Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  FTP Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   

CHEBI ONTOLOGY - ANNOTATIONS

The Chemical Entities of Biological Interest (ChEBI) ontology is downloaded weekly from EMBL-EBI at http://www.ebi.ac.uk/chebi/. The data is made available under the Creative Commons License (CC BY 3.0, http://creativecommons.org/licenses/by/3.0/). For more information see: Degtyarenko et al. (2008) ChEBI: a database and ontology for chemical entities of biological interest. Nucleic Acids Res. 36, D344–D350.

Term:L-serine
go back to main search page
Accession:CHEBI:17115 term browser browse the term
Definition:The L-enantiomer of serine.
Synonyms:related_synonym: (2S)-2-amino-3-hydroxypropanoic acid;   (S)-2-amino-3-hydroxypropanoic acid;   (S)-alpha-Amino-beta-hydroxypropionic acid;   (S)-serine;   Formula=C3H7NO3;   InChI=1S/C3H7NO3/c4-2(1-5)3(6)7/h2,5H,1,4H2,(H,6,7)/t2-/m0/s1;   InChIKey=MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N;   L-2-Amino-3-hydroxypropionic acid;   L-3-Hydroxy-2-aminopropionic acid;   L-3-Hydroxy-alanine;   L-Ser;   L-Serin;   S;   SERINE;   SMILES=N[C@@H](CO)C(O)=O;   Ser;   beta-Hydroxy-L-alanine;   beta-Hydroxyalanine
 alt_id: CHEBI:13167;   CHEBI:21387;   CHEBI:45440;   CHEBI:45451;   CHEBI:45590;   CHEBI:45597;   CHEBI:45677;   CHEBI:6301
 xref: Beilstein:1721404;   CAS:56-45-1;   DrugBank:DB00133;   Drug_Central:4127;   ECMDB:ECMDB00187;   Gmelin:2570;   HMDB:HMDB0000187;   KEGG:C00065;   KEGG:D00016;   KNApSAcK:C00001393;   MetaCyc:SER;   PDBeChem:SER;   PMID:1650428;   PMID:17439666;   PMID:19062365;   PMID:21956576;   PMID:22265470;   PMID:22393170;   PMID:22547037;   PMID:22566084;   PMID:22566694;   Reaxys:1721404;   Wikipedia:L-serine;   YMDB:YMDB00112
 cyclic_relationship: is_conjugate_acid_of CHEBI:32836;   is_conjugate_base_of CHEBI:32837;   is_enantiomer_of CHEBI:16523;   is_tautomer_of CHEBI:33384


show annotations for term's descendants           Sort by:
 
Phe-Ser term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Slc15a1 solute carrier family 15 member 1 affects binding ISO phenylalanylserine analog binds to SLC15A1 protein CTD PMID:21147219 NCBI chr15:106,800,081...106,844,668
Ensembl chr15:106,800,081...106,844,426
JBrowse link

