Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  FTP Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   

ONTOLOGY REPORT - ANNOTATIONS


Term:HPODE
go back to main search page
Accession:CHEBI:36329 term browser browse the term
Definition:Hydroperoxy-octadecadienoic acids, formed in mammalian cells by peroxidation of linoleic acid.
Synonyms:related_synonym: HPODEs
 xref: PMID:23680403 "Europe PMC"
 cyclic_relationship: is_conjugate_acid_of CHEBI:131862


show annotations for term's descendants       view all columns           Sort by:
 
13-HPODE term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G Cat catalase JBrowse link 3 93,379,872 93,412,058 RGD:6480464
G Cav1 caveolin 1 JBrowse link 4 44,597,123 44,630,206 RGD:6480464
G Ccl2 C-C motif chemokine ligand 2 JBrowse link 10 69,412,065 69,413,863 RGD:6480464
G Egr1 early growth response 1 JBrowse link 18 27,657,903 27,660,101 RGD:6480464
G Ppara peroxisome proliferator activated receptor alpha JBrowse link 7 126,618,872 126,687,282 RGD:6480464
G Pparg peroxisome proliferator-activated receptor gamma JBrowse link 4 147,274,055 147,399,383 RGD:6480464
linoleic acid hydroperoxide term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G Agt angiotensinogen JBrowse link 19 57,321,594 57,333,460 RGD:6480464
G Cygb cytoglobin JBrowse link 10 105,618,325 105,628,091 RGD:6480464
G Gpx1 glutathione peroxidase 1 JBrowse link 8 117,117,430 117,118,528 RGD:6480464
G Gpx2 glutathione peroxidase 2 JBrowse link 6 99,839,960 99,843,245 RGD:6480464

Term paths to the root
Path 1
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19748
    role 19695
      biological role 19693
        biochemical role 19191
          metabolite 19162
            eukaryotic metabolite 18779
              plant metabolite 17119
                linoleic acid 109
                  HPODE 10
                    13-HPODE + 6
                    8(R)-HPODE 0
                    9(R)-HPODE 0
                    9(S)-HPODE 0
                    TriHOME + 0
                    linoleic acid hydroperoxide + 4
Path 2
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19748
    subatomic particle 19744
      composite particle 19744
        hadron 19744
          baryon 19744
            nucleon 19744
              atomic nucleus 19744
                atom 19744
                  main group element atom 19628
                    p-block element atom 19628
                      carbon group element atom 19522
                        carbon atom 19516
                          organic molecular entity 19516
                            organic group 18426
                              organic divalent group 18418
                                organodiyl group 18418
                                  carbonyl group 18306
                                    carbonyl compound 18306
                                      carboxylic acid 17973
                                        monocarboxylic acid 17268
                                          fatty acid 15817
                                            unsaturated fatty acid 894
                                              polyunsaturated fatty acid 652
                                                essential fatty acid 377
                                                  omega-6 fatty acid 370
                                                    linoleic acid 109
                                                      HPODE 10
                                                        13-HPODE + 6
                                                        8(R)-HPODE 0
                                                        9(R)-HPODE 0
                                                        9(S)-HPODE 0
                                                        TriHOME + 0
                                                        linoleic acid hydroperoxide + 4
paths to the root

NHLBI Logo

RGD is funded by grant HL64541 from the National Heart, Lung, and Blood Institute on behalf of the NIH.