Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 359,173 (bp)   Positions: 649
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.621
.01
.079
.08
.192
.192
.233
.029
--
--
.134
.118
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.024
.019
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.133
.496
.005
.285
.319
.327
.03
.206
.195
.006
.19
.06
.001
.001
.002
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.007
.124
.163
.212
.008
.007
.004
.003
.007
--
--
.059
.001
.07
--
--
--
--
--
--
.066
.015
.041
.005
.185
.036
.338
.141
.024
.449
.803
.003
.001
.139
.001
.043
.018
.273
.067
.122
.124
.013
.023
--
--
--
--
.21
.019
.551
.125
.018
.008
.183
--
.108
.155
.003
.04
.038
.211
.057
.04
.11
.001
.001
.001
.008
--
--
0
.046
0
.456
.01
.126
.242
.014
--
--
--
--
.487
.182
.084
.071
--
--
--
--
--
.074
.041
--
--
--
--
--
--
--
--
.978
--
.161
.001
.976
.018
.046
.001
.001
.147
.002
.969
.001
.001
.003
.013
.013
.021
--
.436
.005
.005
.007
.325
.002
.113
.23
.002
.002
0
0
0
.002
.007
.059
.082
.013
.212
.075
.413
.03
.101
.046
.004
.262
.144
.06
.034
.03
.064
.137
.153
.161
.148
.02
.021
.004
.001
.002
.001
.003
.042
.599
.621
.22
.003
.011
.347
.284
.321
.328
.139
.001
.001
.055
1
1
.999
1
.998
1
.326
.355
.001
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.003
.204
0
.127
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.005
.002
.124
.041
.006
0
.027
.009
.467
.057
.264
.434
.536
.545
.555
.77
.01
--
.064
.007
.123
--
--
--
.01
.059
--
--
--
.028
--
.026
--
--
--
.032
.02
.019
0
--
--
--
--
--
--
.056
.006
.003
--
--
--
--
.042
.016
--
--
--
--
0
0
.555
.996
.993
.007
.019
.719
.067
.947
.159
.001
.001
0
.027
.115
.084
.014
0
.001
.027
.001
.565
.059
.037
.005
.009
.16
.012
.084
.002
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.559
.014
.026
.008
.017
.805
.002
.001
.008
.002
.009
--
--
--
--
--
.154
.244
.839
.865
.868
.771
.823
.341
.062
.065
.145
.437
.625
.703
.724
.573
.539
.469
.021
.01
.008
.069
.001
.056
.003
.804
.013
.375
.173
.697
.007
0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.999
.016
--
.001
.032
.136
.451
--
--
--
--
--
--
.477
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.016
.324
.033
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.005
.357
.155
.157
.151
.144
.151
.091
.015
.018
.552
--
.03
.022
.122
.621
.02
.008
.031
.063
.056
.092
.057
.043
--
.007
.028
.031
.407
--
.022
.004
.126
.13
.04
.006
.835
.06
0
0
.092
.071
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.08
.007
.112
.398
.011
.004
.025
.025
--
.029
.049
.364
.073
.603
.031
.073
.075
.029
0
--
.016
.09
.021
.004
--
.001
.065
--
.078
--
--
.071
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.013
--
--
--
--
--
.042
.13
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
3
C
G
2
G
C
G
G
A
C
C
A
C
C
C
A
C
T
2
T
T
A
C
C
T
T
G
C
A
A
T
C
G
G
G
A
C
A
G
A
A
G
G
G
G
A
G
C
C
A
T
G
T
T
A
T
T
G
A
T
G
A
G
T
T
G
C
G
T
16
4
A
T
C
C
A
G
G
7
A
A
G
G
A
G
A
C
C
C
22
A
C
T
A
G
G
A
C
C
T
C
G
T
C
T
T
A
8
A
A
A
C
C
C
C
A
T
A
G
G
T
T
C
T
T
A
T
T
G
C
A
A
A
A
A
A
C
G
A
C
T
G
T
C
A
G
A
A
C
T
T
C
T
T
A
A
8
C
G
G
C
T
C
T
G
3
2
G
G
G
G
C
G
C
5
2
T
A
C
G
T
T
T
C
T
C
G
4
T
C
A
T
A
T
G
G
A
C
G
T
G
T
T
C
G
G
C
C
G
C
C
C
C
G
G
T
2
T
T
T
C
C
C
A
T
T
C
T
A
C
4
G
T
C
T
G
A
15
C
T
A
T
G
A
C
G
A
2
G
T
G
G
C
C
A
C
C
T
T
A
G
G
G
G
C
C
G
G
C
T
T
C
C
T
C
G
A
A
A
G
G
C
A
G
15
A
G
T
G
A
T
