Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  FTP Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   

CHEBI ONTOLOGY - ANNOTATIONS

The Chemical Entities of Biological Interest (ChEBI) ontology is downloaded weekly from EMBL-EBI at http://www.ebi.ac.uk/chebi/. The data is made available under the Creative Commons License (CC BY 3.0, http://creativecommons.org/licenses/by/3.0/). For more information see: Degtyarenko et al. (2008) ChEBI: a database and ontology for chemical entities of biological interest. Nucleic Acids Res. 36, D344–D350.

Term:L-histidine
go back to main search page
Accession:CHEBI:15971 term browser browse the term
Definition:The L-enantiomer of the amino acid histidine.
Synonyms:exact_synonym: (2S)-2-amino-3-(1H-imidazol-4-yl)propanoic acid
 related_synonym: (S)-4-(2-Amino-2-carboxyethyl)imidazole;   (S)-alpha-Amino-1H-imidazole-4-propionic acid;   (S)-alpha-amino-1H-Imidazole-4-propanoic acid;   Formula=C6H9N3O2;   H;   HISTIDINE;   His;   InChI=1S/C6H9N3O2/c7-5(6(10)11)1-4-2-8-3-9-4/h2-3,5H,1,7H2,(H,8,9)(H,10,11)/t5-/m0/s1;   InChIKey=HNDVDQJCIGZPNO-YFKPBYRVSA-N;   L-Histidin;   SMILES=N[C@@H](Cc1c[nH]cn1)C(O)=O
 alt_id: CHEBI:13117;   CHEBI:21324;   CHEBI:43048;   CHEBI:43114;   CHEBI:43190;   CHEBI:43239;   CHEBI:6240
 xref: Beilstein:84088;   CAS:71-00-1;   DrugBank:DB00117;   ECMDB:ECMDB00177;   Gmelin:83042;   HMDB:HMDB0000177;   KEGG:C00135;   KEGG:D00032;   KNApSAcK:C00001363;   MetaCyc:HIS;   PDBeChem:HIS;   PMID:15206581;   PMID:21608102;   PMID:21719207;   PMID:22324399;   PMID:22415677;   PMID:22517640;   Reaxys:84088;   Wikipedia:L-histidine;   YMDB:YMDB00369
 cyclic_relationship: is_conjugate_acid_of CHEBI:32510;   is_conjugate_base_of CHEBI:32513;   is_enantiomer_of CHEBI:27947;   is_tautomer_of CHEBI:57595


show annotations for term's descendants           Sort by:
 
ergothioneine term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Ache acetylcholinesterase multiple interactions ISO Ergothioneine inhibits the reaction [Cisplatin results in decreased activity of ACHE protein] CTD PMID:20932872 NCBI chr12:22,472,358...22,477,052
Ensembl chr12:22,472,358...22,478,753
JBrowse link

Term paths to the root
Path 1
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19787
    role 19734
      biological role 19734
        biochemical role 19282
          metabolite 19263
            histidine 1
              L-histidine 1
                Ala-Gly-His 0
                Ala-Leu-Leu-His 0
                Ala-Val-Asp-His 0
                Asn-His 0
                Asn-Trp-Cys-His 0
                Asp-His 0
                Cys-Cys-His-His 0
                Cys-Met-Phe-His 0
                Gly-His 0
                His-His 0
                His-Ile 0
                His-Phe 0
                Ile-His 0
                L-histidine derivative + 1
                L-histidine residue + 0
                L-histidyl group 0
                Leu-Asn-His 0
                N(2)-L-histidino group 0
                N(alpha)-(L-gamma-glutamyl)-hercynyl-L-cysteine sulfoxide 0
                N(alpha)-(L-gamma-glutamyl)-hercynyl-L-selenocysteine 0
                N(pros)-L-histidino group 0
                N(tele)-L-histidino group 0
                Phe-His 0
                Ser-His 0
                Thr-Ala-His 0
                Thr-His 0
                Tyr-His 0
                Val-His 0
                cyclo(L-His-L-Pro) 0
Path 2
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19787
    subatomic particle 19784
      composite particle 19784
        hadron 19784
          baryon 19784
            nucleon 19784
              atomic nucleus 19784
                atom 19784
                  main group element atom 19672
                    p-block element atom 19672
                      carbon group element atom 19574
                        carbon atom 19563
                          organic molecular entity 19563
                            organic group 18495
                              organic divalent group 18488
                                organodiyl group 18488
                                  carbonyl group 18391
                                    carbonyl compound 18391
                                      carboxylic acid 18061
                                        amino acid 14072
                                          alpha-amino acid 11539
                                            L-alpha-amino acid 11374
                                              L-histidine 1
                                                Ala-Gly-His 0
                                                Ala-Leu-Leu-His 0
                                                Ala-Val-Asp-His 0
                                                Asn-His 0
                                                Asn-Trp-Cys-His 0
                                                Asp-His 0
                                                Cys-Cys-His-His 0
                                                Cys-Met-Phe-His 0
                                                Gly-His 0
                                                His-His 0
                                                His-Ile 0
                                                His-Phe 0
                                                Ile-His 0
                                                L-histidine derivative + 1
                                                L-histidine residue + 0
                                                L-histidyl group 0
                                                Leu-Asn-His 0
                                                N(2)-L-histidino group 0
                                                N(alpha)-(L-gamma-glutamyl)-hercynyl-L-cysteine sulfoxide 0
                                                N(alpha)-(L-gamma-glutamyl)-hercynyl-L-selenocysteine 0
                                                N(pros)-L-histidino group 0
                                                N(tele)-L-histidino group 0
                                                Phe-His 0
                                                Ser-His 0
                                                Thr-Ala-His 0
                                                Thr-His 0
                                                Tyr-His 0
                                                Val-His 0
                                                cyclo(L-His-L-Pro) 0
paths to the root

NHLBI Logo

RGD is funded by grant HL64541 from the National Heart, Lung, and Blood Institute on behalf of the NIH.