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ONTOLOGY REPORT - ANNOTATIONS


Term:8,5'-cyclo-2'-deoxyguanosine monophosphate
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Accession:CHEBI:131829 term browser browse the term
Definition:An organic heterotetracyclic compound obtained by intramolecular formation of a C-C bond between positions 8 and 5' of dGMP.
Synonyms:exact_synonym: (6R,7S,8S,10R)-2-amino-8-hydroxy-4-oxo-1,6,7,8,9,10-hexahydro-4H-7,10-epoxyazepino[1,2-e]purin-6-yl dihydrogen phosphate
 related_synonym: 8,5'-cyclo-dGMP;   Formula=C10H12N5O7P;   InChI=1S/C10H12N5O7P/c11-10-13-7-4(9(17)14-10)12-8-6(22-23(18,19)20)5-2(16)1-3(21-5)15(7)8/h2-3,5-6,16H,1H2,(H2,18,19,20)(H3,11,13,14,17)/t2-,3+,5-,6-/m0/s1;   InChIKey=WUVBJPHCDIFJHL-VPXOEYFHSA-N;   SMILES=[C@H]12N3C=4N=C(NC(C4N=C3[C@H]([C@]([C@H](C1)O)(O2)[H])OP(O)(O)=O)=O)N;   cyclo-dGMP;   cyclodGMP
 xref: PMID:22817898 "Europe PMC"


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  CHEBI ontology 19749
    role 19696
      application 19347
        refrigerant 17097
          ammonia 16696
            organic amino compound 16695
              aromatic amine 13605
                8,5'-cyclo-2'-deoxyguanosine monophosphate 0
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  CHEBI ontology 19749
    subatomic particle 19745
      composite particle 19745
        hadron 19745
          baryon 19745
            nucleon 19745
              atomic nucleus 19745
                atom 19745
                  main group element atom 19630
                    p-block element atom 19630
                      chalcogen 19336
                        oxygen atom 19297
                          oxygen molecular entity 19297
                            hydroxides 19050
                              oxoacid 18117
                                pnictogen oxoacid 9845
                                  phosphorus oxoacid 8666
                                    phosphoric acids 7337
                                      phosphoric acid 7337
                                        phosphoric acid derivative 6989
                                          phosphate 6989
                                            organic phosphate 6988
                                              carbohydrate phosphate 1513
                                                phospho sugar 1444
                                                  aldose phosphate 1442
                                                    aldopentose phosphate 1436
                                                      deoxyaldopentose phosphate 9
                                                        2-deoxyribose phosphate 9
                                                          2'-deoxyribonucleotide 8
                                                            2'-deoxyribonucleoside 5'-phosphate 8
                                                              2'-deoxyribonucleoside 5'-monophosphate 3
                                                                purine 2'-deoxyribonucleoside 5'-monophosphate 1
                                                                  2'-deoxyguanosine 5'-monophosphate 1
                                                                    8,5'-cyclo-2'-deoxyguanosine monophosphate 0
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