A
A
C
C
A
C
A
A
A
G
C
C
T
A
A
G
C
C
G
C
A
A
G
A
G
C
G
G
G
C
C
A
A
C
T
C
A
G
G
A
C
C
C
4
T
2
T
C
C
7
T
T
C
A
3
A
G
G
A
G
G
T
G
T
A
C
C
G
G
G
G
C
A
4
3
A
A
C
T
T
T
G
G
T
12
T
C
G
T
G
A
C
G
T
C
T
C
C
G
C
G
A
T
2
A
A
7
C
T
G
T
G
A
A
C
C
T
A
T
A
T
G
C
A
A
C
A
A
A
A
T
A
A
A
C
C
2
3
T
G
C
T
C
C
T
A
10
G
6
T
C
T
G
T
C
T
T
G
T
G
C
C
C
T
G
T
C
A
T
G
C
G
T
T
A
T
T
T
A
3
C
T
T
C
A
C
A
C
C
T
G
A
C
T
A
A
T
T
A
A
A
T
G
C
2
G
A
A
C
C
C
T
C
T
C
C
G
T
C
C
2
6
T
G
T
C
C
C
G
7
T
C
A
T
G
G
2
A
A
13
A
A
A
A
G
G
C
T
G
A
T
C
T
T
A
A
G
T
G
T
C
T
T
G
A
T
G
G
6
3
C
T
12
A
A
T
A
C
T
A
A
G
G
T
T
T
2
A
C
G
A
T
C
C
A
G
2
A
T
C
C
G
9
C
A
G
A
T
2
A
G
G
T
C
G
2
G
T
A
A
G
C
T
C
G
G
T
C
T
C
A
C
T
G
G
A
T
C
G
T
C
A
T
A
G
G
G
C
T
G
T
A
C
A
A
C
2
C
  106,464,427
  106,464,938
  106,465,916
  106,467,311
  106,468,752
  106,468,833
  106,469,394
  106,469,699
  106,470,222
  106,470,509
  106,471,087
  106,471,267
  106,471,884
  106,471,921
  106,471,973
  106,472,273
  106,472,957
  106,473,062
  106,473,072
  106,473,365
  106,473,879
  106,473,921
  106,473,935
  106,473,973
  106,475,376
  106,475,581
  106,475,591
  106,475,709
  106,475,815
  106,475,922
  106,475,961
  106,476,105
  106,476,111
  106,476,255
  106,476,793
  106,476,794
  106,476,905
  106,477,158
  106,477,187
  106,477,244
  106,477,557
  106,477,685
  106,477,721
  106,477,729
  106,478,324
  106,478,357
  106,478,364
  106,486,615
  106,486,860
  106,486,967
  106,486,982
  106,487,110
  106,487,216
  106,487,767
  106,488,353
  106,488,381
  106,488,390
  106,488,393
  106,488,440
  106,488,727
  106,488,871
  106,488,980
  106,489,049
  106,489,329
  106,489,368
  106,489,386
  106,489,721
  106,489,754
  106,489,758
  106,489,761
  106,489,765
  106,489,873
  106,490,137
  106,490,525
  106,490,943
  106,490,965
  106,491,015
  106,491,438
  106,491,483
  106,491,491
  106,491,907
  106,492,141
  106,492,495
  106,492,522
  106,492,677
  106,492,745
  106,492,857
  106,492,858
  106,492,860
  106,494,452
  106,495,291
  106,495,617
  106,495,673
  106,495,767
  106,495,847
  106,496,457
  106,496,827
  106,496,837
  106,496,839
  106,496,963
  106,498,208
  106,498,486
  106,499,384
  106,500,150
  106,500,330
  106,500,678
  106,500,790
  106,501,107
  106,501,118
  106,501,122
  106,501,126
  106,501,834
  106,501,843
  106,501,845
  106,501,909
  106,502,179
  106,502,299
  106,502,351
  106,503,962
  106,504,706
  106,505,135
  106,505,368
  106,505,868
  106,506,027
  106,506,103
  106,506,124
  106,506,387
  106,507,983
  106,508,117
  106,508,759
  106,509,374
  106,509,603
  106,509,634
  106,510,158
  106,510,908
  106,512,055
  106,512,967
  106,513,921
  106,514,341
  106,514,352
  106,514,409
  106,514,486
  106,514,655
  106,514,688
  106,514,999
  106,515,024
  106,515,040
  106,515,299
  106,515,507
  106,515,909
  106,515,919
  106,515,958
  106,516,026
  106,516,042
  106,516,286
  106,516,592
  106,517,011
  106,517,485
  106,517,500
  106,518,140
  106,518,425
  106,519,263
  106,519,357
  106,519,534
  106,519,700
  106,520,201
  106,520,202
  106,520,470
  106,520,472
  106,521,589
  106,521,624
  106,521,728
  106,521,729
  106,521,730
  106,521,848
  106,521,917
  106,521,918
  106,523,049
  106,523,262
  106,523,520
  106,523,930
  106,524,170
  106,525,300
  106,525,302
  106,525,670
  106,525,798
  106,525,802
  106,533,445
  106,533,521
