Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  FTP Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   

CHEBI ONTOLOGY - ANNOTATIONS

The Chemical Entities of Biological Interest (ChEBI) ontology is downloaded weekly from EMBL-EBI at http://www.ebi.ac.uk/chebi/. The data is made available under the Creative Commons License (CC BY 3.0, http://creativecommons.org/licenses/by/3.0/). For more information see: Degtyarenko et al. (2008) ChEBI: a database and ontology for chemical entities of biological interest. Nucleic Acids Res. 36, D344–D350.

Term:uracil
go back to main search page
Accession:CHEBI:17568 term browser browse the term
Definition:A common and naturally occurring pyrimidine nucleobase in which the pyrimidine ring is substituted with two oxo groups at positions 2 and 4. Found in RNA, it base pairs with adenine and replaces thymine during DNA transcription.
Synonyms:exact_synonym: pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione
 related_synonym: 2,4(1H,3H)-pyrimidinedione;   2,4-Pyrimidinedione;   2,4-dioxopyrimidine;   Formula=C4H4N2O2;   InChI=1S/C4H4N2O2/c7-3-1-2-5-4(8)6-3/h1-2H,(H2,5,6,7,8);   InChIKey=ISAKRJDGNUQOIC-UHFFFAOYSA-N;   SMILES=O=c1cc[nH]c(=O)[nH]1;   U;   Ura;   Urazil
 alt_id: CHEBI:15288;   CHEBI:27210;   CHEBI:46375;   CHEBI:9882
 xref: Beilstein:606623;   CAS:66-22-8;   DrugBank:DB03419;   Gmelin:2896;   HMDB:HMDB0000300;   KEGG:C00106;   KEGG:D00027;   KNApSAcK:C00001513
 xref_mesh: MESH:D014498
 xref: MetaCyc:URACIL;   PDBeChem:URA;   PMID:11279060;   PMID:12855717;   PMID:15274295;   PMID:16834123;   PMID:17439666;   PMID:18533995;   PMID:18815805;   PMID:19175333;   PMID:22020693;   PMID:22074393;   PMID:22120518;   PMID:22171528;   PMID:22237209;   PMID:22299724;   PMID:22356544;   PMID:22447672;   PMID:22483865;   PMID:22567906;   PMID:22685418;   PMID:3654008;   Reaxys:606623;   Wikipedia:Uracil
 cyclic_relationship: is_tautomer_of CHEBI:43254


show annotations for term's descendants           Sort by:
 





