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ONTOLOGY REPORT - ANNOTATIONS


Term:GDP-alpha-D-glucose
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Accession:CHEBI:62254 term browser browse the term
Definition:A GDP-D-glucose having alpha-configuration at the anomeric centre.
Synonyms:exact_synonym: guanosine 5'-[3-(alpha-D-glucopyranosyl) dihydrogen diphosphate]
 related_synonym: (GDP-Glc)1;   Formula=C16H25N5O16P2;   GDP-D-glucose;   GDP-glucose;   GDPG;   Guanosine 5'-(trihydrogen diphosphate), P'-alpha-D-glucopyranosyl ester;   Guanosine diphosphate glucose;   Guanosine diphosphoglucose;   InChI=1S/C16H25N5O16P2/c17-16-19-12-6(13(28)20-16)18-3-21(12)14-10(26)8(24)5(34-14)2-33-38(29,30)37-39(31,32)36-15-11(27)9(25)7(23)4(1-22)35-15/h3-5,7-11,14-15,22-27H,1-2H2,(H,29,30)(H,31,32)(H3,17,19,20,28)/t4-,5-,7-,8-,9+,10-,11-,14-,15-/m1/s1;   InChIKey=MVMSCBBUIHUTGJ-LRJDVEEWSA-N;   SMILES=Nc1nc2n(cnc2c(=O)[nH]1)[C@@H]1O[C@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)O[C@H]2O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]2O)[C@@H](O)[C@H]1O
 xref: CAS:5750-57-2 "ChemIDplus";   HMDB:HMDB0003351;   KEGG:C00394;   KEGG:G11108
 xref_mesh: MESH:C100085
 xref: PMID:17407275 "Europe PMC";   PMID:25010571 "Europe PMC";   PMID:4658992 "Europe PMC";   PMID:5084789 "Europe PMC";   Reaxys:79012 "Reaxys"
 cyclic_relationship: is_conjugate_acid_of CHEBI:62230


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GDP-alpha-D-glucose term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G Idh2 isocitrate dehydrogenase (NADP(+)) 2 JBrowse link 1 141,874,354 141,893,674 RGD:6480464

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  CHEBI ontology 19654
    role 19598
      biological role 19596
        biochemical role 19125
          metabolite 19093
            eukaryotic metabolite 18735
              animal metabolite 18475
                mammalian metabolite 18457
                  human metabolite 18120
                    GDP-glucose 1
                      GDP-D-glucose 1
                        GDP-alpha-D-glucose 1
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  CHEBI ontology 19654
    subatomic particle 19650
      composite particle 19650
        hadron 19650
          baryon 19650
            nucleon 19650
              atomic nucleus 19650
                atom 19650
                  main group element atom 19531
                    p-block element atom 19531
                      chalcogen 19217
                        oxygen atom 19171
                          oxygen molecular entity 19171
                            hydroxides 18951
                              oxoacid 18064
                                pnictogen oxoacid 8533
                                  phosphorus oxoacid 8426
                                    phosphoric acids 7312
                                      phosphoric acid 7312
                                        phosphoric acid derivative 6963
                                          phosphate 6963
                                            organic phosphate 6962
                                              carbohydrate phosphate 1498
                                                phospho sugar 1433
                                                  aldose phosphate 1431
                                                    aldopentose phosphate 1425
                                                      ribose phosphate 1419
                                                        ribonucleotide 1378
                                                          purine ribonucleotide 1351
                                                            guanyl ribonucleotide 123
                                                              guanosine phosphate 55
                                                                guanosine 5'-phosphate 55
                                                                  GDP 11
                                                                    GDP-sugar 1
                                                                      GDP-hexose 1
                                                                        GDP-glucose 1
                                                                          GDP-D-glucose 1
                                                                            GDP-alpha-D-glucose 1
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