Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  FTP Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   

ONTOLOGY REPORT - ANNOTATIONS


Term:spiro-epoxide
go back to main search page
Accession:CHEBI:133131 term browser browse the term
Definition:An oxaspiro compound in which a carbon atom of an epoxide ring is the only common member of two rings.
Synonyms:related_synonym: spiro-epoxides;   spiroepoxide;   spiroepoxides


show annotations for term's descendants       view all columns           Sort by:
 
fumagillin term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G Bcl2 BCL2, apoptosis regulator JBrowse link 13 26,605,426 26,769,374 RGD:6480464
G Metap1 methionyl aminopeptidase 1 JBrowse link 2 243,744,620 243,777,673 RGD:6480464
G Metap2 methionyl aminopeptidase 2 JBrowse link 7 34,762,241 34,789,456 RGD:6480464
G Tert telomerase reverse transcriptase JBrowse link 1 32,250,876 32,275,330 RGD:6480464
G Ywhag tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein, gamma JBrowse link 12 23,789,547 23,817,884 RGD:6480464
O-(chloroacetylcarbamoyl)fumagillol term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G Ccnd1 cyclin D1 JBrowse link 1 218,090,750 218,100,447 RGD:6480464
G Cdkn1a cyclin-dependent kinase inhibitor 1A JBrowse link 20 6,348,422 6,358,864 RGD:6480464
G Fgf2 fibroblast growth factor 2 JBrowse link 2 124,081,072 124,134,133 RGD:6480464
G Mmp9 matrix metallopeptidase 9 JBrowse link 3 161,413,410 161,421,473 RGD:6480464
G Nfkb1 nuclear factor kappa B subunit 1 JBrowse link 2 240,773,520 240,890,053 RGD:6480464
G Nos2 nitric oxide synthase 2 JBrowse link 10 66,188,290 66,221,621 RGD:6480464
G Rb1 RB transcriptional corepressor 1 JBrowse link 15 55,081,582 55,209,060 RGD:6480464
G Rela RELA proto-oncogene, NF-kB subunit JBrowse link 1 220,992,770 221,003,249 RGD:6480464
G Sod2 superoxide dismutase 2 JBrowse link 1 47,914,757 47,921,587 RGD:6480464
G Tp53 tumor protein p53 JBrowse link 10 56,186,299 56,198,449 RGD:6480464
troleandomycin term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G Abcb1a ATP binding cassette subfamily B member 1A JBrowse link 4 22,339,829 22,517,642 RGD:6480464
G Cyp3a23/3a1 cytochrome P450, family 3, subfamily a, polypeptide 23/polypeptide 1 JBrowse link 12 11,053,888 11,082,742 RGD:6480464
G Cyp3a9 cytochrome P450, family 3, subfamily a, polypeptide 9 JBrowse link 12 19,074,288 19,114,491 RGD:6480464
G Fn1 fibronectin 1 JBrowse link 9 78,900,111 78,969,018 RGD:6480464
G Gsta2 glutathione S-transferase alpha 2 JBrowse link 8 85,640,081 85,645,621 RGD:6480464
G Madcam1 mucosal vascular addressin cell adhesion molecule 1 JBrowse link 7 12,918,352 12,922,509 RGD:6480464
G Nr1i2 nuclear receptor subfamily 1, group I, member 2 JBrowse link 11 65,022,100 65,058,546 RGD:6480464
G Tnf tumor necrosis factor JBrowse link 20 5,189,382 5,192,000 RGD:6480464

