Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  FTP Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   

RGD DISEASE ONTOLOGY - ANNOTATIONS

RGD uses the Human Disease Ontology (DO, https://disease-ontology.org/) for disease curation across species. RGD automatically downloads each new release of the ontology on a monthly basis. Some additional terms which are required for RGD's curation purposes but are not currently covered in the official version of DO have been added. As corresponding terms are added to DO, these custom terms are retired and the DO terms substituted in existing annotations and subsequently used for curation.

Term:DNA Repair-Deficiency Disorders
go back to main search page
Accession:DOID:9008840 term browser browse the term
Definition:Disorders resulting from defective DNA REPAIR processes or the associated cellular responses to DNA DAMAGE.
Synonyms:exact_synonym: Chromosome Instability Syndrome;   Chromosome Instability Syndromes;   DNA Repair Deficiency;   DNA Repair-Deficiencies;   DNA Repair-Deficiency Disorder;   Deficient DNA Repair;   Deficient DNA Repairs
 primary_id: MESH:D049914;   RDO:0001547
For additional species annotation, visit the Alliance of Genome Resources.


show annotations for term's descendants           Sort by:
 
DNA Repair-Deficiency Disorders term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Pnkp polynucleotide kinase 3'- phosphatase ISO CTD Direct Evidence: marker/mechanism CTD PMID:20118933 NCBI chr 7:44,856,479...44,865,337
Ensembl chr 7:44,857,139...44,862,992
JBrowse link
G Recql4 RecQ protein-like 4 IMP RGD PMID:25859855 RGD:13207506 NCBI chr15:76,703,553...76,710,616
Ensembl chr15:76,703,553...76,710,548
JBrowse link
G Wrn Werner syndrome RecQ like helicase ISO CTD Direct Evidence: marker/mechanism CTD PMID:29616805 NCBI chr 8:33,234,372...33,385,543
Ensembl chr 8:33,234,384...33,385,527
JBrowse link
adenosine deaminase deficiency term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Ada adenosine deaminase ISO
IEA
ClinVar Annotator: match by term: Severe combined immunodeficiency due to ADA deficiency
OMIM:102700
ClinVar Annotator: match by term: SCID DUE TO ADA DEFICIENCY, EARLY-ONSET
ClinVar Annotator: match by OMIM:102700
ClinVar Annotator: match by synonym: SCID due to ADA deficiency, delayed onset
OMIM
ClinVar
MouseDO
PMID:46025, PMID:498598, PMID:980079, PMID:1284479, PMID:1346349, PMID:1680289, PMID:1696926, PMID:1974554, PMID:2166947, PMID:2651461, PMID:2758612, PMID:2773932, PMID:2783588, PMID:3007108, PMID:3182793, PMID:3366897, PMID:3475710, PMID:3684597, PMID:3839802, PMID:6208479, PMID:7554472, PMID:7599635, PMID:8023852, PMID:8031011, PMID:8051429, PMID:8120281, PMID:8178821, PMID:8227344, PMID:8258146, PMID:8299233, PMID:8401541, PMID:8589684, PMID:8614422, PMID:8673127, PMID:9108404, PMID:9225964, PMID:9361033, PMID:9414266, PMID:9758612, PMID:9806422, PMID:10200056, PMID:11067872, PMID:11160213, PMID:11313286, PMID:11354825, PMID:11807006, PMID:14499267, PMID:16276484, PMID:16825284, PMID:17181544, PMID:17185467, PMID:18952502, PMID:19179314, PMID:19665771, PMID:19830125, PMID:20544538, PMID:21228398, PMID:21410451, PMID:21624848, PMID:21664875, PMID:21865538, PMID:22409989, PMID:22447032, PMID:22764473, PMID:22968453, PMID:23260757, PMID:24033266, PMID:25326637, PMID:25525159, PMID:25741868, PMID:25875700, PMID:25954555, PMID:26255240, PMID:26376800, PMID:27095930, PMID:27129325, PMID:27484032, PMID:27872624, PMID:28266921, PMID:28492532, PMID:29744787, PMID:30290665, PMID:30858051, PMID:31319225 NCBI chr 2:163,726,571...163,750,239
Ensembl chr 2:163,726,584...163,750,239
JBrowse link
G LOC107372314 adenosine deaminase intronic regulatory elements ISO ClinVar Annotator: match by term: Severe combined immunodeficiency due to ADA deficiency ClinVar PMID:3684597, PMID:7599635, PMID:8178821, PMID:8299233, PMID:9758612, PMID:17185467, PMID:21664875, PMID:25741868, PMID:26255240, PMID:26376800, PMID:27129325, PMID:28492532, PMID:31319225 NCBI chr 2:163,735,839...163,746,279 JBrowse link
G Myh7 myosin, heavy polypeptide 7, cardiac muscle, beta ISO ClinVar Annotator: match by term: Bubble boy disease ClinVar PMID:7581410, PMID:10521296, PMID:11186938, PMID:11447480, PMID:15358028, PMID:16858239, PMID:17125710, PMID:18029407, PMID:19880069, PMID:20031618, PMID:22857948, PMID:23233322, PMID:23283745, PMID:24033266, PMID:24093860, PMID:24111713, PMID:24793961, PMID:25031304, PMID:25351510, PMID:25637381, PMID:25741868, PMID:26743238, PMID:26969327, PMID:27247418, PMID:27532257, PMID:27737317, PMID:27831900, PMID:28138913, PMID:28420666, PMID:28492532, PMID:28615295, PMID:28790153 NCBI chr14:54,970,684...54,994,626
Ensembl chr14:54,970,684...54,994,626
JBrowse link
G Rag1 recombination activating 1 ISO ClinVar Annotator: match by term: Bubble boy disease ClinVar PMID:11133745, PMID:21664875, PMID:24290284, PMID:24406074, PMID:26476733, PMID:26596586, PMID:28492532, PMID:30290665 NCBI chr 2:101,638,252...101,649,532
Ensembl chr 2:101,638,282...101,649,501
JBrowse link
ataxia telangiectasia term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G 4930550C14Rik RIKEN cDNA 4930550C14 gene ISO ClinVar Annotator: match by term: Ataxia Telangiectasia
ClinVar Annotator: match by term: Ataxia-telangiectasia syndrome
ClinVar Annotator: match by term: Ataxia-telangiectasia without immunodeficiency
ClinVar Annotator: match by term: AT, COMPLEMENTATION GROUP C
ClinVar PMID:2557216, PMID:3338800, PMID:6504056, PMID:7792600, PMID:8659541, PMID:8665503, PMID:8698354, PMID:8755918, PMID:8797579, PMID:8808599, PMID:8845835, PMID:8923007, PMID:9000145, PMID:9043869, PMID:9054948, PMID:9150358, PMID:9244351, PMID:9288106, PMID:9334731, PMID:9443866, PMID:9450874, PMID:9463314, PMID:9488043, PMID:9497252, PMID:9622061, PMID:9682216, PMID:9711876, PMID:9733514, PMID:9764584, PMID:9792409, PMID:9792410, PMID:9872980, PMID:9887333, PMID:10023947, PMID:10234507, PMID:10330348, PMID:10397742, PMID:10416970, PMID:10425038, PMID:10464642, PMID:10534763, PMID:10706620, PMID:10738255, PMID:10817650, PMID:10864201, PMID:10873394, PMID:10980530, PMID:11054065, PMID:11298136, PMID:11382771, PMID:11443540, PMID:11468183, PMID:11505391, PMID:11606401, PMID:11746755, PMID:11756177, PMID:11756185, PMID:11805335, PMID:11826028, PMID:11830610, PMID:11849780, PMID:11857346, PMID:11897822, PMID:12091354, PMID:12149228, PMID:12195425, PMID:12473594, PMID:12497634, PMID:12511424, PMID:12552559, PMID:12552566, PMID:12646636, PMID:12655570, PMID:12673797, PMID:12673804, PMID:12697903, PMID:12745884, PMID:12810666, PMID:12815592, PMID:12882767, PMID:12883528, PMID:12917204, PMID:12935922, PMID:12969974, PMID:14586414, PMID:14627829, PMID:14654357, PMID:14754616, PMID:14970866, PMID:15039971, PMID:15101044, PMID:15159313, PMID:15174027, PMID:15279808, PMID:15390180, PMID:15696190, PMID:15756685, PMID:15843990, PMID:15880721, PMID:15928302, PMID:16014569, PMID:16140923, PMID:16189143, PMID:16238588, PMID:16266405, PMID:16380133, PMID:16387360, PMID:16411093, PMID:16461462, PMID:16603769, PMID:16631465, PMID:16652348, PMID:16832357, PMID:16864838, PMID:16914028, PMID:16941484, PMID:16958054, PMID:17001622, PMID:17124347, PMID:17132159, PMID:17166884, PMID:17298726, PMID:17333338, PMID:17344846, PMID:17376192, PMID:17393301, PMID:17517479, PMID:17540590, PMID:17623063, PMID:17640065, PMID:17910737, PMID:17968022, PMID:18066086, PMID:18321536, PMID:18384426, PMID:18414213, PMID:18431795, PMID:18497957, PMID:18504682, PMID:18560558, PMID:18573109, PMID:18575927, PMID:18634022, PMID:18807267, PMID:18813293, PMID:19018867, PMID:19347964, PMID:19404735, PMID:19431188, PMID:19440741, PMID:19535770, PMID:19605768, PMID:19691550, PMID:19763152, PMID:19781682, PMID:19823873, PMID:20077034, PMID:20153123, PMID:20232390, PMID:20301790, PMID:20305132, PMID:20307669, PMID:20346647, PMID:20480175, PMID:20840352, PMID:20945614, PMID:20966255, PMID:21150274, PMID:21346221, PMID:21354641, PMID:21445571, PMID:21459046, PMID:21665257, PMID:21778326, PMID:21787400, PMID:21792198, PMID:21833744, PMID:21933854, PMID:21965147, PMID:21993670, PMID:22006793, PMID:22017321, PMID:22071889, PMID:22146522, PMID:22213089, PMID:22250480, PMID:22345219, PMID:22369572, PMID:22406018, PMID:22420423, PMID:22529920, PMID:22585167, PMID:22585170, PMID:22649200, PMID:22674506, PMID:22869595, PMID:22895193, PMID:22952040, PMID:22995991, PMID:23091097, PMID:23142947, PMID:23143971, PMID:23264026, PMID:23322442, PMID:23454770, PMID:23532176, PMID:23555315, PMID:23585368, PMID:23585524, PMID:23632773, PMID:23640770, PMID:23667852, PMID:23671275, PMID:23761041, PMID:23774824, PMID:23807571, PMID:23836671, PMID:23946315, PMID:24033266, PMID:24088041, PMID:24090759, PMID:24172824, PMID:24326041, PMID:24416720, PMID:24448499, PMID:24451234, PMID:24556621, PMID:24628946, PMID:24643969, PMID:24728327, PMID:24733792, PMID:24789685, PMID:24951259, PMID:25032865, PMID:25037873, PMID:25040471, PMID:25042771, PMID:25058500, PMID:25077176, PMID:25117502, PMID:25122203, PMID:25133958, PMID:25148578, PMID:25151137, PMID:25182519, PMID:25186627, PMID:25232094, PMID:25318351, PMID:25320358, PMID:25326635, PMID:25330149, PMID:25374739, PMID:25428789, PMID:25452441, PMID:25460276, PMID:25479140, PMID:25480502, PMID:25502423, PMID:25503501, PMID:25523272, PMID:25525159, PMID:25587027, PMID:25589003, PMID:25614872, PMID:25625042, PMID:25741868, PMID:25793145, PMID:25877891, PMID:25914063, PMID:25925381, PMID:25925954, PMID:25938944, PMID:25957637, PMID:25980754, PMID:26009992, PMID:26022348, PMID:26053404, PMID:26094658, PMID:26182300, PMID:26206375, PMID:26220245, PMID:26246601, PMID:26247737, PMID:26270727, PMID:26296696, PMID:26296701, PMID:26344566, PMID:26380989, PMID:26439923, PMID:26467025, PMID:26483394, PMID:26506520, PMID:26530882, PMID:26534844, PMID:26556299, PMID:26580448, PMID:26628246, PMID:26633542, PMID:26633545, PMID:26662178, PMID:26677768, PMID:26681312, PMID:26689913, PMID:26692440, PMID:26693373, PMID:26787654, PMID:26822949, PMID:26824983, PMID:26837699, PMID:26845104, PMID:26898890, PMID:26901136, PMID:26915675, PMID:26917275, PMID:26976419, PMID:27083775, PMID:27121310, PMID:27153395, PMID:27159176, PMID:27304073, PMID:27433846, PMID:27443514, PMID:27449771, PMID:27479817, PMID:27498913, PMID:27528516, PMID:27581129, PMID:27595995, PMID:27602502, PMID:27616075, PMID:27621404, PMID:27664052, PMID:27720647, PMID:27732944, PMID:27798748, PMID:27873105, PMID:27878467, PMID:27913932, PMID:27932211, PMID:27959900, PMID:27978560, PMID:27988859, PMID:28007021, PMID:28008555, PMID:28051113, PMID:28093192, PMID:28093616, PMID:28135145, PMID:28152038, PMID:28170084, PMID:28188106, PMID:28195393, PMID:28338653, PMID:28423363, PMID:28486781, PMID:28492532, PMID:28503720, PMID:28580595, PMID:28591191, PMID:28608266, PMID:28652578, PMID:28687356, PMID:28716242, PMID:28717660, PMID:28724667, PMID:28726808, PMID:28767289, PMID:28779002, PMID:28825054, PMID:28828701, PMID:28843361, PMID:28873162, PMID:28875981, PMID:28975465, PMID:29036293, PMID:29141312, PMID:29335925, PMID:29360161, PMID:29368341, PMID:29371908, PMID:29415044, PMID:29470806, PMID:29478780, PMID:29522266, PMID:29555771, PMID:29566657, PMID:29596542, PMID:29600275, PMID:29664460, PMID:29667044, PMID:29678143, PMID:29684080, PMID:29719442, PMID:29752822, PMID:29753700, PMID:29888287, PMID:29909963, PMID:29922827, PMID:29945567, PMID:29946849, PMID:29954938, PMID:30067863, PMID:30086788, PMID:30128536, PMID:30197789, PMID:30214756, PMID:30256826, PMID:30287823, PMID:30303537, PMID:30311386, PMID:30363071, PMID:30374176, PMID:30426508, PMID:30447919, PMID:30504431, PMID:30549301, PMID:30607632, PMID:30620386, PMID:30723761, PMID:30730459, PMID:30814645, PMID:30819809, PMID:30927251, PMID:31054420, PMID:31118792, PMID:31125277, PMID:31139954, PMID:31159747, PMID:31160347, PMID:31341520, PMID:31843900, PMID:31919090, PMID:31920950, PMID:32183364, PMID:32566746, PMID:32860008 NCBI chr 9:53,402,713...53,434,426
Ensembl chr 9:53,402,325...53,434,402
JBrowse link
G Acat1 acetyl-Coenzyme A acetyltransferase 1 ISO ClinVar Annotator: match by term: Ataxia-telangiectasia syndrome ClinVar PMID:28492532 NCBI chr 9:53,580,522...53,610,350
Ensembl chr 9:53,580,522...53,610,382
JBrowse link
G Atm ataxia telangiectasia mutated ISO
IEA
IMP
ClinVar Annotator: match by term: Ataxia-telangiectasia syndrome
ClinVar Annotator: match by term: Ataxia-telangiectasia without immunodeficiency
OMIM:208900
ClinVar Annotator: match by term: Louis-Bar syndrome
DNA:deletion:exon:
ClinVar Annotator: match by OMIM:208900
CTD Direct Evidence: marker/mechanism
OMIM
ClinVar
MouseDO
CTD
PMID:1953577, PMID:2491181, PMID:2557216, PMID:2798560, PMID:3338800, PMID:6504056, PMID:7792600, PMID:7836845, PMID:8659541, PMID:8665503, PMID:8698354, PMID:8755918, PMID:8789452, PMID:8797579, PMID:8808599, PMID:8845835, PMID:8923007, PMID:8958160, PMID:8968760, PMID:9000145, PMID:9043869, PMID:9054948, PMID:9121450, PMID:9150358, PMID:9244351, PMID:9288106, PMID:9334731, PMID:9443866, PMID:9450874, PMID:9450906, PMID:9463314, PMID:9488043, PMID:9497252, PMID:9600235, PMID:9622061, PMID:9682216, PMID:9711876, PMID:9733514, PMID:9764584, PMID:9792409, PMID:9792410, PMID:9872980, PMID:9887333, PMID:9892178, PMID:10023947, PMID:10234507, PMID:10330348, PMID:10397742, PMID:10416970, PMID:10425038, PMID:10464642, PMID:10534763, PMID:10607471, PMID:10677309, PMID:10706620, PMID:10738255, PMID:10767628, PMID:10817650, PMID:10864201, PMID:10873394, PMID:10980530, PMID:11054065, PMID:11173867, PMID:11298136, PMID:11382771, PMID:11443540, PMID:11468183, PMID:11505391, PMID:11507241, PMID:11507245, PMID:11516106, PMID:11526498, PMID:11606401, PMID:11746755, PMID:11756177, PMID:11756185, PMID:11805335, PMID:11821961, PMID:11826028, PMID:11830610, PMID:11839094, PMID:11849780, PMID:11857346, PMID:11889466, PMID:11897820, PMID:11897822, PMID:11996792, PMID:12072877, PMID:12091354, PMID:12149228, PMID:12195425, PMID:12362033, PMID:12473176, PMID:12473594, PMID:12497634, PMID:12511424, PMID:12552559, PMID:12552566, PMID:12637545, PMID:12646636, PMID:12655570, PMID:12673794, PMID:12673797, PMID:12673804, PMID:12697903, PMID:12745884, PMID:12810666, PMID:12815592, PMID:12882767, PMID:12883528, PMID:12917204, PMID:12935922, PMID:12935933, PMID:12969974, PMID:14562025, PMID:14586414, PMID:14627829, PMID:14634505, PMID:14643952, PMID:14654357, PMID:14695186, PMID:14695534, PMID:14695997, PMID:14735203, PMID:14754616, PMID:14970866, PMID:15039971, PMID:15042666, PMID:15054841, PMID:15101044, PMID:15159313, PMID:15164409, PMID:15174027, PMID:15177039, PMID:15196260, PMID:15217508, PMID:15279807, PMID:15279808, PMID:15280931, PMID:15390180, PMID:15450731, PMID:15498871, PMID:15629612, PMID:15643608, PMID:15696190, PMID:15713674, PMID:15756685, PMID:15824023, PMID:15824150, PMID:15843990, PMID:15880680, PMID:15880721, PMID:15928302, PMID:16014569, PMID:16035317, PMID:16112413, PMID:16140923, PMID:16167060, PMID:16189143, PMID:16238588, PMID:16266405, PMID:16380133, PMID:16387360, PMID:16411093, PMID:16461462, PMID:16574953, PMID:16603769, PMID:16631465, PMID:16652348, PMID:16741161, PMID:16832357, PMID:16864838, PMID:16914028, PMID:16941484, PMID:16958054, PMID:16998505, PMID:17001622, PMID:17023046, PMID:17124347, PMID:17132159, PMID:17166884, PMID:17187232, PMID:17203191, PMID:17298726, PMID:17333338, PMID:17341484, PMID:17344846, PMID:17351744, PMID:17376192, PMID:17393301, PMID:17490827, PMID:17517479, PMID:17535973, PMID:17540590, PMID:17623063, PMID:17640065, PMID:17699107, PMID:17876757, PMID:17910737, PMID:17968022, PMID:17985259, PMID:18066086, PMID:18164969, PMID:18174244, PMID:18261794, PMID:18321536, PMID:18384426, PMID:18414213, PMID:18431795, PMID:18433505, PMID:18497957, PMID:18502988, PMID:18504682, PMID:18560558, PMID:18565893, PMID:18573109, PMID:18575927, PMID:18634022, PMID:18701470, PMID:18807267, PMID:18813293, PMID:18846412, PMID:19018867, PMID:19147735, PMID:19347964, PMID:19404735, PMID:19431188, PMID:19440741, PMID:19535770, PMID:19605768, PMID:19638463, PMID:19683821, PMID:19691550, PMID:19705055, PMID:19763152, PMID:19770270, PMID:19773425, PMID:19781682, PMID:19823873, PMID:20077034, PMID:20124459, PMID:20153123, PMID:20232390, PMID:20301790, PMID:20305132, PMID:20307669, PMID:20308662, PMID:20346647, PMID:20480175, PMID:20544271, PMID:20678261, PMID:20717907, PMID:20826828, PMID:20840352, PMID:20927582, PMID:20945614, PMID:20966255, PMID:20981092, PMID:21150274, PMID:21164480, PMID:21346221, PMID:21354641, PMID:21445571, PMID:21447618, PMID:21459046, PMID:21514219, PMID:21520333, PMID:21593342, PMID:21665257, PMID:21681852, PMID:21778326, PMID:21787400, PMID:21792198, PMID:21833744, PMID:21910157, PMID:21933854, PMID:21965147, PMID:21993670, PMID:22006793, PMID:22017321, PMID:22071889, PMID:22130802, PMID:22146522, PMID:22200977, PMID:22213089, PMID:22250480, PMID:22345219, PMID:22369572, PMID:22406018, PMID:22420423, PMID:22438227, PMID:22527104, PMID:22529920, PMID:22585167, PMID:22585170, PMID:22649200, PMID:22674506, PMID:22763152, PMID:22869595, PMID:22895193, PMID:22927201, PMID:22927308, PMID:22952040, PMID:22995991, PMID:23074045, PMID:23075580, PMID:23091097, PMID:23142947, PMID:23143971, PMID:23264026, PMID:23322442, PMID:23360865, PMID:23369113, PMID:23376243, PMID:23454770, PMID:23532176, PMID:23555315, PMID:23561644, PMID:23566627, PMID:23585368, PMID:23585524, PMID:23612382, PMID:23632773, PMID:23640770, PMID:23652012, PMID:23667852, PMID:23671275, PMID:23726790, PMID:23761041, PMID:23774824, PMID:23807571, PMID:23836671, PMID:23946315, PMID:23960188, PMID:24033266, PMID:24088041, PMID:24090759, PMID:24113346, PMID:24120321, PMID:24142997, PMID:24172824, PMID:24197801, PMID:24201163, PMID:24204193, PMID:24325359, PMID:24326041, PMID:24356096, PMID:24368146, PMID:24405665, PMID:24416720, PMID:24422204, PMID:24448499, PMID:24451234, PMID:24512911, PMID:24549055, PMID:24556621, PMID:24568663, PMID:24628946, PMID:24643969, PMID:24682267, PMID:24695838, PMID:24728327, PMID:24733792, PMID:24763289, PMID:24789685, PMID:24825865, PMID:24831771, PMID:24886963, PMID:24935205, PMID:24951259, PMID:25032865, PMID:25037873, PMID:25040471, PMID:25042771, PMID:25058500, PMID:25077176, PMID:25101980, PMID:25117502, PMID:25122203, PMID:25133958, PMID:25148578, PMID:25151137, PMID:25159481, PMID:25182519, PMID:25186627, PMID:25231023, PMID:25232094, PMID:25257301, PMID:25275298, PMID:25303977, PMID:25318351, PMID:25320358, PMID:25326635, PMID:25326637, PMID:25330149, PMID:25356970, PMID:25374739, PMID:25428789, PMID:25452441, PMID:25460276, PMID:25479140, PMID:25480502, PMID:25502423, PMID:25503501, PMID:25523272, PMID:25525159, PMID:25587027, PMID:25589003, PMID:25614872, PMID:25625042, PMID:25741868, PMID:25749350, PMID:25793145, PMID:25862857, PMID:25877891, PMID:25882375, PMID:25914063, PMID:25925381, PMID:25925954, PMID:25938944, PMID:25957637, PMID:25980754, PMID:26009992, PMID:26010451, PMID:26022348, PMID:26023681, PMID:26053404, PMID:26085511, PMID:26094658, PMID:26098866, PMID:26112015, PMID:26123645, PMID:26155992, PMID:26164066, PMID:26182300, PMID:26206375, PMID:26207792, PMID:26214590, PMID:26220245, PMID:26246601, PMID:26247737, PMID:26250988, PMID:26270727, PMID:26296696, PMID:26296701, PMID:26320869, PMID:26344566, PMID:26380989, PMID:26439923, PMID:26467025, PMID:26483394, PMID:26506520, PMID:26530882, PMID:26534844, PMID:26556299, PMID:26580448, PMID:26628246, PMID:26633542, PMID:26633545, PMID:26635394, PMID:26662178, PMID:26667234, PMID:26677768, PMID:26681312, PMID:26689913, PMID:26692440, PMID:26693373, PMID:26757417, PMID:26771497, PMID:26778106, PMID:26787654, PMID:26822949, PMID:26824983, PMID:26837699, PMID:26845104, PMID:26846839, PMID:26878173, PMID:26898890, PMID:26901136, PMID:26911350, PMID:26915675, PMID:26917275, PMID:26976419, PMID:27016235, PMID:27034805, PMID:27039262, PMID:27064202, PMID:27067391, PMID:27083775, PMID:27093186, PMID:27121310, PMID:27146902, PMID:27149842, PMID:27150160, PMID:27153395, PMID:27159176, PMID:27276934, PMID:27304073, PMID:27413114, PMID:27433846, PMID:27443514, PMID:27449771, PMID:27460089, PMID:27479817, PMID:27484032, PMID:27498913, PMID:27528516, PMID:27553368, PMID:27581129, PMID:27595995, PMID:27599564, PMID:27602502, PMID:27616075, PMID:27621404, PMID:27664052, PMID:27671921, PMID:27720647, PMID:27732944, PMID:27779110, PMID:27782108, PMID:27798748, PMID:27803004, PMID:27844328, PMID:27871447, PMID:27873105, PMID:27878467, PMID:27884168, PMID:27913932, PMID:27932211, PMID:27959900, PMID:27978560, PMID:27980538, PMID:27988859, PMID:27989354, PMID:27997549, PMID:28007021, PMID:28008555, PMID:28051113, PMID:28076423, PMID:28093192, PMID:28093616, PMID:28119368, PMID:28126470, PMID:28135048, PMID:28135145, PMID:28152038, PMID:28170084, PMID:28182994, PMID:28188106, PMID:28195393, PMID:28202063, PMID:28211887, PMID:28281021, PMID:28282032, PMID:28338653, PMID:28423363, PMID:28440963, PMID:28486781, PMID:28492530, PMID:28492532, PMID:28497333, PMID:28503720, PMID:28528518, PMID:28569218, PMID:28580595, PMID:28591191, PMID:28608266, PMID:28640387, PMID:28652578, PMID:28657667, PMID:28687356, PMID:28687971, PMID:28716242, PMID:28717660, PMID:28724667, PMID:28726808, PMID:28767289, PMID:28779002, PMID:28825054, PMID:28828701, PMID:28830922, PMID:28843361, PMID:28849312, PMID:28873162, PMID:28875981, PMID:28878254, PMID:28894253, PMID:28956312, PMID:28975018, PMID:28975465, PMID:29036293, PMID:29059438, PMID:29101607, PMID:29141312, PMID:29271107, PMID:29335925, PMID:29360161, PMID:29368341, PMID:29371908, PMID:29415044, PMID:29423082, PMID:29449433, PMID:29458332, PMID:29470806, PMID:29478780, PMID:29482223, PMID:29486991, PMID:29487225, PMID:29506079, PMID:29506128, PMID:29522266, PMID:29555771, PMID:29566657, PMID:29596542, PMID:29600275, PMID:29641532, PMID:29642553, PMID:29659569, PMID:29664460, PMID:29665859, PMID:29667044, PMID:29678143, PMID:29684080, PMID:29719442, PMID:29752822, PMID:29753700, PMID:29778231, PMID:29785153, PMID:29789584, PMID:29866652, PMID:29888287, PMID:29909963, PMID:29915322, PMID:29922827, PMID:29945567, PMID:29946849, PMID:29954938, PMID:30067863, PMID:30086788, PMID:30093976, PMID:30128536, PMID:30181556, PMID:30197789, PMID:30214756, PMID:30233647, PMID:30256826, PMID:30262796, PMID:30287823, PMID:30303537, PMID:30306255, PMID:30309722, PMID:30311386, PMID:30363071, PMID:30374176, PMID:30389154, PMID:30402232, PMID:30426508, PMID:30447919, PMID:30482293, PMID:30504431, PMID:30537493, PMID:30541756, PMID:30549301, PMID:30553997, PMID:30584090, PMID:30607632, PMID:30620386, PMID:30651582, PMID:30666157, PMID:30713859, PMID:30713931, PMID:30723761, PMID:30730459, PMID:30814645, PMID:30819809, PMID:30883245, PMID:30927251, PMID:30938815, PMID:30982232, PMID:30995915, PMID:31050087, PMID:31054420, PMID:31118792, PMID:31125277, PMID:31139954, PMID:31159747, PMID:31160347, PMID:31227566, PMID:31263571, PMID:31341520, PMID:31360874, PMID:31428572, PMID:31666926, PMID:31742824, PMID:31815095, PMID:31843900, PMID:31867841, PMID:31871109, PMID:31919090, PMID:31920950, PMID:32183364, PMID:32325837, PMID:32488064, PMID:32566746, PMID:32860008, PMID:197781682, PMID:28007901, PMID:19626507 RGD:12879399, RGD:10053611 NCBI chr 9:53,437,122...53,536,828
Ensembl chr 9:53,439,149...53,536,740
JBrowse link
G Bak1 BCL2-antagonist/killer 1 ISO DNA:mutation:exon:c.342C>T(human) RGD PMID:19898928 RGD:14394817 NCBI chr17:27,019,812...27,028,627
Ensembl chr17:27,019,810...27,029,009
JBrowse link
G Bax BCL2-associated X protein susceptibility ISO DNA:mutations:introns:IVS1146C>T, IVS3+14A>G(human) RGD PMID:19898928 RGD:14394817 NCBI chr 7:45,461,695...45,466,903
Ensembl chr 7:45,461,697...45,466,898
JBrowse link
G Bik BCL2-interacting killer susceptibility ISO DNA:deletion:intron:IVS4-12delTC(human) RGD PMID:19898928 RGD:14394817 NCBI chr15:83,526,790...83,544,635
Ensembl chr15:83,526,862...83,544,634
JBrowse link
G Hdac4 histone deacetylase 4 treatment ISO
IEP
protein:altered localization:nucleus: RGD PMID:22466704, PMID:22466704, PMID:22466704 RGD:9681455, RGD:9681455, RGD:9681455 NCBI chr 1:91,928,779...92,195,702
Ensembl chr 1:91,928,779...92,195,699
JBrowse link
G Ifng interferon gamma ISO RGD PMID:6432389 RGD:8693328 NCBI chr10:118,441,046...118,445,894
Ensembl chr10:118,441,046...118,445,892
JBrowse link
G Il2 interleukin 2 ISO RGD PMID:6432389 RGD:8693328 NCBI chr 3:37,120,713...37,125,954
Ensembl chr 3:37,120,523...37,125,959
JBrowse link
G Il6 interleukin 6 severity ISO RGD PMID:26851119 RGD:11529801 NCBI chr 5:30,013,114...30,019,975
Ensembl chr 5:30,013,114...30,019,981
JBrowse link
G Npat nuclear protein in the AT region ISO ClinVar Annotator: match by term: Ataxia-telangiectasia syndrome ClinVar PMID:28492532 NCBI chr 9:53,536,889...53,575,627
Ensembl chr 9:53,537,047...53,574,342
JBrowse link
Ataxia Telangiectasia Like Disorder term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Mre11a MRE11A homolog A, double strand break repair nuclease ISO CTD Direct Evidence: marker/mechanism
ClinVar Annotator: match by term: Ataxia-telangiectasia-like disorder
CTD
ClinVar
PMID:8445618, PMID:8684395, PMID:9845372, PMID:10612394, PMID:11196167, PMID:11238951, PMID:11371508, PMID:12966088, PMID:14684699, PMID:14690604, PMID:15269180, PMID:16858402, PMID:19383352, PMID:20052722, PMID:20805886, PMID:21227757, PMID:22006311, PMID:22078559, PMID:22139912, PMID:22705791, PMID:22863007, PMID:23080121, PMID:23436002, PMID:23718828, PMID:23755103, PMID:23912341, PMID:24030952, PMID:24033266, PMID:24093751, PMID:24549055, PMID:24556621, PMID:24763289, PMID:24894818, PMID:25040471, PMID:25326635, PMID:25452441, PMID:25503501, PMID:25741868, PMID:26057807, PMID:26467025, PMID:26483394, PMID:26534844, PMID:26633542, PMID:26680607, PMID:26757417, PMID:26786923, PMID:26787654, PMID:26845104, PMID:26898890, PMID:27153395, PMID:27329137, PMID:27433846, PMID:27621404, PMID:27783279, PMID:27878467, PMID:28051113, PMID:28125075, PMID:28152038, PMID:28202063, PMID:28486781, PMID:28492532, PMID:28524162, PMID:28559769, PMID:28849312, PMID:28873162, PMID:29170652, PMID:29348823, PMID:29371908, PMID:29752822, PMID:29922827, PMID:30441849, PMID:32566746 NCBI chr 9:14,784,654...14,837,125
Ensembl chr 9:14,784,654...14,837,123
JBrowse link
G Pcna proliferating cell nuclear antigen ISO CTD Direct Evidence: marker/mechanism CTD NCBI chr 2:132,249,286...132,253,180
Ensembl chr 2:132,249,162...132,253,314
JBrowse link
ataxia with oculomotor apraxia type 3 term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Pik3r5 phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 5 ISO ClinVar Annotator: match by OMIM:615217 OMIM
ClinVar
PMID:22065524 NCBI chr11:68,432,125...68,497,849
Ensembl chr11:68,432,121...68,497,849
JBrowse link
Ataxia-Oculomotor Apraxia 4 term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Pnkp polynucleotide kinase 3'- phosphatase ISO ClinVar Annotator: match by term: Ataxia-oculomotor apraxia 4 OMIM
ClinVar
PMID:7165045, PMID:10446192, PMID:18414213, PMID:20118933, PMID:22508754, PMID:23224214, PMID:24965255, PMID:25558065, PMID:25728773, PMID:25741868, PMID:26467025, PMID:27066567, PMID:27165045, PMID:27232581, PMID:28492532, PMID:30039206, PMID:31061747 NCBI chr 7:44,856,479...44,865,337
Ensembl chr 7:44,857,139...44,862,992
JBrowse link
Ataxia-Telangiectasia Variant term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G 4930550C14Rik RIKEN cDNA 4930550C14 gene ISO ClinVar Annotator: match by term: Ataxia-telangiectasia variant ClinVar PMID:8755918, PMID:8808599, PMID:9000145, PMID:9288106, PMID:9463314, PMID:9792410, PMID:9887333, PMID:10234507, PMID:10330348, PMID:11382771, PMID:11826028, PMID:11830610, PMID:14654357, PMID:15174027, PMID:16958054, PMID:17001622, PMID:18575927, PMID:18634022, PMID:19431188, PMID:19781682, PMID:19823873, PMID:21787400, PMID:21792198, PMID:22345219, PMID:22529920, PMID:23143971, PMID:24088041, PMID:24733792, PMID:25037873, PMID:25040471, PMID:25077176, PMID:25186627, PMID:25741868, PMID:25914063, PMID:25980754, PMID:26506520, PMID:26633545, PMID:26681312, PMID:27528516, PMID:27595995, PMID:27798748, PMID:27978560, PMID:27988859, PMID:28008555, PMID:28492532, PMID:28779002, PMID:29719442, PMID:30504431, PMID:30549301 NCBI chr 9:53,402,713...53,434,426
Ensembl chr 9:53,402,325...53,434,402
JBrowse link
G Atm ataxia telangiectasia mutated ISO ClinVar Annotator: match by term: Ataxia-telangiectasia variant ClinVar PMID:8755918, PMID:8808599, PMID:9000145, PMID:9288106, PMID:9463314, PMID:9792410, PMID:9887333, PMID:10234507, PMID:10330348, PMID:11382771, PMID:11826028, PMID:11830610, PMID:14654357, PMID:15054841, PMID:15174027, PMID:16958054, PMID:17001622, PMID:18575927, PMID:18634022, PMID:19431188, PMID:19535770, PMID:19781682, PMID:19823873, PMID:21787400, PMID:21792198, PMID:22345219, PMID:22529920, PMID:23143971, PMID:24088041, PMID:24733792, PMID:25037873, PMID:25040471, PMID:25077176, PMID:25186627, PMID:25525159, PMID:25741868, PMID:25914063, PMID:25980754, PMID:26506520, PMID:26633545, PMID:26681312, PMID:27528516, PMID:27595995, PMID:27798748, PMID:27978560, PMID:27988859, PMID:28008555, PMID:28492532, PMID:28779002, PMID:29719442, PMID:30504431, PMID:30549301, PMID:30819809 NCBI chr 9:53,437,122...53,536,828
Ensembl chr 9:53,439,149...53,536,740
JBrowse link
Ataxia-Telangiectasia-Like Disorder 1 term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Mre11a MRE11A homolog A, double strand break repair nuclease ISO ClinVar Annotator: match by term: Ataxia-telangiectasia-like disorder 1
ClinVar Annotator: match by OMIM:604391
OMIM
ClinVar
PMID:8445618, PMID:8684395, PMID:9845372, PMID:10612394, PMID:11196167, PMID:11238951, PMID:11371508, PMID:12966088, PMID:14684699, PMID:14690604, PMID:15269180, PMID:15574463, PMID:16858402, PMID:18652530, PMID:18854157, PMID:19383352, PMID:20052722, PMID:20805886, PMID:21227757, PMID:21252998, PMID:21324166, PMID:22006311, PMID:22078559, PMID:22139912, PMID:22705791, PMID:22863007, PMID:23080121, PMID:23436002, PMID:23718828, PMID:23912341, PMID:24030952, PMID:24033266, PMID:24332946, PMID:24549055, PMID:24733832, PMID:24763289, PMID:24894818, PMID:25040471, PMID:25326635, PMID:25452441, PMID:25503501, PMID:25741868, PMID:26467025, PMID:26483394, PMID:26534844, PMID:26633542, PMID:26680607, PMID:26786923, PMID:26787654, PMID:26845104, PMID:26898890, PMID:27124789, PMID:27153395, PMID:27329137, PMID:27621404, PMID:27783279, PMID:27878467, PMID:28051113, PMID:28125075, PMID:28152038, PMID:28202063, PMID:28486781, PMID:28492532, PMID:28559769, PMID:28849312, PMID:29170652, PMID:29348823, PMID:29752822, PMID:29922827, PMID:30441849, PMID:32566746 NCBI chr 9:14,784,654...14,837,125
Ensembl chr 9:14,784,654...14,837,123
JBrowse link
Ataxia-Telangiectasia-Like Disorder 2 term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Pcna proliferating cell nuclear antigen ISO ClinVar Annotator: match by term: Ataxia-telangiectasia-like disorder 2 OMIM
ClinVar
PMID:24911150 NCBI chr 2:132,249,286...132,253,180
Ensembl chr 2:132,249,162...132,253,314
JBrowse link
Bloom syndrome term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Blm Bloom syndrome, RecQ like helicase ISO
IEA
ClinVar Annotator: match by term: Bloom syndrome
OMIM:210900
ClinVar Annotator: match by OMIM:210900
CTD Direct Evidence: marker/mechanism
ClinVar
MouseDO
CTD
OMIM
PMID:2678854, PMID:7585968, PMID:9285778, PMID:9388480, PMID:9837821, PMID:9840919, PMID:10069810, PMID:10090915, PMID:10569803, PMID:10734115, PMID:10812332, PMID:10965492, PMID:11399766, PMID:12242432, PMID:12444098, PMID:15579905, PMID:15609317, PMID:15990871, PMID:16876111, PMID:17407155, PMID:17878217, PMID:18414213, PMID:18471088, PMID:19917125, PMID:20301572, PMID:21113733, PMID:21440839, PMID:21815139, PMID:22582397, PMID:22657828, PMID:22829774, PMID:22885301, PMID:23028338, PMID:23129629, PMID:23225144, PMID:23276657, PMID:23292937, PMID:23552953, PMID:23928670, PMID:24033266, PMID:24096176, PMID:24118499, PMID:24448499, PMID:24728327, PMID:24733792, PMID:24816114, PMID:24932421, PMID:25111073, PMID:25129257, PMID:25182961, PMID:25231023, PMID:25399228, PMID:25525159, PMID:25619955, PMID:25637381, PMID:25653542, PMID:25741868, PMID:25850943, PMID:26028025, PMID:26247052, PMID:26296701, PMID:26340805, PMID:26358404, PMID:26503572, PMID:26556299, PMID:26585945, PMID:26786923, PMID:26788541, PMID:26822949, PMID:27124789, PMID:27153395, PMID:27175728, PMID:27356891, PMID:27657136, PMID:27876123, PMID:27959697, PMID:28195393, PMID:28492532, PMID:28611551, PMID:28724667, PMID:28873162, PMID:28877996, PMID:29098565, PMID:29338689, PMID:29439820, PMID:29478780, PMID:29753700, PMID:29785153, PMID:30214240, PMID:30262796, PMID:30306255, PMID:30502717, PMID:30840646, PMID:30871259, PMID:31159747, PMID:31253795, PMID:32566746, PMID:32860008, PMID:9388480, PMID:10779560 RGD:1599420, RGD:1580056 NCBI chr 7:80,454,993...80,535,148
Ensembl chr 7:80,454,733...80,535,119
JBrowse link
G Fes feline sarcoma oncogene ISO ClinVar Annotator: match by term: Bloom syndrome ClinVar PMID:28492532 NCBI chr 7:80,377,758...80,387,954
Ensembl chr 7:80,377,756...80,387,946
JBrowse link
G Furin furin (paired basic amino acid cleaving enzyme) ISO ClinVar Annotator: match by term: Bloom syndrome ClinVar PMID:28492532 NCBI chr 7:80,389,194...80,405,441
Ensembl chr 7:80,388,585...80,405,436
JBrowse link
G Hddc3 HD domain containing 3 ISO ClinVar Annotator: match by term: Bloom syndrome ClinVar PMID:28492532 NCBI chr 7:80,343,075...80,346,716
Ensembl chr 7:80,343,104...80,350,547
JBrowse link
G Lig1 ligase I, DNA, ATP-dependent ISO ClinVar Annotator: match by term: Dna ligase i deficiency ClinVar PMID:1351188, PMID:1581963, PMID:19223467 NCBI chr 7:13,277,175...13,311,426
Ensembl chr 7:13,277,283...13,311,433
JBrowse link
G Man2a2 mannosidase 2, alpha 2 ISO ClinVar Annotator: match by term: Bloom syndrome ClinVar PMID:28492532 NCBI chr 7:80,349,095...80,371,483
Ensembl chr 7:80,349,097...80,371,375
JBrowse link
G Nsmce2 NSE2/MMS21 homolog, SMC5-SMC6 complex SUMO ligase IEA OMIM:210900 MouseDO NCBI chr15:59,374,198...59,601,689
Ensembl chr15:59,374,247...59,601,684
JBrowse link
G Prc1 protein regulator of cytokinesis 1 ISO ClinVar Annotator: match by term: Bloom syndrome ClinVar PMID:28492532 NCBI chr 7:80,294,445...80,316,259
Ensembl chr 7:80,294,450...80,316,259
JBrowse link
G Rccd1 RCC1 domain containing 1 ISO ClinVar Annotator: match by term: Bloom syndrome ClinVar PMID:28492532 NCBI chr 7:80,294,591...80,324,687
Ensembl chr 7:80,293,229...80,324,454
JBrowse link
G Unc45a unc-45 myosin chaperone A ISO ClinVar Annotator: match by term: Bloom syndrome ClinVar PMID:28492532 NCBI chr 7:80,325,292...80,341,000
Ensembl chr 7:80,325,292...80,347,993
JBrowse link
G Ung uracil DNA glycosylase ISO CTD Direct Evidence: marker/mechanism CTD PMID:2106500 NCBI chr 5:114,130,366...114,139,321
Ensembl chr 5:114,130,386...114,139,323
JBrowse link
Cerebrooculofacioskeletal Syndrome term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Ercc6 excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6 ISO ClinVar Annotator: match by term: Cerebrooculofacioskeletal Syndrome ClinVar PMID:18414213, PMID:25741868, PMID:28492532 NCBI chr14:32,513,291...32,580,990
Ensembl chr14:32,513,521...32,580,990
JBrowse link
Cerebrooculofacioskeletal Syndrome 1 term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Ercc2 excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 2 ISO ClinVar Annotator: match by term: CEREBROOCULOFACIOSKELETAL SYNDROME 1 ClinVar PMID:24728327, PMID:25741868 NCBI chr 7:19,382,017...19,395,694
Ensembl chr 7:19,382,010...19,395,694
JBrowse link
G Ercc6 excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6 ISO ClinVar Annotator: match by term: Cerebrooculofacioskeletal syndrome 1
CTD Direct Evidence: marker/mechanism
ClinVar Annotator: match by term: CEREBROOCULOFACIOSKELETAL SYNDROME 1
DNA:nonsense mutation
DNA:point mutation: :c.3862C>T (human)
ClinVar Annotator: match by OMIM:214150
OMIM
ClinVar
CTD
PMID:1372469, PMID:7063265, PMID:9443879, PMID:10739753, PMID:10767341, PMID:18414213, PMID:18628313, PMID:19894250, PMID:20456449, PMID:22661500, PMID:22904069, PMID:23422418, PMID:23428416, PMID:25136123, PMID:25741868, PMID:25820262, PMID:26204423, PMID:26749132, PMID:27004399, PMID:28492532, PMID:29572252, PMID:30311386, PMID:10739753, PMID:20456449 RGD:10401101, RGD:10401092 NCBI chr14:32,513,291...32,580,990
Ensembl chr14:32,513,521...32,580,990
JBrowse link
Cerebrooculofacioskeletal Syndrome 2 term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Ercc2 excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 2 ISO DNA:missense mutations:p.R616W, p.D681N (human)
ClinVar Annotator: match by term: Cerebrooculofacioskeletal syndrome 2
ClinVar Annotator: match by OMIM:610756
ClinVar
OMIM
PMID:7585650, PMID:7920640, PMID:8571952, PMID:9101292, PMID:9238033, PMID:11156600, PMID:11443545, PMID:11710928, PMID:12820975, PMID:15494306, PMID:18470933, PMID:18603627, PMID:18628313, PMID:18637129, PMID:20944642, PMID:22826098, PMID:23221806, PMID:23232694, PMID:23800062, PMID:24033266, PMID:24252196, PMID:24448499, PMID:24728327, PMID:25620205, PMID:25716912, PMID:25741868, PMID:26556299, PMID:27004399, PMID:27745642, PMID:29478780, PMID:11443545 RGD:1601070 NCBI chr 7:19,382,017...19,395,694
Ensembl chr 7:19,382,010...19,395,694
JBrowse link
Cerebrooculofacioskeletal Syndrome 3 term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Ercc5 excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 5 ISO ClinVar Annotator: match by term: Cerebrooculofacioskeletal syndrome 3 ClinVar
OMIM
PMID:8818951, PMID:11443545, PMID:17466625, PMID:24700531 NCBI chr 1:44,146,948...44,181,260
Ensembl chr 1:44,147,744...44,181,260
JBrowse link
Cerebrooculofacioskeletal Syndrome 4 term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Cd3eap CD3E antigen, epsilon polypeptide associated protein ISO ClinVar Annotator: match by term: Cerebrooculofacioskeletal syndrome 4 ClinVar PMID:25741868, PMID:28492532 NCBI chr 7:19,356,007...19,359,483
Ensembl chr 7:19,356,014...19,359,483
JBrowse link
G Ercc1 excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 1 ISO ClinVar Annotator: match by term: Cerebrooculofacioskeletal syndrome 4
ClinVar Annotator: match by OMIM:610758
OMIM
ClinVar
PMID:17273966, PMID:23623389, PMID:25741868, PMID:28492532 NCBI chr 7:19,344,067...19,356,524
Ensembl chr 7:19,344,778...19,356,524
JBrowse link
Cockayne syndrome term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Ercc1 excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 1 ISO ClinVar Annotator: match by term: Cockayne syndrome ClinVar PMID:17273966, PMID:23623389 NCBI chr 7:19,344,067...19,356,524
Ensembl chr 7:19,344,778...19,356,524
JBrowse link
G Ercc2 excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 2 IMP associated with Xeroderma Pigmentosum;DNA:missense mutation: :p.G602D (mouse) RGD PMID:16904611 RGD:10401080 NCBI chr 7:19,382,017...19,395,694
Ensembl chr 7:19,382,010...19,395,694
JBrowse link
G Ercc3 excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 3 IGI RGD PMID:19114557 RGD:10401087 NCBI chr18:32,240,304...32,270,151
Ensembl chr18:32,240,300...32,270,151
JBrowse link
G Ercc5 excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 5 IMP RGD PMID:15082767 RGD:10401090 NCBI chr 1:44,146,948...44,181,260
Ensembl chr 1:44,147,744...44,181,260
JBrowse link
G Ercc6 excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6 ISO
IEA
ClinVar Annotator: match by OMIM:133540
ClinVar Annotator: match by term: Progeroid nanism
ClinVar Annotator: match by term: Cockayne syndrome
OMIM:133540 | OMIM:216400
CTD Direct Evidence: marker/mechanism
DNA:missense mutations:exon:p.D532G (c.1595A>G), p.L536W (c.1607T>G) (human)
ClinVar Annotator: match by term: Cockayne syndrome, type B
DNA:splice-site mutation, deletion:exon, intron:c.1293_1320del, c.2709 + 1G>T (human)
DNA:insertion: :c.1034_1035insT (human)
ClinVar
MouseDO
CTD
PMID:9443879, PMID:10739753, PMID:10767341, PMID:18414213, PMID:22466610, PMID:22466612, PMID:25440059, PMID:25741868, PMID:26972010, PMID:28492532, PMID:30311386, PMID:25463447, PMID:23599700, PMID:18446857 RGD:11567232, RGD:10401100, RGD:10401095 NCBI chr14:32,513,291...32,580,990
