Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  FTP Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   

ONTOLOGY REPORT - ANNOTATIONS


Term:L-tryptophan
go back to main search page
Accession:CHEBI:16828 term browser browse the term
Definition:The L-enantiomer of tryptophan.
Synonyms:related_synonym: (2S)-2-amino-3-(1H-indol-3-yl)propanoic acid;   (S)-alpha-Amino-beta-(3-indolyl)-propionic acid;   (S)-alpha-amino-1H-indole-3-propanoic acid;   (S)-tryptophan;   Formula=C11H12N2O2;   InChI=1S/C11H12N2O2/c12-9(11(14)15)5-7-6-13-10-4-2-1-3-8(7)10/h1-4,6,9,13H,5,12H2,(H,14,15)/t9-/m0/s1;   InChIKey=QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N;   L-beta-3-indolylalanine;   SMILES=N[C@@H](Cc1c[nH]c2ccccc12)C(O)=O;   Trp;   W;   tryptophan
 alt_id: CHEBI:13178;   CHEBI:184633;   CHEBI:21407;   CHEBI:45988;   CHEBI:46086;   CHEBI:46125;   CHEBI:46225;   CHEBI:6310
 xref: Beilstein:86197 "Beilstein";   CAS:73-22-3 "ChemIDplus";   CAS:73-22-3 "KEGG COMPOUND";   CAS:73-22-3 "NIST Chemistry WebBook";   DrugBank:DB00150;   Drug_Central:2780 "DrugCentral";   ECMDB:ECMDB00929;   Gmelin:51434 "Gmelin";   HMDB:HMDB0000929;   KEGG:C00078;   KEGG:D00020;   KNApSAcK:C00001396;   MetaCyc:TRP;   PDBeChem:TRP;   PMID:11395471 "Europe PMC";   PMID:11750787 "Europe PMC";   PMID:11888576 "Europe PMC";   PMID:12766158 "Europe PMC";   PMID:12830226 "Europe PMC";   PMID:12871129 "Europe PMC";   PMID:15206750 "Europe PMC";   PMID:16740930 "Europe PMC";   PMID:16934873 "Europe PMC";   PMID:17127472 "Europe PMC";   PMID:17177562 "Europe PMC";   PMID:17430113 "Europe PMC";   PMID:17585690 "Europe PMC";   PMID:17690425 "Europe PMC";   PMID:17826001 "Europe PMC";   PMID:18234569 "Europe PMC";   PMID:18419734 "Europe PMC";   PMID:18949702 "Europe PMC";   PMID:19896323 "Europe PMC";   PMID:21856896 "Europe PMC";   PMID:22071091 "Europe PMC";   PMID:22162421 "Europe PMC";   PMID:22299628 "Europe PMC";   PMID:22386992 "Europe PMC";   PMID:22402312 "Europe PMC";   PMID:22415302 "Europe PMC";   PMID:22415306 "Europe PMC";   PMID:2917974 "Europe PMC";   Reaxys:86197 "Reaxys";   Wikipedia:Tryptophan;   YMDB:YMDB00126
 cyclic_relationship: is_conjugate_acid_of CHEBI:32702;   is_conjugate_base_of CHEBI:32704;   is_enantiomer_of CHEBI:16296;   is_tautomer_of CHEBI:57912


show annotations for term's descendants       view all columns           Sort by:
 
ilomastat term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G Il13 interleukin 13 JBrowse link 10 38,982,909 38,985,466 RGD:6480464
G Mmp1 matrix metallopeptidase 1 JBrowse link 8 5,703,206 5,723,593 RGD:6480464
G Timp1 TIMP metallopeptidase inhibitor 1 JBrowse link X 1,364,771 1,369,451 RGD:6480464
violacein term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G Casp2 caspase 2 JBrowse link 4 71,652,358 71,670,228 RGD:6480464
G Casp3 caspase 3 JBrowse link 16 48,845,011 48,863,249 RGD:6480464
G Casp9 caspase 9 JBrowse link 5 160,356,211 160,373,774 RGD:6480464