Term paths to the root
Path 1
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19787
    role 19734
      application 19393
        pro-agent 8830
          prodrug 8610
            uracil 5638
              (5R)-6-hydroxy-5-[4-(2-hydroxyethyl)piperidin-1-yl]-5-phenyluracil 0
              (Z)-2-methylureidoacrylic acid 0
              (\{[(1R,2R)-2-(uracil-1-yl)cyclopentyl]oxy\}methyl)phosphonic acid 0
              1,3-dimethyluracil 0
              1,5-dimethyluracil 0
              1-(3-O-phosphono-beta-D-arabinofuranosyl)uracil 0
              1-(ethoxymethyl)-5-isopropyl-6-(phenylsulfanyl)uracil 0
              1-[3-(4-carboxypiperidin-1-yl)-3-deoxy-beta-D-arabinofuranosyl]pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione 0
              1-methyluracil 0
              2'-deoxyuridine + 0
              3,5-dimethyluracil 0
              3-(5-bromouracil-1-yl)-L-alanine 0
              3-(5-fluorouracil-1-yl)-L-alanine 1
              3-(5-iodouracil-1-yl)-L-alanine 0
              3-(uracil-1-yl)-L-alanine 0
              3-methyluracil 0
              4-[(1E,7E)-8-(2,6-dioxo-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl)-3,6-dioxa-2,7-diazaocta-1,7-dien-1-yl]benzoic acid 0
              5,6-dihydrouracil 0
              5,6-dihydroxyuracil 0
              5-(4,5-dihydroxypentyl)uracil 0
              5-[3-(benzyloxy)benzyl]-6-hydroxy-1-[(2-hydroxyethoxy)methyl]pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione 0
              5-acetamido-6-formamido-3-methyluracil 1
              5-benzyl-1-(2-hydroxyethoxymethyl)uracil 2
              5-benzyloxybenzylacyclouridine 0
              5-bromouracil 0
              5-carboxy-2'-deoxyuridine 0
              5-chloro-6-\{[(2Z)-2-iminopyrrolidin-1-yl]methyl\}uracil 0
              5-chlorouracil 2
              5-diazouracil 0
              5-fluorouracil 1363
              5-hydroxymethyluracil + 0
              5-hydroxyuracil 0
              5-iodouracil 0
              5-nitrouracil 0
              6-(3,5-dimethylbenzyl)-1-(ethoxymethyl)-5-isopropyluracil 0
              6-[(1,2-dideoxy-D-ribityl)amino]-5-[(E)-(2-oxopropylidene)amino]uracil 0
              6-[(1,3-dideoxy-D-ribityl)amino]-5-[(E)-(2-oxopropylidene)amino]uracil 0
              6-[(1,4-dideoxy-D-ribityl)amino]-5-[(E)-(2-oxopropylidene)amino]uracil 0
              6-[(1,5-dideoxy-D-ribityl)amino]-5-[(E)-(2-oxopropylidene)amino]uracil 0
              6-[(1-deoxy-D-ribityl)methyl]-5-[(1E)-3-oxobut-1-en-1-yl]uracil 0
              6-[(2-hydroxyethyl)amino]-5-[(E)-(2-oxopropylidene)amino]uracil 0
              6-[(3-hydroxypropyl)amino]-5-[(E)-(2-oxopropylidene)amino]uracil 0
              6-[(4-hydroxybutyl)amino]-5-[(E)-(2-oxopropylidene)amino]uracil 0
              6-[(5-hydroxypentyl)amino]-5-[(E)-(2-oxopropylidene)amino]uracil 0
              6-benzyl-1-(benzyloxymethyl)-5-isopropyluracil 0
              6-cyclohexylsulfanyl-1-ethoxymethyl-5-isopropyluracil 0
              6-methyl-5-[(1E)-3-oxobut-1-en-1-yl]uracil 0
              6-methyluracil 0
              6-propyl-2-thiouracil 4772
              aminouracil + 0
              butafenacil 1
              dasabuvir 0
              emivirine 0
              orotate + 0
              orotic acid + 17
              saflufenacil 0
              thiouracil 1
              tipiracil 0
              uracil-1-yl group 0
              uracil-5-carboxylic acid 0
              uracil-6-ylacetic acid 0
              uridine + 15
              uridines + 43
Path 2
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19787
    subatomic particle 19784
      composite particle 19784
        hadron 19784
          baryon 19784
            nucleon 19784
              atomic nucleus 19784
                atom 19784
                  main group element atom 19672
                    p-block element atom 19672
                      carbon group element atom 19574
                        carbon atom 19563
                          organic molecular entity 19563
                            organic molecule 19488
                              organic cyclic compound 19285
                                organic heterocyclic compound 18410
                                  organic heteromonocyclic compound 16445
                                    diazines 12139
                                      pyrimidines 11956
                                        pyrimidine nucleobase 6083
                                          uracil 5638
                                            (5R)-6-hydroxy-5-[4-(2-hydroxyethyl)piperidin-1-yl]-5-phenyluracil 0
                                            (Z)-2-methylureidoacrylic acid 0
                                            (\{[(1R,2R)-2-(uracil-1-yl)cyclopentyl]oxy\}methyl)phosphonic acid 0
                                            1,3-dimethyluracil 0
                                            1,5-dimethyluracil 0