Ensembl chr14:32,513,521...32,580,990
JBrowse link
G Ercc8 excision repaiross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 8 ISO
IEA
OMIM:133540 | OMIM:216400
DNA:mutations:multiple (human)
ClinVar Annotator: match by term: Cockayne syndrome
CTD Direct Evidence: marker/mechanism
DNA:nonsense mutation: :p.Y322X (human)
MouseDO
ClinVar
CTD
PMID:22466610, PMID:22466612, PMID:22824526, PMID:19894250, PMID:21108394 RGD:7246919, RGD:11064547, RGD:10401108 NCBI chr13:108,158,711...108,201,204
Ensembl chr13:108,158,731...108,195,364
JBrowse link
G Ghr growth hormone receptor IEP RGD PMID:17326724 RGD:10003139 NCBI chr15:3,317,755...3,583,352
Ensembl chr15:3,317,760...3,583,492
JBrowse link
G Igf1 insulin-like growth factor 1 IEP RGD PMID:17326724 RGD:10003139 NCBI chr10:87,858,265...87,937,047
Ensembl chr10:87,858,265...87,937,042
JBrowse link
G Ndufaf2 NADH:ubiquinone oxidoreductase complex assembly factor 2 ISO ClinVar Annotator: match by term: Cockayne syndrome ClinVar NCBI chr13:108,052,589...108,158,652
Ensembl chr13:108,002,715...108,158,623
JBrowse link
G Xpa xeroderma pigmentosum, complementation group A IGI RGD PMID:19114557 RGD:10401087 NCBI chr 4:46,175,220...46,196,344
Ensembl chr 4:46,155,347...46,196,311
JBrowse link
Cockayne Syndrome A term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Ercc8 excision repaiross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 8 ISO DNA:mutations:multiple (human)
ClinVar Annotator: match by term: Cockayne syndrome type A
ClinVar
OMIM
PMID:7664335, PMID:9338586, PMID:14661080, PMID:15744458, PMID:16865293, PMID:18414213, PMID:19384974, PMID:19894250, PMID:20571988, PMID:21108394, PMID:21681106, PMID:21924235, PMID:22099533, PMID:22829088, PMID:25525159, PMID:25741868, PMID:26173784, PMID:26616585, PMID:27004399, PMID:27597947, PMID:28492532, PMID:29057985, PMID:29422660, PMID:29572252, PMID:31319225, PMID:16865293 RGD:10401106 NCBI chr13:108,158,711...108,201,204
Ensembl chr13:108,158,731...108,195,364
JBrowse link
G Ndufaf2 NADH:ubiquinone oxidoreductase complex assembly factor 2 ISO ClinVar Annotator: match by term: Cockayne syndrome type A ClinVar PMID:14661080, PMID:19384974, PMID:19894250, PMID:20571988, PMID:21681106, PMID:21924235, PMID:22099533, PMID:27597947, PMID:28492532, PMID:29572252 NCBI chr13:108,052,589...108,158,652
Ensembl chr13:108,002,715...108,158,623
JBrowse link
Cockayne Syndrome B term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Ercc6 excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6 ISO ClinVar Annotator: match by term: Cockayne syndrome, type B
ClinVar Annotator: match by term: Cockayne syndrome B
ClinVar Annotator: match by term: Cockayne Syndrome, Type II
ClinVar
OMIM
PMID:1372469, PMID:7063265, PMID:7264357, PMID:9443879, PMID:9777763, PMID:10196384, PMID:10767341, PMID:15486090, PMID:18414213, PMID:18446857, PMID:18628313, PMID:18784753, PMID:19894250, PMID:20122405, PMID:20456449, PMID:21143350, PMID:21228398, PMID:22466610, PMID:22483866, PMID:22661500, PMID:22904069, PMID:23311583, PMID:23422418, PMID:23428416, PMID:24154677, PMID:25136123, PMID:25251875, PMID:25326635, PMID:25741868, PMID:25820262, PMID:26204423, PMID:26206375, PMID:26749132, PMID:27004399, PMID:27356891, PMID:28170084, PMID:28492532, PMID:29203878, PMID:29572252, PMID:29915382, PMID:30311386, PMID:32860008 NCBI chr14:32,513,291...32,580,990
Ensembl chr14:32,513,521...32,580,990
JBrowse link
Combined Cellular and Humoral Immune Defects with Granulomas term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Iftap intraflagellar transport associated protein ISO ClinVar Annotator: match by term: Combined cellular and humoral immune defects with granulomas ClinVar PMID:8810255, PMID:25739914, PMID:28492532 NCBI chr 2:101,560,779...101,629,031
Ensembl chr 2:101,560,781...101,649,532
JBrowse link
G Rag1 recombination activating 1 ISO ClinVar Annotator: match by term: Combined cellular and humoral immune defects with granulomas
ClinVar Annotator: match by OMIM:233650
OMIM
ClinVar
PMID:8810255, PMID:9630231, PMID:10701853, PMID:10891452, PMID:11133745, PMID:11313270, PMID:11520796, PMID:11908269, PMID:11971977, PMID:12200379, PMID:15908971, PMID:16276422, PMID:16960852, PMID:17075247, PMID:17572155, PMID:17890453, PMID:18056378, PMID:18442948, PMID:18463379, PMID:18592361, PMID:18701881, PMID:18822103, PMID:19064334, PMID:19246248, PMID:19458910, PMID:19830075, PMID:19912631, PMID:20109747, PMID:20489056, PMID:20956421, PMID:21131235, PMID:21184155, PMID:21502542, PMID:21624848, PMID:21664875, PMID:21771083, PMID:22424479, PMID:23085344, PMID:23122631, PMID:24122031, PMID:24144642, PMID:24290284, PMID:24331380, PMID:24406074, PMID:24418478, PMID:24472623, PMID:24817258, PMID:24985406, PMID:25516070, PMID:25739914, PMID:25741868, PMID:25976673, PMID:26186701, PMID:26457731, PMID:26476733, PMID:26596586, PMID:26829731, PMID:27301863, PMID:27609655, PMID:28216420, PMID:28492532, PMID:28747913, PMID:28769923, PMID:28864286, PMID:30290665, PMID:30307608, PMID:30858051 NCBI chr 2:101,638,252...101,649,532
Ensembl chr 2:101,638,282...101,649,501
JBrowse link
G Rag2 recombination activating gene 2 ISO ClinVar Annotator: match by term: Combined cellular and humoral immune defects with granulomas
ClinVar Annotator: match by term: Combined immunodeficiency with skin granulomas
OMIM
ClinVar
PMID:8810255, PMID:10777560, PMID:10891502, PMID:11133745, PMID:11138625, PMID:11313270, PMID:15025726, PMID:16111638, PMID:16960852, PMID:17572155, PMID:18033247, PMID:18463379, PMID:19178939, PMID:19414857, PMID:20234091, PMID:20603253, PMID:21131235, PMID:21502542, PMID:21624848, PMID:21625022, PMID:22295088, PMID:23243423, PMID:23994475, PMID:24139496, PMID:24144642, PMID:24174341, PMID:24331380, PMID:24481607, PMID:25707801, PMID:25739914, PMID:25741868, PMID:25869295, PMID:26186701, PMID:26457731, PMID:26476733, PMID:26515615, PMID:26692406, PMID:26915675, PMID:28492532, PMID:28747913, PMID:28769923, PMID:29051008, PMID:29772310, PMID:30305145, PMID:30307608 NCBI chr 2:101,624,712...101,632,528
Ensembl chr 2:101,624,718...101,632,529
JBrowse link
coronin-1A deficiency term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Aldoa aldolase A, fructose-bisphosphate ISO ClinVar Annotator: match by term: Immunodeficiency 8 ClinVar PMID:18836449, PMID:28492532 NCBI chr 7:126,795,234...126,800,994
Ensembl chr 7:126,795,234...126,800,751
Ensembl chr 7:126,795,234...126,800,751
JBrowse link
G Coro1a coronin, actin binding protein 1A ISO ClinVar Annotator: match by term: Immunodeficiency 8
ClinVar Annotator: match by OMIM:615401
OMIM
ClinVar
PMID:18836449, PMID:19097825, PMID:23522482, PMID:25073507, PMID:25741868, PMID:28492532 NCBI chr 7:126,699,774...126,704,816
Ensembl chr 7:126,699,773...126,707,787
JBrowse link
G Gdpd3 glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 3 ISO ClinVar Annotator: match by term: Immunodeficiency 8 ClinVar PMID:18836449, PMID:28492532 NCBI chr 7:126,766,414...126,775,645
Ensembl chr 7:126,766,334...126,775,649
JBrowse link
G Mapk3 mitogen-activated protein kinase 3 ISO ClinVar Annotator: match by term: Immunodeficiency 8 ClinVar PMID:18836449, PMID:28492532 NCBI chr 7:126,759,626...126,765,816
Ensembl chr 7:126,759,601...126,765,819
JBrowse link
G Ppp4c protein phosphatase 4, catalytic subunit ISO ClinVar Annotator: match by term: Immunodeficiency 8 ClinVar PMID:18836449, PMID:28492532 NCBI chr 7:126,785,866...126,792,557
Ensembl chr 7:126,785,866...126,792,496
JBrowse link
G Rhoh ras homolog family member H ISO ClinVar Annotator: match by term: T-cell immunodeficiency with epidermodysplasia verruciformis ClinVar PMID:28492532 NCBI chr 5:65,860,742...65,896,700
Ensembl chr 5:65,861,213...65,896,700
JBrowse link
G Tbx6 T-box 6 ISO ClinVar Annotator: match by term: Immunodeficiency 8 ClinVar PMID:18836449, PMID:28492532 NCBI chr 7:126,781,483...126,785,548
Ensembl chr 7:126,781,483...126,785,560
JBrowse link
G Ypel3 yippee like 3 ISO ClinVar Annotator: match by term: Immunodeficiency 8 ClinVar PMID:18836449, PMID:28492532 NCBI chr 7:126,776,963...126,780,510
Ensembl chr 7:126,776,955...126,780,514
JBrowse link
De Sanctis-Cacchione Syndrome term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Ercc6 excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6 ISO ClinVar Annotator: match by term: DE SANCTIS-CACCHIONE SYNDROME
CTD Direct Evidence: marker/mechanism
OMIM
ClinVar
CTD
PMID:1372469, PMID:7063265, PMID:9443879, PMID:10196384, PMID:10767341, PMID:11809892, PMID:18414213, PMID:18628313, PMID:18784753, PMID:19894250, PMID:20122405, PMID:20456449, PMID:21143350, PMID:21228398, PMID:22661500, PMID:22904069, PMID:23311583, PMID:23422418, PMID:23428416, PMID:24154677, PMID:25136123, PMID:25326635, PMID:25356239, PMID:25463447, PMID:25741868, PMID:25820262, PMID:26204423, PMID:26206375, PMID:26218421, PMID:26620705, PMID:26749132, PMID:27004399, PMID:27186691, PMID:27356891, PMID:28170084, PMID:28440418, PMID:28492532, PMID:29203878, PMID:29572252, PMID:29915382, PMID:30311386 NCBI chr14:32,513,291...32,580,990
Ensembl chr14:32,513,521...32,580,990
JBrowse link
Fanconi anemia term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Aopep aminopeptidase O ISO ClinVar Annotator: match by term: Fanconi's anemia
ClinVar Annotator: match by term: Fanconi anemia
ClinVar PMID:1574115, PMID:1641028, PMID:8103176, PMID:8128956, PMID:8348157, PMID:8499901, PMID:8613549, PMID:8621788, PMID:8703809, PMID:8829660, PMID:08844212, PMID:8882868, PMID:9207444, PMID:9242535, PMID:9398857, PMID:11050007, PMID:12093742, PMID:12670332, PMID:12750283, PMID:14695169, PMID:15364573, PMID:15695377, PMID:16015582, PMID:17924555, PMID:20869034, PMID:21520333, PMID:22720145, PMID:23028338, PMID:23634996, PMID:24033266, PMID:24469828, PMID:24584348, PMID:24728327, PMID:25741868, PMID:26466335, PMID:26681312, PMID:26689913, PMID:26740942, PMID:26822237, PMID:28425259, PMID:28492532, PMID:28767289, PMID:29753700, PMID:29922827, PMID:30031030, PMID:30967997, PMID:32566746 NCBI chr13:62,964,893...63,326,096
Ensembl chr13:62,964,893...63,326,096
JBrowse link
G Brca2 breast cancer 2, early onset susceptibility ISO DNA:mutation
ClinVar Annotator: match by term: Fanconi anemia
ClinVar PMID:9971877, PMID:11030417, PMID:11185744, PMID:12491487, PMID:12955716, PMID:12960223, PMID:15026808, PMID:15070707, PMID:15635067, PMID:15645491, PMID:15876480, PMID:16825431, PMID:17924331, PMID:17972177, PMID:18284688, PMID:18431501, PMID:18627636, PMID:18779604, PMID:19043619, PMID:20104584, PMID:20127978, PMID:20927582, PMID:21120943, PMID:21218378, PMID:21523855, PMID:21548014, PMID:21702907, PMID:21719596, PMID:21990134, PMID:22009639, PMID:22034289, PMID:22126563, PMID:22228431, PMID:22293751, PMID:22486713, PMID:22874498, PMID:23555315, PMID:23704879, PMID:23893897, PMID:24033266, PMID:24055113, PMID:24123850, PMID:24728327, PMID:25085752, PMID:25525159, PMID:25637381, PMID:25682074, PMID:25741868, PMID:26295337, PMID:26296701, PMID:26467025, PMID:26689913, PMID:26834852, PMID:26920070, PMID:27376475, PMID:28222693, PMID:28492532, PMID:28831036, PMID:29394989, PMID:29753700, PMID:29884841, PMID:30254663, PMID:31131967, PMID:12065746 RGD:734658 NCBI chr 5:150,522,297...150,570,147
Ensembl chr 5:150,522,630...150,570,329
JBrowse link
G Brip1 BRCA1 interacting protein C-terminal helicase 1 ISO CTD Direct Evidence: marker/mechanism
ClinVar Annotator: match by term: Fanconi's anemia
ClinVar Annotator: match by term: Fanconi anemia
CTD
ClinVar
PMID:16116421, PMID:16116423, PMID:16116424, PMID:16153896, PMID:17033622, PMID:19127258, PMID:19763819, PMID:20177395, PMID:20639400, PMID:21165771, PMID:21345144, PMID:21964575, PMID:22006311, PMID:24240112, PMID:24556621, PMID:25741868, PMID:25980754, PMID:26315354, PMID:26467025, PMID:26681312, PMID:26822949, PMID:26845104, PMID:26921362, PMID:26968956, PMID:27179029, PMID:28492532, PMID:29368626 NCBI chr11:86,058,136...86,201,215
Ensembl chr11:86,058,138...86,201,193
JBrowse link
G Brk1 BRICK1, SCAR/WAVE actin-nucleating complex subunit ISO ClinVar Annotator: match by term: Fanconi anemia ClinVar PMID:28492532 NCBI chr 6:113,604,772...113,616,951
Ensembl chr 6:113,604,772...113,616,951
JBrowse link
G Fanca Fanconi anemia, complementation group A disease_progression ISO ClinVar Annotator: match by OMIM:227650
ClinVar Annotator: match by term: Fanconi anemia
ClinVar Annotator: match by term: Fanconi's anemia
ClinVar Annotator: match by term: Fanconi anemia, complementation group A
CTD Direct Evidence: marker/mechanism
DNA:deletions, transitions:exon, intron:multiple
DNA:missense mutations, splice-site mutations:exon, intron:multiple
ClinVar
CTD
PMID:1792455, PMID:2472832, PMID:8502512, PMID:08896563, PMID:09371798, PMID:09399890, PMID:9711872, PMID:9721219, PMID:9806548, PMID:9929978, PMID:10090479, PMID:10094191, PMID:10431244, PMID:10521298, PMID:10807541, PMID:11050007, PMID:11063725, PMID:11091222, PMID:11093276, PMID:11344308, PMID:11389461, PMID:11739169, PMID:12031647, PMID:12444097, PMID:12697994, PMID:12955722, PMID:14695169, PMID:15059067, PMID:15383454, PMID:15516848, PMID:15523645, PMID:15591268, PMID:15609317, PMID:15643609, PMID:16015582, PMID:16084127, PMID:16116422, PMID:16397136, PMID:16445838, PMID:16611311, PMID:16720839, PMID:16774934, PMID:16946016, PMID:17726045, PMID:17924555, PMID:18414213, PMID:19278965, PMID:19367192, PMID:19423727, PMID:21273304, PMID:21279724, PMID:21519011, PMID:21520333, PMID:21568838, PMID:21659346, PMID:22482891, PMID:22720145, PMID:22778927, PMID:22950077, PMID:23021409, PMID:23067021, PMID:23613520, PMID:23806870, PMID:23898106, PMID:23934222, PMID:23973728, PMID:24037726, PMID:24082139, PMID:24349332, PMID:24584348, PMID:24689079, PMID:24704046, PMID:24728327, PMID:24989076, PMID:25239263, PMID:25525159, PMID:25533962, PMID:25583207, PMID:25703136, PMID:25741868, PMID:25751062, PMID:26136524, PMID:26181256, PMID:26296701, PMID:26492932, PMID:26689913, PMID:26740942, PMID:26799702, PMID:26841305, PMID:27041517, PMID:27701467, PMID:28102861, PMID:28202063, PMID:28492532, PMID:28600779, PMID:28678401, PMID:28687356, PMID:28717661, PMID:28767289, PMID:28864460, PMID:28973083, PMID:29093742, PMID:29098742, PMID:29269525, PMID:29797310, PMID:29904161, PMID:30031030, PMID:30032139, PMID:30086788, PMID:30311386, PMID:12827451, PMID:11110674, PMID:15523645 RGD:11344919, RGD:11344914, RGD:11344899 NCBI chr 8:123,266,294...123,318,651
Ensembl chr 8:123,268,300...123,318,576
JBrowse link
G Fancb Fanconi anemia, complementation group B ISO ClinVar Annotator: match by term: Fanconi anemia
ClinVar Annotator: match by term: Fanconi's anemia
ClinVar PMID:24033266, PMID:25741868, PMID:28492532 NCBI chr  X:164,980,480...164,997,272
Ensembl chr  X:164,980,592...164,997,272
JBrowse link
G Fancc Fanconi anemia, complementation group C onset ISO ClinVar Annotator: match by term: Fanconi Anemia
ClinVar Annotator: match by term: Fanconi anemia
ClinVar Annotator: match by term: Fanconi's anemia
CTD Direct Evidence: marker/mechanism
DNA:deletion: :322delG (human)
DNA:insertion, missense, substitution mutations:cds:c.455_456dupA,c.996G>A, c.1390C>T(p.Q464X)(human)
ClinVar
CTD
PMID:1574115, PMID:1641028, PMID:7492758, PMID:7689011, PMID:8081385, PMID:8103176, PMID:8128956, PMID:08348157, PMID:8499901, PMID:8613549, PMID:8621788, PMID:8639804, PMID:8703809, PMID:8829660, PMID:08844212, PMID:8882868, PMID:9207444, PMID:9242535, PMID:9398857, PMID:09452030, PMID:9521584, PMID:09616183, PMID:10666230, PMID:11050007, PMID:11110674, PMID:11427142, PMID:11520787, PMID:12093742, PMID:12670332, PMID:12750283, PMID:14695169, PMID:14726700, PMID:15364573, PMID:15516848, PMID:15695377, PMID:16015582, PMID:16429406, PMID:17909071, PMID:17924555, PMID:19622403, PMID:20301575, PMID:20507306, PMID:20509860, PMID:20869034, PMID:21520333, PMID:21659346, PMID:22482891, PMID:22701786, PMID:22720145, PMID:22778927, PMID:23028338, PMID:23613520, PMID:23634996, PMID:24033266, PMID:24469828, PMID:24584348, PMID:24728327, PMID:25168418, PMID:25741868, PMID:25801821, PMID:26466335, PMID:26681312, PMID:26689913, PMID:26740942, PMID:26778106, PMID:26822237, PMID:26990548, PMID:27133164, PMID:27153395, PMID:27577878, PMID:28125075, PMID:28125078, PMID:28259476, PMID:28425259, PMID:28492532, PMID:28678401, PMID:28717661, PMID:28767289, PMID:29038235, PMID:29439820, PMID:29753700, PMID:29922827, PMID:30031030, PMID:30967997, PMID:31300551, PMID:32566746, PMID:11110674, PMID:16429406 RGD:11344914, RGD:11041907 NCBI chr13:63,301,334...63,497,292
Ensembl chr13:63,285,043...63,497,278
JBrowse link
G Fancd2 Fanconi anemia, complementation group D2 ISO ClinVar Annotator: match by term: Fanconi anemia
CTD Direct Evidence: marker/mechanism
DNA:missense mutations, nonsense mutation, splice-site mutation: :multiple
ClinVar
CTD
PMID:11239453, PMID:14667412, PMID:17308347, PMID:17436244, PMID:21356188, PMID:22720145, PMID:22828868, PMID:23613520, PMID:24033266, PMID:24728327, PMID:25703294, PMID:25741868, PMID:27041517, PMID:28202063, PMID:28492532, PMID:28678401, PMID:19287902, PMID:11239453 RGD:11344904, RGD:1601137 NCBI chr 6:113,531,640...113,597,020
Ensembl chr 6:113,531,682...113,597,017
JBrowse link
G Fancd2os Fancd2 opposite strand ISO ClinVar Annotator: match by term: Fanconi anemia ClinVar PMID:24728327, PMID:25741868, PMID:28492532 NCBI chr 6:113,596,761...113,600,715
Ensembl chr 6:113,596,761...113,600,715
JBrowse link
G Fance Fanconi anemia, complementation group E ISO ClinVar Annotator: match by term: Fanconi anemia ClinVar NCBI chr17:28,313,530...28,326,574
Ensembl chr17:28,313,519...28,326,572
JBrowse link
G Fancf Fanconi anemia, complementation group F ISO ClinVar Annotator: match by term: Fanconi's anemia
ClinVar Annotator: match by term: Fanconi anemia
ClinVar PMID:9382107, PMID:10615118, PMID:15262960, PMID:16084127, PMID:17924555, PMID:24728327, PMID:25741868, PMID:26033879, PMID:27714961, PMID:28102861, PMID:28492532 NCBI chr 7:51,860,577...51,862,267
Ensembl chr 7:51,860,577...51,862,267
JBrowse link
G Fancg Fanconi anemia, complementation group G ISO ClinVar Annotator: match by term: Fanconi's anemia
ClinVar Annotator: match by term: Fanconi anemia
CTD Direct Evidence: marker/mechanism
ClinVar
CTD
PMID:9806458, PMID:09806548, PMID:10807541, PMID:10961856, PMID:11093276, PMID:11126723, PMID:11438206, PMID:12552564, PMID:12673805, PMID:15657175, PMID:16084127, PMID:16643430, PMID:17924555, PMID:20301575, PMID:22778927, PMID:23613520, PMID:24033266, PMID:24136620, PMID:24584348, PMID:24728327, PMID:25703136, PMID:25741868, PMID:26689913, PMID:26968956, PMID:27041517, PMID:28102861, PMID:28202063, PMID:28492532, PMID:28717661, PMID:30031030 NCBI chr 4:43,002,337...43,010,567
Ensembl chr 4:43,002,343...43,010,506
JBrowse link
G Fanci Fanconi anemia, complementation group I ISO ClinVar Annotator: match by term: Fanconi's anemia
ClinVar Annotator: match by term: Fanconi anemia
DNA:mutations: :multiple
ClinVar PMID:15477547, PMID:16177225, PMID:17088268, PMID:17426723, PMID:17438011, PMID:17452773, PMID:17460694, PMID:17950645, PMID:17980715, PMID:18414213, PMID:18991199, PMID:19010300, PMID:20691285, PMID:21038416, PMID:21228398, PMID:22720145, PMID:23613520, PMID:23783014, PMID:24033266, PMID:24989076, PMID:25462018, PMID:25741868, PMID:26104464, PMID:26296701, PMID:26467025, PMID:26590883, PMID:28492532, PMID:28678401, PMID:28878254, PMID:29439820, PMID:26590883 RGD:11344925 NCBI chr 7:79,392,312...79,450,266
Ensembl chr 7:79,391,929...79,450,264
JBrowse link
G Fancl Fanconi anemia, complementation group L ISO ClinVar Annotator: match by term: Fanconi's anemia
ClinVar Annotator: match by term: Fanconi anemia
CTD Direct Evidence: marker/mechanism
ClinVar
CTD
PMID:12973351, PMID:19405097, PMID:21279724, PMID:23613520, PMID:24033266, PMID:25239263, PMID:25659033, PMID:25741868, PMID:26149689, PMID:26822237, PMID:26822949, PMID:27153395, PMID:27986371, PMID:28492532, PMID:29335925, PMID:30995915, PMID:31300551 NCBI chr11:26,387,084...26,471,883
