Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  FTP Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   

ONTOLOGY REPORT - ANNOTATIONS


Term:HPODE
go back to main search page
Accession:CHEBI:36329 term browser browse the term
Definition:Hydroperoxy-octadecadienoic acids, formed in mammalian cells by peroxidation of linoleic acid.
Synonyms:related_synonym: HPODEs
 xref: PMID:23680403 "Europe PMC"
 cyclic_relationship: is_conjugate_acid_of CHEBI:131862


show annotations for term's descendants       view all columns           Sort by:
 
13-HPODE term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G Cat catalase JBrowse link 2 103,453,904 103,485,153 RGD:6480464
G Cav1 caveolin 1, caveolae protein JBrowse link 6 17,306,335 17,341,328 RGD:6480464
G Ccl2 chemokine (C-C motif) ligand 2 JBrowse link 11 82,035,577 82,037,452 RGD:6480464
G Egr1 early growth response 1 JBrowse link 18 34,861,207 34,864,956 RGD:6480464
G Ppara peroxisome proliferator activated receptor alpha JBrowse link 15 85,734,910 85,806,851 RGD:6480464
G Pparg peroxisome proliferator activated receptor gamma JBrowse link 6 115,360,879 115,490,404 RGD:6480464
linoleic acid hydroperoxide term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G Agt angiotensinogen (serpin peptidase inhibitor, clade A, member 8) JBrowse link 8 124,556,587 124,569,706 RGD:6480464
G Cygb cytoglobin JBrowse link 11 116,645,595 116,654,504 RGD:6480464
G Gpx1 glutathione peroxidase 1 JBrowse link 9 108,339,080 108,340,342 RGD:6480464
G Gpx2 glutathione peroxidase 2 JBrowse link 12 76,792,335 76,795,554 RGD:6480464

Term paths to the root
Path 1
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 21258
    role 21241
      biological role 21239
        biochemical role 20281
          metabolite 20220
            eukaryotic metabolite 20058
              plant metabolite 18246
                linoleic acid 115
                  HPODE 10
                    13-HPODE + 6
                    8(R)-HPODE 0
                    9(R)-HPODE 0
                    9(S)-HPODE 0
                    TriHOME + 0
                    linoleic acid hydroperoxide + 4
Path 2
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 21258
    subatomic particle 21254
      composite particle 21254
        hadron 21254
          baryon 21254
            nucleon 21254
              atomic nucleus 21254
                atom 21254
                  main group element atom 21120
                    p-block element atom 21120
                      carbon group element atom 20892
                        carbon atom 20783
                          organic molecular entity 20783
                            organic group 19177
                              organic divalent group 19167
                                organodiyl group 19167
                                  carbonyl group 19137
                                    carbonyl compound 19137
                                      carboxylic acid 18817
                                        monocarboxylic acid 18013
                                          fatty acid 16415
                                            unsaturated fatty acid 908
                                              polyunsaturated fatty acid 659
                                                essential fatty acid 386
                                                  omega-6 fatty acid 379
                                                    linoleic acid 115
                                                      HPODE 10
                                                        13-HPODE + 6
                                                        8(R)-HPODE 0
                                                        9(R)-HPODE 0
                                                        9(S)-HPODE 0
                                                        TriHOME + 0
                                                        linoleic acid hydroperoxide + 4
paths to the root

NHLBI Logo

RGD is funded by grant HL64541 from the National Heart, Lung, and Blood Institute on behalf of the NIH.