Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  FTP Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   

ONTOLOGY REPORT - ANNOTATIONS


Term:lipopolysaccharide
go back to main search page
Accession:CHEBI:16412 term browser browse the term
Definition:Liposaccharide natural compounds consisting of a trisaccharide repeating unit (two heptose units and octulosonic acid) with oligosaccharide side chains and 3-hydroxytetradecanoic acid units (they are a major constituent of the cell walls of Gram-negative bacteria).
Synonyms:related_synonym: LPS;   lipopolysaccharides
 alt_id: CHEBI:14520;   CHEBI:25062;   CHEBI:6494;   MESH:D008070
 xref: KEGG:C00338
 xref_mesh: MESH:D008070
 xref: PMID:15589368 "Europe PMC";   PMID:24186868 "Europe PMC";   PMID:24506665 "Europe PMC";   PMID:24642373 "Europe PMC";   PMID:24659348 "Europe PMC"


show annotations for term's descendants       view all columns           Sort by:
 
lipopolysaccharide term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G HSD11B1 hydroxysteroid 11-beta dehydrogenase 1 JBrowse link 7 8,344,380 8,409,901 RGD:6480464

Term paths to the root
Path 1
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 225
    chemical entity 225
      molecular entity 225
        polyatomic entity 217
          macromolecule 4
            biomacromolecule 3
              polysaccharide derivative 1
                lipopolysaccharide 1
                  3-deoxyoctulosonyllipopolysaccharide 0
                  Cosmosporaside D, (rel)- 0
                  Cosmosporaside E, (rel)- 0
                  E. coli strain 0111 B4 lipopolysaccharide 0
                  Glucoselysine 0
                  HCH-acetylsalicortin 0
                  LSM-36656 0
                  LSM-36728 0
                  LSM-36730 0
                  LSM-36740 0
                  N-acetyl-D-glucosaminyllipopolysaccharides 0
                  N-acetyl-beta-D-mannosaminouronosyl-(1->4)-lipopolysaccharide 0
                  citrusoside A 0
                  citrusoside B 0
                  citrusoside C 0
                  citrusoside D 0
                  galactosyllipopolysaccharide + 0
                  glucosyllipopolysaccharide + 0
                  soldanelline B 0
Path 2
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 225
    subatomic particle 225
      composite particle 225
        hadron 225
          baryon 225
            nucleon 225
              atomic nucleus 225
                atom 225
                  main group element atom 218
                    p-block element atom 218
                      carbon group element atom 207
                        carbon atom 206
                          organic molecular entity 206
                            heteroorganic entity 200
                              organochalcogen compound 169
                                organooxygen compound 168
                                  carbohydrates and carbohydrate derivatives 38
                                    carbohydrate 38
                                      polysaccharide 2
                                        polysaccharide derivative 1
                                          O-polysaccharide 1
                                            lipopolysaccharide 1
                                              3-deoxyoctulosonyllipopolysaccharide 0
                                              Cosmosporaside D, (rel)- 0
                                              Cosmosporaside E, (rel)- 0
                                              E. coli strain 0111 B4 lipopolysaccharide 0
                                              Glucoselysine 0
                                              HCH-acetylsalicortin 0
                                              LSM-36656 0
                                              LSM-36728 0
                                              LSM-36730 0
                                              LSM-36740 0
                                              N-acetyl-D-glucosaminyllipopolysaccharides 0
                                              N-acetyl-beta-D-mannosaminouronosyl-(1->4)-lipopolysaccharide 0
                                              citrusoside A 0
                                              citrusoside B 0
                                              citrusoside C 0
                                              citrusoside D 0
                                              galactosyllipopolysaccharide + 0
                                              glucosyllipopolysaccharide + 0
                                              soldanelline B 0
paths to the root

NHLBI Logo

RGD is funded by grant HL64541 from the National Heart, Lung, and Blood Institute on behalf of the NIH.