Ensembl chr11:26,386,135...26,471,876
JBrowse link
G Fancm Fanconi anemia, complementation group M ISO ClinVar Annotator: match by term: Fanconi anemia
CTD Direct Evidence: marker/mechanism
ClinVar
CTD
PMID:2867840, PMID:16116422, PMID:17289582, PMID:18174376, PMID:18414213, PMID:19379763, PMID:19737859, PMID:19763152, PMID:20307669, PMID:21681190, PMID:22406018, PMID:23932590, PMID:24003026, PMID:25288723, PMID:25741868, PMID:26067930, PMID:26094658, PMID:26130695, PMID:26296701, PMID:26483394, PMID:26689913, PMID:26740942, PMID:26822949, PMID:28033443, PMID:28492532, PMID:28678401, PMID:28702895, PMID:28837157, PMID:28837162, PMID:28881617, PMID:29231814, PMID:29287190, PMID:29351780, PMID:29895858, PMID:30075111, PMID:30426508, PMID:30995915, PMID:31700994, PMID:32566746 NCBI chr12:65,074,110...65,131,842
Ensembl chr12:65,075,603...65,132,058
JBrowse link
G Flt3l FMS-like tyrosine kinase 3 ligand ISO protein:increased expression:serum,plasma: RGD PMID:7492765 RGD:11049505 NCBI chr 7:45,131,183...45,136,490
Ensembl chr 7:45,129,788...45,136,432
JBrowse link
G Gstm1 glutathione S-transferase, mu 1 disease_progression ISO RGD PMID:16173971 RGD:10450839 NCBI chr 3:108,012,250...108,017,973
Ensembl chr 3:108,012,255...108,017,973
JBrowse link
G Gstt1 glutathione S-transferase, theta 1 treatment ISO RGD PMID:16173971 RGD:10450839 NCBI chr10:75,783,813...75,798,584
Ensembl chr10:75,783,813...75,798,584
JBrowse link
G Ifng interferon gamma ISO protein:increased expression:plasma RGD PMID:24021704 RGD:11049161 NCBI chr10:118,441,046...118,445,894
Ensembl chr10:118,441,046...118,445,892
JBrowse link
G Il10 interleukin 10 ISO protein:increased expression:plasma RGD PMID:24021704 RGD:11049161 NCBI chr 1:131,019,845...131,024,970
Ensembl chr 1:131,019,845...131,024,974
JBrowse link
G Mc1r melanocortin 1 receptor ISO ClinVar Annotator: match by term: Fanconi anemia ClinVar PMID:9721219, PMID:28492532, PMID:29098742 NCBI chr 8:123,407,082...123,410,744
Ensembl chr 8:123,407,107...123,410,744
JBrowse link
G Mx2 MX dynamin-like GTPase 2 ISO CTD Direct Evidence: marker/mechanism CTD PMID:9389754 NCBI chr16:97,536,081...97,560,901
Ensembl chr16:97,535,308...97,560,900
JBrowse link
G Palb2 partner and localizer of BRCA2 ISO ClinVar Annotator: match by term: Fanconi anemia ClinVar PMID:17200668, PMID:18302019, PMID:25741868, PMID:26467025, PMID:26564480, PMID:28492532 NCBI chr 7:122,107,262...122,132,980
Ensembl chr 7:122,107,262...122,132,985
JBrowse link
G Polg polymerase (DNA directed), gamma ISO ClinVar Annotator: match by term: Fanconi anemia
ClinVar Annotator: match by term: Fanconi's anemia
ClinVar PMID:15477547, PMID:16177225, PMID:17088268, PMID:17426723, PMID:17438011, PMID:17950645, PMID:17980715, PMID:18414213, PMID:18991199, PMID:19010300, PMID:20691285, PMID:21038416, PMID:21228398, PMID:23783014, PMID:24033266, PMID:25462018, PMID:25741868, PMID:26104464, PMID:26467025, PMID:28492532 NCBI chr 7:79,446,231...79,467,911
Ensembl chr 7:79,446,231...79,466,362
JBrowse link
G Prf1 perforin 1 (pore forming protein) ISO RGD PMID:21542827 RGD:6482802 NCBI chr10:61,297,751...61,304,684
Ensembl chr10:61,297,833...61,304,680
JBrowse link
G Ptch1 patched 1 ISO ClinVar Annotator: match by term: Fanconi anemia ClinVar PMID:28492532 NCBI chr13:63,508,328...63,573,460
Ensembl chr13:63,508,328...63,573,598
JBrowse link
G Rad51c RAD51 paralog C ISO CTD Direct Evidence: marker/mechanism
ClinVar Annotator: match by term: Fanconi anemia
ClinVar Annotator: match by term: Fanconi's anemia
CTD
ClinVar
PMID:20400963, PMID:20400964, PMID:20697805, PMID:20723205, PMID:21537932, PMID:21750962, PMID:21980511, PMID:21990120, PMID:22167183, PMID:22370629, PMID:22451500, PMID:22476429, PMID:22725699, PMID:23117857, PMID:24082139, PMID:24504028, PMID:25086635, PMID:25470109, PMID:25741868, PMID:26057125, PMID:26261251, PMID:26406419, PMID:26467025, PMID:26483394, PMID:26740214, PMID:27153395, PMID:28492532 NCBI chr11:87,376,645...87,404,954
Ensembl chr11:87,376,645...87,404,954
JBrowse link
G Slx4 SLX4 structure-specific endonuclease subunit homolog (S. cerevisiae) ISO ClinVar Annotator: match by term: Fanconi's anemia
ClinVar Annotator: match by term: Fanconi anemia
CTD Direct Evidence: marker/mechanism
ClinVar
CTD
PMID:19596235, PMID:19596236, PMID:21240275, PMID:21240276, PMID:21240277, PMID:21805310, PMID:22383991, PMID:22401137, PMID:22911665, PMID:23211700, PMID:23840564, PMID:24037726, PMID:24763404, PMID:25288723, PMID:25326635, PMID:25741868, PMID:26201965, PMID:26824983, PMID:28125078, PMID:28202063, PMID:28492532, PMID:28678401, PMID:28717660, PMID:29868112 NCBI chr16:3,979,105...4,003,829
Ensembl chr16:3,979,105...4,003,770
JBrowse link
G Spire2 spire type actin nucleation factor 2 ISO ClinVar Annotator: match by term: Fanconi anemia ClinVar PMID:9721219, PMID:28492532, PMID:29098742 NCBI chr 8:123,332,713...123,369,518
Ensembl chr 8:123,332,713...123,369,515
JBrowse link
G Tcf25 transcription factor 25 (basic helix-loop-helix) ISO ClinVar Annotator: match by term: Fanconi anemia ClinVar PMID:9721219, PMID:28492532, PMID:29098742 NCBI chr 8:123,370,772...123,404,174
Ensembl chr 8:123,373,753...123,403,835
JBrowse link
G Tnf tumor necrosis factor ISO protein:increased expression:plasma
CTD Direct Evidence: marker/mechanism
CTD PMID:22628295, PMID:8438880, PMID:24021704 RGD:10450524, RGD:11049161 NCBI chr17:35,199,367...35,202,007
Ensembl chr17:35,199,381...35,202,007
JBrowse link
G Usp1 ubiquitin specific peptidase 1 IEA MouseDO NCBI chr 4:98,923,810...98,935,543
Ensembl chr 4:98,923,810...98,935,543
JBrowse link
G Vcp valosin containing protein ISO ClinVar Annotator: match by term: Fanconi anemia ClinVar PMID:11438206, PMID:16643430, PMID:24728327, PMID:25741868, PMID:28492532 NCBI chr 4:42,979,964...43,000,507
Ensembl chr 4:42,979,963...43,000,507
JBrowse link
G Vhl von Hippel-Lindau tumor suppressor ISO ClinVar Annotator: match by term: Fanconi anemia ClinVar PMID:28492532 NCBI chr 6:113,623,994...113,631,634
Ensembl chr 6:113,623,959...113,631,633
JBrowse link
G Vrk2 vaccinia related kinase 2 ISO ClinVar Annotator: match by term: Fanconi's anemia
ClinVar Annotator: match by term: Fanconi anemia
ClinVar PMID:19405097, PMID:21279724, PMID:23613520, PMID:24033266, PMID:25239263, PMID:25659033, PMID:25741868, PMID:26822237, PMID:26822949, PMID:27153395, PMID:28492532 NCBI chr11:26,471,398...26,594,012
Ensembl chr11:26,471,322...26,593,999
JBrowse link
G Zfp276 zinc finger protein (C2H2 type) 276 ISO ClinVar Annotator: match by term: Fanconi's anemia
ClinVar Annotator: match by term: Fanconi anemia
ClinVar PMID:9371798, PMID:9721219, PMID:10090479, PMID:10094191, PMID:10521298, PMID:11091222, PMID:12444097, PMID:15059067, PMID:15523645, PMID:15643609, PMID:16084127, PMID:17924555, PMID:18414213, PMID:19278965, PMID:19367192, PMID:21273304, PMID:23021409, PMID:23613520, PMID:23973728, PMID:24037726, PMID:24584348, PMID:24728327, PMID:25741868, PMID:26296701, PMID:26689913, PMID:28102861, PMID:28202063, PMID:28492532, PMID:28717661, PMID:28767289, PMID:29098742, PMID:29904161, PMID:30032139 NCBI chr 8:123,254,195...123,270,551
Ensembl chr 8:123,254,195...123,269,745
JBrowse link
Fanconi anemia complementation group A term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Aopep aminopeptidase O ISO ClinVar Annotator: match by term: Fanconi anemia, complementation group A ClinVar PMID:08844212, PMID:12670332, PMID:15695377, PMID:24728327, PMID:25741868, PMID:26689913, PMID:28492532, PMID:30031030, PMID:32566746 NCBI chr13:62,964,893...63,326,096
Ensembl chr13:62,964,893...63,326,096
JBrowse link
G Brca1 breast cancer 1, early onset ISO ClinVar Annotator: match by term: Fanconi anemia, complementation group A ClinVar PMID:11157798, PMID:11802209, PMID:12496476, PMID:15235020, PMID:17308087, PMID:17574969, PMID:17924331, PMID:19200354, PMID:19563646, PMID:20516115, PMID:21324516, PMID:21356067, PMID:21473589, PMID:21702907, PMID:21965345, PMID:21990134, PMID:22889855, PMID:23867111, PMID:24055113, PMID:24569164, PMID:25472942, PMID:25741868, PMID:26467025, PMID:28265380, PMID:28324225, PMID:28477318, PMID:28492532, PMID:28724667, PMID:28831036, PMID:29712865, PMID:30103829 NCBI chr11:101,488,761...101,551,955
Ensembl chr11:101,488,764...101,551,955
JBrowse link
G Fanca Fanconi anemia, complementation group A ISO
IEA
ClinVar Annotator: match by term: Fanconi anemia, complementation group A
OMIM:227650
ClinVar
OMIM
MouseDO
PMID:1792455, PMID:2339692, PMID:2472832, PMID:8502512, PMID:08896563, PMID:08896564, PMID:9371798, PMID:09399890, PMID:9711872, PMID:09721219, PMID:9806548, PMID:9929978, PMID:10090479, PMID:10094191, PMID:10431244, PMID:10521298, PMID:10807541, PMID:10862090, PMID:11050007, PMID:11063725, PMID:11091222, PMID:11093276, PMID:11344308, PMID:11389461, PMID:11739169, PMID:12031647, PMID:12444097, PMID:12697994, PMID:12827451, PMID:12955722, PMID:14695169, PMID:15059067, PMID:15383454, PMID:15516848, PMID:15522956, PMID:15523645, PMID:15591268, PMID:15609317, PMID:15643609, PMID:16084127, PMID:16116422, PMID:16397136, PMID:16611311, PMID:16720839, PMID:16774934, PMID:16946016, PMID:17327415, PMID:17726045, PMID:17924555, PMID:18414213, PMID:19109555, PMID:19139070, PMID:19278965, PMID:19367192, PMID:19423727, PMID:20435624, PMID:21273304, PMID:21519011, PMID:21520333, PMID:21568838, PMID:21659346, PMID:22778927, PMID:22950077, PMID:23021409, PMID:23067021, PMID:23613520, PMID:23806870, PMID:23898106, PMID:23934222, PMID:23973728, PMID:24037726, PMID:24082139, PMID:24349332, PMID:24584348, PMID:24704046, PMID:24728327, PMID:24989076, PMID:25168418, PMID:25239263, PMID:25288723, PMID:25525159, PMID:25533962, PMID:25583207, PMID:25741868, PMID:25751062, PMID:25953249, PMID:26136524, PMID:26140431, PMID:26181256, PMID:26296701, PMID:26492932, PMID:26580448, PMID:26689913, PMID:26740942, PMID:26799702, PMID:27041517, PMID:27701467, PMID:28102861, PMID:28202063, PMID:28492532, PMID:28600779, PMID:28678401, PMID:28717661, PMID:28767289, PMID:28864460, PMID:28973083, PMID:29093742, PMID:29098742, PMID:29269525, PMID:29904161, PMID:30032139, PMID:30086788, PMID:30311386 NCBI chr 8:123,266,294...123,318,651
Ensembl chr 8:123,268,300...123,318,576
JBrowse link
G Fancb Fanconi anemia, complementation group B ISO ClinVar Annotator: match by term: Fanconi anemia, complementation group A ClinVar PMID:25741868, PMID:28492532 NCBI chr  X:164,980,480...164,997,272
Ensembl chr  X:164,980,592...164,997,272
JBrowse link
G Fancc Fanconi anemia, complementation group C ISO ClinVar Annotator: match by term: Fanconi anemia, complementation group A ClinVar PMID:08128956, PMID:08348157, PMID:08844212, PMID:8882868, PMID:9521584, PMID:09616183, PMID:12670332, PMID:14695169, PMID:14726700, PMID:15695377, PMID:23028338, PMID:24033266, PMID:24728327, PMID:25741868, PMID:26689913, PMID:26740942, PMID:27153395, PMID:28492532, PMID:28767289, PMID:30031030, PMID:32566746 NCBI chr13:63,301,334...63,497,292
Ensembl chr13:63,285,043...63,497,278
JBrowse link
G Fancd2 Fanconi anemia, complementation group D2 ISO ClinVar Annotator: match by term: Fanconi anemia, complementation group A ClinVar PMID:24728327, PMID:25168418, PMID:25741868, PMID:28492532 NCBI chr 6:113,531,640...113,597,020
Ensembl chr 6:113,531,682...113,597,017
JBrowse link
G Fancd2os Fancd2 opposite strand ISO ClinVar Annotator: match by term: Fanconi anemia, complementation group A ClinVar NCBI chr 6:113,596,761...113,600,715
Ensembl chr 6:113,596,761...113,600,715
JBrowse link
G Fancg Fanconi anemia, complementation group G ISO ClinVar Annotator: match by term: Fanconi anemia, complementation group A ClinVar PMID:28492532 NCBI chr 4:43,002,337...43,010,567
Ensembl chr 4:43,002,343...43,010,506
JBrowse link
G Fanci Fanconi anemia, complementation group I ISO ClinVar Annotator: match by term: Fanconi anemia, complementation group A ClinVar PMID:25741868, PMID:28492532 NCBI chr 7:79,392,312...79,450,266
Ensembl chr 7:79,391,929...79,450,264
JBrowse link
G Fancl Fanconi anemia, complementation group L ISO ClinVar Annotator: match by term: Fanconi anemia, complementation group A ClinVar PMID:19405097, PMID:21279724, PMID:25741868, PMID:26822237, PMID:26822949, PMID:28492532 NCBI chr11:26,387,084...26,471,883
Ensembl chr11:26,386,135...26,471,876
JBrowse link
G Fancm Fanconi anemia, complementation group M ISO ClinVar Annotator: match by term: Fanconi anemia, complementation group A ClinVar PMID:17289582, PMID:18174376, PMID:19379763, PMID:23932590, PMID:24003026, PMID:25288723, PMID:25741868, PMID:28492532, PMID:28837162, PMID:29231814, PMID:29351780, PMID:30075111, PMID:31700994 NCBI chr12:65,074,110...65,131,842
Ensembl chr12:65,075,603...65,132,058
JBrowse link
G Slx4 SLX4 structure-specific endonuclease subunit homolog (S. cerevisiae) ISO ClinVar Annotator: match by term: Fanconi anemia, complementation group A ClinVar PMID:22401137, PMID:22911665, PMID:23211700, PMID:23840564, PMID:25741868, PMID:26201965, PMID:28202063, PMID:28492532, PMID:28717660 NCBI chr16:3,979,105...4,003,829
Ensembl chr16:3,979,105...4,003,770
JBrowse link
G Vrk2 vaccinia related kinase 2 ISO ClinVar Annotator: match by term: Fanconi anemia, complementation group A ClinVar PMID:19405097, PMID:21279724, PMID:25741868, PMID:26822237, PMID:26822949, PMID:28492532 NCBI chr11:26,471,398...26,594,012
Ensembl chr11:26,471,322...26,593,999
JBrowse link
G Zfp276 zinc finger protein (C2H2 type) 276 ISO ClinVar Annotator: match by term: Fanconi anemia, complementation group A ClinVar PMID:9371798, PMID:09399890, PMID:09721219, PMID:10090479, PMID:10094191, PMID:10521298, PMID:11091222, PMID:12444097, PMID:12955722, PMID:15059067, PMID:15522956, PMID:15523645, PMID:15643609, PMID:16084127, PMID:17924555, PMID:18414213, PMID:19109555, PMID:19139070, PMID:19278965, PMID:19367192, PMID:21273304, PMID:22778927, PMID:23021409, PMID:23613520, PMID:23973728, PMID:24037726, PMID:24584348, PMID:24728327, PMID:25168418, PMID:25741868, PMID:26296701, PMID:26689913, PMID:27041517, PMID:28102861, PMID:28202063, PMID:28492532, PMID:28717661, PMID:28767289, PMID:28864460, PMID:29098742, PMID:29904161, PMID:30032139 NCBI chr 8:123,254,195...123,270,551
Ensembl chr 8:123,254,195...123,269,745
JBrowse link
Fanconi anemia complementation group B term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Fancb Fanconi anemia, complementation group B ISO ClinVar Annotator: match by term: Fanconi anemia, complementation group B
ClinVar Annotator: match by null
OMIM
ClinVar
PMID:8368240, PMID:15502827, PMID:16679491, PMID:17924555, PMID:21910217, PMID:23613520, PMID:24033266, PMID:25168418, PMID:25741868, PMID:28492532 NCBI chr  X:164,980,480...164,997,272
Ensembl chr  X:164,980,592...164,997,272
JBrowse link
Fanconi anemia complementation group C term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Aopep aminopeptidase O ISO ClinVar Annotator: match by term: Fanconi anemia, complementation group C ClinVar PMID:1574115, PMID:1641028, PMID:8103176, PMID:8128956, PMID:8348157, PMID:8499901, PMID:8613549, PMID:8621788, PMID:8703809, PMID:8829660, PMID:08844212, PMID:8882868, PMID:9207444, PMID:9242535, PMID:9398857, PMID:10431244, PMID:11050007, PMID:12093742, PMID:12670332, PMID:14695169, PMID:15364573, PMID:15695377, PMID:16015582, PMID:16429406, PMID:17924555, PMID:19278965, PMID:20869034, PMID:22720145, PMID:22778927, PMID:23028338, PMID:23634996, PMID:24033266, PMID:24469828, PMID:24584348, PMID:24728327, PMID:25741868, PMID:26466335, PMID:26681312, PMID:26689913, PMID:26740942, PMID:26822237, PMID:28425259, PMID:28492532, PMID:28767289, PMID:29753700, PMID:29922827, PMID:30031030, PMID:30967997 NCBI chr13:62,964,893...63,326,096
Ensembl chr13:62,964,893...63,326,096
JBrowse link
G Fancc Fanconi anemia, complementation group C ISO
IEA
ClinVar Annotator: match by term: Fanconi anemia, complementation group C
OMIM:227645
ClinVar Annotator: match by OMIM:227645
ClinVar Annotator: match by null
OMIM
ClinVar
MouseDO
PMID:1574115, PMID:1641028, PMID:7492758, PMID:7689011, PMID:8081385, PMID:8103176, PMID:8128956, PMID:08348157, PMID:8499901, PMID:8613549, PMID:8621788, PMID:8639804, PMID:8703809, PMID:8829660, PMID:08844212, PMID:8882868, PMID:9207444, PMID:9242535, PMID:9398857, PMID:09452030, PMID:9521584, PMID:09616183, PMID:10431244, PMID:10666230, PMID:10994546, PMID:11050007, PMID:11110674, PMID:11427142, PMID:11520787, PMID:12093742, PMID:12670332, PMID:14695169, PMID:14726700, PMID:15364573, PMID:15516848, PMID:15695377, PMID:16015582, PMID:16429406, PMID:17909071, PMID:17924555, PMID:19278965, PMID:19622403, PMID:20301575, PMID:20507306, PMID:20509860, PMID:20869034, PMID:21659346, PMID:22701786, PMID:22720145, PMID:22778927, PMID:23028338, PMID:23613520, PMID:23634996, PMID:23934222, PMID:24033266, PMID:24469828, PMID:24584348, PMID:24728327, PMID:25168418, PMID:25741868, PMID:25801821, PMID:26466335, PMID:26681312, PMID:26689913, PMID:26740942, PMID:26778106, PMID:26822237, PMID:26990548, PMID:27133164, PMID:27153395, PMID:27577878, PMID:28125075, PMID:28125078, PMID:28259476, PMID:28425259, PMID:28492532, PMID:28678401, PMID:28717661, PMID:28767289, PMID:29038235, PMID:29439820, PMID:29753700, PMID:29922827, PMID:30031030, PMID:30967997, PMID:31300551 NCBI chr13:63,301,334...63,497,292
Ensembl chr13:63,285,043...63,497,278
JBrowse link
Fanconi anemia complementation group D1 term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Brca2 breast cancer 2, early onset ISO
IEA
ClinVar Annotator: match by term: Fanconi anemia, complementation group D1
OMIM:605724
ClinVar Annotator: match by null
OMIM
ClinVar
MouseDO
