Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  FTP Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   

ONTOLOGY REPORT - ANNOTATIONS


Term:5beta-cholestane
go back to main search page
Accession:CHEBI:35517 term browser browse the term
Definition:A cholestane that has formula C27H48.
Synonyms:related_synonym: Formula=C27H48;   InChI=1S/C27H48/c1-19(2)9-8-10-20(3)23-14-15-24-22-13-12-21-11-6-7-17-26(21,4)25(22)16-18-27(23,24)5/h19-25H,6-18H2,1-5H3/t20-,21+,22+,23-,24+,25+,26+,27-/m1/s1;   InChIKey=XIIAYQZJNBULGD-CJPSHIORSA-N;   SMILES=[H][C@@]12CCCC[C@]1(C)[C@@]1([H])CC[C@]3(C)[C@]([H])(CC[C@@]3([H])[C@]1([H])CC2)[C@H](C)CCCC(C)C;   beta-cholestane;   coprostane;   pseudocholestane
 xref: Beilstein:2051807 "Beilstein";   CAS:481-20-9 "NIST Chemistry WebBook";   LIPID_MAPS_instance:LMST01010085 "LIPID MAPS"


show annotations for term's descendants       view all columns           Sort by:
 
20-hydroxyecdysone term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G Akt1 AKT serine/threonine kinase 1 JBrowse link 6 137,218,398 137,239,970 RGD:6480464
G Casp3 caspase 3 JBrowse link 16 48,845,011 48,863,249 RGD:6480464
G Gsk3b glycogen synthase kinase 3 beta JBrowse link 11 65,060,884 65,208,842 RGD:6480464
G Hmox1 heme oxygenase 1 JBrowse link 19 14,508,634 14,515,455 RGD:6480464
G Hspa5 heat shock protein family A (Hsp70) member 5 JBrowse link 3 13,838,304 13,842,763 RGD:6480464
G Nfe2l2 nuclear factor, erythroid 2-like 2 JBrowse link 3 62,497,568 62,525,146 RGD:6480464

