Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  FTP Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   

ONTOLOGY REPORT - ANNOTATIONS


Term:valerate
go back to main search page
Accession:CHEBI:31011 term browser browse the term
Definition:A short-chain fatty acid anion that is the conjugate base of valeric acid; present in ester form as component of many steroid-based pharmaceuticals.
Synonyms:related_synonym: CH3-[CH2]3-COO(-);   Formula=C5H9O2;   InChI=1S/C5H10O2/c1-2-3-4-5(6)7/h2-4H2,1H3,(H,6,7)/p-1;   InChIKey=NQPDZGIKBAWPEJ-UHFFFAOYSA-M;   SMILES=CCCCC([O-])=O;   n-propylacetate;   pentanoate;   pentanoic acid, ion(1-)
 alt_id: CHEBI:14751;   CHEBI:25890
 xref: Beilstein:3903735 "Beilstein";   CAS:10023-74-2 "ChemIDplus";   Gmelin:325619 "Gmelin";   PMID:17314444 "Europe PMC";   PMID:18783570 "Europe PMC";   Reaxys:3903735 "Reaxys"
 cyclic_relationship: is_conjugate_base_of CHEBI:17418


show annotations for term's descendants       view all columns           Sort by:
 
sodium valproate term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G Hdac8 histone deacetylase 8 JBrowse link X 72,163,777 72,370,058 RGD:9681716

Term paths to the root
Path 1
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19754
    role 19701
      biological role 19700
        biochemical role 19201
          metabolite 19174
            eukaryotic metabolite 18802
              plant metabolite 17282
                valerate 1
                  (2R,3R)-2,3-dihydroxy-3-methylpentanoate 0
                  (2R,3S)-2-hydroxy-3-methylpentanoate 0
                  (2S)-2-[(R)-1-carboxyethylamino]pentanoate 0
                  (R)-2-hydroxy-4-methylpentanoate 0
                  (S)-3-methyl-2-oxovalerate 0
                  (S)-4-amino-5-oxopentanoate 0
                  2,4-diaminopentanoate + 0
                  2-amino-4-oxopentanoic acid zwitterion + 0
                  2-oxopentanoate 0
                  3-hydroxy-3-methyl-2-oxopentanoate + 0
                  3-methyl-2-oxovalerate + 0
                  4-methyl-2-oxopentanoate 0
                  5-amino-2-oxopentanoate 0
                  5-guanidino-2-oxopentanoate 0
                  5-hydroxypentanoate + 0
                  5-oxopentanoate + 0
                  acetylpyruvate 0
                  mevalonate + 0
                  ornithinate + 0
                  oxopentanoates + 0
                  valproate + 1
Path 2
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19754
    subatomic particle 19752
      composite particle 19752
        hadron 19752
          baryon 19752
            nucleon 19752
              atomic nucleus 19752
                atom 19752
                  main group element atom 19637
                    p-block element atom 19637
                      carbon group element atom 19528
                        carbon atom 19517
                          organic molecular entity 19517
                            organic ion 8112
                              organic anion 2589
                                carboxylic acid anion 2206
                                  monocarboxylic acid anion 1483
                                    fatty acid anion 95
                                      saturated fatty acid anion 95
                                        straight-chain saturated fatty acid anion 8
                                          valerate 1
                                            (2R,3R)-2,3-dihydroxy-3-methylpentanoate 0
                                            (2R,3S)-2-hydroxy-3-methylpentanoate 0
                                            (2S)-2-[(R)-1-carboxyethylamino]pentanoate 0
                                            (R)-2-hydroxy-4-methylpentanoate 0
                                            (S)-3-methyl-2-oxovalerate 0
                                            (S)-4-amino-5-oxopentanoate 0
                                            2,4-diaminopentanoate + 0
                                            2-amino-4-oxopentanoic acid zwitterion + 0
                                            2-oxopentanoate 0
                                            3-hydroxy-3-methyl-2-oxopentanoate + 0
                                            3-methyl-2-oxovalerate + 0
                                            4-methyl-2-oxopentanoate 0
                                            5-amino-2-oxopentanoate 0
                                            5-guanidino-2-oxopentanoate 0
                                            5-hydroxypentanoate + 0
                                            5-oxopentanoate + 0
                                            acetylpyruvate 0
                                            mevalonate + 0
                                            ornithinate + 0
                                            oxopentanoates + 0
                                            valproate + 1
paths to the root

NHLBI Logo

RGD is funded by grant HL64541 from the National Heart, Lung, and Blood Institute on behalf of the NIH.