Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  FTP Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   

ONTOLOGY REPORT - ANNOTATIONS


Term:L-arginine
go back to main search page
Accession:CHEBI:16467 term browser browse the term
Definition:An L-alpha-amino acid that is the L-isomer of arginine.
Synonyms:related_synonym: (2S)-2-amino-5-(carbamimidamido)pentanoic acid;   (2S)-2-amino-5-guanidinopentanoic acid;   (S)-2-Amino-5-guanidinovaleric acid;   (S)-2-amino-5-guanidinopentanoic acid;   Arg;   Formula=C6H14N4O2;   InChI=1S/C6H14N4O2/c7-4(5(11)12)2-1-3-10-6(8)9/h4H,1-3,7H2,(H,11,12)(H4,8,9,10)/t4-/m0/s1;   InChIKey=ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-N;   L-Arg;   L-Arginin;   R;   SMILES=N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O;   arginine
 alt_id: CHEBI:13077;   CHEBI:21235;   CHEBI:42927;   CHEBI:6185
 xref: Beilstein:1725413 "ChemIDplus";   CAS:74-79-3 "ChemIDplus";   CAS:74-79-3 "KEGG COMPOUND";   CAS:74-79-3 "NIST Chemistry WebBook";   DrugBank:DB00125;   Drug_Central:1549 "DrugCentral";   ECMDB:ECMDB00517;   Gmelin:83283 "Gmelin";   HMDB:HMDB0000517;   KEGG:C00062;   KEGG:D02982;   KNApSAcK:C00001340;   MetaCyc:ARG;   PDBeChem:ARG;   PDBeChem:GND;   PMID:10848923 "Europe PMC";   PMID:11139824 "Europe PMC";   PMID:11300497 "Europe PMC";   PMID:11898853 "Europe PMC";   PMID:12812828 "Europe PMC";   PMID:15016745 "Europe PMC";   PMID:15465805 "Europe PMC";   PMID:16056256 "Europe PMC";   PMID:16416365 "Europe PMC";   PMID:17168727 "Europe PMC";   PMID:17439666 "Europe PMC";   PMID:19030957 "Europe PMC";   PMID:21600268 "Europe PMC";   PMID:21814794 "Europe PMC";   PMID:22179117 "Europe PMC";   PMID:22243793 "Europe PMC";   PMID:22251130 "Europe PMC";   PMID:22361732 "Europe PMC";   PMID:22425811 "Europe PMC";   PMID:22428068 "Europe PMC";   PMID:22439203 "Europe PMC";   PMID:22553931 "Europe PMC";   PMID:22619480 "Europe PMC";   PMID:22626826 "Europe PMC";   PMID:22652429 "Europe PMC";   PMID:22667467 "Europe PMC";   PMID:22709481 "Europe PMC";   PMID:8070089 "Europe PMC";   Reaxys:1725413 "Reaxys";   Wikipedia:L-arginine;   YMDB:YMDB00592
 cyclic_relationship: is_conjugate_acid_of CHEBI:32681;   is_conjugate_base_of CHEBI:32682;   is_enantiomer_of CHEBI:15816


show annotations for term's descendants       view all columns           Sort by:
 
(N(omega)-L-arginino)succinic acid term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G Idh2 isocitrate dehydrogenase (NADP(+)) 2 JBrowse link 1 141,874,354 141,893,674 RGD:6480464
G Lepr leptin receptor JBrowse link 5 120,503,475 120,682,281 RGD:6480464
argatroban term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G Acta2 actin alpha 2, smooth muscle JBrowse link 1 252,537,614 252,550,394 RGD:6480464
G Adgre1 adhesion G protein-coupled receptor E1 JBrowse link 9 9,431,888 9,585,883 RGD:6480464
G Ccl2 C-C motif chemokine ligand 2 JBrowse link 10 69,412,065 69,413,863 RGD:6480464
G Cd68 Cd68 molecule JBrowse link 10 56,268,726 56,270,605 RGD:6480464
G Col1a1 collagen type I alpha 1 chain JBrowse link 10 82,745,801 82,762,790 RGD:6480464
G Cxcl2 C-X-C motif chemokine ligand 2 JBrowse link 14 18,731,346 18,733,391 RGD:6480464
G F2 coagulation factor II JBrowse link 3 80,529,468 80,542,993 RGD:6480464
G Icam1 intercellular adhesion molecule 1 JBrowse link 8 22,035,287 22,047,049 RGD:6480464
G Ldlr low density lipoprotein receptor JBrowse link 8 22,750,425 22,773,305 RGD:6480464
G Timp1 TIMP metallopeptidase inhibitor 1 JBrowse link X 1,364,771 1,369,451 RGD:6480464
S-methyl-L-thiocitrulline term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G Edn1 endothelin 1 JBrowse link 17 22,136,814 22,143,745 RGD:6480464
G Nos1 nitric oxide synthase 1 JBrowse link 12 44,214,949 44,405,530 RGD:6480464
G Slc18a2 solute carrier family 18 member A2 JBrowse link 1 280,397,831 280,457,968 RGD:6480464

