Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  FTP Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   

ONTOLOGY REPORT - ANNOTATIONS


Term:UDP-D-galactose
go back to main search page
Accession:CHEBI:18307 term browser browse the term
Definition:A UDP-sugar having D-galactose as the sugar component.
Synonyms:exact_synonym: uridine 5'-[3-(D-galactopyranosyl) dihydrogen diphosphate]
 related_synonym: Formula=C15H24N2O17P2;   InChI=1S/C15H24N2O17P2/c18-3-5-8(20)10(22)12(24)14(32-5)33-36(28,29)34-35(26,27)30-4-6-9(21)11(23)13(31-6)17-2-1-7(19)16-15(17)25/h1-2,5-6,8-14,18,20-24H,3-4H2,(H,26,27)(H,28,29)(H,16,19,25)/t5-,6-,8+,9-,10+,11-,12-,13-,14?/m1/s1;   InChIKey=HSCJRCZFDFQWRP-LNYDKVEPSA-N;   SMILES=OC[C@H]1OC(OP(O)(=O)OP(O)(=O)OC[C@H]2O[C@H]([C@H](O)[C@@H]2O)n2ccc(=O)[nH]c2=O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O;   UDP-D-galactopyranose;   UDPgalactose;   Udp galactose;   Udpgal;   Uridine 5'-(trihydrogen diphosphate), P'-alpha-D-galactopyranosyl ester;   Uridine diphosphate galactose;   Uridine diphosphogalactose;   Uridine pyrophosphogalactose;   Uridinediphosphogalactose
 alt_id: CHEBI:13487;   CHEBI:13495;   CHEBI:22100;   CHEBI:42751;   CHEBI:9811
 xref: Beilstein:773447 "Beilstein";   CAS:2956-16-3 "ChemIDplus";   DrugBank:DB03501;   HMDB:HMDB0000302;   KEGG:C00052
 xref_mesh: MESH:D014531
 xref: PDBeChem:GDU;   PMID:19699703 "Europe PMC";   PMID:24041039 "Europe PMC";   Reaxys:773447 "Reaxys"
 cyclic_relationship: is_conjugate_acid_of CHEBI:58439


show annotations for term's descendants       view all columns           Sort by:
 
UDP-D-galactose term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G Gale UDP-galactose-4-epimerase JBrowse link 5 154,310,453 154,314,959 RGD:6480464
G Gpr17 G protein-coupled receptor 17 JBrowse link 18 24,733,306 24,739,194 RGD:6480464
G Uxs1 UDP-glucuronate decarboxylase 1 JBrowse link 9 11,165,006 11,240,329 RGD:6480464
UDP-alpha-D-galactose term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G Gale UDP-galactose-4-epimerase JBrowse link 5 154,310,453 154,314,959 RGD:6480464
G Gpr17 G protein-coupled receptor 17 JBrowse link 18 24,733,306 24,739,194 RGD:6480464
G Uxs1 UDP-glucuronate decarboxylase 1 JBrowse link 9 11,165,006 11,240,329 RGD:6480464

Term paths to the root
Path 1
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19734
    role 19680
      biological role 19678
        biochemical role 19177
          metabolite 19147
            eukaryotic metabolite 18768
              animal metabolite 18509
                mammalian metabolite 18492
                  human metabolite 18131
                    UDP-D-galactose 3
                      UDP-alpha-D-galactose 3
Path 2
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19734
    subatomic particle 19730
      composite particle 19730
        hadron 19730
          baryon 19730
            nucleon 19730
              atomic nucleus 19730
                atom 19730
                  main group element atom 19614
                    p-block element atom 19614
                      chalcogen 19323
                        oxygen atom 19284
                          oxygen molecular entity 19284
                            hydroxides 19042
                              oxoacid 18106
                                pnictogen oxoacid 9849
                                  phosphorus oxoacid 8671
                                    phosphoric acids 7340
                                      phosphoric acid 7340
                                        phosphoric acid derivative 6991
                                          phosphate 6991
                                            organic phosphate 6990
                                              carbohydrate phosphate 1514
                                                phospho sugar 1445
                                                  aldose phosphate 1443
                                                    aldopentose phosphate 1437
                                                      ribose phosphate 1431
                                                        ribonucleotide 1390
                                                          ribonucleoside 5'-phosphate 392
                                                            ribonucleoside 5'-diphosphate 107
                                                              pyrimidine ribonucleoside 5'-diphosphate 19
                                                                UDP 14
                                                                  UDP-sugar 8
                                                                    UDP-D-galactose 3
                                                                      UDP-alpha-D-galactose 3
paths to the root

NHLBI Logo

RGD is funded by grant HL64541 from the National Heart, Lung, and Blood Institute on behalf of the NIH.