Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  FTP Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   

ONTOLOGY REPORT - ANNOTATIONS


Term:alkane
go back to main search page
Accession:CHEBI:18310 term browser browse the term
Definition:An acyclic branched or unbranched hydrocarbon having the general formula CnH2n+2, and therefore consisting entirely of hydrogen atoms and saturated carbon atoms.
Synonyms:exact_synonym: alkanes
 related_synonym: Alkan;   Formula=CH3R;   RH;   SMILES=C[*];   alcane;   alcanes;   alcano;   alcanos;   an alkane
 alt_id: CHEBI:13435;   CHEBI:22317;   CHEBI:2576
 xref: KEGG:C01371


show annotations for term's descendants       view all columns           Sort by:
 
ethylenediaminetetraacetic acid term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G ANPEP alanyl aminopeptidase, membrane JBrowse link 7 55,351,081 55,373,856 RGD:6480464
G LTA4H leukotriene A4 hydrolase JBrowse link 5 87,486,552 87,518,520 RGD:6480464
flutamide term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G GJA1 gap junction protein alpha 1 JBrowse link 1 40,988,818 41,002,129 RGD:6480464
fumonisin B1 term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G BCL2 BCL2 apoptosis regulator JBrowse link 1 158,337,403 158,518,214 RGD:6480464
G CASP3 caspase 3 JBrowse link 15 45,744,320 45,753,252 RGD:6480464
G CCL2 chemokine (C-C motif) ligand 2 JBrowse link 12 40,798,109 40,800,013 RGD:6480464
G CCL20 C-C motif chemokine ligand 20 JBrowse link 15 129,172,743 129,176,069 RGD:6480464
G CXCL8 C-X-C motif chemokine ligand 8 JBrowse link 8 69,932,646 69,935,861 RGD:6480464
G CYCS cytochrome c, somatic JBrowse link 18 47,169,921 47,172,212 RGD:6480464
G GSR glutathione-disulfide reductase JBrowse link 15 54,382,564 54,433,989 RGD:6480464
G IFNG interferon gamma JBrowse link 5 32,477,906 32,482,670 RGD:6480464
G IL17A interleukin 17A JBrowse link 7 46,013,584 46,017,161 RGD:6480464
G IL1A interleukin 1 alpha JBrowse link 3 43,718,320 43,731,668 RGD:6480464
G IL6 interleukin 6 JBrowse link 9 91,506,421 91,510,830 RGD:6480464
G LOC110258578 interleukin-1 beta-like RGD:6480464
G TNF tumor necrosis factor JBrowse link 7 23,699,635 23,702,393 RGD:6480464
G TP53 tumor protein p53 JBrowse link 12 52,939,643 52,953,786 RGD:6480464
iodomethane term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G PGK1 phosphoglycerate kinase 1 JBrowse link X 62,187,472 62,210,321 RGD:6480464
methoprene term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G GPD1 glycerol-3-phosphate dehydrogenase 1 JBrowse link 5 16,008,179 16,021,676 RGD:6480464
N,N,N',N'-tetrakis(2-pyridylmethyl)ethylenediamine term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G ANXA5 annexin A5 JBrowse link 8 102,387,833 102,420,868 RGD:6480464
G CASP3 caspase 3 JBrowse link 15 45,744,320 45,753,252 RGD:6480464
G IL6 interleukin 6 JBrowse link 9 91,506,421 91,510,830 RGD:6480464
G PPARA peroxisome proliferator activated receptor alpha JBrowse link 5 3,302,755 3,321,091 RGD:6480464
G PPARG peroxisome proliferator activated receptor gamma JBrowse link 13 68,301,566 68,433,951 RGD:6480464
G PTGS2 prostaglandin-endoperoxide synthase 2 JBrowse link 9 127,850,164 127,858,866 RGD:6480464
G SELE selectin E JBrowse link 4 81,289,061 81,299,657 RGD:6480464
G TNF tumor necrosis factor JBrowse link 7 23,699,635 23,702,393 RGD:6480464
G VCAM1 vascular cell adhesion molecule 1 JBrowse link 4 117,496,914 117,511,211 RGD:6480464
norflurazon term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G CYP2C49 cytochrome P450 2C49 JBrowse link 14 106,571,803 106,612,082 RGD:6480464
orlistat term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G PNLIP pancreatic lipase JBrowse link 14 126,771,920 126,789,097 RGD:6480464
ritonavir term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G NOS3 nitric oxide synthase 3 JBrowse link 18 6,209,218 6,228,912 RGD:6480464