Term paths to the root
Path 1
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19716
    role 19663
      application 19308
        pharmaceutical 19179
          drug 19179
            nutraceutical 9574
              L-tryptophan 6
                (2S)-3-(1H-indol-3-yl)-2-isocyanopropanoate 0
                1-L-tryptophano group 0
                5-methoxytryptophan 0
                Ala-Phe-Trp-Asn 0
                Ala-Trp-Asn-Asp 0
                Arg-Trp-Ser-Tyr 0
                Asn-Met-Trp-Asn 0
                Asn-Trp 0
                Asn-Trp-Asp-Ser 0
                Asn-Trp-Cys-His 0
                Asp-Trp-Trp-Val 0
                Gln-Phe-Trp-Tyr 0
                Gln-Trp 0
                Glu-Ala-Trp 0
                Glu-Glu-Gln-Trp 0
                Glu-Gly-Trp 0
                Glu-Lys-Trp-Ala 0
                Glu-Trp 0
                Ile-Leu-Trp-Trp 0
                L-tryptophan derivative + 3
                L-tryptophan residue + 0
                L-tryptophano group 0
                L-tryptophanyl radical + 0
                L-tryptophanyl radical cation + 0
                L-tryptophyl group 0
                Leu-Trp 0
                Lys-Ser-Trp 0
                Lys-Thr-Trp-Tyr 0
                Phe-Trp-Ala 0
                Phe-Trp-Trp 0
                Pro-Trp-Val-Gly 0
                Ser-Trp 0
                Ser-Trp-Lys 0
                Thr-Trp 0
                Thr-Trp-Asp 0
                Trp-Ala 0
                Trp-Ala-Asp 0
                Trp-Ala-Gly 0
                Trp-Asn 0
                Trp-Asp-Ser 0
                Trp-Ile 0
                Trp-Pro 0
                Trp-Ser 0
                Trp-Thr 0
                Trp-Trp 0
                Trp-Trp-Val 0
                proviolacein + 3
Path 2
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19716
    subatomic particle 19712
      composite particle 19712
        hadron 19712
          baryon 19712
            nucleon 19712
              atomic nucleus 19712
                atom 19712
                  main group element atom 19598
                    p-block element atom 19598
                      carbon group element atom 19486
                        carbon atom 19480
                          organic molecular entity 19480
                            organic group 18407
                              organic divalent group 18397
                                organodiyl group 18397
                                  carbonyl group 18285
                                    carbonyl compound 18285
                                      carboxylic acid 17940
                                        amino acid 12442
                                          alpha-amino acid 7648
                                            L-alpha-amino acid 7312
                                              erythrose 4-phosphate/phosphoenolpyruvate family amino acid 2105
                                                L-tryptophan 6
                                                  (2S)-3-(1H-indol-3-yl)-2-isocyanopropanoate 0
                                                  1-L-tryptophano group 0
                                                  5-methoxytryptophan 0
                                                  Ala-Phe-Trp-Asn 0
                                                  Ala-Trp-Asn-Asp 0
                                                  Arg-Trp-Ser-Tyr 0
                                                  Asn-Met-Trp-Asn 0
                                                  Asn-Trp 0
                                                  Asn-Trp-Asp-Ser 0
                                                  Asn-Trp-Cys-His 0
                                                  Asp-Trp-Trp-Val 0
                                                  Gln-Phe-Trp-Tyr 0
                                                  Gln-Trp 0
                                                  Glu-Ala-Trp 0
                                                  Glu-Glu-Gln-Trp 0
                                                  Glu-Gly-Trp 0
                                                  Glu-Lys-Trp-Ala 0
                                                  Glu-Trp 0
                                                  Ile-Leu-Trp-Trp 0
                                                  L-tryptophan derivative + 3
                                                  L-tryptophan residue + 0
                                                  L-tryptophano group 0
                                                  L-tryptophanyl radical + 0
                                                  L-tryptophanyl radical cation + 0
                                                  L-tryptophyl group 0
                                                  Leu-Trp 0
                                                  Lys-Ser-Trp 0
                                                  Lys-Thr-Trp-Tyr 0
                                                  Phe-Trp-Ala 0
                                                  Phe-Trp-Trp 0
                                                  Pro-Trp-Val-Gly 0
                                                  Ser-Trp 0
                                                  Ser-Trp-Lys 0
                                                  Thr-Trp 0
                                                  Thr-Trp-Asp 0
                                                  Trp-Ala 0
                                                  Trp-Ala-Asp 0
                                                  Trp-Ala-Gly 0
                                                  Trp-Asn 0
                                                  Trp-Asp-Ser 0
                                                  Trp-Ile 0
                                                  Trp-Pro 0
                                                  Trp-Ser 0
                                                  Trp-Thr 0
                                                  Trp-Trp 0
                                                  Trp-Trp-Val 0
                                                  proviolacein + 3
paths to the root

NHLBI Logo

RGD is funded by grant HL64541 from the National Heart, Lung, and Blood Institute on behalf of the NIH.