Term paths to the root
Path 1
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19728
    chemical entity 19726
      atom 19724
        nonmetal atom 19597
          carbon atom 19494
            organic molecular entity 19494
              lipid 16956
                steroid 12779
                  steroid fundamental parent 12404
                    cholestane 329
                      5beta-cholestane 6
                        2,22,25-trideoxyecdysone 0
                        2-deoxyecdysone 0
                        25-deoxyecdysone 0
                        3alpha,7alpha,12alpha,24-tetrahydroxy-5beta-cholestan-26-oic acid + 0
                        3alpha,7alpha,12alpha-trihydroxy-5beta-cholestan-26-al + 0
                        3alpha,7alpha,12alpha-trihydroxy-5beta-cholestan-26-oic acid + 0
                        3alpha,7alpha,24-trihydroxy-5beta-cholestan-26-al + 0
                        3alpha,7alpha,24-trihydroxy-5beta-cholestan-26-oic acid + 0
                        3alpha,7alpha-dihydroxy-5beta-cholestan-26-al 0
                        3alpha,7alpha-dihydroxy-5beta-cholestan-26-oic acid + 0
                        3alpha,7beta-dihydroxy-5beta-cholest-24-en-26-oic acid 0
                        5,6beta-epoxy-5beta-cholestane 0
                        5beta-cholest-7-ene 0
                        5beta-cholestan-3-one 0
                        5beta-cholestane-3alpha,7alpha,12alpha,24,26-pentol + 0
                        5beta-cholestane-3alpha,7alpha,12alpha,24-tetrol + 0
                        5beta-cholestane-3alpha,7alpha,12alpha,26-tetrol + 0
                        5beta-cholestane-3alpha,7alpha,12alpha-triol 0
                        5beta-cholestane-3alpha,7alpha,24,26-tetrol + 0
                        5beta-cholestane-3alpha,7alpha,24-triol + 0
                        5beta-cholestane-3alpha,7alpha,26-triol 0
                        5beta-cholestane-3alpha,7alpha-diol 0
                        5beta-cyprinol + 0
                        5beta-scymnol + 0
                        7alpha,12alpha,24-trihydroxy-5beta-cholestan-3-one + 0
                        7alpha,12alpha,26-trihydroxy-5beta-cholestan-3-one 0
                        7alpha,12alpha-dihydroxy-5beta-cholestan-3-one 0
                        7alpha,24-dihydroxy-5beta-cholestan-3-one + 0
                        7alpha,26-dihydroxy-5beta-cholestan-3-one 0
                        7alpha-hydroxy-5beta-cholestan-3-one 0
                        cholesterol beta-epoxide 0
                        coprostanol + 0
                        ecdysone + 6
Path 2
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19728
    subatomic particle 19724
      composite particle 19724
        hadron 19724
          baryon 19724
            nucleon 19724
              atomic nucleus 19724
                atom 19724
                  main group element atom 19610
                    p-block element atom 19610
                      carbon group element atom 19501
                        carbon atom 19494
                          organic molecular entity 19494
                            organic molecule 19417
                              organic cyclic compound 19184
                                organic polycyclic compound 16026
                                  steroid 12779
                                    steroid fundamental parent 12404
                                      cholestane 329
                                        5beta-cholestane 6
                                          2,22,25-trideoxyecdysone 0
                                          2-deoxyecdysone 0
                                          25-deoxyecdysone 0
                                          3alpha,7alpha,12alpha,24-tetrahydroxy-5beta-cholestan-26-oic acid + 0
                                          3alpha,7alpha,12alpha-trihydroxy-5beta-cholestan-26-al + 0
                                          3alpha,7alpha,12alpha-trihydroxy-5beta-cholestan-26-oic acid + 0
                                          3alpha,7alpha,24-trihydroxy-5beta-cholestan-26-al + 0
                                          3alpha,7alpha,24-trihydroxy-5beta-cholestan-26-oic acid + 0
                                          3alpha,7alpha-dihydroxy-5beta-cholestan-26-al 0
                                          3alpha,7alpha-dihydroxy-5beta-cholestan-26-oic acid + 0
                                          3alpha,7beta-dihydroxy-5beta-cholest-24-en-26-oic acid 0
                                          5,6beta-epoxy-5beta-cholestane 0
                                          5beta-cholest-7-ene 0
                                          5beta-cholestan-3-one 0
                                          5beta-cholestane-3alpha,7alpha,12alpha,24,26-pentol + 0
                                          5beta-cholestane-3alpha,7alpha,12alpha,24-tetrol + 0
                                          5beta-cholestane-3alpha,7alpha,12alpha,26-tetrol + 0
                                          5beta-cholestane-3alpha,7alpha,12alpha-triol 0
                                          5beta-cholestane-3alpha,7alpha,24,26-tetrol + 0
                                          5beta-cholestane-3alpha,7alpha,24-triol + 0
                                          5beta-cholestane-3alpha,7alpha,26-triol 0
                                          5beta-cholestane-3alpha,7alpha-diol 0
                                          5beta-cyprinol + 0
                                          5beta-scymnol + 0
                                          7alpha,12alpha,24-trihydroxy-5beta-cholestan-3-one + 0
                                          7alpha,12alpha,26-trihydroxy-5beta-cholestan-3-one 0
                                          7alpha,12alpha-dihydroxy-5beta-cholestan-3-one 0
                                          7alpha,24-dihydroxy-5beta-cholestan-3-one + 0
                                          7alpha,26-dihydroxy-5beta-cholestan-3-one 0
                                          7alpha-hydroxy-5beta-cholestan-3-one 0
                                          cholesterol beta-epoxide 0
                                          coprostanol + 0
                                          ecdysone + 6
paths to the root

NHLBI Logo

RGD is funded by grant HL64541 from the National Heart, Lung, and Blood Institute on behalf of the NIH.