PMID:18, PMID:1234, PMID:1232165, PMID:1517275, PMID:1684755, PMID:1843150, PMID:1990134, PMID:2073695, PMID:2199013, PMID:2928257, PMID:3108138, PMID:4055113, PMID:7924331, PMID:8075631, PMID:8415037, PMID:8524414, PMID:8640236, PMID:8673090, PMID:8673091, PMID:8673092, PMID:8705994, PMID:8758903, PMID:8840963, PMID:8841191, PMID:8841192, PMID:8896551, PMID:9042907, PMID:9042909, PMID:9126734, PMID:9145676, PMID:9150152, PMID:9150154, PMID:9150172, PMID:9667259, PMID:9758598, PMID:9761393, PMID:9771877, PMID:9792861, PMID:9971877, PMID:10359546, PMID:10399947, PMID:10417300, PMID:10433620, PMID:10449599, PMID:10453741, PMID:10464609, PMID:10534775, PMID:10551859, PMID:10570174, PMID:10644434, PMID:10699917, PMID:10717622, PMID:10728701, PMID:10755399, PMID:10800284, PMID:10882858, PMID:10923033, PMID:10969800, PMID:10978364, PMID:11030417, PMID:11030418, PMID:11062481, PMID:11106241, PMID:11149425, PMID:11180449, PMID:11185744, PMID:11241844, PMID:11304778, PMID:11307153, PMID:11389159, PMID:11400546, PMID:11447276, PMID:11556836, PMID:11595708, PMID:11698567, PMID:11710835, PMID:11802209, PMID:11843247, PMID:11873550, PMID:11927503, PMID:11929857, PMID:11948123, PMID:11950811, PMID:12065746, PMID:12097257, PMID:12097290, PMID:12100744, PMID:12161607, PMID:12204006, PMID:12215251, PMID:12228710, PMID:12237285, PMID:12373604, PMID:12442171, PMID:12442274, PMID:12453858, PMID:12473589, PMID:12474142, PMID:12491487, PMID:12491499, PMID:12527904, PMID:12552570, PMID:12556369, PMID:12624724, PMID:12670525, PMID:12684407, PMID:12750298, PMID:12754708, PMID:12759930, PMID:12815053, PMID:12845657, PMID:12942367, PMID:12955716, PMID:12955719, PMID:12960223, PMID:14555511, PMID:14559878, PMID:14576434, PMID:14647210, PMID:14647438, PMID:14670928, PMID:14684619, PMID:14732925, PMID:14973102, PMID:15004464, PMID:15026808, PMID:15070707, PMID:15115758, PMID:15117986, PMID:15131399, PMID:15146557, PMID:15168169, PMID:15172753, PMID:15235023, PMID:15290653, PMID:15317758, PMID:15365993, PMID:15382066, PMID:15533909, PMID:15617999, PMID:15635067, PMID:15645491, PMID:15689453, PMID:15695382, PMID:15744044, PMID:15799620, PMID:15800311, PMID:15800615, PMID:15806175, PMID:15876480, PMID:15918047, PMID:15955690, PMID:15983021, PMID:15994883, PMID:16030099, PMID:16047333, PMID:16115142, PMID:16162645, PMID:16168118, PMID:16168123, PMID:16234499, PMID:16261408, PMID:16284991, PMID:16389418, PMID:16455195, PMID:16489001, PMID:16550498, PMID:16683254, PMID:16685647, PMID:16741161, PMID:16758124, PMID:16760289, PMID:16792514, PMID:16825431, PMID:16826315, PMID:16847550, PMID:16905680, PMID:16912212, PMID:16920162, PMID:16931905, PMID:16949048, PMID:17018160, PMID:17026620, PMID:17087817, PMID:17100994, PMID:17148771, PMID:17233897, PMID:17250666, PMID:17257844, PMID:17262179, PMID:17289875, PMID:17308087, PMID:17333343, PMID:17341484, PMID:17453335, PMID:17503080, PMID:17513806, PMID:17515903, PMID:17591843, PMID:17591940, PMID:17592676, PMID:17624602, PMID:17657584, PMID:17686308, PMID:17724471, PMID:17767707, PMID:17899372, PMID:17924331, PMID:17925560, PMID:17971607, PMID:17972177, PMID:17997147, PMID:18006916, PMID:18042939, PMID:18092194, PMID:18176857, PMID:18268356, PMID:18284688, PMID:18312450, PMID:18375895, PMID:18403564, PMID:18418466, PMID:18431501, PMID:18451181, PMID:18465347, PMID:18489799, PMID:18497862, PMID:18559594, PMID:18593900, PMID:18607349, PMID:18627636, PMID:18627637, PMID:18693280, PMID:18703817, PMID:18724707, PMID:18779604, PMID:18824701, PMID:18844490, PMID:18951449, PMID:18951461, PMID:19016756, PMID:19030985, PMID:19043619, PMID:19188187, PMID:19200354, PMID:19229607, PMID:19393826, PMID:19471317, PMID:19473207, PMID:19491284, PMID:19499246, PMID:19540122, PMID:19619314, PMID:19656415, PMID:19747923, PMID:19795481, PMID:19799798, PMID:19861517, PMID:19863560, PMID:19941162, PMID:20010525, PMID:20041885, PMID:20054658, PMID:20104584, PMID:20127978, PMID:20135345, PMID:20167696, PMID:20195775, PMID:20215541, PMID:20216074, PMID:20301425, PMID:20380699, PMID:20383589, PMID:20589654, PMID:20608899, PMID:20614180, PMID:20683152, PMID:20694749, PMID:20736950, PMID:20858050, PMID:20887823, PMID:20927582, PMID:20960228, PMID:21042765, PMID:21120943, PMID:21156238, PMID:21203900, PMID:21218378, PMID:21232165, PMID:21233401, PMID:21279724, PMID:21324516, PMID:21356067, PMID:21394826, PMID:21465317, PMID:21497495, PMID:21520273, PMID:21520333, PMID:21548014, PMID:21638052, PMID:21671020, PMID:21673748, PMID:21702907, PMID:21719596, PMID:21769658, PMID:21789034, PMID:21939546, PMID:21952622, PMID:21965345, PMID:21990134, PMID:21990165, PMID:22006311, PMID:22009639, PMID:22034289, PMID:22126563, PMID:22144684, PMID:22160602, PMID:22217648, PMID:22366370, PMID:22425665, PMID:22430266, PMID:22460208, PMID:22476429, PMID:22486713, PMID:22505045, PMID:22535016, PMID:22632462, PMID:22655046, PMID:22666503, PMID:22678057, PMID:22684231, PMID:22703879, PMID:22711857, PMID:22713736, PMID:22720145, PMID:22729890, PMID:22752604, PMID:22753899, PMID:22762150, PMID:22798144, PMID:22811390, PMID:22848303, PMID:22874498, PMID:22875147, PMID:22913592, PMID:22921157, PMID:22921312, PMID:22923021, PMID:22962691, PMID:22970155, PMID:22977638, PMID:22995991, PMID:23071527, PMID:23096105, PMID:23096355, PMID:23108138, PMID:23199084, PMID:23231788, PMID:23249957, PMID:23318356, PMID:23320992, PMID:23328489, PMID:23341105, PMID:23415752, PMID:23469205, PMID:23479189, PMID:23531862, PMID:23535729, PMID:23555315, PMID:23593081, PMID:23621881, PMID:23633455, PMID:23635950, PMID:23658460, PMID:23683081, PMID:23704879, PMID:23729402, PMID:23767878, PMID:23884708, PMID:23893897, PMID:23929434, PMID:23940062, PMID:23942203, PMID:23960188, PMID:23983145, PMID:24033266, PMID:24055113, PMID:24082139, PMID:24094589, PMID:24123850, PMID:24156927, PMID:24301060, PMID:24312913, PMID:24323938, PMID:24337145, PMID:24348212, PMID:24372583, PMID:24448499, PMID:24489791, PMID:24504028, PMID:24556621, PMID:24607278, PMID:24618965, PMID:24728189, PMID:24728327, PMID:24737347, PMID:24814045, PMID:24817641, PMID:24884479, PMID:24916970, PMID:25011685, PMID:25066507, PMID:25085752, PMID:25136594, PMID:25146914, PMID:25186627, PMID:25203624, PMID:25233892, PMID:25348012, PMID:25382762, PMID:25395318, PMID:25452441, PMID:25479140, PMID:25525159, PMID:25556971, PMID:25569433, PMID:25637381, PMID:25682074, PMID:25741868, PMID:25777348, PMID:25782689, PMID:25801821, PMID:25802882, PMID:25863477, PMID:25896959, PMID:25948282, PMID:25980754, PMID:26064523, PMID:26155992, PMID:26183948, PMID:26187060, PMID:26207792, PMID:26287763, PMID:26295337, PMID:26296701, PMID:26306726, PMID:26315209, PMID:26332594, PMID:26440929, PMID:26455428, PMID:26467025, PMID:26483394, PMID:26517685, PMID:26541979, PMID:26577449, PMID:26580448, PMID:26586665, PMID:26657402, PMID:26681312, PMID:26681682, PMID:26689913, PMID:26692440, PMID:26709275, PMID:26724258, PMID:26740942, PMID:26761715, PMID:26780556, PMID:26834852, PMID:26845104, PMID:26848529, PMID:26867194, PMID:26898890, PMID:26920070, PMID:26968956, PMID:27062684, PMID:27124784, PMID:27153395, PMID:27257965, PMID:27376475, PMID:27383479, PMID:27393621, PMID:27469594, PMID:27495310, PMID:27498913, PMID:27516001, PMID:27616075, PMID:27628236, PMID:27633797, PMID:27658390, PMID:27701467, PMID:27732944, PMID:27741520, PMID:27767231, PMID:27831900, PMID:27907908, PMID:28008555, PMID:28111427, PMID:28132688, PMID:28152038, PMID:28222693, PMID:28231738, PMID:28288110, PMID:28294317, PMID:28301460, PMID:28324225, PMID:28339459, PMID:28346442, PMID:28364669, PMID:28422718, PMID:28439188, PMID:28477318, PMID:28492532, PMID:28541631, PMID:28640387, PMID:28664449, PMID:28678401, PMID:28724667, PMID:28726806, PMID:28767289, PMID:28807866, PMID:28814288, PMID:28831036, PMID:28843361, PMID:28975465, PMID:28993434, PMID:29020732, PMID:29084914, PMID:29088781, PMID:29126202, PMID:29192238, PMID:29215753, PMID:29240602, PMID:29288066, PMID:29321669, PMID:29339979, PMID:29368341, PMID:29394989, PMID:29433453, PMID:29446198, PMID:29470806, PMID:29492181, PMID:29580235, PMID:29642553, PMID:29667044, PMID:29731985, PMID:29752822, PMID:29753700, PMID:29802286, PMID:29854292, PMID:29884841, PMID:29907814, PMID:29988080, PMID:30093976, PMID:30199306, PMID:30207912, PMID:30212499, PMID:30254663, PMID:30286154, PMID:30287823, PMID:30311386, PMID:30350268, PMID:30400234, PMID:30472649, PMID:30606148, PMID:30702160, PMID:30825404, PMID:31131967, PMID:32438681 NCBI chr 5:150,522,297...150,570,147
Ensembl chr 5:150,522,630...150,570,329
JBrowse link
Fanconi anemia complementation group D2 term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Fancd2 Fanconi anemia, complementation group D2 ISO
IEA
ClinVar Annotator: match by term: Fanconi anemia, complementation group D2
OMIM:227646
ClinVar Annotator: match by OMIM:227646
OMIM
ClinVar
MouseDO
PMID:11239453, PMID:16280053, PMID:17308347, PMID:17436244, PMID:21356188, PMID:22720145, PMID:22828868, PMID:23613520, PMID:24033266, PMID:24728327, PMID:25168418, PMID:25703294, PMID:25741868, PMID:27041517, PMID:28202063, PMID:28492532, PMID:32581362 NCBI chr 6:113,531,640...113,597,020
Ensembl chr 6:113,531,682...113,597,017
JBrowse link
G Fancd2os Fancd2 opposite strand ISO ClinVar Annotator: match by term: Fanconi anemia, complementation group D2 ClinVar PMID:11239453, PMID:16280053, PMID:17436244, PMID:23613520, PMID:24728327, PMID:25741868, PMID:28492532, PMID:32581362 NCBI chr 6:113,596,761...113,600,715
Ensembl chr 6:113,596,761...113,600,715
JBrowse link
Fanconi anemia complementation group E term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Fance Fanconi anemia, complementation group E ISO ClinVar Annotator: match by term: Fanconi anemia, complementation group E
ClinVar Annotator: match by OMIM:600901
OMIM
ClinVar
PMID:7662964, PMID:9382107, PMID:10205272, PMID:11001585, PMID:14695169, PMID:15609317, PMID:16774934, PMID:17308347, PMID:17924555, PMID:18271933, PMID:21279724, PMID:22778927, PMID:24033266, PMID:24728327, PMID:25058500, PMID:25741868, PMID:26822949, PMID:27165003, PMID:28492532, PMID:28678401, PMID:30311386, PMID:30609409 NCBI chr17:28,313,530...28,326,574
Ensembl chr17:28,313,519...28,326,572
JBrowse link
Fanconi anemia complementation group F term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Fancf Fanconi anemia, complementation group F ISO ClinVar Annotator: match by term: Fanconi anemia, complementation group F
ClinVar Annotator: match by OMIM:603467
OMIM
ClinVar
PMID:9382107, PMID:10615118, PMID:16084127, PMID:16774934, PMID:17924555, PMID:18271933, PMID:22778927, PMID:24033266, PMID:24728327, PMID:25741868, PMID:26033879, PMID:27714961, PMID:28102861, PMID:28492532 NCBI chr 7:51,860,577...51,862,267
Ensembl chr 7:51,860,577...51,862,267
JBrowse link
Fanconi anemia complementation group G term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Fancg Fanconi anemia, complementation group G ISO ClinVar Annotator: match by term: Fanconi anemia, complementation group G
ClinVar Annotator: match by OMIM:614082
OMIM
ClinVar
PMID:9806458, PMID:09806548, PMID:10807541, PMID:10961856, PMID:11093276, PMID:11126723, PMID:11438206, PMID:12552564, PMID:12673805, PMID:15657175, PMID:16084127, PMID:16643430, PMID:17924555, PMID:20301575, PMID:22778927, PMID:23613520, PMID:24136620, PMID:24300640, PMID:24728327, PMID:24763404, PMID:25703136, PMID:25741868, PMID:26968956, PMID:28102861, PMID:28492532, PMID:28717661, PMID:30031030 NCBI chr 4:43,002,337...43,010,567
Ensembl chr 4:43,002,343...43,010,506
JBrowse link
G Vcp valosin containing protein ISO ClinVar Annotator: match by term: Fanconi anemia, complementation group G ClinVar PMID:11438206, PMID:16643430, PMID:24728327, PMID:25741868, PMID:28492532 NCBI chr 4:42,979,964...43,000,507
Ensembl chr 4:42,979,963...43,000,507
JBrowse link
Fanconi anemia complementation group I term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Fanci Fanconi anemia, complementation group I ISO ClinVar Annotator: match by term: Fanconi anemia, complementation group I
DNA:mutations:exon, intron:multiple
ClinVar Annotator: match by null
ClinVar Annotator: match by OMIM:609053
OMIM
ClinVar
PMID:17412408, PMID:17452773, PMID:17460694, PMID:17924555, PMID:18414213, PMID:18931676, PMID:21324748, PMID:22720145, PMID:22778927, PMID:23093618, PMID:23524600, PMID:23613520, PMID:24989076, PMID:25741868, PMID:26296701, PMID:26467025, PMID:26590883, PMID:27987238, PMID:28492532, PMID:28678401, PMID:28878254, PMID:29439820, PMID:17452773 RGD:11344924 NCBI chr 7:79,392,312...79,450,266
Ensembl chr 7:79,391,929...79,450,264
JBrowse link
G Polg polymerase (DNA directed), gamma ISO ClinVar Annotator: match by term: Fanconi anemia, complementation group I ClinVar PMID:18414213, PMID:22778927, PMID:23524600, PMID:25741868, PMID:26467025, PMID:27987238, PMID:28492532 NCBI chr 7:79,446,231...79,467,911
Ensembl chr 7:79,446,231...79,466,362
JBrowse link
Fanconi anemia complementation group J term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Brip1 BRCA1 interacting protein C-terminal helicase 1 ISO ClinVar Annotator: match by term: Fanconi anemia, complementation group J
DNA:nonsense mutation:cds:p.R798* (human)
ClinVar Annotator: match by OMIM:609054
OMIM
ClinVar
PMID:11301010, PMID:12565990, PMID:12569564, PMID:12872252, PMID:14983014, PMID:15285897, PMID:16116421, PMID:16116423, PMID:16116424, PMID:16153896, PMID:16280053, PMID:16430786, PMID:16973432, PMID:17033622, PMID:17145708, PMID:17342202, PMID:17596542, PMID:18414782, PMID:18426915, PMID:18483852, PMID:18510924, PMID:18628483, PMID:19099189, PMID:19127258, PMID:19150983, PMID:19197335, PMID:19339519, PMID:19379763, PMID:19442249, PMID:19519404, PMID:19584272, PMID:19763819, PMID:19935797, PMID:20068231, PMID:20159562, PMID:20168331, PMID:20177395, PMID:20639400, PMID:20980836, PMID:21127055, PMID:21165771, PMID:21279724, PMID:21345144, PMID:21356067, PMID:21409391, PMID:21964575, PMID:22006311, PMID:22024395, PMID:22287629, PMID:22582397, PMID:22692731, PMID:22792074, PMID:23161009, PMID:23276657, PMID:23555315, PMID:23613520, PMID:23644138, PMID:23935105, PMID:24033266, PMID:24123366, PMID:24240112, PMID:24376576, PMID:24448499, PMID:24487782, PMID:24556621, PMID:24573678, PMID:24584348, PMID:24728327, PMID:24755471, PMID:24763289, PMID:24895130, PMID:25058500, PMID:25186627, PMID:25256751, PMID:25318351, PMID:25374583, PMID:25452441, PMID:25525159, PMID:25583461, PMID:25722345, PMID:25741868, PMID:25846551, PMID:25980754, PMID:25981591, PMID:26206375, PMID:26207792, PMID:26264438, PMID:26296696, PMID:26315354, PMID:26467025, PMID:26483394, PMID:26534844, PMID:26556299, PMID:26580448, PMID:26596371, PMID:26635394, PMID:26659599, PMID:26681312, PMID:26681682, PMID:26689913, PMID:26709662, PMID:26720728, PMID:26757417, PMID:26786923, PMID:26790966, PMID:26822149, PMID:26822949, PMID:26824983, PMID:26845104, PMID:26901136, PMID:26911350, PMID:26921362, PMID:26968956, PMID:26976419, PMID:27074266, PMID:27107905, PMID:27150160, PMID:27153395, PMID:27165003, PMID:27179029, PMID:27193682, PMID:27378695, PMID:27427815, PMID:27433846, PMID:27443514, PMID:27498913, PMID:27527004, PMID:27547810, PMID:27553368, PMID:27621404, PMID:27701467, PMID:27978560, PMID:27997549, PMID:28076423, PMID:28135145, PMID:28152038, PMID:28202063, PMID:28423363, PMID:28492532, PMID:28495237, PMID:28503720, PMID:28528518, PMID:28678401, PMID:28709830, PMID:28717660, PMID:28767289, PMID:28796317, PMID:28911102, PMID:28961279, PMID:29263802, PMID:29335925, PMID:29338689, PMID:29360161, PMID:29368626, PMID:29470806, PMID:29625052, PMID:29636988, PMID:29667044, PMID:29788478, PMID:29922827, PMID:29929473, PMID:30086788, PMID:30093976, PMID:30130155, PMID:30230034, PMID:30262796, PMID:30295334, PMID:30311386, PMID:30322717, PMID:30374176, PMID:30414346, PMID:30728895, PMID:30982232, PMID:31159747, PMID:31214711, PMID:31265121, PMID:31341520, PMID:31822495, PMID:31843900, PMID:32566746, PMID:26968956 RGD:11251781 NCBI chr11:86,058,136...86,201,215
Ensembl chr11:86,058,138...86,201,193
JBrowse link
Fanconi anemia complementation group L term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Fancl Fanconi anemia, complementation group L ISO ClinVar Annotator: match by term: Fanconi anemia, complementation group L
ClinVar Annotator: match by OMIM:614083
OMIM
ClinVar
PMID:19405097, PMID:21279724, PMID:23613520, PMID:24033266, PMID:25239263, PMID:25659033, PMID:25741868, PMID:25754594, PMID:26822237, PMID:26822949, PMID:27153395, PMID:28492532 NCBI chr11:26,387,084...26,471,883
Ensembl chr11:26,386,135...26,471,876
JBrowse link
G Vrk2 vaccinia related kinase 2 ISO ClinVar Annotator: match by term: Fanconi anemia, complementation group L ClinVar PMID:19405097, PMID:21279724, PMID:23613520, PMID:24033266, PMID:25239263, PMID:25659033, PMID:25741868, PMID:26822237, PMID:26822949, PMID:27153395, PMID:28492532 NCBI chr11:26,471,398...26,594,012
Ensembl chr11:26,471,322...26,593,999
JBrowse link
Fanconi Anemia Complementation Group M term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Fancm Fanconi anemia, complementation group M ISO ClinVar Annotator: match by term: Fanconi anemia, complementation group M OMIM
ClinVar
PMID:16116422, PMID:19423727, PMID:19737859, PMID:25741868, PMID:28492532 NCBI chr12:65,074,110...65,131,842
Ensembl chr12:65,075,603...65,132,058
JBrowse link
Fanconi anemia complementation group N term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Palb2 partner and localizer of BRCA2 ISO ClinVar Annotator: match by term: Fanconi anemia, complementation group N
ClinVar Annotator: match by OMIM:610832
OMIM
ClinVar
PMID:16793542, PMID:17200668, PMID:17200671, PMID:17200672, PMID:17287723, PMID:17420451, PMID:17924555, PMID:18288683, PMID:18302019, PMID:18446436, PMID:18987736, PMID:19264984, PMID:19333784, PMID:19369211, PMID:19584259, PMID:19609323, PMID:19635604, PMID:19763884, PMID:20091115, PMID:20122277, PMID:20180015, PMID:20412113, PMID:20582465, PMID:20589654, PMID:20722467, PMID:20852946, PMID:20927582, PMID:21113654, PMID:21165770, PMID:21285249, PMID:21356067, PMID:21365267, PMID:21409391, PMID:21618343, PMID:21932393, PMID:22052327, PMID:22241545, PMID:22310028, PMID:22692731, PMID:22995991, PMID:23341105, PMID:23448497, PMID:23555315, PMID:23824750, PMID:23935836, PMID:23977390, PMID:24033266, PMID:24141787, PMID:24206657, PMID:24415441, PMID:24448499, PMID:24556926, PMID:24728327, PMID:24949998, PMID:25099575, PMID:25117502, PMID:25186627, PMID:25225577, PMID:25356972, PMID:25447460, PMID:25452441, PMID:25479140, PMID:25503501, PMID:25525159, PMID:25575445, PMID:25666743, PMID:25741868, PMID:25794774, PMID:25980754, PMID:26094658, PMID:26283626, PMID:26315354, PMID:26411315, PMID:26467025, PMID:26489409, PMID:26534844, PMID:26564480, PMID:26649820, PMID:26681312, PMID:26689913, PMID:26692951, PMID:26740942, PMID:26845104, PMID:26878173, PMID:26898890, PMID:26976419, PMID:26990772, PMID:27067391, PMID:27099641, PMID:27106063, PMID:27153395, PMID:27328445, PMID:27356891, PMID:27397723, PMID:27573125, PMID:27595995, PMID:27616075, PMID:27621404, PMID:27783279, PMID:27829436, PMID:27930734, PMID:27978560, PMID:28008555, PMID:28051113, PMID:28152038, PMID:28279176, PMID:28281021, PMID:28319063, PMID:28380452, PMID:28492532, PMID:28503720, PMID:28580595, PMID:28664506, PMID:28767289, PMID:28779002, PMID:28796317, PMID:28825143, PMID:28873162, PMID:29052111, PMID:29190888, PMID:29263802, PMID:29360161, PMID:29368341, PMID:29522266, PMID:29667044, PMID:29802286, PMID:29909963, PMID:30287823, PMID:30306255, PMID:30982232, PMID:31159747, PMID:31586400, PMID:31636395, PMID:32566746 NCBI chr 7:122,107,262...122,132,980
Ensembl chr 7:122,107,262...122,132,985
JBrowse link
Fanconi anemia complementation group O term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Rad51c RAD51 paralog C ISO ClinVar Annotator: match by term: Fanconi anemia, complementation group O
ClinVar Annotator: match by OMIM:613390
OMIM
ClinVar
PMID:12442171, PMID:12966089, PMID:14704354, PMID:15126333, PMID:15170666, PMID:18203022, PMID:20052722, PMID:20400963, PMID:20400964, PMID:20697805, PMID:20723205, PMID:20952512, PMID:21447597, PMID:21537932, PMID:21597919, PMID:21616938, PMID:21750962, PMID:21980511, PMID:21990120, PMID:22006311, PMID:22167183, PMID:22370629, PMID:22451500, PMID:22476429, PMID:22538716, PMID:22725699, PMID:22810696, PMID:23117857, PMID:23176254, PMID:23500037, PMID:23704328, PMID:24082139, PMID:24139550, PMID:24141787, PMID:24240112, PMID:24315737, PMID:24359560, PMID:24504028, PMID:24549055, PMID:24631219, PMID:24763404, PMID:24800917, PMID:24993905, PMID:24998779, PMID:25086635, PMID:25154786, PMID:25186627, PMID:25292178, PMID:25318351, PMID:25338684, PMID:25452441, PMID:25470109, PMID:25525159, PMID:25741868, PMID:25833843, PMID:25980754, PMID:26057125, PMID:26103414, PMID:26261251, PMID:26270727, PMID:26354865, PMID:26406419, PMID:26467025, PMID:26483394, PMID:26556299, PMID:26580448, PMID:26681312, PMID:26687385, PMID:26689913, PMID:26691941, PMID:26720728, PMID:26740214, PMID:26822949, PMID:26824983, PMID:26845104, PMID:26848151, PMID:26976419, PMID:27037238, PMID:27149507, PMID:27149842, PMID:27153395, PMID:27230542, PMID:27328445, PMID:27433846, PMID:27443514, PMID:27616075, PMID:27621404, PMID:27622768, PMID:27852271, PMID:27878467, PMID:27913932, PMID:27978560, PMID:28123851, PMID:28135145, PMID:28152038, PMID:28202063, PMID:28281021, PMID:28492532, PMID:28588062, PMID:28678401, PMID:28709830, PMID:28767289, PMID:28802053, PMID:28829762, PMID:28864920, PMID:28873162, PMID:28905878, PMID:28975465, PMID:29020732, PMID:29053726, PMID:29054568, PMID:29158291, PMID:29255180, PMID:29278735, PMID:29360161, PMID:29409816, PMID:29458332, PMID:29470806, PMID:29522266, PMID:29566657, PMID:29659569, PMID:29752822, PMID:29785153, PMID:29922827, PMID:29978187, PMID:30086788, PMID:30128536, PMID:30257646, PMID:30311386, PMID:30322717, PMID:30374176, PMID:30426508, PMID:30551670, PMID:30927251, PMID:30949688, PMID:30995915, PMID:31300551, PMID:31422574, PMID:31843900, PMID:32566746 NCBI chr11:87,376,645...87,404,954
Ensembl chr11:87,376,645...87,404,954
JBrowse link
Fanconi anemia complementation group P term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Slx4 SLX4 structure-specific endonuclease subunit homolog (S. cerevisiae) ISO ClinVar Annotator: match by term: Fanconi anemia, complementation group P
ClinVar Annotator: match by This custom term has been created by RGD curators.
