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ONTOLOGY REPORT - ANNOTATIONS


Term:alkyl,acyl-sn-glycero-3-phosphocholine
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Accession:CHEBI:68489 term browser browse the term
Definition:A glycerophosphocholine that is sn-glycero-3-phosphocholine in which positions 1 and 2 are substituted by unspecified acyl and alkyl groups, and in which the positions of the acyl and alkyl groups are also unspecified.
Synonyms:related_synonym: Formula=C8H18NO6PR2;   SMILES=[H][C@@](CO[*])(COP([O-])(=O)OCC[N+](C)(C)C)O[*];   alkyl,acyl-sn-glycero-3-phosphocholines


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2-acetyl-1-alkyl-sn-glycero-3-phosphocholine term browser
Symbol Object Name JBrowse Chr Start Stop Reference
G Agtr1a angiotensin II receptor, type 1a JBrowse link 17 35,907,102 35,958,136 RGD:6480464
G Alox12 arachidonate 12-lipoxygenase, 12S type JBrowse link 10 56,851,734 56,864,049 RGD:6480464
G Alox5 arachidonate 5-lipoxygenase JBrowse link 4 148,398,004 148,446,308 RGD:6480464
G Ccl2 C-C motif chemokine ligand 2 JBrowse link 10 69,412,065 69,413,863 RGD:6480464
G Ccr2 C-C motif chemokine receptor 2 RGD:6480464
G Crp C-reactive protein JBrowse link 13 91,080,448 91,081,358 RGD:6480464
G Cx3cr1 C-X3-C motif chemokine receptor 1 JBrowse link 8 128,740,756 128,754,514 RGD:6480464
G Edn1 endothelin 1 JBrowse link 17 22,136,814 22,143,745 RGD:6480464
G Ednrb endothelin receptor type B JBrowse link 15 88,004,775 88,036,354 RGD:6480464
G Egr1 early growth response 1 JBrowse link 18 27,657,903 27,660,101 RGD:6480464
G Il1a interleukin 1 alpha JBrowse link 3 121,824,712 121,836,122 RGD:6480464
G Il1b interleukin 1 beta JBrowse link 3 121,876,256 121,882,637 RGD:6480464
G Itgam integrin subunit alpha M JBrowse link 1 199,495,312 199,545,738 RGD:6480464
G Ltb4r leukotriene B4 receptor JBrowse link 15 34,449,299 34,453,352 RGD:6480464
G Mmp13 matrix metallopeptidase 13 JBrowse link 8 5,522,739 5,533,018 RGD:6480464
G Nceh1 neutral cholesterol ester hydrolase 1 JBrowse link 2 112,868,834 112,932,622 RGD:6480464
G Nfkbia NFKB inhibitor alpha JBrowse link 6 76,267,227 76,270,457 RGD:6480464
G Olr1 oxidized low density lipoprotein receptor 1 JBrowse link 4 163,239,853 163,261,937 RGD:6480464
G Pla2g7 phospholipase A2 group VII JBrowse link 9 19,935,754 19,978,013 RGD:6480464
G Ppara peroxisome proliferator activated receptor alpha JBrowse link 7 126,618,872 126,687,282 RGD:6480464
G Ptafr platelet-activating factor receptor JBrowse link 5 150,746,284 150,775,675 RGD:6480464
G Ptgs1 prostaglandin-endoperoxide synthase 1 JBrowse link 3 15,560,685 15,582,339 RGD:6480464
G Ptgs2 prostaglandin-endoperoxide synthase 2 JBrowse link 13 67,351,230 67,356,920 RGD:6480464
G Rgs4 regulator of G-protein signaling 4 JBrowse link 13 88,054,817 88,061,108 RGD:6480464
G Sele selectin E JBrowse link 13 82,355,234 82,365,323 RGD:6480464
G Sell selectin L JBrowse link 13 82,369,820 82,387,774 RGD:6480464
G Selp selectin P JBrowse link 13 82,428,914 82,464,629 RGD:6480464
G Timp4 TIMP metallopeptidase inhibitor 4 JBrowse link 4 147,156,948 147,163,467 RGD:6480464
G Tnf tumor necrosis factor JBrowse link 20 5,189,382 5,192,000 RGD:6480464

