Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  FTP Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   

ONTOLOGY REPORT - ANNOTATIONS


Term:prostaglandin F1alpha
go back to main search page
Accession:CHEBI:28852 term browser browse the term
Definition:A prostaglandins Falpha that has formula C20H36O5.
Synonyms:exact_synonym: (13E,15S)-9alpha,11alpha,15-trihydroxyprost-13-en-1-oic acid
 related_synonym: (13E,15S)-9alpha,11alpha-9,11,15-Trihydroxyprost-13-en-1-oic acid;   Formula=C20H36O5;   InChI=1S/C20H36O5/c1-2-3-6-9-15(21)12-13-17-16(18(22)14-19(17)23)10-7-4-5-8-11-20(24)25/h12-13,15-19,21-23H,2-11,14H2,1H3,(H,24,25)/b13-12+/t15-,16+,17+,18-,19+/m0/s1;   InChIKey=DZUXGQBLFALXCR-CDIPTNKSSA-N;   PGF 1-alpha;   Prostaglandin F1;   Prostaglandin f1-alpha;   SMILES=CCCCC[C@H](O)\\C=C\\[C@H]1[C@H](O)C[C@H](O)[C@@H]1CCCCCCC(O)=O
 alt_id: CHEBI:26325;   CHEBI:8515
 xref: CAS:745-62-0 "ChemIDplus";   CAS:745-62-0 "KEGG COMPOUND";   KEGG:C06475;   LIPID_MAPS_instance:LMFA03010137 "LIPID MAPS"
 xref_mesh: MESH:C100006


show annotations for term's descendants       view all columns           Sort by:
 
prostaglandin F1alpha term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G Ptgr1 prostaglandin reductase 1 JBrowse link 5 76,110,746 76,129,361 RGD:6480464
G Ptgs2 prostaglandin-endoperoxide synthase 2 JBrowse link 13 67,351,230 67,356,920 RGD:6480464
6-oxoprostaglandin F1alpha term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G Agt angiotensinogen JBrowse link 19 57,321,594 57,333,460 RGD:6480464
G Alox15 arachidonate 15-lipoxygenase JBrowse link 10 56,953,692 56,962,145 RGD:6480464
G Apoe apolipoprotein E JBrowse link 1 80,612,894 80,616,820 RGD:6480464
G Avp arginine vasopressin JBrowse link 3 123,117,482 123,119,460 RGD:6480464
G Bdkrb2 bradykinin receptor B2 JBrowse link 6 129,399,468 129,429,676 RGD:6480464
G Calca calcitonin-related polypeptide alpha JBrowse link 1 184,184,018 184,188,922 RGD:6480464
G Klkb1 kallikrein B1 JBrowse link 16 50,151,127 50,175,407 RGD:6480464
G Kng2 kininogen 2 JBrowse link 11 81,509,185 81,516,759 RGD:6480464
G Nos2 nitric oxide synthase 2 JBrowse link 10 66,188,290 66,221,621 RGD:6480464
G Ptgis prostaglandin I2 synthase JBrowse link 3 163,950,746 163,986,129 RGD:6480464
G Ptgs2 prostaglandin-endoperoxide synthase 2 JBrowse link 13 67,351,230 67,356,920 RGD:6480464
G Tnf tumor necrosis factor JBrowse link 20 5,189,382 5,192,000 RGD:6480464

Term paths to the root
Path 1
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19728
    role 19675
      biological role 19673
        biochemical role 19178
          metabolite 19150
            eukaryotic metabolite 18769
              animal metabolite 18507
                mammalian metabolite 18489
                  human metabolite 18127
                    prostaglandin F1alpha 13
                      13,14-dihydro-15-keto-PGF1alpha 0
                      15-ketoprostaglandin F1alpha 0
                      2,3-dinor-6-oxoprostaglandin F1alpha + 0
                      2,3-dinor-8-epi-prostaglandin F1alpha 0
                      6,15-diketo,13,14-dihydroprostaglandin F1alpha 0
                      6-oxoprostaglandin F1alpha 12
                      prostaglandin F1alpha alcohol 0
Path 2
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19728
    subatomic particle 19724
      composite particle 19724
        hadron 19724
          baryon 19724
            nucleon 19724
              atomic nucleus 19724
                atom 19724
                  main group element atom 19610
                    p-block element atom 19610
                      carbon group element atom 19501
                        carbon atom 19494
                          organic molecular entity 19494
                            organic group 18413
                              organic divalent group 18404
                                organodiyl group 18404
                                  carbonyl group 18293
                                    carbonyl compound 18293
                                      carboxylic acid 17960
                                        monocarboxylic acid 17264
                                          fatty acid 15816
                                            fatty acid derivative 1018
                                              icosanoid 451
                                                prostanoid 394
                                                  prostaglandin 389
                                                    prostaglandins F 97
                                                      prostaglandins Falpha 96
                                                        prostaglandin F1alpha 13
                                                          13,14-dihydro-15-keto-PGF1alpha 0
                                                          15-ketoprostaglandin F1alpha 0
                                                          2,3-dinor-6-oxoprostaglandin F1alpha + 0
                                                          2,3-dinor-8-epi-prostaglandin F1alpha 0
                                                          6,15-diketo,13,14-dihydroprostaglandin F1alpha 0
                                                          6-oxoprostaglandin F1alpha 12
                                                          prostaglandin F1alpha alcohol 0
paths to the root

NHLBI Logo

RGD is funded by grant HL64541 from the National Heart, Lung, and Blood Institute on behalf of the NIH.