OMIM
ClinVar
PMID:21240275, PMID:21240277, PMID:21805310, PMID:22383991, PMID:22401137, PMID:22911665, PMID:23211700, PMID:23840564, PMID:25288723, PMID:25326635, PMID:25741868, PMID:26201965, PMID:28202063, PMID:28492532, PMID:28717660 NCBI chr16:3,979,105...4,003,829
Ensembl chr16:3,979,105...4,003,770
JBrowse link
Fanconi anemia complementation group Q term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Ercc4 excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 4 ISO ClinVar Annotator: match by term: Fanconi anemia, complementation group Q
ClinVar Annotator: match by term: Fanconi anemia, complementation group q
ClinVar Annotator: match by OMIM:615272
OMIM
ClinVar
PMID:23623386, PMID:25741868, PMID:28292785, PMID:28492532, PMID:30165384, PMID:30658521 NCBI chr16:13,109,366...13,152,009
Ensembl chr16:13,109,684...13,150,617
JBrowse link
Fanconi anemia complementation group R term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Rad51 RAD51 recombinase ISO ClinVar Annotator: match by term: Fanconi anemia, complementation group R ClinVar
OMIM
PMID:24808016, PMID:25741868, PMID:25813273, PMID:26253028, PMID:26681308 NCBI chr 2:119,112,814...119,136,073
Ensembl chr 2:119,112,793...119,147,445
JBrowse link
Fanconi Anemia Complementation Group S term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Brca1 breast cancer 1, early onset ISO ClinVar Annotator: match by term: FANCONI ANEMIA, COMPLEMENTATION GROUP S ClinVar
OMIM
PMID:7795652, PMID:7837387, PMID:7894493, PMID:8554067, PMID:8606385, PMID:8644702, PMID:8807330, PMID:8968102, PMID:9159158, PMID:9333265, PMID:9361038, PMID:9525870, PMID:9609997, PMID:9663595, PMID:10788334, PMID:10945975, PMID:11157798, PMID:11278247, PMID:11320250, PMID:11389159, PMID:11436123, PMID:11597388, PMID:11802209, PMID:12142080, PMID:12204006, PMID:12393792, PMID:12491499, PMID:12496476, PMID:12531920, PMID:12566964, PMID:12601471, PMID:12732733, PMID:12810666, PMID:12938098, PMID:14760071, PMID:14976165, PMID:15001988, PMID:15004537, PMID:15024741, PMID:15172985, PMID:15235020, PMID:15290653, PMID:15365993, PMID:15383404, PMID:15569676, PMID:15876480, PMID:16168118, PMID:16227521, PMID:16267036, PMID:16280041, PMID:16284991, PMID:16403807, PMID:16515586, PMID:16518693, PMID:16528604, PMID:16683254, PMID:17148771, PMID:17305420, PMID:17308087, PMID:17453335, PMID:17574969, PMID:17924331, PMID:18006916, PMID:18159056, PMID:18489799, PMID:18680205, PMID:18763032, PMID:18783588, PMID:18821011, PMID:18824701, PMID:19016756, PMID:19200354, PMID:19543972, PMID:19563646, PMID:19594371, PMID:19638463, PMID:19770520, PMID:19949876, PMID:19996028, PMID:20103620, PMID:20104584, PMID:20180014, PMID:20345474, PMID:20373018, PMID:20378548, PMID:20507347, PMID:20516115, PMID:20569256, PMID:20614009, PMID:20683152, PMID:21147198, PMID:21232165, PMID:21324516, PMID:21356067, PMID:21394826, PMID:21447777, PMID:21473589, PMID:21503673, PMID:21520273, PMID:21702907, PMID:21922593, PMID:21965345, PMID:21989927, PMID:21990134, PMID:21990165, PMID:22010008, PMID:22172724, PMID:22434525, PMID:22476429, PMID:22652532, PMID:22713736, PMID:22798144, PMID:22843421, PMID:22889855, PMID:23161852, PMID:23199084, PMID:23269703, PMID:23469205, PMID:23536787, PMID:23580280, PMID:23683081, PMID:23704879, PMID:23725378, PMID:23767878, PMID:23867111, PMID:24010542, PMID:24033266, PMID:24055113, PMID:24131973, PMID:24240112, PMID:24312913, PMID:24504028, PMID:24528374, PMID:24569164, PMID:24667779, PMID:24728189, PMID:24772314, PMID:24884479, PMID:25085752, PMID:25330149, PMID:25400221, PMID:25428789, PMID:25452441, PMID:25472942, PMID:25525159, PMID:25637381, PMID:25682074, PMID:25741868, PMID:25748678, PMID:25782689, PMID:25880076, PMID:25948282, PMID:26010302, PMID:26083025, PMID:26187060, PMID:26219728, PMID:26287763, PMID:26295337, PMID:26467025, PMID:26681312, PMID:26689913, PMID:26718727, PMID:26779294, PMID:26786923, PMID:26843898, PMID:26845104, PMID:26852130, PMID:26913838, PMID:27153395, PMID:27257965, PMID:27272900, PMID:27393621, PMID:27425403, PMID:27433846, PMID:27741520, PMID:27836010, PMID:27914478, PMID:27978560, PMID:28111427, PMID:28265380, PMID:28283652, PMID:28294317, PMID:28324225, PMID:28364669, PMID:28423363, PMID:28477318, PMID:28492532, PMID:28664449, PMID:28724667, PMID:28781887, PMID:28831036, PMID:29133208, PMID:29335924, PMID:29339979, PMID:29433453, PMID:29470806, PMID:29478780, PMID:29492181, PMID:29712865, PMID:29752822, PMID:29797126, PMID:29907814, PMID:29998185, PMID:30055521, PMID:30067863, PMID:30103829, PMID:30209399, PMID:30311386, PMID:30606148, PMID:30765603, PMID:31341520, PMID:31347298 NCBI chr11:101,488,761...101,551,955
Ensembl chr11:101,488,764...101,551,955
JBrowse link
Fanconi anemia complementation group T term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Ube2t ubiquitin-conjugating enzyme E2T ISO ClinVar Annotator: match by term: Fanconi anemia, complementation group t
ClinVar Annotator: match by term: Fanconi anemia, complementation group T
ClinVar
OMIM
PMID:26046368, PMID:26119737 NCBI chr 1:134,962,565...134,974,180
Ensembl chr 1:134,962,565...134,974,162
JBrowse link
Fanconi anemia complementation group U term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Xrcc2 X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 2 ISO ClinVar Annotator: match by term: Fanconi anemia, complementation group U OMIM
ClinVar
PMID:11118202, PMID:20189471, PMID:22232082, PMID:22464251, PMID:23054243, PMID:25637381, PMID:25741868, PMID:26046366, PMID:26689913, PMID:26845104, PMID:27208205, PMID:27233470, PMID:28486781, PMID:28492532, PMID:28767289, PMID:32860008 NCBI chr 5:25,689,814...25,705,797
Ensembl chr 5:25,689,812...25,705,825
JBrowse link
Fanconi anemia complementation group V term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Mad2l2 MAD2 mitotic arrest deficient-like 2 ISO ClinVar Annotator: match by term: Fanconi anemia, complementation group V ClinVar
OMIM
PMID:27500492 NCBI chr 4:148,130,158...148,145,704
Ensembl chr 4:148,130,384...148,145,699
JBrowse link
Fanconi Anemia Complementation Group W term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Rfwd3 ring finger and WD repeat domain 3 ISO ClinVar Annotator: match by term: FANCONI ANEMIA, COMPLEMENTATION GROUP W ClinVar
OMIM
PMID:25741868, PMID:28691929 NCBI chr 8:111,270,944...111,300,222
Ensembl chr 8:111,270,944...111,300,222
JBrowse link
hereditary nonpolyposis colorectal cancer type 2 term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Mlh1 mutL homolog 1 ISO ClinVar Annotator: match by term: COLON CANCER, FAMILIAL NONPOLYPOSIS, TYPE 2
ClinVar Annotator: match by term: Lynch syndrome II
CTD Direct Evidence: marker/mechanism
ClinVar Annotator: match by OMIM:609310
OMIM
ClinVar
CTD
PMID:16, PMID:1522200, PMID:1756143, PMID:2022152, PMID:5713769, PMID:7557107, PMID:7584997, PMID:8145827, PMID:8521398, PMID:8566964, PMID:8571956, PMID:8574961, PMID:8581513, PMID:8592341, PMID:8797773, PMID:08808596, PMID:8872463, PMID:8880570, PMID:8938136, PMID:8940269, PMID:8993976, PMID:9052445, PMID:9057658, PMID:9071575, PMID:9087566, PMID:9218993, PMID:9234704, PMID:9272156, PMID:9298827, PMID:9322509, PMID:9326924, PMID:9377556, PMID:9419403, PMID:9506527, PMID:9526167, PMID:9559627, PMID:9611074, PMID:9697702, PMID:9718327, PMID:9777949, PMID:9806477, PMID:9831355, PMID:9833759, PMID:9927033, PMID:9927034, PMID:10037723, PMID:10200055, PMID:10323887, PMID:10348818, PMID:10386556, PMID:10389971, PMID:10422993, PMID:10446963, PMID:10448273, PMID:10480359, PMID:10495924, PMID:10573010, PMID:10598809, PMID:10601588, PMID:10612827, PMID:10671064, PMID:10709098, PMID:10713887, PMID:10732761, PMID:10793088, PMID:10829038, PMID:10861474, PMID:10874307, PMID:10923051, PMID:10970186, PMID:10995807, PMID:11015456, PMID:11112663, PMID:11139242, PMID:11151427, PMID:11179758, PMID:11208710, PMID:11342971, PMID:11343035, PMID:11369138, PMID:11376800, PMID:11385712, PMID:11389087, PMID:11427529, PMID:11429708, PMID:11474654, PMID:11524701, PMID:11555625, PMID:11574484, PMID:11585727, PMID:11601928, PMID:11606497, PMID:11726306, PMID:11748856, PMID:11781295, PMID:11793442, PMID:11839723, PMID:11870161, PMID:11879922, PMID:11920458, PMID:11920650, PMID:11948175, PMID:12011148, PMID:12037578, PMID:12067992, PMID:12070261, PMID:12095971, PMID:12112654, PMID:12115348, PMID:12173039, PMID:12183410, PMID:12200596, PMID:12362047, PMID:12373605, PMID:12377806, PMID:12386821, PMID:12414824, PMID:12419761, PMID:12513688, PMID:12522551, PMID:12547705, PMID:12618391, PMID:12624141, PMID:12655568, PMID:12658575, PMID:12799449, PMID:12808326, PMID:12810663, PMID:12874865, PMID:12919137, PMID:12919140, PMID:14512394, PMID:14514376, PMID:14574010, PMID:14635101, PMID:14645426, PMID:14688830, PMID:14699485, PMID:14762794, PMID:14871975, PMID:14961575, PMID:15024732, PMID:15133479, PMID:15139004, PMID:15173238, PMID:15178966, PMID:15184898, PMID:15222003, PMID:15235038, PMID:15253764, PMID:15254659, PMID:15256438, PMID:15289847, PMID:15300854, PMID:15309712, PMID:15340264, PMID:15342696, PMID:15345113, PMID:15365995, PMID:15475387, PMID:15494688, PMID:15520370, PMID:15563510, PMID:15571801, PMID:15613555, PMID:15655560, PMID:15713769, PMID:15731775, PMID:15765394, PMID:15845562, PMID:15849733, PMID:15864295, PMID:15870828, PMID:15872200, PMID:15926618, PMID:15943554, PMID:15955785, PMID:15991064, PMID:15991306, PMID:15996210, PMID:16034045, PMID:16083711, PMID:16142001, PMID:16181381, PMID:16203774, PMID:16206289, PMID:16216036, PMID:16270383, PMID:16288214, PMID:16338176, PMID:16341550, PMID:16341804, PMID:16395668, PMID:16425354, PMID:16451135, PMID:16456782, PMID:16636019, PMID:16685411, PMID:16724012, PMID:16736289, PMID:16807412, PMID:16810763, PMID:16830052, PMID:16837128, PMID:16885385, PMID:16929514, PMID:16963262, PMID:16982745, PMID:16995940, PMID:17011982, PMID:17054581, PMID:17074586, PMID:17117178, PMID:17135187, PMID:17192056, PMID:17199584, PMID:17210669, PMID:17250665, PMID:17267619, PMID:17301300, PMID:17312306, PMID:17348456, PMID:17417778, PMID:17440950, PMID:17453009, PMID:17473388, PMID:17505997, PMID:17510385, PMID:17569143, PMID:17576681, PMID:17594722, PMID:17653898, PMID:17690979, PMID:17889038, PMID:17895478, PMID:18033691, PMID:18069769, PMID:18094436, PMID:18205192, PMID:18307539, PMID:18325052, PMID:18337503, PMID:18373977, PMID:18383312, PMID:18389388, PMID:18415027, PMID:18470917, PMID:18518984, PMID:18547406, PMID:18561205, PMID:18566915, PMID:18625694, PMID:18636350, PMID:18713544, PMID:18726168, PMID:18772310, PMID:18792805, PMID:18809606, PMID:18931482, PMID:18951437, PMID:18951440, PMID:19116412, PMID:19117025, PMID:19120036, PMID:19142183, PMID:19224586, PMID:19250818, PMID:19267393, PMID:19386570, PMID:19389263, PMID:19419416, PMID:19459153, PMID:19504447, PMID:19526325, PMID:19665066, PMID:19669161, PMID:19685281, PMID:19690142, PMID:19697156, PMID:19698169, PMID:19760518, PMID:19863800, PMID:20020535, PMID:20034658, PMID:20045164, PMID:20176655, PMID:20176959, PMID:20223024, PMID:20233461, PMID:20373145, PMID:20473912, PMID:20533529, PMID:20587412, PMID:20682701, PMID:20858721, PMID:20864636, PMID:20937110, PMID:20978114, PMID:20978117, PMID:21034533, PMID:21056691, PMID:21120944, PMID:21153778, PMID:21155023, PMID:21239990, PMID:21247423, PMID:21286667, PMID:21311894, PMID:21387278, PMID:21404117, PMID:21475916, PMID:21520333, PMID:21598002, PMID:21636617, PMID:21642682, PMID:21671475, PMID:21681552, PMID:21785361, PMID:21840485, PMID:21868491, PMID:21901500, PMID:21952876, PMID:22006311, PMID:22081473, PMID:22086678, PMID:22136435, PMID:22144684, PMID:22252508, PMID:22290698, PMID:22322191, PMID:22395473, PMID:22691310, PMID:22703879, PMID:22736432, PMID:22753075, PMID:22776989, PMID:22875147, PMID:22878509, PMID:22949379, PMID:22949387, PMID:22995991, PMID:23047549, PMID:23329266, PMID:23354017, PMID:23403630, PMID:23431106, PMID:23523604, PMID:23544471, PMID:23573243, PMID:23640085, PMID:23695190, PMID:23729658, PMID:23741719, PMID:23747338, PMID:23760103, PMID:24032978, PMID:24033266, PMID:24055113, PMID:24073290, PMID:24084575, PMID:24090359, PMID:24278394, PMID:24323032, PMID:24344984, PMID:24362816, PMID:24383517, PMID:24440087, PMID:24456667, PMID:24549055, PMID:24689082, PMID:24710284, PMID:24728327, PMID:24743384, PMID:24802709, PMID:24933000, PMID:24953332, PMID:25077178, PMID:25110875, PMID:25111426, PMID:25115387, PMID:25133505, PMID:25142776, PMID:25148578, PMID:25157968, PMID:25186627, PMID:25197397, PMID:25338684, PMID:25430799, PMID:25437057, PMID:25477341, PMID:25479140, PMID:25503501, PMID:25525159, PMID:25559809, PMID:25579085, PMID:25617771, PMID:25637381, PMID:25648859, PMID:25741868, PMID:25762362, PMID:25823662, PMID:25871441, PMID:25871621, PMID:25882375, PMID:25892863, PMID:25980754, PMID:26053027, PMID:26078562, PMID:26096739, PMID:26206375, PMID:26247049, PMID:26247079, PMID:26248088, PMID:26249686, PMID:26300997, PMID:26332594, PMID:26333163, PMID:26437257, PMID:26437357, PMID:26467025, PMID:26485756, PMID:26510091, PMID:26580448, PMID:26637282, PMID:26659599, PMID:26659639, PMID:26681312, PMID:26761715, PMID:26811195, PMID:26817999, PMID:26845104, PMID:26888055, PMID:26895986, PMID:26898890, PMID:26900293, PMID:26976419, PMID:27064304, PMID:27093186, PMID:27121310, PMID:27152634, PMID:27153395, PMID:27173243, PMID:27185373, PMID:27284491, PMID:27295708, PMID:27300758, PMID:27435373, PMID:27449771, PMID:27487738, PMID:27498913, PMID:27527004, PMID:27553368, PMID:27600092, PMID:27601186, PMID:27616075, PMID:27629256, PMID:27647783, PMID:27696107, PMID:27732944, PMID:27831900, PMID:27930734, PMID:27978560, PMID:28127413, PMID:28135145, PMID:28445943, PMID:28449805, PMID:28466842, PMID:28492532, PMID:28503720, PMID:28514183, PMID:28526081, PMID:28528518, PMID:28687356, PMID:28724667, PMID:28767289, PMID:28822769, PMID:28874130, PMID:28932927, PMID:28944238, PMID:29050249, PMID:29151953, PMID:29212164, PMID:29228462, PMID:29288294, PMID:29360550, PMID:29368341, PMID:29419868, PMID:29472279, PMID:29484706, PMID:29505604, PMID:29506128, PMID:29520894, PMID:29575718, PMID:29596542, PMID:29758216, PMID:29887214, PMID:29922827, PMID:30019097, PMID:30093976, PMID:30238922, PMID:30256826, PMID:30324682, PMID:30521064, PMID:30720243, PMID:30866919, PMID:30998989, PMID:31273885, PMID:31386297, PMID:31391288, PMID:31642931, PMID:31784484, PMID:32566746 NCBI chr 9:111,228,228...111,271,786
Ensembl chr 9:111,228,228...111,271,791
JBrowse link
hereditary nonpolyposis colorectal cancer type 4 term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Pms2 PMS1 homolog2, mismatch repair system component ISO ClinVar Annotator: match by term: Hereditary nonpolyposis colorectal cancer type 4
ClinVar Annotator: match by OMIM:614337
OMIM
ClinVar
PMID:2440087, PMID:7628019, PMID:7629132, PMID:7632227, PMID:7661930, PMID:7704024, PMID:8072530, PMID:8993976, PMID:9488480, PMID:9683794, PMID:10037723, PMID:10199405, PMID:10479499, PMID:10480359, PMID:11574484, PMID:11793469, PMID:11897781, PMID:12208142, PMID:12714694, PMID:14756672, PMID:15077197, PMID:15256438, PMID:15304120, PMID:15448003, PMID:15470502, PMID:15521988, PMID:15845562, PMID:15872200, PMID:15887099, PMID:15887124, PMID:15955779, PMID:16144131, PMID:16426742, PMID:16472587, PMID:16507833, PMID:16609022, PMID:16619239, PMID:17016615, PMID:17072973, PMID:17139668, PMID:17557300, PMID:17976239, PMID:17993636, PMID:18178629, PMID:18268114, PMID:18273873, PMID:18602922, PMID:18768816, PMID:18824584, PMID:19132747, PMID:19156169, PMID:19283792, PMID:19389263, PMID:19479271, PMID:19495563, PMID:19526325, PMID:19690142, PMID:20176959, PMID:20186688, PMID:20186689, PMID:20205264, PMID:20487569, PMID:20531397, PMID:20698049, PMID:21204794, PMID:21239990, PMID:21261604, PMID:21356188, PMID:21376568, PMID:21618646, PMID:21984973, PMID:22081473, PMID:22086678, PMID:22120844, PMID:22290698, PMID:22577899, PMID:22658618, PMID:22703879, PMID:22848017, PMID:22875147, PMID:22918162, PMID:22941189, PMID:22949387, PMID:23012243, PMID:23017166, PMID:23376243, PMID:23435383, PMID:23499907, PMID:23652311, PMID:23709753, PMID:23837913, PMID:23960188, PMID:23981578, PMID:24027009, PMID:24033266, PMID:24055113, PMID:24072394, PMID:24326041, PMID:24351291, PMID:24362816, PMID:24434690, PMID:24440087, PMID:24549055, PMID:24556621, PMID:24618965, PMID:24689082, PMID:24710284, PMID:24728189, PMID:24728327, PMID:24763289, PMID:24897087, PMID:25117502, PMID:25142776, PMID:25151201, PMID:25186627, PMID:25194673, PMID:25326637, PMID:25345868, PMID:25430799, PMID:25477341, PMID:25479140, PMID:25503501, PMID:25512458, PMID:25525159, PMID:25559809, PMID:25567908, PMID:25637381, PMID:25648859, PMID:25741868, PMID:25801821, PMID:25850602, PMID:25856668, PMID:25871621, PMID:25938944, PMID:25964535, PMID:25980754, PMID:26110232, PMID:26116798, PMID:26163658, PMID:26232782, PMID:26247049, PMID:26249686, PMID:26270727, PMID:26272126, PMID:26318770, PMID:26320870, PMID:26333163, PMID:26423401, PMID:26437257, PMID:26467025, PMID:26483394, PMID:26517685, PMID:26552419, PMID:26580448, PMID:26681312, PMID:26689913, PMID:26720728, PMID:26798439, PMID:26811195, PMID:26837502, PMID:26845104, PMID:26888055, PMID:26895986, PMID:26898890, PMID:26976419, PMID:27001570, PMID:27017610, PMID:27028851, PMID:27037742, PMID:27060149, PMID:27060170, PMID:27064304, PMID:27146957, PMID:27153395, PMID:27203213, PMID:27356891, PMID:27379089, PMID:27433846, PMID:27435373, PMID:27443514, PMID:27449771, PMID:27476653, PMID:27498913, PMID:27535533, PMID:27589204, PMID:27600092, PMID:27601186, PMID:27616075, PMID:27647783, PMID:27696107, PMID:27863258, PMID:27878467, PMID:27930734, PMID:27978560, PMID:27997549, PMID:28135048, PMID:28135145, PMID:28195393, PMID:28365877, PMID:28449805, PMID:28466842, PMID:28492532, PMID:28494185, PMID:28503720, PMID:28503822, PMID:28514183, PMID:28528518, PMID:28562508, PMID:28577310, PMID:28596308, PMID:28640387, PMID:28724667, PMID:28726808, PMID:28765196, PMID:28805995, PMID:28873162, PMID:28874130, PMID:28975465, PMID:29335925, PMID:29345684, PMID:29659569, PMID:29684080, PMID:29785153, PMID:29887214, PMID:29945567, PMID:29967336, PMID:30039884, PMID:30093976, PMID:30122538, PMID:30155321, PMID:30256826, PMID:30311386, PMID:30337059, PMID:30374176, PMID:30376427, PMID:30447919, PMID:30521064, PMID:30653781, PMID:30680046, PMID:30760869, PMID:30787465, PMID:31101557, PMID:31159747, PMID:31300551, PMID:31391288, PMID:31433215, PMID:31921681, PMID:32566746, PMID:32773772 NCBI chr 5:143,909,901...143,972,745
