Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  FTP Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   

ONTOLOGY REPORT - ANNOTATIONS


Term:L-serine
go back to main search page
Accession:CHEBI:17115 term browser browse the term
Definition:The L-enantiomer of serine.
Synonyms:related_synonym: (2S)-2-amino-3-hydroxypropanoic acid;   (S)-2-amino-3-hydroxypropanoic acid;   (S)-alpha-Amino-beta-hydroxypropionic acid;   (S)-serine;   Formula=C3H7NO3;   InChI=1S/C3H7NO3/c4-2(1-5)3(6)7/h2,5H,1,4H2,(H,6,7)/t2-/m0/s1;   InChIKey=MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N;   L-2-Amino-3-hydroxypropionic acid;   L-3-Hydroxy-2-aminopropionic acid;   L-3-Hydroxy-alanine;   L-Ser;   L-Serin;   S;   SERINE;   SMILES=N[C@@H](CO)C(O)=O;   Ser;   beta-Hydroxy-L-alanine;   beta-Hydroxyalanine
 alt_id: CHEBI:13167;   CHEBI:21387;   CHEBI:45440;   CHEBI:45451;   CHEBI:45590;   CHEBI:45597;   CHEBI:45677;   CHEBI:6301
 xref: Beilstein:1721404 "Beilstein";   CAS:56-45-1 "ChemIDplus";   CAS:56-45-1 "KEGG COMPOUND";   CAS:56-45-1 "NIST Chemistry WebBook";   DrugBank:DB00133;   Drug_Central:4127 "DrugCentral";   ECMDB:ECMDB00187;   Gmelin:2570 "Gmelin";   HMDB:HMDB0000187;   KEGG:C00065;   KEGG:D00016;   KNApSAcK:C00001393;   MetaCyc:SER;   PDBeChem:SER;   PMID:1650428 "Europe PMC";   PMID:17439666 "Europe PMC";   PMID:19062365 "Europe PMC";   PMID:21956576 "Europe PMC";   PMID:22265470 "Europe PMC";   PMID:22393170 "Europe PMC";   PMID:22547037 "Europe PMC";   PMID:22566084 "Europe PMC";   PMID:22566694 "Europe PMC";   Reaxys:1721404 "Reaxys";   Wikipedia:L-serine;   YMDB:YMDB00112
 cyclic_relationship: is_conjugate_acid_of CHEBI:32836;   is_conjugate_base_of CHEBI:32837;   is_enantiomer_of CHEBI:16523;   is_tautomer_of CHEBI:33384


show annotations for term's descendants       view all columns           Sort by:
 
Phe-Ser term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G Slc15a1 solute carrier family 15 member 1 JBrowse link 15 106,800,081 106,844,668 RGD:6480464

