Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  FTP Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   

ONTOLOGY REPORT - ANNOTATIONS


Term:benzoate
go back to main search page
Accession:CHEBI:16150 term browser browse the term
Definition:The simplest member of the class of benzoates that is the conjugate base of benzoic acid, comprising a benzoic acid core with a proton missing to give a charge of -1.
Synonyms:related_synonym: Benzenecarboxylate;   Benzeneformate;   Benzenemethanoate;   Formula=C7H5O2;   InChI=1S/C7H6O2/c8-7(9)6-4-2-1-3-5-6/h1-5H,(H,8,9)/p-1;   InChIKey=WPYMKLBDIGXBTP-UHFFFAOYSA-M;   Phenylcarboxylate;   Phenylformate;   SMILES=[O-]C(=O)c1ccccc1;   benzoate anion;   benzoic acid, ion(1-)
 alt_id: CHEBI:13879;   CHEBI:22717
 xref: Beilstein:1862486 "Beilstein";   CAS:766-76-7 "ChemIDplus";   CAS:766-76-7 "NIST Chemistry WebBook";   Gmelin:2945 "Gmelin";   HMDB:HMDB0001870;   KEGG:C00180;   MetaCyc:BENZOATE;   Reaxys:1862486 "Reaxys";   UM-BBD_compID:c0121 "UM-BBD"
 cyclic_relationship: is_conjugate_base_of CHEBI:30746


show annotations for term's descendants       view all columns           Sort by:
 
3,4-dihydroxybenzoate term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G Epas1 endothelial PAS domain protein 1 JBrowse link 6 10,306,508 10,385,239 RGD:6480464
G Hif1a hypoxia inducible factor 1 subunit alpha JBrowse link 6 96,810,868 96,856,303 RGD:6480464
G Hmox1 heme oxygenase 1 JBrowse link 19 14,508,634 14,515,455 RGD:6480464
G Slc40a1 solute carrier family 40 member 1 JBrowse link 9 52,819,451 52,830,461 RGD:6480464
G Sod2 superoxide dismutase 2 JBrowse link 1 47,914,757 47,921,587 RGD:6480464
sodium benzoate term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G Ahr aryl hydrocarbon receptor JBrowse link 6 54,963,990 55,001,806 RGD:6480464
G Camk2a calcium/calmodulin-dependent protein kinase II alpha JBrowse link 18 56,193,978 56,295,869 RGD:6480464
G Casp3 caspase 3 JBrowse link 16 48,845,011 48,863,249 RGD:6480464
G Casp9 caspase 9 JBrowse link 5 160,356,211 160,373,774 RGD:6480464
G Cyp1a1 cytochrome P450, family 1, subfamily a, polypeptide 1 JBrowse link 8 62,472,087 62,478,122 RGD:6480464
G Dao D-amino-acid oxidase JBrowse link 12 48,353,691 48,373,647 RGD:6480464
G Esr1 estrogen receptor 1 JBrowse link 1 41,192,029 41,594,799 RGD:6480464
G Ifng interferon gamma JBrowse link 7 61,337,383 61,341,419 RGD:6480464
G Il6 interleukin 6 JBrowse link 4 3,043,231 3,047,807 RGD:6480464
G Msr1 macrophage scavenger receptor 1 JBrowse link 16 56,817,714 56,900,025 RGD:6480464
G Otc ornithine carbamoyltransferase JBrowse link X 13,524,804 13,601,074 RGD:6480464
G Tnf tumor necrosis factor JBrowse link 20 5,189,382 5,192,000 RGD:6480464
G Tp53 tumor protein p53 JBrowse link 10 56,186,299 56,198,449 RGD:6480464