Ensembl chr 5:143,909,964...143,933,968
JBrowse link
G Rb1 RB transcriptional corepressor 1 ISO ClinVar Annotator: match by term: Hereditary nonpolyposis colorectal cancer type 4 ClinVar PMID:7795591, PMID:12541220, PMID:14722923, PMID:15884040, PMID:16343894 NCBI chr14:73,192,858...73,325,951
Ensembl chr14:73,183,673...73,325,822
JBrowse link
hereditary nonpolyposis colorectal cancer type 5 term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Fbxo11 F-box protein 11 ISO ClinVar Annotator: match by term: Hereditary nonpolyposis colorectal cancer type 5 ClinVar PMID:19250818, PMID:24689082, PMID:26467025 NCBI chr17:87,990,859...88,066,045
Ensembl chr17:87,990,859...88,065,291
JBrowse link
G Msh6 mutS homolog 6 ISO ClinVar Annotator: match by term: Hereditary nonpolyposis colorectal cancer type 5
ClinVar Annotator: match by OMIM:614350
OMIM
ClinVar
PMID:1548301, PMID:1734424, PMID:1736038, PMID:1851154, PMID:1958276, PMID:2059188, PMID:2563738, PMID:2633163, PMID:7604266, PMID:8063241, PMID:8838326, PMID:9307272, PMID:9354786, PMID:9390556, PMID:9510473, PMID:9929971, PMID:10413423, PMID:10471527, PMID:10480359, PMID:10507723, PMID:10508506, PMID:10521294, PMID:10537275, PMID:10612827, PMID:10675480, PMID:10699937, PMID:11153917, PMID:11333868, PMID:11470537, PMID:11586295, PMID:11709755, PMID:11807791, PMID:11900875, PMID:12019211, PMID:12202775, PMID:12376742, PMID:12522549, PMID:12537658, PMID:12547705, PMID:12658575, PMID:12732731, PMID:12920072, PMID:14520694, PMID:14574004, PMID:14585961, PMID:14871975, PMID:14961575, PMID:15098177, PMID:15184898, PMID:15236168, PMID:15340264, PMID:15354210, PMID:15365995, PMID:15483016, PMID:15713769, PMID:15782118, PMID:15805151, PMID:15837969, PMID:15872200, PMID:15952900, PMID:16010685, PMID:16034045, PMID:16203774, PMID:16237223, PMID:16270383, PMID:16283678, PMID:16283884, PMID:16341805, PMID:16408224, PMID:16418736, PMID:16464007, PMID:16525781, PMID:16636019, PMID:16638864, PMID:16771955, PMID:16807412, PMID:16813607, PMID:16885385, PMID:16929514, PMID:16940983, PMID:17117178, PMID:17205513, PMID:17312306, PMID:17323113, PMID:17344846, PMID:17417778, PMID:17440981, PMID:17453009, PMID:17498565, PMID:17531815, PMID:17557300, PMID:17594722, PMID:17661183, PMID:17718861, PMID:17854147, PMID:17973265, PMID:18033691, PMID:18067074, PMID:18269114, PMID:18301448, PMID:18355840, PMID:18389388, PMID:18409202, PMID:18415027, PMID:18521850, PMID:18523027, PMID:18566915, PMID:18625694, PMID:18701435, PMID:18790734, PMID:18809606, PMID:19072991, PMID:19130300, PMID:19194194, PMID:19250818, PMID:19389263, PMID:19575290, PMID:19685280, PMID:19685281, PMID:19766128, PMID:19781088, PMID:19851887, PMID:19924528, PMID:20007843, PMID:20028993, PMID:20045164, PMID:20149637, PMID:20176959, PMID:20301390, PMID:20379851, PMID:20459533, PMID:20487569, PMID:20587412, PMID:20591884, PMID:20682701, PMID:20937110, PMID:21039432, PMID:21056691, PMID:21081928, PMID:21120944, PMID:21153778, PMID:21155762, PMID:21239990, PMID:21247423, PMID:21437237, PMID:21520333, PMID:21642682, PMID:21674763, PMID:21836479, PMID:22006311, PMID:22081473, PMID:22102614, PMID:22180424, PMID:22219001, PMID:22250089, PMID:22290698, PMID:22495361, PMID:22581703, PMID:22692065, PMID:22703879, PMID:22766992, PMID:22810696, PMID:22851212, PMID:22949379, PMID:22949387, PMID:23047549, PMID:23104009, PMID:23263490, PMID:23354634, PMID:23359684, PMID:23403630, PMID:23523604, PMID:23530095, PMID:23541221, PMID:23544471, PMID:23621914, PMID:23652311, PMID:23729658, PMID:23733757, PMID:23755103, PMID:23757202, PMID:23990280, PMID:24033266, PMID:24040339, PMID:24055113, PMID:24068316, PMID:24073290, PMID:24100870, PMID:24278394, PMID:24307375, PMID:24323032, PMID:24362816, PMID:24393486, PMID:24425144, PMID:24440087, PMID:24448499, PMID:24608573, PMID:24689082, PMID:24710284, PMID:24728189, PMID:24728327, PMID:24737826, PMID:24763289, PMID:24933000, PMID:25006859, PMID:25110875, PMID:25111426, PMID:25117503, PMID:25133505, PMID:25142776, PMID:25186627, PMID:25194673, PMID:25203624, PMID:25224212, PMID:25231023, PMID:25303977, PMID:25307252, PMID:25318351, PMID:25318681, PMID:25370038, PMID:25419514, PMID:25430799, PMID:25479140, PMID:25503501, PMID:25525159, PMID:25559809, PMID:25561518, PMID:25583476, PMID:25617771, PMID:25637381, PMID:25648859, PMID:25670083, PMID:25741868, PMID:25801821, PMID:25848751, PMID:25871441, PMID:25892863, PMID:25980754, PMID:26099011, PMID:26181448, PMID:26206375, PMID:26296696, PMID:26300997, PMID:26318770, PMID:26332594, PMID:26333163, PMID:26436109, PMID:26437257, PMID:26440929, PMID:26457233, PMID:26467025, PMID:26483394, PMID:26517685, PMID:26530882, PMID:26544533, PMID:26552419, PMID:26580448, PMID:26635394, PMID:26648449, PMID:26666765, PMID:26674132, PMID:26681312, PMID:26689913, PMID:26691941, PMID:26720728, PMID:26805314, PMID:26832770, PMID:26845104, PMID:26888055, PMID:26898890, PMID:26900293, PMID:26901136, PMID:26976419, PMID:27028851, PMID:27060149, PMID:27153395, PMID:27273229, PMID:27294619, PMID:27300552, PMID:27329137, PMID:27443514, PMID:27449771, PMID:27487738, PMID:27553368, PMID:27600092, PMID:27601186, PMID:27696107, PMID:27723366, PMID:27760322, PMID:27854360, PMID:27878467, PMID:27920101, PMID:27928858, PMID:27978560, PMID:28125075, PMID:28135145, PMID:28153049, PMID:28176205, PMID:28195393, PMID:28283864, PMID:28323777, PMID:28460341, PMID:28466842, PMID:28481244, PMID:28492532, PMID:28502729, PMID:28503720, PMID:28514183, PMID:28528518, PMID:28531214, PMID:28596308, PMID:28640387, PMID:28687356, PMID:28726808, PMID:28767289, PMID:28873162, PMID:28874130, PMID:28878254, PMID:28932927, PMID:28944238, PMID:29212164, PMID:29345684, PMID:29360161, PMID:29368341, PMID:29575718, PMID:29596542, PMID:29659569, PMID:29684080, PMID:29750335, PMID:29785566, PMID:29887214, PMID:29915797, PMID:29922827, PMID:29945567, PMID:30013564, PMID:30128536, PMID:30225334, PMID:30256826, PMID:30306255, PMID:30311386, PMID:30498870, PMID:30521064, PMID:30982232, PMID:31100584, PMID:31204389, PMID:31307542, PMID:31386297, PMID:31391288, PMID:31422574, PMID:31422818, PMID:31666926, PMID:31965077, PMID:32141610, PMID:32566746, PMID:32773772 NCBI chr17:87,975,050...87,990,892
Ensembl chr17:87,975,062...87,990,892
JBrowse link
hereditary nonpolyposis colorectal cancer type 6 term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Tgfbr2 transforming growth factor, beta receptor II ISO ClinVar Annotator: match by term: Colon cancer, hereditary nonpolyposis, type 6
ClinVar Annotator: match by term: Hereditary nonpolyposis colorectal cancer type 6
OMIM
ClinVar
PMID:9590282, PMID:9927040, PMID:11212236, PMID:15235604, PMID:15731757, PMID:16791849, PMID:16928994, PMID:17061023, PMID:17319955, PMID:17344846, PMID:17652900, PMID:17935258, PMID:18084123, PMID:18781618, PMID:19996017, PMID:20956634, PMID:21267002, PMID:21524434, PMID:22113417, PMID:22488992, PMID:23103230, PMID:24033266, PMID:24055113, PMID:24941995, PMID:25116393, PMID:25741868, PMID:26017485, PMID:27879313, PMID:27930701, PMID:28492532, PMID:28659821 NCBI chr 9:116,087,695...116,175,363
Ensembl chr 9:116,084,293...116,175,360
JBrowse link
hereditary nonpolyposis colorectal cancer type 7 term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Arel1 apoptosis resistant E3 ubiquitin protein ligase 1 ISO ClinVar Annotator: match by term: MLH3-Related Lynch Syndrome ClinVar PMID:12702580, PMID:17656264, PMID:22290698, PMID:28492532 NCBI chr12:84,918,140...84,970,878
Ensembl chr12:84,918,148...84,970,900
JBrowse link
G Eif2b2 eukaryotic translation initiation factor 2B, subunit 2 beta ISO ClinVar Annotator: match by term: Hereditary nonpolyposis colorectal cancer type 7 ClinVar NCBI chr12:85,219,481...85,226,628
Ensembl chr12:85,219,481...85,226,628
JBrowse link
G Mlh3 mutL homolog 3 ISO ClinVar Annotator: match by term: Hereditary nonpolyposis colorectal cancer type 7
ClinVar Annotator: match by term: MLH3-Related Lynch Syndrome
ClinVar Annotator: match by OMIM:614385
OMIM
ClinVar
PMID:11586295, PMID:12702580, PMID:12800209, PMID:16885347, PMID:16981255, PMID:17656264, PMID:18414213, PMID:18521850, PMID:19156873, PMID:21153778, PMID:22290698, PMID:23960188, PMID:24549055, PMID:25142776, PMID:25637381, PMID:25741868, PMID:26296701, PMID:27696107, PMID:28492532, PMID:29212164, PMID:30311386 NCBI chr12:85,234,466...85,270,647
Ensembl chr12:85,234,520...85,270,599
JBrowse link
hereditary nonpolyposis colorectal cancer type 8 term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Epcam epithelial cell adhesion molecule ISO ClinVar Annotator: match by term: Hereditary nonpolyposis colorectal cancer type 8
ClinVar Annotator: match by OMIM:613244
OMIM
ClinVar
PMID:16951683, PMID:19098912, PMID:23462293, PMID:24142340, PMID:25741868, PMID:28492532, PMID:28701297 NCBI chr17:87,635,979...87,651,127
Ensembl chr17:87,635,979...87,651,129
JBrowse link
immunodeficiency 10 term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Stim1 stromal interaction molecule 1 ISO ClinVar Annotator: match by term: STIM1 DEFICIENCY
ClinVar Annotator: match by term: Immune dysfunction with T-cell inactivation due to calcium entry defect 2
ClinVar Annotator: match by OMIM:612783
OMIM
ClinVar
PMID:19420366, PMID:20876309, PMID:21427704, PMID:22190180, PMID:24621671, PMID:25741868, PMID:25918394, PMID:26560041, PMID:28492532 NCBI chr 7:102,261,514...102,437,319
Ensembl chr 7:102,267,806...102,437,319
JBrowse link
immunodeficiency 11A term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Card11 caspase recruitment domain family, member 11 ISO ClinVar Annotator: match by term: Immunodeficiency 11 OMIM
ClinVar
PMID:18323416, PMID:23027925, PMID:23129749, PMID:23374270, PMID:23561803, PMID:24728327, PMID:25352053, PMID:25741868, PMID:26861442, PMID:28492532, PMID:28824638, PMID:29472930, PMID:30170123 NCBI chr 5:140,872,999...141,000,596
Ensembl chr 5:140,872,990...141,000,582
JBrowse link
immunodeficiency 15B term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Ikbkb inhibitor of kappaB kinase beta ISO OMIM NCBI chr 8:22,659,205...22,706,589
Ensembl chr 8:22,659,212...22,706,589
JBrowse link
immunodeficiency 19 term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Arcn1 archain 1 ISO ClinVar Annotator: match by term: Immunodeficiency 19 ClinVar PMID:28492532 NCBI chr 9:44,742,143...44,767,808
Ensembl chr 9:44,741,564...44,767,845
JBrowse link
G Atp5l ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial F0 complex, subunit G ISO ClinVar Annotator: match by term: Immunodeficiency 19 ClinVar PMID:28492532 NCBI chr 9:44,913,248...44,920,742
Ensembl chr 9:44,912,557...44,920,742
JBrowse link
G Bcl9l B cell CLL/lymphoma 9-like ISO ClinVar Annotator: match by term: Immunodeficiency 19 ClinVar PMID:28492532 NCBI chr 9:44,482,738...44,511,906
Ensembl chr 9:44,482,825...44,511,896
JBrowse link
G Ccdc84 coiled-coil domain containing 84 ISO ClinVar Annotator: match by term: Immunodeficiency 19 ClinVar PMID:28492532 NCBI chr 9:44,410,159...44,418,084
Ensembl chr 9:44,410,159...44,418,569
JBrowse link
G Cd3d CD3 antigen, delta polypeptide ISO ClinVar Annotator: match by term: Immunodeficiency 19
ClinVar Annotator: match by OMIM:615617
OMIM
ClinVar
PMID:10935641, PMID:14602880, PMID:15546002, PMID:21883749, PMID:21926461, PMID:22039266, PMID:23336327, PMID:24290291, PMID:25344390, PMID:27807805, PMID:28492532 NCBI chr 9:44,981,769...44,987,052
Ensembl chr 9:44,981,786...44,987,339
JBrowse link
G Cd3e CD3 antigen, epsilon polypeptide ISO ClinVar Annotator: match by term: Immunodeficiency 19 ClinVar PMID:28492532 NCBI chr 9:44,998,735...45,009,663
Ensembl chr 9:44,998,740...45,009,627
JBrowse link
G Cd3g CD3 antigen, gamma polypeptide ISO ClinVar Annotator: match by term: Immunodeficiency 19 ClinVar PMID:28492532 NCBI chr 9:44,969,572...44,980,431
Ensembl chr 9:44,969,572...44,980,431
JBrowse link
G Cxcr5 chemokine (C-X-C motif) receptor 5 ISO ClinVar Annotator: match by term: Immunodeficiency 19 ClinVar PMID:28492532 NCBI chr 9:44,511,787...44,526,444
Ensembl chr 9:44,511,787...44,561,877
JBrowse link
G Ddx6 DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 6 ISO ClinVar Annotator: match by term: Immunodeficiency 19 ClinVar PMID:28492532 NCBI chr 9:44,602,983...44,640,731
Ensembl chr 9:44,604,892...44,640,731
JBrowse link
G Dpagt1 dolichyl-phosphate (UDP-N-acetylglucosamine) acetylglucosaminephosphotransferase 1 (GlcNAc-1-P transferase) ISO ClinVar Annotator: match by term: Immunodeficiency 19 ClinVar PMID:28492532 NCBI chr 9:44,325,857...44,333,895
Ensembl chr 9:44,326,019...44,333,900
JBrowse link
G Foxr1 forkhead box R1 ISO ClinVar Annotator: match by term: Immunodeficiency 19 ClinVar PMID:28492532 NCBI chr 9:44,434,234...44,440,868
Ensembl chr 9:44,433,773...44,441,136
JBrowse link
G H2ax H2A.X variant histone ISO ClinVar Annotator: match by term: Immunodeficiency 19 ClinVar PMID:28492532 NCBI chr 9:44,334,715...44,336,077
Ensembl chr 9:44,334,694...44,336,077
JBrowse link
G Hmbs hydroxymethylbilane synthase ISO ClinVar Annotator: match by term: Immunodeficiency 19 ClinVar PMID:28492532 NCBI chr 9:44,336,348...44,344,228
Ensembl chr 9:44,336,339...44,344,228
JBrowse link
G Hyou1 hypoxia up-regulated 1 ISO ClinVar Annotator: match by term: Immunodeficiency 19 ClinVar PMID:28492532 NCBI chr 9:44,379,490...44,392,369
Ensembl chr 9:44,379,490...44,392,369
JBrowse link
G Ift46 intraflagellar transport 46 ISO ClinVar Annotator: match by term: Immunodeficiency 19 ClinVar PMID:28492532 NCBI chr 9:44,770,456...44,792,714
Ensembl chr 9:44,767,908...44,793,447
JBrowse link
G Il10ra interleukin 10 receptor, alpha ISO ClinVar Annotator: match by term: Immunodeficiency 19 ClinVar PMID:28492532 NCBI chr 9:45,253,837...45,269,149
Ensembl chr 9:45,253,837...45,269,149
JBrowse link
G Jaml junction adhesion molecule like ISO ClinVar Annotator: match by term: Immunodeficiency 19 ClinVar PMID:28492532 NCBI chr 9:45,079,153...45,108,531
Ensembl chr 9:45,079,183...45,108,534
JBrowse link
G Kmt2a lysine (K)-specific methyltransferase 2A ISO ClinVar Annotator: match by term: Immunodeficiency 19 ClinVar PMID:28492532 NCBI chr 9:44,803,355...44,881,352
Ensembl chr 9:44,803,355...44,881,296
JBrowse link
G Mpzl2 myelin protein zero-like 2 ISO ClinVar Annotator: match by term: Immunodeficiency 19 ClinVar PMID:28492532 NCBI chr 9:45,042,344...45,054,043
Ensembl chr 9:45,039,799...45,054,015
JBrowse link
G Mpzl3 myelin protein zero-like 3 ISO ClinVar Annotator: match by term: Immunodeficiency 19 ClinVar PMID:28492532 NCBI chr 9:45,055,181...45,077,437
Ensembl chr 9:45,055,186...45,077,436
JBrowse link
G Phldb1 pleckstrin homology like domain, family B, member 1 ISO ClinVar Annotator: match by term: Immunodeficiency 19 ClinVar PMID:28492532 NCBI chr 9:44,686,308...44,735,248
Ensembl chr 9:44,686,304...44,735,198
JBrowse link
G Rps25 ribosomal protein S25 ISO ClinVar Annotator: match by term: Immunodeficiency 19 ClinVar PMID:28492532 NCBI chr 9:44,407,714...44,410,406
Ensembl chr 9:44,407,139...44,410,427
JBrowse link
G Scn2b sodium channel, voltage-gated, type II, beta ISO ClinVar Annotator: match by term: Immunodeficiency 19 ClinVar PMID:28492532 NCBI chr 9:45,117,876...45,130,070
Ensembl chr 9:45,117,782...45,130,070
JBrowse link
G Scn4b sodium channel, type IV, beta ISO ClinVar Annotator: match by term: Immunodeficiency 19 ClinVar PMID:28492532 NCBI chr 9:45,138,624...45,154,155
Ensembl chr 9:45,138,395...45,154,152
JBrowse link
G Slc37a4 solute carrier family 37 (glucose-6-phosphate transporter), member 4 ISO ClinVar Annotator: match by term: Immunodeficiency 19 ClinVar PMID:28492532 NCBI chr 9:44,396,946...44,402,966
Ensembl chr 9:44,396,852...44,402,968
JBrowse link
G Tmem25 transmembrane protein 25 ISO ClinVar Annotator: match by term: Immunodeficiency 19 ClinVar PMID:28492532 NCBI chr 9:44,793,772...44,799,524
Ensembl chr 9:44,793,769...44,799,307
JBrowse link
G Tmprss4 transmembrane protease, serine 4 ISO ClinVar Annotator: match by term: Immunodeficiency 19 ClinVar PMID:28492532 NCBI chr 9:45,172,726...45,204,119
Ensembl chr 9:45,172,726...45,204,092
JBrowse link
G Trappc4 trafficking protein particle complex 4 ISO ClinVar Annotator: match by term: Immunodeficiency 19 ClinVar PMID:28492532 NCBI chr 9:44,403,755...44,407,548
Ensembl chr 9:44,403,698...44,407,600
JBrowse link
G Treh trehalase (brush-border membrane glycoprotein) ISO ClinVar Annotator: match by term: Immunodeficiency 19 ClinVar PMID:28492532 NCBI chr 9:44,673,233...44,686,305
Ensembl chr 9:44,673,233...44,686,305
JBrowse link
G Ttc36 tetratricopeptide repeat domain 36 ISO ClinVar Annotator: match by term: Immunodeficiency 19 ClinVar PMID:28492532 NCBI chr 9:44,799,400...44,802,951
Ensembl chr 9:44,799,397...44,803,072
JBrowse link
G Ube4a ubiquitination factor E4A ISO ClinVar Annotator: match by term: Immunodeficiency 19 ClinVar PMID:28492532 NCBI chr 9:44,923,127...44,965,615
Ensembl chr 9:44,923,127...44,965,600
JBrowse link
G Upk2 uroplakin 2 ISO ClinVar Annotator: match by term: Immunodeficiency 19 ClinVar PMID:28492532 NCBI chr 9:44,452,715...44,454,767
Ensembl chr 9:44,452,715...44,454,976
JBrowse link
G Vps11 VPS11, CORVET/HOPS core subunit ISO ClinVar Annotator: match by term: Immunodeficiency 19 ClinVar PMID:28492532 NCBI chr 9:44,347,749...44,361,673
Ensembl chr 9:44,347,749...44,361,670
JBrowse link
immunodeficiency 22 term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Lck lymphocyte protein tyrosine kinase ISO ClinVar Annotator: match by term: Immunodeficiency 22 ClinVar
OMIM
PMID:22985903, PMID:25741868, PMID:28492532 NCBI chr 4:129,548,344...129,573,641
Ensembl chr 4:129,548,344...129,573,641
JBrowse link
immunodeficiency 24 term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Ctps cytidine 5'-triphosphate synthase ISO ClinVar Annotator: match by term: Immunodeficiency 24 OMIM
ClinVar
PMID:24870241, PMID:27638562, PMID:28492532 NCBI chr 4:120,539,868...120,570,276
Ensembl chr 4:120,539,868...120,570,276
JBrowse link
immunodeficiency 26 term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Prkdc protein kinase, DNA activated, catalytic polypeptide ISO ClinVar Annotator: match by term: Immunodeficiency 26 without neurologic abnormalities
ClinVar Annotator: match by term: Immunodeficiency 26 with or without neurologic abnormalities