Term paths to the root
Path 1
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19669
    role 19613
      application 19235
        fuel 10302
          methanol 2945
            hydroxymethyl group 8
              serine 8
                L-serine 1
                  Ala-Ala-Ser 0
                  Ala-Asn-Gln-Ser 0
                  Ala-Asp-Ser 0
                  Ala-Gly-Ser 0
                  Ala-Leu-Leu-Ser 0
                  Ala-Leu-Val-Ser 0
                  Ala-Met-Ser-Arg 0
                  Ala-Phe-Thr-Ser 0
                  Ala-Ser 0
                  Ala-Val-Asp-Ser 0
                  Arg-Asn-Gly-Ser 0
                  Arg-Asp-Gln-Ser 0
                  Arg-Trp-Ser-Tyr 0
                  Asn-Asn-Pro-Ser 0
                  Asn-Leu-Leu-Ser 0
                  Asn-Ser 0
                  Asn-Trp-Asp-Ser 0
                  Asp-Gln-Ser 0
                  Asp-Leu-Leu-Ser 0
                  Asp-Leu-Thr-Ser 0
                  Asp-Pro-Ser-Ser 0
                  Asp-Ser 0
                  Cys-Ser 0
                  Glu-Ile-Ser 0
                  Glu-Ser 0
                  Gly-Ser 0
                  L-3-oxoalanine + 0
                  L-serine derivative + 0
                  L-serine residue + 0
                  L-serino group 0
                  L-seryl group 0
                  Leu-Ala-Ser 0
                  Leu-Asp-Ser 0
                  Leu-Gly-Ser 0
                  Leu-Leu-Ser 0
                  Leu-Ser 0
                  Leu-Ser-Ser-Tyr 0
                  Leu-Thr-Ser 0
                  Leu-Val-Ser 0
                  Lys-Ser-Trp 0
                  Met-Ser 0
                  N-arachidonoyl-L-serine 0
                  O-ureido-L-serine 0
                  Phe-Ser 1
                  Pro-Ser 0
                  Ser-His 0
                  Ser-Leu-Ser 0
                  Ser-Lys 0
                  Ser-Phe 0
                  Ser-Ser 0
                  Ser-Thr 0
                  Ser-Trp 0
                  Ser-Trp-Lys 0
                  Ser-Tyr 0
                  Thr-Ala-Ser 0
                  Thr-Ser 0
                  Trp-Asp-Ser 0
                  Trp-Ser 0
                  Tyr-Ser 0
                  lejimalide A 0
                  lejimalide B 0
Path 2
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19669
    subatomic particle 19665
      composite particle 19665
        hadron 19665
          baryon 19665
            nucleon 19665
              atomic nucleus 19665
                atom 19665
                  main group element atom 19545
                    p-block element atom 19545
                      carbon group element atom 19428
                        carbon atom 19420
                          organic molecular entity 19420
                            organic group 18343
                              organic divalent group 18334
                                organodiyl group 18334
                                  carbonyl group 18222
                                    carbonyl compound 18222
                                      carboxylic acid 17923
                                        amino acid 12315
                                          alpha-amino acid 7422
                                            L-alpha-amino acid 7079
                                              serine family amino acid 1402
                                                L-serine 1
                                                  Ala-Ala-Ser 0
                                                  Ala-Asn-Gln-Ser 0
                                                  Ala-Asp-Ser 0
                                                  Ala-Gly-Ser 0
                                                  Ala-Leu-Leu-Ser 0
                                                  Ala-Leu-Val-Ser 0
                                                  Ala-Met-Ser-Arg 0
                                                  Ala-Phe-Thr-Ser 0
                                                  Ala-Ser 0
                                                  Ala-Val-Asp-Ser 0
                                                  Arg-Asn-Gly-Ser 0
                                                  Arg-Asp-Gln-Ser 0
                                                  Arg-Trp-Ser-Tyr 0
                                                  Asn-Asn-Pro-Ser 0
                                                  Asn-Leu-Leu-Ser 0
                                                  Asn-Ser 0
                                                  Asn-Trp-Asp-Ser 0
                                                  Asp-Gln-Ser 0
                                                  Asp-Leu-Leu-Ser 0
                                                  Asp-Leu-Thr-Ser 0
                                                  Asp-Pro-Ser-Ser 0
                                                  Asp-Ser 0
                                                  Cys-Ser 0
                                                  Glu-Ile-Ser 0
                                                  Glu-Ser 0
                                                  Gly-Ser 0
                                                  L-3-oxoalanine + 0
                                                  L-serine derivative + 0
                                                  L-serine residue + 0
                                                  L-serino group 0
                                                  L-seryl group 0
                                                  Leu-Ala-Ser 0
                                                  Leu-Asp-Ser 0
                                                  Leu-Gly-Ser 0
                                                  Leu-Leu-Ser 0
                                                  Leu-Ser 0
                                                  Leu-Ser-Ser-Tyr 0
                                                  Leu-Thr-Ser 0
                                                  Leu-Val-Ser 0
                                                  Lys-Ser-Trp 0
                                                  Met-Ser 0
                                                  N-arachidonoyl-L-serine 0
                                                  O-ureido-L-serine 0
                                                  Phe-Ser 1
                                                  Pro-Ser 0
                                                  Ser-His 0
                                                  Ser-Leu-Ser 0
                                                  Ser-Lys 0
                                                  Ser-Phe 0
                                                  Ser-Ser 0
                                                  Ser-Thr 0
                                                  Ser-Trp 0
                                                  Ser-Trp-Lys 0
                                                  Ser-Tyr 0
                                                  Thr-Ala-Ser 0
                                                  Thr-Ser 0
                                                  Trp-Asp-Ser 0
                                                  Trp-Ser 0
                                                  Tyr-Ser 0
                                                  lejimalide A 0
                                                  lejimalide B 0
paths to the root

NHLBI Logo

RGD is funded by grant HL64541 from the National Heart, Lung, and Blood Institute on behalf of the NIH.