Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  FTP Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   

ONTOLOGY REPORT - ANNOTATIONS


Term:2'-deoxycytosine 5'-monophosphate
go back to main search page
Accession:CHEBI:15918 term browser browse the term
Definition:A pyrimidine 2'-deoxyribonucleoside 5'-monophosphate having cytosine as the nucleobase.
Synonyms:exact_synonym: 2'-deoxy-5'-cytidylic acid
 related_synonym: 2'-Deoxycytidine 5'-monophosphate;   Deoxycytidine monophosphate;   Deoxycytidylate;   Deoxycytidylic acid;   Formula=C9H14N3O7P;   InChI=1S/C9H14N3O7P/c10-7-1-2-12(9(14)11-7)8-3-5(13)6(19-8)4-18-20(15,16)17/h1-2,5-6,8,13H,3-4H2,(H2,10,11,14)(H2,15,16,17)/t5-,6+,8+/m0/s1;   InChIKey=NCMVOABPESMRCP-SHYZEUOFSA-N;   SMILES=Nc1ccn([C@H]2C[C@H](O)[C@@H](COP(O)(O)=O)O2)c(=O)n1;   dCMP
 alt_id: CHEBI:10493;   CHEBI:14070;   CHEBI:14071;   CHEBI:14115;   CHEBI:19242;   CHEBI:41838;   CHEBI:41875
 xref: CAS:1032-65-1 "ChemIDplus";   CAS:1032-65-1 "KEGG COMPOUND";   DrugBank:DB03798;   KEGG:C00239
 xref_mesh: MESH:D003843
 xref: PDBeChem:DCM
 cyclic_relationship: is_conjugate_acid_of CHEBI:57566;   is_enantiomer_of CHEBI:41929


show annotations for term's descendants       view all columns           Sort by:
 
2'-deoxycytosine 5'-monophosphate term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G Idh2 isocitrate dehydrogenase (NADP(+)) 2 JBrowse link 1 141,874,354 141,893,674 RGD:6480464

Term paths to the root
Path 1
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19662
    role 19606
      biological role 19604
        biochemical role 19133
          metabolite 19101
            prokaryotic metabolite 18236
              bacterial metabolite 18236
                Escherichia coli metabolite 18132
                  2'-deoxycytosine 5'-monophosphate 1
                    2'-deoxy-5,6-dihydroxy-5,6-dihydrocytidine 5'-monophosphate 0
                    2'-deoxycytidine 5'-monophosphate residue + 0
                    5-iododeoxycytidine monophosphate 0
                    dCMP 3'-end residue + 0
                    dCMP 5'-end residue + 0
Path 2
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19662
    subatomic particle 19658
      composite particle 19658
        hadron 19658
          baryon 19658
            nucleon 19658
              atomic nucleus 19658
                atom 19658
                  main group element atom 19539
                    p-block element atom 19539
                      chalcogen 19228
                        oxygen atom 19182
                          oxygen molecular entity 19182
                            hydroxides 18964
                              oxoacid 18075
                                pnictogen oxoacid 8543
                                  phosphorus oxoacid 8436
                                    phosphoric acids 7318
                                      phosphoric acid 7318
                                        phosphoric acid derivative 6968
                                          phosphate 6968
                                            organic phosphate 6967
                                              carbohydrate phosphate 1498
                                                phospho sugar 1433
                                                  aldose phosphate 1431
                                                    aldopentose phosphate 1425
                                                      deoxyaldopentose phosphate 9
                                                        2-deoxyribose phosphate 9
                                                          2'-deoxyribonucleotide 8
                                                            2'-deoxyribonucleoside 5'-phosphate 8
                                                              2'-deoxyribonucleoside 5'-monophosphate 3
                                                                pyrimidine 2'-deoxyribonucleoside 5'-monophosphate 3
                                                                  2'-deoxycytosine 5'-monophosphate 1
                                                                    2'-deoxy-5,6-dihydroxy-5,6-dihydrocytidine 5'-monophosphate 0
                                                                    2'-deoxycytidine 5'-monophosphate residue + 0
                                                                    5-iododeoxycytidine monophosphate 0
                                                                    dCMP 3'-end residue + 0
                                                                    dCMP 5'-end residue + 0
paths to the root

NHLBI Logo

RGD is funded by grant HL64541 from the National Heart, Lung, and Blood Institute on behalf of the NIH.