Term paths to the root
Path 1
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19662
    role 19606
      application 19232
        indicator 8524
          biomarker 6271
            L-arginine 15
              5-methyl-L-arginine + 0
              Ala-Arg 0
              Ala-Met-Ser-Arg 0
              Arg-Asn-Gln-Arg 0
              Arg-Asn-Gly-Ser 0
              Arg-Asp-Gln-Ser 0
              Arg-Lys-Cys-Gly 0
              Arg-Phe-Phe-Cys 0
              Arg-Pro 0
              Arg-Thr-Cys-Cys 0
              Arg-Thr-Thr-Asp 0
              Arg-Trp-Ser-Tyr 0
              Asp-Arg 0
              Asp-Gln-Arg 0
              Glu-Glu-Arg 0
              Glu-Trp-Asp-Arg 0
              Gly-Arg-Pro 0
              L-arginine derivative + 15
              L-arginine residue 0
              L-arginyl group 0
              L-arginyl-L-amino acid 0
              Leu-Arg 0
              N(2)-L-arginino group 0
              N(omega)-L-arginino group 0
              N-acyl-L-arginine + 0
              Phe-Arg 0
              Phe-Arg-Thr 0
              Pro-Arg-Pro 0
              poly(glycyl-L-arginine) 0
Path 2
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19662
    subatomic particle 19658
      composite particle 19658
        hadron 19658
          baryon 19658
            nucleon 19658
              atomic nucleus 19658
                atom 19658
                  main group element atom 19539
                    p-block element atom 19539
                      carbon group element atom 19422
                        carbon atom 19414
                          organic molecular entity 19414
                            organic group 18340
                              organic divalent group 18330
                                organodiyl group 18330
                                  carbonyl group 18217
                                    carbonyl compound 18217
                                      carboxylic acid 17921
                                        amino acid 12313
                                          alpha-amino acid 7429
                                            L-alpha-amino acid 7086
                                              glutamine family amino acid 5347
                                                L-arginine 15
                                                  5-methyl-L-arginine + 0
                                                  Ala-Arg 0
                                                  Ala-Met-Ser-Arg 0
                                                  Arg-Asn-Gln-Arg 0
                                                  Arg-Asn-Gly-Ser 0
                                                  Arg-Asp-Gln-Ser 0
                                                  Arg-Lys-Cys-Gly 0
                                                  Arg-Phe-Phe-Cys 0
                                                  Arg-Pro 0
                                                  Arg-Thr-Cys-Cys 0
                                                  Arg-Thr-Thr-Asp 0
                                                  Arg-Trp-Ser-Tyr 0
                                                  Asp-Arg 0
                                                  Asp-Gln-Arg 0
                                                  Glu-Glu-Arg 0
                                                  Glu-Trp-Asp-Arg 0
                                                  Gly-Arg-Pro 0
                                                  L-arginine derivative + 15
                                                  L-arginine residue 0
                                                  L-arginyl group 0
                                                  L-arginyl-L-amino acid 0
                                                  Leu-Arg 0
                                                  N(2)-L-arginino group 0
                                                  N(omega)-L-arginino group 0
                                                  N-acyl-L-arginine + 0
                                                  Phe-Arg 0
                                                  Phe-Arg-Thr 0
                                                  Pro-Arg-Pro 0
                                                  poly(glycyl-L-arginine) 0
paths to the root

NHLBI Logo

RGD is funded by grant HL64541 from the National Heart, Lung, and Blood Institute on behalf of the NIH.