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Path 1
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19748
    role 19695
      biological role 19693
        osmolyte 2005
          glycerol 1747
            ether lipid 29
              alkylacylglycero-3-phosphocholine 29
                alkyl,acyl-sn-glycero-3-phosphocholine 29
                  1-O-(alk-1-enyl)-2-O-acyl-sn-glycero-3-phosphocholine + 0
                  1-acyl-2-[(Z)-alk-1-enyl]-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                  1-acyl-2-alkyl-sn-glycero-3-phosphocholine + 0
                  2-acyl-1-alkyl-sn-glycero-3-phosphocholine + 29
                  phosphatidylcholine O-13:0 0
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                  phosphatidylcholine O-40:1 + 0
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                  phosphatidylcholine O-40:3 + 0
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                  phosphatidylcholine O-40:7 0
                  phosphatidylcholine O-40:8 0
                  phosphatidylcholine O-41:1 0
                  phosphatidylcholine O-42:0 + 0
                  phosphatidylcholine O-42:1 + 0
                  phosphatidylcholine O-42:2 + 0
                  phosphatidylcholine O-42:3 + 0
                  phosphatidylcholine O-42:4 + 0
                  phosphatidylcholine O-42:5 0
                  phosphatidylcholine O-42:6 0
                  phosphatidylcholine O-44:0 0
                  phosphatidylcholine O-44:1 0
                  phosphatidylcholine O-44:2 0
                  phosphatidylcholine O-44:3 + 0
                  phosphatidylcholine O-44:4 + 0
                  phosphatidylcholine O-44:5 + 0
                  phosphatidylcholine O-44:6 0
                  phosphatidylcholine O-45:1 0
Path 2
Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19748
    subatomic particle 19744
      composite particle 19744
        hadron 19744
          baryon 19744
            nucleon 19744
              atomic nucleus 19744
                atom 19744
                  main group element atom 19628
                    p-block element atom 19628
                      chalcogen 19337
                        oxygen atom 19298
                          oxygen molecular entity 19298
                            hydroxides 19053
                              oxoacid 18117
                                pnictogen oxoacid 9850
                                  phosphorus oxoacid 8673
                                    phosphoric acids 7343
                                      phosphoric acid 7343
                                        phosphoric acid derivative 6994
                                          phosphate 6994
                                            organic phosphate 6993
                                              phospholipid 288
                                                glycerophospholipid 196
                                                  glycerophosphocholine 115
                                                    alkylacylglycero-3-phosphocholine 29
                                                      alkyl,acyl-sn-glycero-3-phosphocholine 29
                                                        1-O-(alk-1-enyl)-2-O-acyl-sn-glycero-3-phosphocholine + 0
                                                        1-acyl-2-[(Z)-alk-1-enyl]-sn-glycero-3-phosphocholine 0
                                                        1-acyl-2-alkyl-sn-glycero-3-phosphocholine + 0
                                                        2-acyl-1-alkyl-sn-glycero-3-phosphocholine + 29
                                                        phosphatidylcholine O-13:0 0
                                                        phosphatidylcholine O-20:1 + 0
                                                        phosphatidylcholine O-26:0 0
                                                        phosphatidylcholine O-26:1 0
                                                        phosphatidylcholine O-28:0 0
                                                        phosphatidylcholine O-28:1 0
                                                        phosphatidylcholine O-29:0 0
                                                        phosphatidylcholine O-30:0 + 0
                                                        phosphatidylcholine O-30:1 + 0
                                                        phosphatidylcholine O-30:2 + 0
                                                        phosphatidylcholine O-31:0 0
                                                        phosphatidylcholine O-31:1 0
                                                        phosphatidylcholine O-31:3 0
                                                        phosphatidylcholine O-32:0 + 0
                                                        phosphatidylcholine O-32:1 + 0
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                                                        phosphatidylcholine O-32:3 0
                                                        phosphatidylcholine O-33:0 0
                                                        phosphatidylcholine O-33:1 0
                                                        phosphatidylcholine O-33:2 0
                                                        phosphatidylcholine O-33:3 0
                                                        phosphatidylcholine O-33:4 0
                                                        phosphatidylcholine O-33:6 0
                                                        phosphatidylcholine O-34:0 + 0
                                                        phosphatidylcholine O-34:1 + 0
                                                        phosphatidylcholine O-34:2 + 0
                                                        phosphatidylcholine O-34:3 + 0
                                                        phosphatidylcholine O-34:4 0
                                                        phosphatidylcholine O-34:5 0
                                                        phosphatidylcholine O-34:6 0
                                                        phosphatidylcholine O-35:2 0
                                                        phosphatidylcholine O-35:3 0
                                                        phosphatidylcholine O-35:4 0
                                                        phosphatidylcholine O-36:0 + 0
                                                        phosphatidylcholine O-36:1 + 0
                                                        phosphatidylcholine O-36:2 + 0
                                                        phosphatidylcholine O-36:3 + 0
                                                        phosphatidylcholine O-36:4 + 0
                                                        phosphatidylcholine O-36:5 + 0
                                                        phosphatidylcholine O-36:6 0
                                                        phosphatidylcholine O-37:6 0
                                                        phosphatidylcholine O-37:7 0
                                                        phosphatidylcholine O-38:0 + 0
                                                        phosphatidylcholine O-38:1 + 0
                                                        phosphatidylcholine O-38:2 + 0
                                                        phosphatidylcholine O-38:3 + 0
                                                        phosphatidylcholine O-38:4 + 0
                                                        phosphatidylcholine O-38:5 + 0
                                                        phosphatidylcholine O-38:6 + 0
                                                        phosphatidylcholine O-38:7 0
                                                        phosphatidylcholine O-39:0 0
                                                        phosphatidylcholine O-40:0 + 0
                                                        phosphatidylcholine O-40:1 + 0
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