Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 74,288 (bp)   Positions: 301
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.012
.004
.087
.017
.051
.209
.012
.001
.003
.244
.029
.14
.19
.002
--
.239
.016
.016
.014
.01
.007
.002
--
--
--
--
--
.008
.001
--
.137
.017
.013
.201
.412
.007
--
--
--
--
.086
.001
.075
.094
.011
.805
0
.017
0
.006
.02
.042
.101
.158
.001
.037
.612
.02
.018
.006
.01
0
.016
.656
.249
.154
.135
.072
.028
.001
.004
.008
.068
.004
.031
--
.015
--
--
--
--
--
.086
.173
.044
.012
.113
.097
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.003
.042
.562
.019
.011
--
.039
.126
.014
.004
--
--
--
--
--
0
.141
.001
.053
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.004
.012
.026
.247
--
.01
.075
.616
.12
--
--
.007
.017
--
.01
.002
.008
.014
.06
--
--
--
--
.059
.062
.043
0
.565
--
.173
.825
--
--
--
--
.26
.007
--
.005
.093
--
--
--
.013
.253
--
.155
.011
.029
.196
.004
0
.002
.004
.572
.037
.002
.012
.006
0
.005
.235
.008
.038
.961
.001
.001
.01
.007
.009
.002
.001
.002
.006
.004
.005
--
.807
--
--
.141
.146
.025
.001
.037
.032
.065
--
.025
.027
.011
.007
.004
.002
.025
.155
.142
.095
.123
.125
--
.032
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.005
.001
0
.001
.067
.06
--
.232
.805
.871
.919
.981
--
--
--
--
--
.003
.043
.014
.039
.069
.046
.127
.081
.001
0
.023
--
.082
.367
.55
.572
.083
.03
.018
.019
.003
.015
.024
.015
.201
.144
0
.004
.062
.058
--
.003
.002
.006
.032
.003
.111
0
.997
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
T
C
G
14
A
A
T
C
C
C
C
T
2
A
T
C
A
C
A
C
4
T
C
A
C
T
A
A
T
4
T
C
A
A
4
C
T
C
G
C
C
G
C
G
T
T
T
A
C
C
T
G
4
G
C
A
T
C
C
T
C
G
G
A
T
A
2
T
C
C
12
C
G
C
C
T
G
C
C
G
G
G
C
C
C
G
T
C
A
G
C
C
G
G
T
T
C
A
C
A
G
G
2
3
2
A
A
G
G
G
G
G
G
C
C
A
G
C
T
T
T
C
C
G
A
T
T
C
T
A
A
T
C
C
A
A
A
A
G
2
G
2
A
G
A
T
G
C
C
G
C
3
A
G
A
4
3
T
C
A
G
G
C
C
A
A
T
A
C
C
4
C
T
C
G
C
C
G
G
T
A
T
T
T
4
C
T
C
G
T
T
A
A
C
A
A
C
A
C
C
C
C
3
T
C
C
C
C
C
T
T
C
C
G
C
A
8
C
G
10
C
A
G
T
T
C
T
A
3
C
C
G
A
4
8
C
T
G
T
T
T
C
T
4
G
C
T
A
10
2
T
C
C
T
A
T
T
A
G
A
A
C
26
A
T
C
C
T
G
A
C
4
G
A
A
A
C
C
G
T
C
G
G
A
4
A
C
C
C
G
T
13
A
6
A
T
T
A
G
A
  11,479,690
  11,479,985
  11,480,082
  11,480,101
  11,480,108
  11,481,328
  11,481,426
  11,481,460
  11,481,472
  11,481,727
  11,481,806
  11,481,970
  11,482,130
  11,482,558
  11,482,630
  11,482,763
  11,483,275
  11,483,276
  11,483,277
  11,483,280
  11,483,291
  11,483,320
  11,483,334
  11,483,342
  11,483,480
  11,483,481
  11,483,496
  11,483,680
  11,483,732
  11,483,949
  11,484,178
  11,484,211
  11,484,384
  11,484,892
  11,485,195
  11,485,461
  11,485,543
  11,486,094
  11,486,328
  11,486,369
  11,486,534
  11,486,563
  11,486,693
  11,486,730
  11,486,800
  11,487,233
  11,487,894
  11,488,074
  11,488,239
  11,488,279
  11,488,721
  11,489,194
  11,489,228
  11,489,294
  11,489,930
  11,490,062
  11,490,360
  11,490,699
  11,490,702
  11,491,162
  11,491,331
  11,491,486
  11,491,643
  11,491,823
  11,492,087
  11,492,120
  11,492,242
  11,492,371
  11,492,474
  11,492,593
  11,492,596
  11,492,711
  11,492,755
  11,492,842
  11,492,912
  11,492,973
  11,493,344
  11,493,473
  11,493,525
  11,493,554
  11,493,594
  11,493,598
  11,493,931
  11,493,945
  11,494,293
  11,494,306
  11,494,589
  11,494,860
  11,495,221
  11,495,303
  11,495,467
  11,495,838
  11,495,878
  11,495,879
  11,495,975
  11,495,984
  11,496,239
  11,496,291
  11,496,301
