Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  FTP Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   

ONTOLOGY REPORT - ANNOTATIONS


Term:uracil
go back to main search page
Accession:CHEBI:17568 term browser browse the term
Definition:A common and naturally occurring pyrimidine nucleobase in which the pyrimidine ring is substituted with two oxo groups at positions 2 and 4. Found in RNA, it base pairs with adenine and replaces thymine during DNA transcription.
Synonyms:exact_synonym: pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione
 related_synonym: 2,4(1H,3H)-pyrimidinedione;   2,4-Pyrimidinedione;   2,4-dioxopyrimidine;   Formula=C4H4N2O2;   InChI=1S/C4H4N2O2/c7-3-1-2-5-4(8)6-3/h1-2H,(H2,5,6,7,8);   InChIKey=ISAKRJDGNUQOIC-UHFFFAOYSA-N;   SMILES=O=c1cc[nH]c(=O)[nH]1;   U;   Ura;   Urazil
 alt_id: CHEBI:15288;   CHEBI:27210;   CHEBI:46375;   CHEBI:9882
 xref: Beilstein:606623 "Beilstein";   CAS:66-22-8 "ChemIDplus";   CAS:66-22-8 "KEGG COMPOUND";   CAS:66-22-8 "NIST Chemistry WebBook";   DrugBank:DB03419;   Gmelin:2896 "Gmelin";   HMDB:HMDB0000300;   KEGG:C00106;   KEGG:D00027;   KNApSAcK:C00001513
 xref_mesh: MESH:D014498
 xref: MetaCyc:URACIL;   PDBeChem:URA;   PMID:11279060 "Europe PMC";   PMID:12855717 "Europe PMC";   PMID:15274295 "Europe PMC";   PMID:16834123 "Europe PMC";   PMID:17439666 "Europe PMC";   PMID:18533995 "Europe PMC";   PMID:18815805 "Europe PMC";   PMID:19175333 "Europe PMC";   PMID:22020693 "Europe PMC";   PMID:22074393 "Europe PMC";   PMID:22120518 "Europe PMC";   PMID:22171528 "Europe PMC";   PMID:22237209 "Europe PMC";   PMID:22299724 "Europe PMC";   PMID:22356544 "Europe PMC";   PMID:22447672 "Europe PMC";   PMID:22483865 "Europe PMC";   PMID:22567906 "Europe PMC";   PMID:22685418 "Europe PMC";   PMID:3654008 "Europe PMC";   Reaxys:606623 "Reaxys";   Wikipedia:Uracil
 cyclic_relationship: is_tautomer_of CHEBI:43254


show annotations for term's descendants       view all columns           Sort by:
 





