Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  FTP Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   

ONTOLOGY REPORT - ANNOTATIONS


Term:2'-deoxyguanosine 5'-monophosphate
go back to main search page
Accession:CHEBI:16192 term browser browse the term
Definition:A purine 2'-deoxyribonucleoside 5'-monophosphate having guanine as the nucleobase.
Synonyms:exact_synonym: 2'-deoxy-5'-guanylic acid
 related_synonym: 2'-Deoxy-GMP;   2'-Deoxyguanosine 5'-(dihydrogen phosphate);   2'-Deoxyguanosine 5'-phosphate;   2'-Deoxyguanylic acid;   2'-dGMP;   Deoxy-GMP;   Deoxyguanosine 5'-monophosphate;   Deoxyguanosine 5'-phosphate;   Deoxyguanosine monophosphate;   Deoxyguanylic acid;   Formula=C10H14N5O7P;   InChI=1S/C10H14N5O7P/c11-10-13-8-7(9(17)14-10)12-3-15(8)6-1-4(16)5(22-6)2-21-23(18,19)20/h3-6,16H,1-2H2,(H2,18,19,20)(H3,11,13,14,17)/t4-,5+,6+/m0/s1;   InChIKey=LTFMZDNNPPEQNG-KVQBGUIXSA-N;   SMILES=Nc1nc2n(cnc2c(=O)[nH]1)[C@H]1C[C@H](O)[C@@H](COP(O)(O)=O)O1;   dGMP
 alt_id: CHEBI:10496;   CHEBI:14074;   CHEBI:19246;   CHEBI:41902;   CHEBI:41939;   CHEBI:42676;   CHEBI:42726;   CHEBI:42733;   CHEBI:47449
 xref: CAS:902-04-5 "ChemIDplus";   CAS:902-04-5 "KEGG COMPOUND";   DrugBank:DB04457;   ECMDB:ECMDB01044;   HMDB:HMDB0001044;   KEGG:C00362;   KNApSAcK:C00019356
 xref_mesh: MESH:C007257
 xref: MetaCyc:DGMP;   PDBeChem:DGP;   PMID:13610867 "Europe PMC";   PMID:20085298 "Europe PMC";   PMID:21720611 "Europe PMC";   PMID:23365666 "Europe PMC";   PMID:2559771 "Europe PMC";   PMID:9858930 "Europe PMC";   Reaxys:58430 "Reaxys";   Wikipedia:Deoxyguanosine_monophosphate;   YMDB:YMDB00506
 cyclic_relationship: is_conjugate_acid_of CHEBI:57673;   is_enantiomer_of CHEBI:41945;   is_tautomer_of CHEBI:45049


show annotations for term's descendants       view all columns           Sort by:
 
2'-deoxyguanosine 5'-monophosphate term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G Idh2 isocitrate dehydrogenase (NADP(+)) 2 JBrowse link 1 141,874,354 141,893,674 RGD:6480464

Term paths to the root
Path 1
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19669
    role 19613
      biological role 19611
        biochemical role 19138
          metabolite 19106
            prokaryotic metabolite 18227
              bacterial metabolite 18227
                Escherichia coli metabolite 18121
                  2'-deoxyguanosine 5'-monophosphate 1
                    2'-deoxyguanosine 5'-monophosphate residue + 0
                    8,5'-cyclo-2'-deoxyguanosine monophosphate 0
                    cis-diammine[bis(dGMP)]platinum 0
                    dGMP 3'-end residue + 0
                    dGMP 5'-end residue + 0
Path 2
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19669
    subatomic particle 19665
      composite particle 19665
        hadron 19665
          baryon 19665
            nucleon 19665
              atomic nucleus 19665
                atom 19665
                  main group element atom 19545
                    p-block element atom 19545
                      chalcogen 19233
                        oxygen atom 19188
                          oxygen molecular entity 19188
                            hydroxides 18965
                              oxoacid 18076
                                pnictogen oxoacid 8534
                                  phosphorus oxoacid 8429
                                    phosphoric acids 7314
                                      phosphoric acid 7314
                                        phosphoric acid derivative 6965
                                          phosphate 6965
                                            organic phosphate 6964
                                              carbohydrate phosphate 1496
                                                phospho sugar 1431
                                                  aldose phosphate 1429
                                                    aldopentose phosphate 1423
                                                      deoxyaldopentose phosphate 9
                                                        2-deoxyribose phosphate 9
                                                          2'-deoxyribonucleotide 8
                                                            2'-deoxyribonucleoside 5'-phosphate 8
                                                              2'-deoxyribonucleoside 5'-monophosphate 3
                                                                purine 2'-deoxyribonucleoside 5'-monophosphate 1
                                                                  2'-deoxyguanosine 5'-monophosphate 1
                                                                    2'-deoxyguanosine 5'-monophosphate residue + 0
                                                                    8,5'-cyclo-2'-deoxyguanosine monophosphate 0
                                                                    cis-diammine[bis(dGMP)]platinum 0
                                                                    dGMP 3'-end residue + 0
                                                                    dGMP 5'-end residue + 0
paths to the root

NHLBI Logo

RGD is funded by grant HL64541 from the National Heart, Lung, and Blood Institute on behalf of the NIH.