  11,496,390
  11,496,408
  11,496,420
  11,496,498
  11,496,971
  11,497,071
  11,497,072
  11,497,274
  11,497,573
  11,497,751
  11,497,920
  11,498,053
  11,498,156
  11,498,524
  11,498,527
  11,498,556
  11,498,750
  11,498,932
  11,498,951
  11,499,033
  11,499,188
  11,499,586
  11,499,590
  11,499,594
  11,499,680
  11,499,768
  11,500,693
  11,500,757
  11,500,795
  11,500,834
  11,501,075
  11,501,099
  11,501,108
  11,501,434
  11,501,648
  11,501,987
  11,502,054
  11,502,219
  11,503,802
  11,504,091
  11,504,443
  11,504,572
  11,505,513
  11,505,846
  11,505,847
  11,507,011
  11,507,073
  11,508,047
  11,508,617
  11,508,695
  11,508,707
  11,508,722
  11,508,850
  11,509,602
  11,509,606
  11,509,670
  11,510,010
  11,510,206
  11,510,207
  11,512,051
  11,513,036
  11,513,277
  11,513,386
  11,513,722
  11,513,917
  11,515,992
  11,516,010
  11,516,325
  11,516,372
  11,517,300
  11,517,643
  11,517,860
  11,518,018
  11,519,017
  11,519,131
  11,519,959
  11,520,075
  11,520,462
  11,520,472
  11,520,846
  11,521,154
  11,521,223
  11,521,466
  11,521,830
  11,522,047
  11,522,059
  11,522,301
  11,522,379
  11,522,414
  11,522,708
  11,522,747
  11,522,757
  11,522,792
  11,523,004
  11,523,151
  11,523,317
  11,523,411
  11,523,521
  11,523,587
  11,523,896
  11,523,983
  11,524,156
  11,524,171
  11,524,186
  11,524,222
  11,524,264
  11,524,312
  11,524,330
  11,524,348
  11,524,368
  11,524,617
  11,525,000
  11,525,117
  11,525,298
  11,525,364
  11,525,437
  11,525,471
  11,525,761
  11,525,770
  11,525,771
  11,526,129
  11,527,123
  11,528,425
  11,528,731
  11,529,636
  11,532,679
  11,532,895
  11,532,954
  11,533,109
  11,535,503
  11,535,524
  11,535,576
  11,535,577
  11,535,601
  11,535,826
  11,538,192
  11,538,278
  11,538,376
  11,538,380
  11,538,451
  11,538,472
  11,538,476
  11,538,480
  11,538,484
  11,538,488
  11,538,739
  11,538,774
  11,539,566
  11,539,896
  11,539,998
  11,540,469
  11,540,604
  11,540,660
  11,541,686
  11,541,723
  11,541,813
  11,541,847
  11,541,855
  11,542,846
  11,542,968
  11,543,064
  11,543,124
  11,543,164
  11,543,634
  11,543,698
  11,543,790
  11,544,361
  11,545,796
  11,546,370
  11,546,435
  11,546,565
  11,547,147
  11,547,276
  11,547,752
  11,548,166
  11,548,453
  11,548,546
  11,548,559
  11,548,568
  11,548,670
  11,548,683
  11,548,687
  11,548,846
  11,549,155
  11,549,686
  11,550,140
  11,550,141
  11,550,268
  11,550,285
  11,550,478
  11,550,489
  11,550,527
  11,550,529
  11,550,974
  11,551,151
  11,551,201
  11,551,606
  11,551,661
  11,551,773
  11,551,822
  11,552,509
  11,552,639
3
C
T
A
-
C
G
C
T
A
A
T
C
-
G
A
3
5
G/C
G/A
A/CAA
-
C/T
T
G
T
A
C
G
A/T
-
C
T
G
T
-
2
C
T
A
G
T
T
T
A
9
2
C
G
T
T
C
A
-
T
G
T
C
T
G
G
T
A
A
T/A
C/TACAC
C
-
C
-
2
-
T
A
T
4
C
A
T
CTTTTTTTTT/CTTTTTTTTTT
A
C
4
-
T
T
A
G
T
G
A
G
T
T
2/G
A
G
4
10
T
-
A
A
-
-/3
-
G
G
C
A
T
C
T
GTGTGTGT/GTGTGT
G
T
T
A
T
C
C/T
C/T
T/C
T
A
G
-
2/T
T
4
G
2
-
T
T
2
-
G
G
A
-
A
-/2
-/A
A
C
A
C
A
T
A
A
-
-/A
2
T
-/4
-/3
-/TG
A
C
A/G
-
A
A/C
2
G
C
G
A
A
-
A
-
9
A
T
T
A
C
C
G
C
C
C
-
G
C
T
T
C
C
G
G
G
G
G
A
G
G
T/C
T/C
T/C
-
C/T
T/C
T/C
T/C
T/C
T
G
C
3
-
A
T
C
-
2/C
A
-
T
2/A
A
C
A
T
C
2
-
-/C
17
A/G
T
-/4
-
T/C
C/T
A/G
C/T
C/T
C/T
T/C
C/T
-
A
T
C
G
-
-
C
T/C
G/C
C/T
G/A
C/T
G
G
A/G
G
G
T
-/26
G
C
T
T
C
A/GGGAGGA
G
T
-
GAAAAGAA/GAAAAGA
G
G
T
T
T
A
C
T
A
A
G/A
-/4
G/A
G/C
T
T
A
C
-
G
-
G
C
C
G
A
-