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ONTOLOGY REPORT - ANNOTATIONS


Term:CDP
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Accession:CHEBI:17239 term browser browse the term
Definition:A pyrimidine ribonucleoside 5'-diphosphate having cytosine as the nucleobase.
Synonyms:related_synonym: 5'-CDP;   Cytidine 5'-diphosphate;   Cytidine 5'-diphosphoric acid;   Cytidine 5'-pyrophosphate;   Cytidine diphosphate;   Cytidine, 5'-(trihydrogen pyrophosphate);   Formula=C9H15N3O11P2;   InChI=1S/C9H15N3O11P2/c10-5-1-2-12(9(15)11-5)8-7(14)6(13)4(22-8)3-21-25(19,20)23-24(16,17)18/h1-2,4,6-8,13-14H,3H2,(H,19,20)(H2,10,11,15)(H2,16,17,18)/t4-,6-,7-,8-/m1/s1;   InChIKey=ZWIADYZPOWUWEW-XVFCMESISA-N;   SMILES=Nc1ccn([C@@H]2O[C@H](COP(O)(=O)OP(O)(O)=O)[C@@H](O)[C@H]2O)c(=O)n1;   cytidine 5'-(trihydrogen diphosphate)
 alt_id: CHEBI:13254;   CHEBI:23519;   CHEBI:3260;   CHEBI:41451
 xref: CAS:63-38-7 "ChemIDplus";   CAS:63-38-7 "KEGG COMPOUND";   DrugBank:DB04555;   KEGG:C00112;   PDBeChem:CDF;   PDBeChem:CDP
 cyclic_relationship: is_conjugate_acid_of CHEBI:58069


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CDP-choline term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G Casp3 caspase 3 JBrowse link 16 48,845,011 48,863,249 RGD:6480464
G Icam1 intercellular adhesion molecule 1 JBrowse link 8 22,035,287 22,047,049 RGD:6480464
G Nceh1 neutral cholesterol ester hydrolase 1 JBrowse link 2 112,868,834 112,932,622 RGD:6480464
G Parp1 poly (ADP-ribose) polymerase 1 JBrowse link 13 98,857,255 98,889,444 RGD:6480464
G Sirt1 sirtuin 1 JBrowse link 20 26,831,971 26,851,587 RGD:6480464

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Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19662
    role 19606
      biological role 19604
        biochemical role 19133
          metabolite 19101
            prokaryotic metabolite 18236
              bacterial metabolite 18236
                Escherichia coli metabolite 18132
                  CDP 5
                    2'-deoxy-5-hydroxymethyl-CDP 0
                    CDP-1L-myo-inositol 0
                    CDP-2,3-bis-O-(geranylgeranyl)-sn-glycerol 0
                    CDP-choline 5
                    CDP-glycerols + 0
                    CDP-sugar + 0
                    dCDP 0
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  CHEBI ontology 19662
    subatomic particle 19658
      composite particle 19658
        hadron 19658
          baryon 19658
            nucleon 19658
              atomic nucleus 19658
                atom 19658
                  main group element atom 19539
                    p-block element atom 19539
                      chalcogen 19228
                        oxygen atom 19182
                          oxygen molecular entity 19182
                            hydroxides 18964
                              oxoacid 18075
                                pnictogen oxoacid 8543
                                  phosphorus oxoacid 8436
                                    phosphoric acids 7318
                                      phosphoric acid 7318
                                        phosphoric acid derivative 6968
                                          phosphate 6968
                                            organic phosphate 6967
                                              carbohydrate phosphate 1498
                                                phospho sugar 1433
                                                  aldose phosphate 1431
                                                    aldopentose phosphate 1425
                                                      ribose phosphate 1419
                                                        ribonucleotide 1378
                                                          ribonucleoside 5'-phosphate 386
                                                            ribonucleoside 5'-diphosphate 104
                                                              pyrimidine ribonucleoside 5'-diphosphate 19
                                                                CDP 5
                                                                  2'-deoxy-5-hydroxymethyl-CDP 0
                                                                  CDP-1L-myo-inositol 0
                                                                  CDP-2,3-bis-O-(geranylgeranyl)-sn-glycerol 0
                                                                  CDP-choline 5
                                                                  CDP-glycerols + 0
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                                                                  dCDP 0
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