Term paths to the root
Path 1
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19716
    role 19663
      biological role 19661
        biochemical role 19179
          metabolite 19151
            eukaryotic metabolite 18770
              plant metabolite 17103
                benzoate 18
                  2,3-dihydroxybenzoate 0
                  2,3-dimethylbenzoate 0
                  2,4,6-trimethylbenzoate 0
                  2,4-dichlorobenzoate 0
                  2,4-dimethylbenzoate 0
                  2,5-dimethylbenzoate 0
                  2,6-dichlorobenzoate 0
                  2,6-dimethylbenzoate 0
                  2-diazoniobenzoate + 0
                  2-halobenzoate + 0
                  2-nitrobenzoate 0
                  3,4-dihydroxybenzoate 5
                  3,4-dimethylbenzoate 0
                  3,5-dibromo-4-hydroxybenzoate 0
                  3,5-dichloro-4-hydroxybenzoate 0
                  3,5-dimethylbenzoate 0
                  3-bromo-4-hydroxybenzoate 0
                  3-chlorobenzoate 0
                  3-diazoniobenzoate + 0
                  3-ethoxybenzoate 0
                  3-fluorobenzoate 0
                  3-hydroxybenzoate 0
                  4-(beta-D-glucosyloxy)benzoate 0
                  4-aminobenzoate 0
                  4-chlorobenzoate 0
                  4-diazoniobenzoate + 0
                  4-fluorobenzoate 0
                  4-hydroxy-3-octaprenylbenzoate 0
                  4-hydroxybenzoate + 0
                  4-methoxybenzoate 0
                  4-nitrobenzoate 0
                  4-sulfonatobenzoate(2-) 0
                  cloperastine fendizoate 0
                  macrophomate 0
                  p-mercuribenzoate 0
                  sodium benzoate + 13
Path 2
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19716
    subatomic particle 19712
      composite particle 19712
        hadron 19712
          baryon 19712
            nucleon 19712
              atomic nucleus 19712
                atom 19712
                  main group element atom 19598
                    p-block element atom 19598
                      carbon group element atom 19486
                        carbon atom 19480
                          organic molecular entity 19480
                            organic ion 7897
                              organic anion 2229
                                carboxylic acid anion 1828
                                  monocarboxylic acid anion 1482
                                    benzoates 1264
                                      benzoate 18
                                        2,3-dihydroxybenzoate 0
                                        2,3-dimethylbenzoate 0
                                        2,4,6-trimethylbenzoate 0
                                        2,4-dichlorobenzoate 0
                                        2,4-dimethylbenzoate 0
                                        2,5-dimethylbenzoate 0
                                        2,6-dichlorobenzoate 0
                                        2,6-dimethylbenzoate 0
                                        2-diazoniobenzoate + 0
                                        2-halobenzoate + 0
                                        2-nitrobenzoate 0
                                        3,4-dihydroxybenzoate 5
                                        3,4-dimethylbenzoate 0
                                        3,5-dibromo-4-hydroxybenzoate 0
                                        3,5-dichloro-4-hydroxybenzoate 0
                                        3,5-dimethylbenzoate 0
                                        3-bromo-4-hydroxybenzoate 0
                                        3-chlorobenzoate 0
                                        3-diazoniobenzoate + 0
                                        3-ethoxybenzoate 0
                                        3-fluorobenzoate 0
                                        3-hydroxybenzoate 0
                                        4-(beta-D-glucosyloxy)benzoate 0
                                        4-aminobenzoate 0
                                        4-chlorobenzoate 0
                                        4-diazoniobenzoate + 0
                                        4-fluorobenzoate 0
                                        4-hydroxy-3-octaprenylbenzoate 0
                                        4-hydroxybenzoate + 0
                                        4-methoxybenzoate 0
                                        4-nitrobenzoate 0
                                        4-sulfonatobenzoate(2-) 0
                                        cloperastine fendizoate 0
                                        macrophomate 0
                                        p-mercuribenzoate 0
                                        sodium benzoate + 13
paths to the root

NHLBI Logo

RGD is funded by grant HL64541 from the National Heart, Lung, and Blood Institute on behalf of the NIH.