Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  FTP Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   


Term:cyclic ADP-ribose
go back to main search page
Accession:CHEBI:31445 term browser browse the term
Definition:A cyclic purine nucleotide that is synthesised from NAD+ by ADP-ribosyl cyclase; acts as an agonist at ryanodine receptors.
Synonyms:related_synonym: E-NAD;   Enzyme-activated NAD;   Formula=C15H21N5O13P2;   InChI=1S/C15H21N5O13P2/c16-12-7-13-18-4-19(12)14-10(23)8(21)5(31-14)1-29-34(25,26)33-35(27,28)30-2-6-9(22)11(24)15(32-6)20(13)3-17-7/h3-6,8-11,14-16,21-24H,1-2H2,(H,25,26)(H,27,28)/t5-,6-,8-,9-,10-,11-,14-,15-/m1/s1;   InChIKey=BQOHYSXSASDCEA-KEOHHSTQSA-N;   SMILES=O[C@@H]1[C@H]2COP(O)(=O)OP(O)(=O)OC[C@H]3O[C@H]([C@H](O)[C@@H]3O)n3cnc4n(cnc4c3=N)[C@H](O2)[C@@H]1O;   cADPR;   cyclic ADP-D-ribose;   cyclic adenosine diphosphate ribose
 xref: CAS:119340-53-3 "ChemIDplus";   CAS:119340-53-3 "KEGG COMPOUND";   KEGG:C13050
 xref_mesh: MESH:D036563
 xref: MetaCyc:CPD-14880;   PMID:21176119 "Europe PMC";   PMID:22274607 "Europe PMC";   PMID:22422046 "Europe PMC";   PMID:22547068 "Europe PMC";   PMID:22677461 "Europe PMC";   PMID:22822066 "Europe PMC";   PMID:22995315 "Europe PMC";   PMID:23183877 "Europe PMC";   PMID:23218671 "Europe PMC";   PMID:23343681 "Europe PMC";   Patent:US2005065109;   Patent:US2005276762;   Patent:WO2006120681;   Reaxys:7064766 "Reaxys";   Wikipedia:CADPR
 cyclic_relationship: is_conjugate_acid_of CHEBI:73672

show annotations for term's descendants       view all columns           Sort by:
cyclic ADP-ribose term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G Cd38 CD38 molecule JBrowse link 14 71,714,768 71,754,990 RGD:6480464
G Homer1 homer scaffold protein 1 JBrowse link 2 22,909,550 23,012,303 RGD:6480464
G Ryr2 ryanodine receptor 2 JBrowse link 17 65,533,998 65,955,606 RGD:6480464

Term paths to the root
Path 1
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19728
    role 19675
      biological role 19673
        biochemical role 19178
          metabolite 19150
            cyclic ADP-ribose 3
              2'-phospho-cyclic ADP-ribose 0
Path 2
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19728
    subatomic particle 19724
      composite particle 19724
        hadron 19724
          baryon 19724
            nucleon 19724
              atomic nucleus 19724
                atom 19724
                  main group element atom 19610
                    p-block element atom 19610
                      chalcogen 19322
                        oxygen atom 19283
                          oxygen molecular entity 19283
                            hydroxides 19042
                              oxoacid 18106
                                pnictogen oxoacid 9843
                                  phosphorus oxoacid 8661
                                    phosphoric acids 7332
                                      phosphoric acid 7332
                                        phosphoric acid derivative 6982
                                          phosphate 6982
                                            organic phosphate 6981
                                              carbohydrate phosphate 1508
                                                phospho sugar 1443
                                                  aldose phosphate 1441
                                                    aldopentose phosphate 1435
                                                      ribose phosphate 1429
                                                        ribonucleotide 1388
                                                          purine ribonucleotide 1361
                                                            adenyl ribonucleotide 1239
                                                              adenosine phosphate 248
                                                                adenosine 5'-phosphate 247
                                                                  ADP 82
                                                                    ADP-sugar 7
                                                                      ADP-D-ribose 7
                                                                        cyclic ADP-ribose 3
                                                                          2'-phospho-cyclic ADP-ribose 0
paths to the root


RGD is funded by grant HL64541 from the National Heart, Lung, and Blood Institute on behalf of the NIH.