Term paths to the root
Path 1
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 828
    chemical entity 828
      atom 812
        nonmetal atom 786
          carbon atom 765
            organic molecular entity 765
              aliphatic compound 32
                alkane 28
                  2,2,4,4,6,8,8-heptamethylnonane 0
                  2,2,4,6,6-pentamethylheptane 0
                  2,3,3-trimethylpentane 0
                  2,3,5,8-tetramethyldecane 0
                  2,3,5-trimethylhexane 0
                  2,3-dimethylbutane 0
                  2,4-dimethylheptane 0
                  2,4-dimethylhexane 0
                  2,5-dimethylundecane 0
                  2,6,11-trimethyldodecane 0
                  2,6,7-trimethyldecane 0
                  2,6,8-Trimethyldecane 0
                  2,6-dimethylheptadecane 0
                  2,7,10-trimethyldodecane 0
                  2-Methylheptane 0
                  2-Methylpentane 0
                  2-methylicosane 0
                  3,3,5-Trimethylheptane 0
                  3,3-dimethylhexane 0
                  3,3-dimethyloctane 0
                  3,5-dimethyloctane 0
                  3,7-dimethylundecane 0
                  3,8-dimethylundecane 0
                  3-Methylheptane 0
                  3-Methyloctadecane 0
                  3-Methylpentane 0
                  3-ethyl-2,7-dimethyloctane 0
                  3-methylhexane 0
                  4,6-dimethyldodecane 0
                  4,6-dimethylundecane 0
                  4,7-dimethylundecane 0
                  4-Methylpentadecane 0
                  4-methylheptane + 0
                  4-methyltridecane 0
                  4-methylundecane 0
                  alkyl group + 2
                  butane + 0
                  decane + 0
                  dodecane + 0
                  ethane + 11
                  farnesane + 1
                  heptane + 0
                  hexane + 0
                  isobutane + 1
                  isooctane 0
                  isopentane + 0
                  long-chain alkane + 14
                  methane + 3
                  neopentane + 0
                  nonane + 0
                  octane + 0
                  pentane + 0
                  propane + 1
                  undecane + 0
                  xi-4-Methyldecane 0
Path 2
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 828
    subatomic particle 812
      composite particle 812
        hadron 812
          baryon 812
            nucleon 812
              atomic nucleus 812
                atom 812
                  main group element atom 800
                    main group molecular entity 798
                      s-block molecular entity 679
                        hydrogen molecular entity 673
                          hydrides 310
                            organic hydride 222
                              organic fundamental parent 222
                                hydrocarbon 157
                                  alkane 28
                                    2,2,4,4,6,8,8-heptamethylnonane 0
                                    2,2,4,6,6-pentamethylheptane 0
                                    2,3,3-trimethylpentane 0
                                    2,3,5,8-tetramethyldecane 0
                                    2,3,5-trimethylhexane 0
                                    2,3-dimethylbutane 0
                                    2,4-dimethylheptane 0
                                    2,4-dimethylhexane 0
                                    2,5-dimethylundecane 0
                                    2,6,11-trimethyldodecane 0
                                    2,6,7-trimethyldecane 0
                                    2,6,8-Trimethyldecane 0
                                    2,6-dimethylheptadecane 0
                                    2,7,10-trimethyldodecane 0
                                    2-Methylheptane 0
                                    2-Methylpentane 0
                                    2-methylicosane 0
                                    3,3,5-Trimethylheptane 0
                                    3,3-dimethylhexane 0
                                    3,3-dimethyloctane 0
                                    3,5-dimethyloctane 0
                                    3,7-dimethylundecane 0
                                    3,8-dimethylundecane 0
                                    3-Methylheptane 0
                                    3-Methyloctadecane 0
                                    3-Methylpentane 0
                                    3-ethyl-2,7-dimethyloctane 0
                                    3-methylhexane 0
                                    4,6-dimethyldodecane 0
                                    4,6-dimethylundecane 0
                                    4,7-dimethylundecane 0
                                    4-Methylpentadecane 0
                                    4-methylheptane + 0
                                    4-methyltridecane 0
                                    4-methylundecane 0
                                    alkyl group + 2
                                    butane + 0
                                    decane + 0
                                    dodecane + 0
                                    ethane + 11
                                    farnesane + 1
                                    heptane + 0
                                    hexane + 0
                                    isobutane + 1
                                    isooctane 0
                                    isopentane + 0
                                    long-chain alkane + 14
                                    methane + 3
                                    neopentane + 0
                                    nonane + 0
                                    octane + 0
                                    pentane + 0
                                    propane + 1
                                    undecane + 0
                                    xi-4-Methyldecane 0
paths to the root

NHLBI Logo

RGD is funded by grant HL64541 from the National Heart, Lung, and Blood Institute on behalf of the NIH.