  106,535,290
  106,535,357
  106,535,596
  106,536,345
  106,537,038
  106,537,289
  106,537,531
  106,538,076
  106,538,423
  106,539,858
  106,539,868
  106,540,509
  106,540,510
  106,540,541
  106,540,571
  106,540,653
  106,540,733
  106,540,791
  106,541,558
  106,542,506
  106,543,345
  106,545,101
  106,545,160
  106,545,203
  106,545,288
  106,546,650
  106,546,735
  106,546,736
  106,547,426
  106,547,865
  106,548,242
  106,548,405
  106,549,071
  106,549,332
  106,549,362
  106,550,827
  106,551,026
  106,551,051
  106,552,134
  106,552,528
  106,553,051
  106,553,588
  106,554,176
  106,556,091
  106,556,514
  106,556,581
  106,558,290
  106,559,544
  106,560,059
  106,560,349
  106,560,636
  106,560,970
  106,561,765
  106,564,641
  106,564,789
  106,564,889
  106,564,971
  106,565,003
  106,565,104
  106,565,134
  106,565,212
  106,565,231
  106,565,250
  106,565,367
  106,565,449
  106,565,523
  106,565,530
  106,565,533
  106,565,539
  106,565,544
  106,565,546
  106,565,552
  106,565,554
  106,565,564
  106,565,584
  106,565,616
  106,565,658
  106,565,667
  106,565,682
  106,565,691
  106,565,729
  106,565,767
  106,565,889
  106,565,957
  106,566,094
  106,566,109
  106,566,160
  106,566,172
  106,566,177
  106,566,178
  106,566,217
  106,566,265
  106,566,266
  106,566,290
  106,566,386
  106,566,426
  106,566,538
  106,566,544
  106,566,626
  106,566,640
  106,566,707
  106,566,916
  106,567,716
  106,567,717
  106,567,953
  106,567,954
  106,568,002
  106,568,059
  106,568,091
  106,568,130
  106,568,662
  106,568,672
  106,568,673
  106,568,691
  106,568,705
  106,569,072
  106,569,568
  106,569,703
  106,570,096
  106,570,150
  106,575,651
  106,575,665
  106,575,806
  106,575,817
  106,575,826
  106,575,830
  106,575,833
  106,575,842
  106,575,846
  106,575,868
  106,576,212
  106,576,410
  106,576,515
  106,576,910
  106,577,993
  106,578,627
  106,578,857
  106,579,020
  106,579,456
  106,579,729
  106,580,619
  106,581,072
  106,581,428
  106,582,680
  106,582,712
  106,582,725
  106,582,726
  106,582,727
  106,582,744
  106,583,429
  106,585,122
  106,585,740
  106,591,501
  106,591,512
  106,591,590
  106,591,755
  106,593,045
  106,593,317
  106,593,470
  106,593,544
  106,594,855
  106,594,989
  106,595,767
  106,595,907
  106,596,441
  106,596,557
  106,596,662
  106,596,815
  106,596,962
  106,597,021
  106,598,308
  106,598,549
  106,599,358
  106,599,737
  106,602,638
  106,603,240
  106,603,244
  106,603,400
  106,608,799
  106,608,948
  106,608,999
  106,613,517
  106,613,652
  106,614,178
  106,614,247
  106,615,299
  106,615,365
  106,615,526
  106,615,532
  106,615,875
  106,615,877
  106,617,309
  106,617,311
  106,617,421
  106,617,544
  106,617,646
  106,618,774
  106,619,000
  106,619,772
  106,621,885
  106,623,011
  106,625,042
  106,625,273
  106,625,570
  106,626,150
  106,626,355
  106,627,425
  106,627,838
  106,628,477
  106,628,521
  106,628,535
  106,629,127
  106,630,172
  106,630,252
  106,630,287
  106,630,836
  106,631,470
  106,631,476
  106,632,762
  106,632,787
  106,632,936
  106,633,327
  106,633,432
  106,633,820
  106,633,967
  106,634,124
  106,634,241
  106,634,293
  106,634,294
  106,634,300
  106,634,343
  106,634,579
  106,634,631
  106,634,638
  106,634,967
  106,636,314
  106,637,110
  106,637,144
  106,637,492
  106,638,072