                                            1-(3-O-phosphono-beta-D-arabinofuranosyl)uracil 0
                                            1-(ethoxymethyl)-5-isopropyl-6-(phenylsulfanyl)uracil 0
                                            1-[3-(4-carboxypiperidin-1-yl)-3-deoxy-beta-D-arabinofuranosyl]pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione 0
                                            1-methyluracil 0
                                            2'-deoxyuridine + 0
                                            3,5-dimethyluracil 0
                                            3-(5-bromouracil-1-yl)-L-alanine 0
                                            3-(5-fluorouracil-1-yl)-L-alanine 1
                                            3-(5-iodouracil-1-yl)-L-alanine 0
                                            3-(uracil-1-yl)-L-alanine 0
                                            3-methyluracil 0
                                            4-[(1E,7E)-8-(2,6-dioxo-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl)-3,6-dioxa-2,7-diazaocta-1,7-dien-1-yl]benzoic acid 0
                                            5,6-dihydrouracil 0
                                            5,6-dihydroxyuracil 0
                                            5-(4,5-dihydroxypentyl)uracil 0
                                            5-[3-(benzyloxy)benzyl]-6-hydroxy-1-[(2-hydroxyethoxy)methyl]pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione 0
                                            5-acetamido-6-formamido-3-methyluracil 1
                                            5-benzyl-1-(2-hydroxyethoxymethyl)uracil 2
                                            5-benzyloxybenzylacyclouridine 0
                                            5-bromouracil 0
                                            5-carboxy-2'-deoxyuridine 0
                                            5-chloro-6-\{[(2Z)-2-iminopyrrolidin-1-yl]methyl\}uracil 0
                                            5-chlorouracil 2
                                            5-diazouracil 0
                                            5-fluorouracil 1363
                                            5-hydroxymethyluracil + 0
                                            5-hydroxyuracil 0
                                            5-iodouracil 0
                                            5-nitrouracil 0
                                            6-(3,5-dimethylbenzyl)-1-(ethoxymethyl)-5-isopropyluracil 0
                                            6-[(1,2-dideoxy-D-ribityl)amino]-5-[(E)-(2-oxopropylidene)amino]uracil 0
                                            6-[(1,3-dideoxy-D-ribityl)amino]-5-[(E)-(2-oxopropylidene)amino]uracil 0
                                            6-[(1,4-dideoxy-D-ribityl)amino]-5-[(E)-(2-oxopropylidene)amino]uracil 0
                                            6-[(1,5-dideoxy-D-ribityl)amino]-5-[(E)-(2-oxopropylidene)amino]uracil 0
                                            6-[(1-deoxy-D-ribityl)methyl]-5-[(1E)-3-oxobut-1-en-1-yl]uracil 0
                                            6-[(2-hydroxyethyl)amino]-5-[(E)-(2-oxopropylidene)amino]uracil 0
                                            6-[(3-hydroxypropyl)amino]-5-[(E)-(2-oxopropylidene)amino]uracil 0
                                            6-[(4-hydroxybutyl)amino]-5-[(E)-(2-oxopropylidene)amino]uracil 0
                                            6-[(5-hydroxypentyl)amino]-5-[(E)-(2-oxopropylidene)amino]uracil 0
                                            6-benzyl-1-(benzyloxymethyl)-5-isopropyluracil 0
                                            6-cyclohexylsulfanyl-1-ethoxymethyl-5-isopropyluracil 0
                                            6-methyl-5-[(1E)-3-oxobut-1-en-1-yl]uracil 0
                                            6-methyluracil 0
                                            6-propyl-2-thiouracil 4772
                                            aminouracil + 0
                                            butafenacil 1
                                            dasabuvir 0
                                            emivirine 0
                                            orotate + 0
                                            orotic acid + 17
                                            saflufenacil 0
                                            thiouracil 1
                                            tipiracil 0
                                            uracil-1-yl group 0
                                            uracil-5-carboxylic acid 0
                                            uracil-6-ylacetic acid 0
                                            uridine + 15
                                            uridines + 43
paths to the root

NHLBI Logo

RGD is funded by grant HL64541 from the National Heart, Lung, and Blood Institute on behalf of the NIH.