Term paths to the root
Path 1
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19787
    role 19734
      application 19393
        fuel 10797
          methanol 3062
            hydroxymethyl group 8
              serine 8
                L-serine 1
                  Ala-Ala-Ser 0
                  Ala-Asn-Gln-Ser 0
                  Ala-Asp-Ser 0
                  Ala-Gly-Ser 0
                  Ala-Leu-Leu-Ser 0
                  Ala-Leu-Val-Ser 0
                  Ala-Met-Ser-Arg 0
                  Ala-Phe-Thr-Ser 0
                  Ala-Ser 0
                  Ala-Val-Asp-Ser 0
                  Arg-Asn-Gly-Ser 0
                  Arg-Asp-Gln-Ser 0
                  Arg-Trp-Ser-Tyr 0
                  Asn-Asn-Pro-Ser 0
                  Asn-Leu-Leu-Ser 0
                  Asn-Ser 0
                  Asn-Trp-Asp-Ser 0
                  Asp-Gln-Ser 0
                  Asp-Leu-Leu-Ser 0
                  Asp-Leu-Thr-Ser 0
                  Asp-Pro-Ser-Ser 0
                  Asp-Ser 0
                  Cys-Ser 0
                  Glu-Ile-Ser 0
                  Glu-Ser 0
                  Gly-Ser 0
                  L-3-oxoalanine + 0
                  L-serine derivative + 0
                  L-serine residue + 0
                  L-serino group 0
                  L-seryl group 0
                  Leu-Ala-Ser 0
                  Leu-Asp-Ser 0
                  Leu-Gly-Ser 0
                  Leu-Leu-Ser 0
                  Leu-Ser 0
                  Leu-Ser-Ser-Tyr 0
                  Leu-Thr-Ser 0
                  Leu-Val-Ser 0
                  Lys-Leu-Ser 0
                  Lys-Ser-Trp 0
                  Met-Ser 0
                  N(2)-[3-(3-oxo-3,4-dihydroquinoxalin-2-yl)propanoyl]-L-serinamide 0
                  N-arachidonoyl-L-serine 0
                  O-ureido-L-serine 0
                  Phe-Ser 1
                  Pro-Ser 0
                  Ser-His 0
                  Ser-Leu-Ser 0
                  Ser-Lys 0
                  Ser-Phe 0
                  Ser-Ser 0
                  Ser-Thr 0
                  Ser-Trp 0
                  Ser-Trp-Lys 0
                  Ser-Tyr 0
                  Thr-Ala-Ser 0
                  Thr-Ser 0
                  Trp-Asp-Ser 0
                  Trp-Ser 0
                  Tyr-Ser 0
                  cryptomaldamide 0
                  lejimalide A 0
                  lejimalide B 0
Path 2
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19787
    subatomic particle 19784
      composite particle 19784
        hadron 19784
          baryon 19784
            nucleon 19784
              atomic nucleus 19784
                atom 19784
                  main group element atom 19672
                    p-block element atom 19672
                      carbon group element atom 19574
                        carbon atom 19563
                          organic molecular entity 19563
                            organic group 18495
                              organic divalent group 18488
                                organodiyl group 18488
                                  carbonyl group 18391
                                    carbonyl compound 18391
                                      carboxylic acid 18061
                                        amino acid 14072
                                          alpha-amino acid 11539
                                            L-alpha-amino acid 11374
                                              serine family amino acid 1851
                                                L-serine 1
                                                  Ala-Ala-Ser 0
                                                  Ala-Asn-Gln-Ser 0
                                                  Ala-Asp-Ser 0
                                                  Ala-Gly-Ser 0
                                                  Ala-Leu-Leu-Ser 0
                                                  Ala-Leu-Val-Ser 0
                                                  Ala-Met-Ser-Arg 0
                                                  Ala-Phe-Thr-Ser 0
                                                  Ala-Ser 0
                                                  Ala-Val-Asp-Ser 0
                                                  Arg-Asn-Gly-Ser 0
                                                  Arg-Asp-Gln-Ser 0
                                                  Arg-Trp-Ser-Tyr 0
                                                  Asn-Asn-Pro-Ser 0
                                                  Asn-Leu-Leu-Ser 0
                                                  Asn-Ser 0
                                                  Asn-Trp-Asp-Ser 0
                                                  Asp-Gln-Ser 0
                                                  Asp-Leu-Leu-Ser 0
                                                  Asp-Leu-Thr-Ser 0
                                                  Asp-Pro-Ser-Ser 0
                                                  Asp-Ser 0
                                                  Cys-Ser 0
                                                  Glu-Ile-Ser 0
                                                  Glu-Ser 0
                                                  Gly-Ser 0
                                                  L-3-oxoalanine + 0
                                                  L-serine derivative + 0
                                                  L-serine residue + 0
                                                  L-serino group 0
                                                  L-seryl group 0
                                                  Leu-Ala-Ser 0
                                                  Leu-Asp-Ser 0
                                                  Leu-Gly-Ser 0
                                                  Leu-Leu-Ser 0
                                                  Leu-Ser 0
                                                  Leu-Ser-Ser-Tyr 0
                                                  Leu-Thr-Ser 0
                                                  Leu-Val-Ser 0
                                                  Lys-Leu-Ser 0
                                                  Lys-Ser-Trp 0
                                                  Met-Ser 0
                                                  N(2)-[3-(3-oxo-3,4-dihydroquinoxalin-2-yl)propanoyl]-L-serinamide 0
                                                  N-arachidonoyl-L-serine 0
                                                  O-ureido-L-serine 0
                                                  Phe-Ser 1
                                                  Pro-Ser 0
                                                  Ser-His 0
                                                  Ser-Leu-Ser 0
                                                  Ser-Lys 0
                                                  Ser-Phe 0
                                                  Ser-Ser 0
                                                  Ser-Thr 0
                                                  Ser-Trp 0
                                                  Ser-Trp-Lys 0
                                                  Ser-Tyr 0
                                                  Thr-Ala-Ser 0
                                                  Thr-Ser 0
                                                  Trp-Asp-Ser 0
                                                  Trp-Ser 0
                                                  Tyr-Ser 0
                                                  cryptomaldamide 0
                                                  lejimalide A 0
                                                  lejimalide B 0
paths to the root

NHLBI Logo

RGD is funded by grant HL64541 from the National Heart, Lung, and Blood Institute on behalf of the NIH.