  106,638,553
  106,639,151
  106,640,169
  106,642,464
  106,643,098
  106,644,954
  106,645,272
  106,645,277
  106,645,367
  106,645,398
  106,646,991
  106,647,987
  106,659,449
  106,659,467
  106,659,470
  106,659,472
  106,659,478
  106,659,495
  106,659,605
  106,659,606
  106,659,725
  106,659,767
  106,659,769
  106,659,771
  106,659,777
  106,659,789
  106,659,792
  106,659,794
  106,661,931
  106,662,692
  106,662,944
  106,664,792
  106,665,096
  106,666,262
  106,667,388
  106,667,821
  106,668,759
  106,669,172
  106,670,067
  106,671,119
  106,673,188
  106,673,480
  106,673,924
  106,676,196
  106,676,876
  106,678,002
  106,678,131
  106,678,253
  106,678,909
  106,678,984
  106,679,095
  106,680,644
  106,680,913
  106,681,327
  106,681,928
  106,683,853
  106,683,938
  106,685,022
  106,688,360
  106,688,716
  106,690,014
  106,690,087
  106,690,865
  106,691,505
  106,691,746
  106,692,789
  106,693,527
  106,694,223
  106,694,299
  106,694,647
  106,694,776
  106,694,929
  106,695,049
  106,695,238
  106,695,240
  106,696,203
  106,697,031
  106,701,190
  106,701,266
  106,701,275
  106,703,191
  106,704,831
  106,704,903
  106,706,786
  106,707,441
  106,709,119
  106,725,209
  106,725,731
  106,727,377
  106,727,505
  106,728,821
  106,728,846
  106,728,852
  106,728,868
  106,730,248
  106,732,081
  106,734,271
  106,734,282
  106,734,283
  106,736,492
  106,736,566
  106,736,961
  106,736,964
  106,736,967
  106,736,970
  106,736,973
  106,737,164
  106,737,531
  106,737,532
  106,738,346
  106,739,410
  106,739,920
  106,739,943
  106,743,585
  106,746,122
  106,746,482
  106,747,392
  106,747,614
  106,747,996
  106,748,179
  106,748,469
  106,748,538
  106,748,589
  106,748,692
  106,748,832
  106,750,126
  106,750,579
  106,750,889
  106,751,308
  106,752,099
  106,752,153
  106,752,240
  106,752,242
  106,753,693
  106,754,372
  106,754,739
  106,754,804
  106,755,374
  106,756,050
  106,757,700
  106,757,934
  106,759,240
  106,760,137
  106,760,163
  106,760,599
  106,760,629
  106,760,652
  106,760,707
  106,763,513
  106,763,951
  106,764,006
  106,764,622
  106,764,945
  106,765,809
  106,775,981
  106,776,205
  106,776,746
  106,777,148
  106,777,401
  106,777,928
  106,778,032
  106,778,222
  106,778,405
  106,778,599
  106,779,785
  106,779,793
  106,780,302
  106,781,262
  106,781,374
  106,782,909
  106,782,919
  106,782,920
  106,783,725
  106,784,573
  106,784,660
  106,784,908
  106,787,134
  106,787,167
  106,787,187
  106,789,056
  106,790,609
  106,791,433
  106,791,513
  106,793,017
  106,793,443
  106,793,959
  106,795,690
  106,802,636
  106,803,100
  106,803,107
  106,803,192
  106,803,428
  106,804,792
  106,805,266
  106,805,603
  106,805,652
  106,805,739
  106,805,851
  106,806,117
  106,806,183
  106,806,210
  106,806,238
  106,806,405
  106,806,422
  106,806,437
  106,807,040
  106,807,063
  106,807,066
  106,807,072
  106,807,213
  106,807,277
  106,807,327
  106,809,853
  106,815,587
  106,815,887
  106,816,432
  106,817,936
  106,818,242
  106,820,354
  106,822,928
-
A
A
-
-
T
3
A
T
T
T
T
T
A
T
T
T
-
-
A
C
-
4
G
3
C
T
G
G
C
G
T
T
A
T
T
T
G
T
G
G
3
C
T
C/G
G/A
A/G
A
T
AT/ATT
C
A
-
A
G
G/TGTTGTTGTG
G/T
T/G
G
-
A
C
A
C
C
T
3/C
C/G
G/T
-
-
T
2
A
T
5
A
3
-
G
2
A
A
-
T
5
5/C
5/C
2
-/22
3
T
C
C
T
A
-/A
A/C
A/CAAA
C
A
A
C
T
-
C
G
-
G
G/A
G/A
-/C
2/C
T/C
T