Term paths to the root
Path 1
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19669
    role 19613
      application 19235
        pro-agent 8765
          prodrug 8562
            uracil 5622
              (5R)-6-hydroxy-5-[4-(2-hydroxyethyl)piperidin-1-yl]-5-phenyluracil 0
              (Z)-2-methylureidoacrylic acid 0
              (\{[(1R,2R)-2-(uracil-1-yl)cyclopentyl]oxy\}methyl)phosphonic acid 0
              1,3-dimethyluracil 0
              1,5-dimethyluracil 0
              1-(3-O-phosphono-beta-D-arabinofuranosyl)uracil 0
              1-(ethoxymethyl)-5-isopropyl-6-(phenylsulfanyl)uracil 0
              1-[3-(4-carboxypiperidin-1-yl)-3-deoxy-beta-D-arabinofuranosyl]pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione 0
              1-methyluracil 0
              2'-deoxyuridine + 0
              3,5-dimethyluracil 0
              3-(5-bromouracil-1-yl)-L-alanine 0
              3-(5-fluorouracil-1-yl)-L-alanine 1
              3-(5-iodouracil-1-yl)-L-alanine 0
              3-(uracil-1-yl)-L-alanine 0
              3-methyluracil 0
              4-[(1E,7E)-8-(2,6-dioxo-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl)-3,6-dioxa-2,7-diazaocta-1,7-dien-1-yl]benzoic acid 0
              5,6-dihydrouracil 0
              5,6-dihydroxyuracil 0
              5-(4,5-dihydroxypentyl)uracil 0
              5-[3-(benzyloxy)benzyl]-6-hydroxy-1-[(2-hydroxyethoxy)methyl]pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione 0
              5-acetamido-6-formamido-3-methyluracil 1
              5-benzyl-1-(2-hydroxyethoxymethyl)uracil 2
              5-benzyloxybenzylacyclouridine 0
              5-bromouracil 0
              5-carboxy-2'-deoxyuridine 0
              5-chloro-6-\{[(2Z)-2-iminopyrrolidin-1-yl]methyl\}uracil 0
              5-chlorouracil 2
              5-diazouracil 0
              5-fluorouracil 1350
              5-hydroxymethyluracil + 0
              5-hydroxyuracil 0
              5-iodouracil 0
              5-nitrouracil 0
              6-(3,5-dimethylbenzyl)-1-(ethoxymethyl)-5-isopropyluracil 0
              6-benzyl-1-(benzyloxymethyl)-5-isopropyluracil 0
              6-cyclohexylsulfanyl-1-ethoxymethyl-5-isopropyluracil 0
              6-methyluracil 0
              6-propyl-2-thiouracil 4768
              aminouracil + 0
              butafenacil 1
              dasabuvir 0
              emivirine 0
              orotate + 0
              orotic acid + 17
              saflufenacil 0
              thiouracil 1
              tipiracil 0
              uracil-1-yl group 0
              uracil-5-carboxylic acid 0
              uracil-6-ylacetic acid 0
              uridine + 15
              uridines + 43
Path 2
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19669
    subatomic particle 19665
      composite particle 19665
        hadron 19665
          baryon 19665
            nucleon 19665
              atomic nucleus 19665
                atom 19665
                  main group element atom 19545
                    p-block element atom 19545
                      carbon group element atom 19428
                        carbon atom 19420
                          organic molecular entity 19420
                            organic molecule 19343
                              organic cyclic compound 19093
                                organic heterocyclic compound 18157
                                  organic heteromonocyclic compound 16249
                                    diazines 12101
                                      pyrimidines 11917
                                        pyrimidine nucleobase 6060
                                          uracil 5622
                                            (5R)-6-hydroxy-5-[4-(2-hydroxyethyl)piperidin-1-yl]-5-phenyluracil 0
                                            (Z)-2-methylureidoacrylic acid 0
                                            (\{[(1R,2R)-2-(uracil-1-yl)cyclopentyl]oxy\}methyl)phosphonic acid 0
                                            1,3-dimethyluracil 0
                                            1,5-dimethyluracil 0
                                            1-(3-O-phosphono-beta-D-arabinofuranosyl)uracil 0
                                            1-(ethoxymethyl)-5-isopropyl-6-(phenylsulfanyl)uracil 0
                                            1-[3-(4-carboxypiperidin-1-yl)-3-deoxy-beta-D-arabinofuranosyl]pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione 0
                                            1-methyluracil 0
                                            2'-deoxyuridine + 0
                                            3,5-dimethyluracil 0
                                            3-(5-bromouracil-1-yl)-L-alanine 0
                                            3-(5-fluorouracil-1-yl)-L-alanine 1
                                            3-(5-iodouracil-1-yl)-L-alanine 0
                                            3-(uracil-1-yl)-L-alanine 0
                                            3-methyluracil 0
                                            4-[(1E,7E)-8-(2,6-dioxo-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl)-3,6-dioxa-2,7-diazaocta-1,7-dien-1-yl]benzoic acid 0
                                            5,6-dihydrouracil 0
                                            5,6-dihydroxyuracil 0
                                            5-(4,5-dihydroxypentyl)uracil 0
                                            5-[3-(benzyloxy)benzyl]-6-hydroxy-1-[(2-hydroxyethoxy)methyl]pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione 0
                                            5-acetamido-6-formamido-3-methyluracil 1
                                            5-benzyl-1-(2-hydroxyethoxymethyl)uracil 2
                                            5-benzyloxybenzylacyclouridine 0
                                            5-bromouracil 0
                                            5-carboxy-2'-deoxyuridine 0
                                            5-chloro-6-\{[(2Z)-2-iminopyrrolidin-1-yl]methyl\}uracil 0
                                            5-chlorouracil 2
                                            5-diazouracil 0
                                            5-fluorouracil 1350
                                            5-hydroxymethyluracil + 0
                                            5-hydroxyuracil 0
                                            5-iodouracil 0
                                            5-nitrouracil 0
                                            6-(3,5-dimethylbenzyl)-1-(ethoxymethyl)-5-isopropyluracil 0
                                            6-benzyl-1-(benzyloxymethyl)-5-isopropyluracil 0
                                            6-cyclohexylsulfanyl-1-ethoxymethyl-5-isopropyluracil 0
                                            6-methyluracil 0
                                            6-propyl-2-thiouracil 4768
                                            aminouracil + 0
                                            butafenacil 1
                                            dasabuvir 0
                                            emivirine 0
                                            orotate + 0
                                            orotic acid + 17
                                            saflufenacil 0
                                            thiouracil 1
                                            tipiracil 0
                                            uracil-1-yl group 0
                                            uracil-5-carboxylic acid 0
                                            uracil-6-ylacetic acid 0
                                            uridine + 15
                                            uridines + 43
paths to the root

NHLBI Logo

RGD is funded by grant HL64541 from the National Heart, Lung, and Blood Institute on behalf of the NIH.