Term paths to the root
Path 1
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19764
    chemical entity 19763
      molecular entity 19761
        main group molecular entity 19646
          gas molecular entity 17394
            oxirane 5378
              epoxide 5376
                spiro-epoxide 23
                  14,15-dihydroajugapitin 0
                  14,15-dihydroclerodin 0
                  14-hydro-15-hydroxyajugachin A 0
                  14-hydro-15-hydroxyajugapitin 0
                  15-epi-lupulin B 0
                  15-hydroxyajubractin C 0
                  3-epi-14,15-dihydrocaryoptin 0
                  3-epi-caryoptin 0
                  6-(2,2,3-trimethylcyclopent-3-enyl)-1-oxaspiro[2.5]oct-5-ene 0
                  FR901464 0
                  FR901465 0
                  O-(chloroacetylcarbamoyl)fumagillol 10
                  Petasitenine 0
                  ajubractin A 0
                  ajubractin B 0
                  ajubractin C 0
                  ajubractin D 0
                  ajubractin E 0
                  ajugaciliatin H 0
                  ajugacumbin A 0
                  ajugalide B 0
                  ajugalide C 0
                  ajugamarin A1 0
                  ajugamarin A2 0
                  ajugamarin B1 0
                  ajugamarin G1 0
                  ajugamarin H1 0
                  ajuganipponin A 0
                  ajuganipponin B 0
                  ajugapantin A 0
                  ajugapitin 0
                  ajugatakasin A 0
                  ajugatakasin B 0
                  caryoptin 0
                  clerodin 0
                  coriatin 0
                  curvularol 0
                  florosenine 0
                  fumagillin + 5
                  fumagillol + 15
                  ivain II 0
                  jacobine N-oxide 0
                  jacozine + 0
                  jacozine N-oxide 0
                  oleandolide + 8
                  otosenine + 0
                  pentalenolactone 0
                  pentalenolactone F 0
                  streptolydigin 0
Path 2
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19764
    subatomic particle 19762
      composite particle 19762
        hadron 19762
          baryon 19762
            nucleon 19762
              atomic nucleus 19762
                atom 19762
                  main group element atom 19646
                    p-block element atom 19646
                      carbon group element atom 19540
                        carbon atom 19529
                          organic molecular entity 19529
                            organic molecule 19447
                              organic cyclic compound 19207
                                organic heterocyclic compound 18277
                                  organic heteromonocyclic compound 16369
                                    saturated organic heteromonocyclic parent 5417
                                      oxirane 5378
                                        epoxide 5376
                                          spiro-epoxide 23
                                            14,15-dihydroajugapitin 0
                                            14,15-dihydroclerodin 0
                                            14-hydro-15-hydroxyajugachin A 0
                                            14-hydro-15-hydroxyajugapitin 0
                                            15-epi-lupulin B 0
                                            15-hydroxyajubractin C 0
                                            3-epi-14,15-dihydrocaryoptin 0
                                            3-epi-caryoptin 0
                                            6-(2,2,3-trimethylcyclopent-3-enyl)-1-oxaspiro[2.5]oct-5-ene 0
                                            FR901464 0
                                            FR901465 0
                                            O-(chloroacetylcarbamoyl)fumagillol 10
                                            Petasitenine 0
                                            ajubractin A 0
                                            ajubractin B 0
                                            ajubractin C 0
                                            ajubractin D 0
                                            ajubractin E 0
                                            ajugaciliatin H 0
                                            ajugacumbin A 0
                                            ajugalide B 0
                                            ajugalide C 0
                                            ajugamarin A1 0
                                            ajugamarin A2 0
                                            ajugamarin B1 0
                                            ajugamarin G1 0
                                            ajugamarin H1 0
                                            ajuganipponin A 0
                                            ajuganipponin B 0
                                            ajugapantin A 0
                                            ajugapitin 0
                                            ajugatakasin A 0
                                            ajugatakasin B 0
                                            caryoptin 0
                                            clerodin 0
                                            coriatin 0
                                            curvularol 0
                                            florosenine 0
                                            fumagillin + 5
                                            fumagillol + 15
                                            ivain II 0
                                            jacobine N-oxide 0
                                            jacozine + 0
                                            jacozine N-oxide 0
                                            oleandolide + 8
                                            otosenine + 0
                                            pentalenolactone 0
                                            pentalenolactone F 0
                                            streptolydigin 0
paths to the root

NHLBI Logo

RGD is funded by grant HL64541 from the National Heart, Lung, and Blood Institute on behalf of the NIH.