31,969,011
  31,969,197
  31,969,309
  31,969,379
  31,969,410
  31,969,437
  31,969,769
  31,969,781
  31,969,787
  31,969,928
  31,969,959
  31,969,962
  31,970,062
  31,970,390
  31,970,713
  31,970,900
  31,970,931
  31,971,851
  31,972,772
  31,973,247
  31,973,786
  31,973,836
  31,973,852
  31,974,134
  31,975,114
  31,975,313
  31,975,468
  31,976,543
  31,977,570
  31,977,652
  31,977,860
  31,977,935
  31,978,553
  31,978,804
  31,979,026
  31,979,239
  31,979,382
  31,980,649
  31,981,119
  31,981,453
  31,982,282
  31,982,383
  31,983,413
  31,983,886
  31,983,975
  31,984,459
  31,984,809
  31,986,625
  31,986,644
  31,987,325
  31,987,674
  31,990,936
  31,991,364
  31,991,388
  31,991,429
  31,991,947
  31,991,948
  31,992,536
  31,992,595
  31,992,813
  31,992,947
  31,993,401
  31,993,695
  31,993,812
  31,993,868
  31,994,743
  31,995,395
  31,995,824
  31,995,984
  31,996,409
  31,996,459
  31,996,911
  31,998,269
  31,998,706
  31,998,854
  31,999,846
  32,001,232
  32,002,029
  32,002,209
  32,002,588
  32,002,666
  32,003,274
  32,004,034
  32,004,121
  32,004,251
  32,005,988
  32,006,204
  32,006,505
  32,006,643
  32,006,772
  32,006,932
  32,006,976
  32,006,978
  32,006,981
  32,006,993
  32,007,049
  32,007,052
  32,007,086
  32,007,207
  32,007,226
  32,007,238
  32,007,257
  32,007,266
  32,007,380
  32,007,617
  32,007,750
  32,008,303
  32,008,349
  32,008,396
  32,008,414
  32,008,468
  32,008,485
  32,008,534
  32,008,544
  32,008,558
  32,008,575
  32,008,589
  32,008,661
  32,008,693
  32,008,765
  32,009,006
  32,009,598
  32,009,674
  32,009,676
  32,009,684
  32,009,796
  32,010,133
  32,010,166
  32,010,225
  32,010,336
  32,010,478
  32,010,487
  32,010,497
  32,010,523
  32,010,570
  32,010,634
  32,010,688
  32,011,372
  32,011,603
  32,011,811
  32,012,618
  32,012,688
  32,012,690
  32,012,947
  32,013,224
  32,013,237
  32,013,426
  32,013,446
  32,014,011
  32,014,844
  32,014,889
  32,015,058
  32,015,095
  32,015,143
  32,015,187
  32,015,419
  32,015,970
  32,016,271
  32,016,749
  32,017,657
  32,017,815
  32,018,996
  32,019,402
  32,019,978
  32,021,484
  32,021,571
  32,022,520
  32,023,048
  32,023,059
  32,023,342
  32,023,541
  32,023,542
  32,023,939
  32,024,074
  32,024,083
  32,024,622
  32,025,418
  32,025,791
  32,026,060
  32,026,659
  32,027,376
  32,027,485
  32,027,555
  32,027,564
  32,027,565
  32,028,036
  32,028,247
  32,028,942
  32,028,943
  32,029,862
  32,030,056
  32,030,456
  32,030,742
  32,031,283
  32,031,462
  32,031,882
  32,032,023
  32,032,147
  32,032,148
  32,032,177
  32,032,438
  32,032,641
  32,032,670
  32,033,250
  32,033,381
  32,033,461
  32,033,772
  32,034,370
  32,034,538
  32,034,791
  32,035,158
  32,035,343
  32,035,487
  32,035,673
  32,035,796
  32,035,888
  32,036,025
  32,036,617
  32,036,650
  32,036,670
  32,037,138
  32,037,162
  32,037,173
  32,037,411
  32,037,594
  32,037,743
  32,037,839
  32,038,028
  32,038,121
  32,038,132
  32,038,283
  32,038,515
  32,038,980
  32,039,261
  32,039,304
  32,039,831
  32,039,919
  32,040,043
  32,040,161
  32,040,500
  32,040,678
  32,040,840
  32,040,966
  32,041,058
  32,041,243
  32,041,595
  32,042,607
  32,042,715
  32,042,907
  32,043,112
  32,043,431
  32,043,673
  32,043,805
  32,043,995
  32,044,094
  32,044,216
  32,044,253
  32,044,603
  32,045,781
  32,046,027
  32,046,839
  32,046,844
  32,046,866
  32,047,152
  32,047,328
  32,047,521
  32,047,525
  32,047,527
  32,047,529
  32,048,421
  32,048,463
  32,048,520
  32,048,875
  32,052,330
  32,052,349
  32,052,878
  32,053,452
  32,054,152
  32,054,207
  32,054,694
  32,055,209
  32,055,778
  32,056,494
  32,056,817
  32,057,017
  32,057,152
  32,057,271
  32,057,373
  32,057,919
  32,059,120
  32,059,121
  32,060,047
  32,060,388
  32,060,570
  32,060,603
  32,061,122
  32,061,488
  32,061,767
  32,062,156
  32,062,908
  32,063,066
  32,064,293
  32,065,453
  32,065,702
  32,066,252
  32,066,740
  32,067,046
  32,067,145
  32,067,194
  32,067,280
  32,067,430
  32,067,674
  32,067,950
  32,069,347
  32,071,884
  32,071,885
  32,073,175
G
A
T
G
G
G
2
G
-
T
G
T
A
A
C
G/A
C
T/C
C
A
A
2/T
T
A/G
A
2
A
-
G
T
G
C
C/T
T/G
G
C
C
C
A
A
C
C
T
2
-
G
2/A