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ONTOLOGY REPORT - ANNOTATIONS


Term:cyclic di-AMP
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Accession:CHEBI:71578 term browser browse the term
Definition:A cyclic purine dinucleotide that is the 3',5'-cyclic dimer of AMP.
Synonyms:exact_synonym: (2R,3R,3aS,7aR,9R,10R,10aS,14aR)-2,9-bis(6-amino-9H-purin-9-yl)octahydro-2H,7H-difuro[3,2-d:3',2'-j][1,3,7,9,2,8]tetraoxadiphosphacyclododecine-3,5,10,12-tetrol 5,12-dioxide
 related_synonym: 3',5'-cyclic di-AMP;   Formula=C20H24N10O12P2;   InChI=1S/C20H24N10O12P2/c21-15-9-17(25-3-23-15)29(5-27-9)19-11(31)13-7(39-19)1-37-43(33,34)42-14-8(2-38-44(35,36)41-13)40-20(12(14)32)30-6-28-10-16(22)24-4-26-18(10)30/h3-8,11-14,19-20,31-32H,1-2H2,(H,33,34)(H,35,36)(H2,21,23,25)(H2,22,24,26)/t7-,8-,11-,12-,13-,14-,19-,20-/m1/s1;   InChIKey=PDXMFTWFFKBFIN-XPWFQUROSA-N;   SMILES=Nc1ncnc2n(cnc12)[C@@H]1O[C@@H]2COP(O)(=O)O[C@@H]3[C@@H](COP(O)(=O)O[C@H]2[C@H]1O)O[C@H]([C@@H]3O)n1cnc2c(N)ncnc12;   bis(3',5')-cyclic diadenylic acid;   bis-(3'-5')-cyclic dimeric adenosine monophosphate;   cyclic di-3',5'-adenylic acid
 xref: PMID:22211522 "Europe PMC";   PMID:22508860 "Europe PMC";   PMID:23142775 "Europe PMC";   PMID:23192352 "Europe PMC";   PMID:23250743 "Europe PMC";   Reaxys:8379358 "Reaxys"
 cyclic_relationship: is_conjugate_acid_of CHEBI:71500


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Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19728
    role 19675
      biological role 19673
        biochemical role 19178
          metabolite 19150
            prokaryotic metabolite 18257
              bacterial metabolite 18257
                Mycoplasma genitalium metabolite 6863
                  cyclic di-AMP 0
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Term Annotations click to browse term
  CHEBI ontology 19728
    subatomic particle 19724
      composite particle 19724
        hadron 19724
          baryon 19724
            nucleon 19724
              atomic nucleus 19724
                atom 19724
                  main group element atom 19610
                    p-block element atom 19610
                      chalcogen 19322
                        oxygen atom 19283
                          oxygen molecular entity 19283
                            hydroxides 19042
                              oxoacid 18106
                                pnictogen oxoacid 9843
                                  phosphorus oxoacid 8661
                                    phosphoric acids 7332
                                      phosphoric acid 7332
                                        phosphoric acid derivative 6982
                                          phosphate 6982
                                            organic phosphate 6981
                                              carbohydrate phosphate 1508
                                                phospho sugar 1443
                                                  aldose phosphate 1441
                                                    aldopentose phosphate 1435
                                                      ribose phosphate 1429
                                                        ribonucleotide 1388
                                                          purine ribonucleotide 1361
                                                            adenyl ribonucleotide 1239
                                                              cyclic di-AMP 0
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