Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  FTP Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   

ONTOLOGY REPORT - ANNOTATIONS


Term:UTP
go back to main search page
Accession:CHEBI:15713 term browser browse the term
Definition:A pyrimidine ribonucleoside 5'-triphosphate having uracil as the nucleobase.
Synonyms:exact_synonym: uridine 5'-(tetrahydrogen triphosphate)
 related_synonym: 5'-UTP;   Formula=C9H15N2O15P3;   H4utp;   InChI=1S/C9H15N2O15P3/c12-5-1-2-11(9(15)10-5)8-7(14)6(13)4(24-8)3-23-28(19,20)26-29(21,22)25-27(16,17)18/h1-2,4,6-8,13-14H,3H2,(H,19,20)(H,21,22)(H,10,12,15)(H2,16,17,18)/t4-,6-,7-,8-/m1/s1;   InChIKey=PGAVKCOVUIYSFO-XVFCMESISA-N;   SMILES=O[C@@H]1[C@@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OP(O)(O)=O)O[C@H]([C@@H]1O)n1ccc(=O)[nH]c1=O;   Uridine 5'-triphosphate;   Uridine triphosphate;   uridine 5'-triphosphoric acid
 alt_id: CHEBI:13510;   CHEBI:27233;   CHEBI:9850
 xref: Beilstein:71520 "Beilstein";   CAS:63-39-8 "ChemIDplus";   CAS:63-39-8 "KEGG COMPOUND";   DrugBank:DB04005;   Drug_Central:3639 "DrugCentral";   Gmelin:307896 "Gmelin";   KEGG:C00075
 xref_mesh: MESH:D014544
 xref: PDBeChem:UTP
 cyclic_relationship: is_conjugate_acid_of CHEBI:46398;   is_conjugate_acid_of CHEBI:57481


show annotations for term's descendants       view all columns           Sort by:
 
UTP term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G Ahr aryl hydrocarbon receptor JBrowse link 6 54,963,990 55,001,806 RGD:6480464
G Calca calcitonin-related polypeptide alpha JBrowse link 1 184,184,018 184,188,922 RGD:6480464
G Egfr epidermal growth factor receptor JBrowse link 14 99,919,485 100,104,136 RGD:6480464
G Gnaq G protein subunit alpha q JBrowse link 1 233,382,778 233,622,584 RGD:6480464
G Hcar2 hydroxycarboxylic acid receptor 2 JBrowse link 12 38,160,464 38,161,546 RGD:6480464
G Il6 interleukin 6 JBrowse link 4 3,043,231 3,047,807 RGD:6480464
G Mapk1 mitogen activated protein kinase 1 JBrowse link 11 88,203,863 88,273,301 RGD:6480464
G Mapk3 mitogen activated protein kinase 3 JBrowse link 1 198,192,773 198,198,975 RGD:6480464
G Myl2 myosin light chain 2 JBrowse link 12 39,951,863 39,959,065 RGD:6480464
G Myocd myocardin JBrowse link 10 51,682,053 51,781,458 RGD:6480464
G Nppa natriuretic peptide A JBrowse link 5 164,808,407 164,809,716 RGD:6480464
G P2ry2 purinergic receptor P2Y2 JBrowse link 1 166,031,228 166,045,423 RGD:6480464
G P2ry4 pyrimidinergic receptor P2Y4 JBrowse link X 70,421,599 70,447,109 RGD:6480464
G Panx1 Pannexin 1 JBrowse link 8 13,567,185 13,606,040 RGD:6480464
G Sftpb surfactant protein B JBrowse link 4 100,166,855 100,175,941 RGD:6480464
G Sftpc surfactant protein C JBrowse link 15 52,211,538 52,214,480 RGD:6480464

Term paths to the root
Path 1
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19669
    role 19613
      biological role 19611
        biochemical role 19138
          metabolite 19106
            prokaryotic metabolite 18227
              bacterial metabolite 18227
                Escherichia coli metabolite 18121
                  UTP 16
                    5-bromouridine 5'-triphosphate 0
                    allyl-UTP 0
                    crotyl-UTP 0
                    dimethylallyl-UTP 0
                    ethyl-UTP 0
                    isopentenyl-UTP 0
Path 2
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19669
    subatomic particle 19665
      composite particle 19665
        hadron 19665
          baryon 19665
            nucleon 19665
              atomic nucleus 19665
                atom 19665
                  main group element atom 19545
                    p-block element atom 19545
                      chalcogen 19233
                        oxygen atom 19188
                          oxygen molecular entity 19188
                            hydroxides 18965
                              oxoacid 18076
                                pnictogen oxoacid 8534
                                  phosphorus oxoacid 8429
                                    phosphoric acids 7314
                                      phosphoric acid 7314
                                        phosphoric acid derivative 6965
                                          phosphate 6965
                                            organic phosphate 6964
                                              carbohydrate phosphate 1496
                                                phospho sugar 1431
                                                  aldose phosphate 1429
                                                    aldopentose phosphate 1423
                                                      ribose phosphate 1417
                                                        ribonucleotide 1376
                                                          ribonucleoside 5'-phosphate 385
                                                            ribonucleoside 5'-triphosphate 225
                                                              pyrimidine ribonucleoside 5'-triphosphate 17
                                                                UTP 16
                                                                  5-bromouridine 5'-triphosphate 0
                                                                  allyl-UTP 0
                                                                  crotyl-UTP 0
                                                                  dimethylallyl-UTP 0
                                                                  ethyl-UTP 0
                                                                  isopentenyl-UTP 0
paths to the root

NHLBI Logo

RGD is funded by grant HL64541 from the National Heart, Lung, and Blood Institute on behalf of the NIH.