ClinVar
OMIM
PMID:19075392, PMID:23722905, PMID:25741868, PMID:26122175, PMID:28492532 NCBI chr16:15,637,444...15,842,239
Ensembl chr16:15,637,866...15,842,235
JBrowse link
immunodeficiency 48 term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Zap70 zeta-chain (TCR) associated protein kinase ISO ClinVar Annotator: match by term: Combined immunodeficiency due to ZAP70 deficiency
ClinVar Annotator: match by term: ZAP70-Related Severe Combined Immunodeficiency
OMIM
ClinVar
PMID:8124727, PMID:8202712, PMID:8202713, PMID:11412303, PMID:24033266, PMID:25741868, PMID:28492532 NCBI chr 1:36,761,798...36,782,821
Ensembl chr 1:36,761,798...36,782,818
JBrowse link
immunodeficiency 54 term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Mcm4 minichromosome maintenance complex component 4 ISO ClinVar Annotator: match by term: Natural killer cell and glucocorticoid deficiency with DNA repair defect
ClinVar Annotator: match by OMIM:609981
OMIM
ClinVar
PMID:16532402, PMID:22354167, PMID:22354170, PMID:22499342, PMID:24033266, PMID:25741868, PMID:28492532 NCBI chr16:15,623,897...15,637,400
Ensembl chr16:15,623,897...15,637,400
JBrowse link
immunodeficiency 9 term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Orai1 ORAI calcium release-activated calcium modulator 1 ISO ClinVar Annotator: match by term: IMMUNODEFICIENCY 9
ClinVar Annotator: match by term: Immune dysfunction with T-cell inactivation due to calcium entry defect 1
ClinVar Annotator: match by OMIM:612782
OMIM
ClinVar
PMID:7531512, PMID:7798233, PMID:8814256, PMID:16582901, PMID:18187424, PMID:19182790, PMID:20004786, PMID:24033266, PMID:25741868, PMID:26576490, PMID:28492532, PMID:31036819 NCBI chr 5:123,015,074...123,030,452
Ensembl chr 5:123,015,074...123,030,456
JBrowse link
Immunoskeletal Dysplasia with Neurodevelopmental Abnormalities term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Extl3 exostosin-like glycosyltransferase 3 ISO ClinVar Annotator: match by term: IMMUNOSKELETAL DYSPLASIA WITH NEURODEVELOPMENTAL ABNORMALITIES
ClinVar Annotator: match by term: Immunoskeletal dysplasia with neurodevelopmental abnormalities
ClinVar
OMIM
PMID:25741868, PMID:28132690, PMID:28148688 NCBI chr14:65,052,059...65,149,899
Ensembl chr14:65,052,060...65,149,855
JBrowse link
janus kinase-3 deficiency term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Jak3 Janus kinase 3 ISS OMIM:600802 MouseDO NCBI chr 8:71,676,383...71,690,577
Ensembl chr 8:71,676,296...71,690,575
JBrowse link
Li-Fraumeni syndrome term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Alox12b arachidonate 12-lipoxygenase, 12R type ISO ClinVar Annotator: match by term: Li-Fraumeni syndrome ClinVar PMID:20522432, PMID:21056402, PMID:23172776, PMID:26681312, PMID:28492532 NCBI chr11:69,157,072...69,169,791
Ensembl chr11:69,156,989...69,169,792
JBrowse link
G Alox8 arachidonate 8-lipoxygenase ISO ClinVar Annotator: match by term: Li-Fraumeni syndrome ClinVar PMID:20522432, PMID:21056402, PMID:23172776, PMID:26681312, PMID:28492532 NCBI chr11:69,183,885...69,197,843
Ensembl chr11:69,183,932...69,197,843
JBrowse link
G Aloxe3 arachidonate lipoxygenase 3 ISO ClinVar Annotator: match by term: Li-Fraumeni syndrome ClinVar PMID:20522432, PMID:21056402, PMID:23172776, PMID:26681312, PMID:28492532 NCBI chr11:69,125,417...69,149,115
Ensembl chr11:69,125,896...69,149,115
JBrowse link
G Arhgef15 Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 15 ISO ClinVar Annotator: match by term: Li-Fraumeni syndrome ClinVar PMID:20522432, PMID:21056402, PMID:23172776, PMID:26681312, PMID:28492532 NCBI chr11:68,928,900...68,956,934
Ensembl chr11:68,943,155...68,957,480
JBrowse link
G Aurkb aurora kinase B ISO ClinVar Annotator: match by term: Li-Fraumeni syndrome ClinVar PMID:20522432, PMID:21056402, PMID:23172776, PMID:26681312, PMID:28492532 NCBI chr11:69,045,624...69,051,664
Ensembl chr11:69,045,647...69,051,664
JBrowse link
G Borcs6 BLOC-1 related complex subunit 6 ISO ClinVar Annotator: match by term: Li-Fraumeni syndrome ClinVar PMID:20522432, PMID:21056402, PMID:23172776, PMID:26681312, PMID:28492532 NCBI chr11:69,059,775...69,061,576
Ensembl chr11:69,059,717...69,061,578
JBrowse link
G Chd3 chromodomain helicase DNA binding protein 3 ISO ClinVar Annotator: match by term: Li-Fraumeni syndrome ClinVar PMID:20522432, PMID:21056402, PMID:23172776, PMID:26681312, PMID:28492532 NCBI chr11:69,343,273...69,369,499
Ensembl chr11:69,343,273...69,369,406
JBrowse link
G Chek2 checkpoint kinase 2 ISO CTD Direct Evidence: marker/mechanism
ClinVar Annotator: match by term: Li-Fraumeni syndrome
CTD
ClinVar
PMID:10617473, PMID:11053450, PMID:11298456, PMID:11390408, PMID:11479205, PMID:11571648, PMID:11719428, PMID:11901158, PMID:11967536, PMID:12049740, PMID:12094328, PMID:12533788, PMID:12610780, PMID:12690581, PMID:14648717, PMID:14648718, PMID:14648719, PMID:15122511, PMID:15239132, PMID:15488637, PMID:15492928, PMID:15520402, PMID:15535844, PMID:16257342, PMID:16492927, PMID:16880452, PMID:16982735, PMID:17085682, PMID:17721994, PMID:18172190, PMID:19338683, PMID:19805189, PMID:21807500, PMID:21956126, PMID:22006311, PMID:22058428, PMID:22114986, PMID:22419737, PMID:22811390, PMID:22994785, PMID:23334666, PMID:23469205, PMID:24033266, PMID:24549055, PMID:24728327, PMID:24884479, PMID:25431674, PMID:25741868, PMID:26084796, PMID:26467025, PMID:26641009, PMID:26681312, PMID:26822237, PMID:26845104, PMID:26884562, PMID:26898890, PMID:27067391, PMID:27083775, PMID:27153395, PMID:27269948, PMID:27433846, PMID:27751358, PMID:27798748, PMID:28125075, PMID:28135145, PMID:28195393, PMID:28492532, PMID:28503720, PMID:28514723, PMID:28724667, PMID:28727877, PMID:28734145, PMID:28779002, PMID:28802053, PMID:28874143, PMID:29146883, PMID:29351919, PMID:29356917, PMID:29479983, PMID:29489754, PMID:29520813, PMID:29684080, PMID:29909963, PMID:30311386, PMID:30851065, PMID:30967556 NCBI chr 5:110,839,800...110,874,140
Ensembl chr 5:110,839,979...110,874,145
JBrowse link
G Cntrob centrobin, centrosomal BRCA2 interacting protein ISO ClinVar Annotator: match by term: Li-Fraumeni syndrome ClinVar PMID:20522432, PMID:21056402, PMID:23172776, PMID:26681312, PMID:28492532 NCBI chr11:69,297,909...69,323,898
Ensembl chr11:69,299,487...69,323,775
JBrowse link
G Ctc1 CTS telomere maintenance complex component 1 ISO ClinVar Annotator: match by term: Li-Fraumeni syndrome ClinVar PMID:20522432, PMID:21056402, PMID:23172776, PMID:26681312, PMID:28492532 NCBI chr11:69,015,188...69,036,473
Ensembl chr11:69,015,911...69,036,473
JBrowse link
G Cyb5d1 cytochrome b5 domain containing 1 ISO ClinVar Annotator: match by term: Li-Fraumeni syndrome ClinVar PMID:20522432, PMID:21056402, PMID:23172776, PMID:26681312, PMID:28492532 NCBI chr11:69,390,930...69,395,727
Ensembl chr11:69,391,925...69,395,631
JBrowse link
G Dnah2 dynein, axonemal, heavy chain 2 ISO ClinVar Annotator: match by term: Li-Fraumeni syndrome ClinVar PMID:20522432, PMID:21056402, PMID:23172776, PMID:26681312, PMID:28492532 NCBI chr11:69,420,807...69,549,108
Ensembl chr11:69,420,809...69,549,110
JBrowse link
G Efnb3 ephrin B3 ISO ClinVar Annotator: match by term: Li-Fraumeni syndrome ClinVar PMID:20522432, PMID:21056402, PMID:23172776, PMID:26681312, PMID:28492532 NCBI chr11:69,554,092...69,561,150
Ensembl chr11:69,554,092...69,560,205
JBrowse link
G Gm22442 predicted gene, 22442 ISO ClinVar Annotator: match by term: Li-Fraumeni syndrome ClinVar PMID:20522432, PMID:21056402, PMID:23172776, PMID:26681312, PMID:28492532 NCBI chr11:69,350,518...69,350,661
Ensembl chr11:69,350,518...69,350,661
JBrowse link
G Gucy2e guanylate cyclase 2e ISO ClinVar Annotator: match by term: Li-Fraumeni syndrome ClinVar PMID:20522432, PMID:21056402, PMID:23172776, PMID:26681312, PMID:28492532 NCBI chr11:69,218,117...69,237,279
Ensembl chr11:69,218,117...69,237,036
JBrowse link
G Hes7 hes family bHLH transcription factor 7 ISO ClinVar Annotator: match by term: Li-Fraumeni syndrome ClinVar PMID:20522432, PMID:21056402, PMID:23172776, PMID:26681312, PMID:28492532 NCBI chr11:69,118,906...69,124,054
Ensembl chr11:69,120,404...69,124,055
JBrowse link
G Kcnab3 potassium voltage-gated channel, shaker-related subfamily, beta member 3 ISO ClinVar Annotator: match by term: Li-Fraumeni syndrome ClinVar PMID:20522432, PMID:21056402, PMID:23172776, PMID:26681312, PMID:28492532 NCBI chr11:69,326,258...69,333,041
Ensembl chr11:69,326,258...69,333,042
JBrowse link
G Kdm6b KDM1 lysine (K)-specific demethylase 6B ISO ClinVar Annotator: match by term: Li-Fraumeni syndrome ClinVar PMID:20522432, PMID:21056402, PMID:23172776, PMID:26681312, PMID:28492532 NCBI chr11:69,398,508...69,420,367
Ensembl chr11:69,398,508...69,413,675
JBrowse link
G Naa38 N(alpha)-acetyltransferase 38, NatC auxiliary subunit ISO ClinVar Annotator: match by term: Li-Fraumeni syndrome ClinVar PMID:20522432, PMID:21056402, PMID:23172776, PMID:26681312, PMID:28492532 NCBI chr11:69,395,791...69,396,671
Ensembl chr11:69,395,487...69,396,680
JBrowse link
G Odf4 outer dense fiber of sperm tails 4 ISO ClinVar Annotator: match by term: Li-Fraumeni syndrome ClinVar PMID:20522432, PMID:21056402, PMID:23172776, PMID:26681312, PMID:28492532 NCBI chr11:68,921,835...68,927,081
Ensembl chr11:68,921,835...68,927,081
JBrowse link
G Per1 period circadian clock 1 ISO ClinVar Annotator: match by term: Li-Fraumeni syndrome ClinVar PMID:20522432, PMID:21056402, PMID:23172776, PMID:26681312, PMID:28492532 NCBI chr11:69,095,108...69,109,965
Ensembl chr11:69,095,217...69,109,960
JBrowse link
G Pfas phosphoribosylformylglycinamidine synthase (FGAR amidotransferase) ISO ClinVar Annotator: match by term: Li-Fraumeni syndrome ClinVar PMID:20522432, PMID:21056402, PMID:23172776, PMID:26681312, PMID:28492532 NCBI chr11:68,985,701...69,008,460
Ensembl chr11:68,985,697...69,008,460
JBrowse link
G Rangrf RAN guanine nucleotide release factor ISO ClinVar Annotator: match by term: Li-Fraumeni syndrome ClinVar PMID:20522432, PMID:21056402, PMID:23172776, PMID:26681312, PMID:28492532 NCBI chr11:68,972,484...68,975,185
Ensembl chr11:68,972,484...68,975,185
JBrowse link
G Rnf227 ring finger protein 227 ISO ClinVar Annotator: match by term: Li-Fraumeni syndrome ClinVar PMID:20522432, PMID:21056402, PMID:23172776, PMID:26681312, PMID:28492532 NCBI chr11:69,340,796...69,342,641
Ensembl chr11:69,340,461...69,342,641
JBrowse link
G Rpl26 ribosomal protein L26 ISO ClinVar Annotator: match by term: Li-Fraumeni syndrome ClinVar PMID:20522432, PMID:21056402, PMID:23172776, PMID:26681312, PMID:28492532 NCBI chr11:68,901,566...68,904,534
Ensembl chr11:68,901,583...68,906,989
JBrowse link
G Slc25a35 solute carrier family 25, member 35 ISO ClinVar Annotator: match by term: Li-Fraumeni syndrome ClinVar PMID:20522432, PMID:21056402, PMID:23172776, PMID:26681312, PMID:28492532 NCBI chr11:68,968,096...68,972,516
Ensembl chr11:68,968,131...68,974,365
JBrowse link
G Snord118 small nucleolar RNA, C/D box 118 ISO ClinVar Annotator: match by term: Li-Fraumeni syndrome ClinVar PMID:20522432, PMID:21056402, PMID:23172776, PMID:26681312, PMID:28492532 NCBI chr11:69,073,426...69,073,562
Ensembl chr11:69,073,427...69,073,561
JBrowse link
G Tmem107 transmembrane protein 107 ISO ClinVar Annotator: match by term: Li-Fraumeni syndrome ClinVar PMID:20522432, PMID:21056402, PMID:23172776, PMID:26681312, PMID:28492532 NCBI chr11:69,070,809...69,073,293
Ensembl chr11:69,070,806...69,073,293
JBrowse link
G Tmem88 transmembrane protein 88 ISO ClinVar Annotator: match by term: Li-Fraumeni syndrome ClinVar PMID:20522432, PMID:21056402, PMID:23172776, PMID:26681312, PMID:28492532 NCBI chr11:69,396,516...69,398,234
Ensembl chr11:69,396,519...69,398,234
JBrowse link
G Trappc1 trafficking protein particle complex 1 ISO ClinVar Annotator: match by term: Li-Fraumeni syndrome ClinVar PMID:20522432, PMID:21056402, PMID:23172776, PMID:26681312, PMID:28492532 NCBI chr11:69,323,986...69,325,793
Ensembl chr11:69,323,980...69,325,793
JBrowse link
G Trp53 transformation related protein 53 ISO
IEA
DNA:missense mutations
ClinVar Annotator: match by term: Li-Fraumeni syndrome
ClinVar Annotator: match by term: Sarcoma family syndrome of Li and Fraumeni
OMIM:151623 | OMIM:609265
CTD Direct Evidence: marker/mechanism
ClinVar Annotator: match by null
ClinVar
MouseDO
CTD
PMID:887414, PMID:920706, PMID:1349102, PMID:1349175, PMID:1359493, PMID:1394133, PMID:1467311, PMID:1552135, PMID:1559227, PMID:1562462, PMID:1565143, PMID:1565144, PMID:1569604, PMID:1581912, PMID:1591732, PMID:1631137, PMID:1631151, PMID:1644930, PMID:1672732, PMID:1673792, PMID:1679237, PMID:1683921, PMID:1686725, PMID:1737852, PMID:1849234, PMID:1915267, PMID:1918170, PMID:1933902, PMID:1975675, PMID:1978757, PMID:1999338, PMID:2046748, PMID:2113594, PMID:2134334, PMID:2259385, PMID:2531845, PMID:2554494, PMID:2750177, PMID:2802540, PMID:2826609, PMID:7565304, PMID:7599045, PMID:7651740, PMID:7664239, PMID:7669577, PMID:7700647, PMID:7706467, PMID:7707106, PMID:7732013, PMID:7750099, PMID:7761089, PMID:7783166, PMID:7791795, PMID:7796267, PMID:7881428, PMID:7887414, PMID:7936651, PMID:7955036, PMID:7966399, PMID:7969167, PMID:7978053, PMID:7981076, PMID:8012986, PMID:8023157, PMID:8062826, PMID:8075648, PMID:8080050, PMID:8099841, PMID:8102535, PMID:8118819, PMID:8134126, PMID:8134127, PMID:8164043, PMID:8198984, PMID:8203469, PMID:8242631, PMID:8242752, PMID:8308926, PMID:8336941, PMID:8352280, PMID:8364550, PMID:8401536, PMID:8423216, PMID:8425176, PMID:8479743, PMID:8479749, PMID:8527048, PMID:8550239, PMID:8633021, PMID:8639798, PMID:8649785, PMID:8675009, PMID:8688334, PMID:8700525, PMID:8710380, PMID:8718514, PMID:8756654, PMID:8825920, PMID:8829627, PMID:9020384, PMID:9047394, PMID:9049183, PMID:9067756, PMID:9096669, PMID:9115587, PMID:9150393, PMID:9157982, PMID:9207066, PMID:9218725, PMID:9242456, PMID:9285560, PMID:9290701, PMID:9301461, PMID:9364015, PMID:9367778, PMID:9405613, PMID:9407971, PMID:9446663, PMID:9452042, PMID:9470817, PMID:9472631, PMID:9482117, PMID:9524109, PMID:9525742, PMID:9546439, PMID:9569035, PMID:9569050, PMID:9572492, PMID:9582268, PMID:9598730, PMID:9607760, PMID:9627118, PMID:9632751, PMID:9635828, PMID:9662334, PMID:9667734, PMID:9681828, PMID:9704930, PMID:9704931, PMID:9723024, PMID:9766574, PMID:9792154, PMID:9825943, PMID:9839505, PMID:9865903, PMID:9891044, PMID:10064694, PMID:10206274, PMID:10229196, PMID:10329187, PMID:10389749, PMID:10408787, PMID:10411893, PMID:10432928, PMID:10435620, PMID:10486243, PMID:10486318, PMID:10497279, PMID:10507764, PMID:10519380, PMID:10519384, PMID:10554037, PMID:10557074, PMID:10567903, PMID:10589545, PMID:10616528, PMID:10629033, PMID:10653977, PMID:10654936, PMID:10697617, PMID:10706125, PMID:10713666, PMID:10719737, PMID:10753186, PMID:10754498, PMID:10761705, PMID:10777217, PMID:10780666, PMID:10797439, PMID:10802655, PMID:10811497, PMID:10854221, PMID:10864200, PMID:10871862, PMID:10914716, PMID:10922393, PMID:10949938, PMID:10980596, PMID:11040944, PMID:11051239, PMID:11051241, PMID:11101847, PMID:11124955, PMID:11139324, PMID:11161397, PMID:11180592, PMID:11222779, PMID:11229518, PMID:11238924, PMID:11285227, PMID:11313981, PMID:11315715, PMID:11332399, PMID:11358831, PMID:11359905, PMID:11370630, PMID:11391594, PMID:11403041, PMID:11420672, PMID:11420676, PMID:11423991, PMID:11429700, PMID:11429705, PMID:11453810, PMID:11479205, PMID:11481490, PMID:11494139, PMID:11518751, PMID:11590071, PMID:11593407, PMID:11600572, PMID:11668476, PMID:11715068, PMID:11753428, PMID:11782540, PMID:11793474, PMID:11896595, PMID:11900253, PMID:11920788, PMID:11920959, PMID:12007217, PMID:12019170, PMID:12034820, PMID:12067251, PMID:12070601, PMID:12076704, PMID:12124823, PMID:12209975, PMID:12406399, PMID:12433927, PMID:12509279, PMID:12509970, PMID:12524418, PMID:12567188, PMID:12610779, PMID:12619118, PMID:12672316, PMID:12695689, PMID:12700230, PMID:12702523, PMID:12716906, PMID:12725534, PMID:12726864, PMID:12759621, PMID:12779080, PMID:12792784, PMID:12826609, PMID:12885464, PMID:12901974, PMID:12909720, PMID:12917626, PMID:14559903, PMID:14584079, PMID:14612556, PMID:14656244, PMID:14670539, PMID:14673037, PMID:14695212, PMID:15004724, PMID:15017592, PMID:15037740, PMID:15060172, PMID:15077194, PMID:15095302, PMID:15121773, PMID:15138567, PMID:15161705, PMID:15173255, PMID:15192123, PMID:15221755, PMID:15308588, PMID:15342977, PMID:15355915, PMID:15381368, PMID:15390294, PMID:15489903, PMID:15523690, PMID:15541116, PMID:15548685, PMID:15564800, PMID:15580553, PMID:15607980, PMID:15607981, PMID:15611070, PMID:15630097, PMID:15654279, PMID:15659650, PMID:15703170, PMID:15722483, PMID:15741269, PMID:15756275, PMID:15781620, PMID:15781632, PMID:15784129, PMID:15825182, PMID:15850016, PMID:15851479, PMID:15925506, PMID:15951970, PMID:15964795, PMID:15977174, PMID:15982667, PMID:15993273, PMID:16000567, PMID:16007150, PMID:16033918, PMID:16061860, PMID:16199549, PMID:16204849, PMID:16209708, PMID:16258005, PMID:16288208, PMID:16312222, PMID:16322298, PMID:16333835, PMID:16337994, PMID:16401470, PMID:16437140, PMID:16474844, PMID:16477330, PMID:16489069, PMID:16494995, PMID:16508005, PMID:16522644, PMID:16534790, PMID:16551709, PMID:16596195, PMID:16633321, PMID:16644204, PMID:16682957, PMID:16687402, PMID:16707427, PMID:16736287, PMID:16741917, PMID:16778209, PMID:16793544, PMID:16818505, PMID:16818665, PMID:16821082, PMID:16827139, PMID:16861262, PMID:16907706, PMID:16941491, PMID:16964264, PMID:16969106, PMID:17002294, PMID:17015838, PMID:17133269, PMID:17170001, PMID:17189187, PMID:17224074, PMID:17224268, PMID:17289876, PMID:17301252, PMID:17308077, PMID:17311302, PMID:17318340, PMID:17390010, PMID:17401428, PMID:17401432, PMID:17417627, PMID:17417775, PMID:17427234, PMID:17436385, PMID:17530187, PMID:17535973, PMID:17540308, PMID:17541742, PMID:17557566, PMID:17567834, PMID:17572079, PMID:17599946, PMID:17606709, PMID:17636407, PMID:17638920, PMID:17683073, PMID:17690113, PMID:17724467, PMID:17727479, PMID:17875924, PMID:17903248, PMID:17947339, PMID:17977830, PMID:17982662, PMID:18037961, PMID:18199664, PMID:18208484, PMID:18248785, PMID:18307025, PMID:18348285, PMID:18348286, PMID:18357466, PMID:18391940, PMID:18393224, PMID:18413811, PMID:18453682, PMID:18477611, PMID:18489080, PMID:18511570, PMID:18555592, PMID:18575712, PMID:18580489, PMID:18628487, PMID:18685109, PMID:18762572, PMID:18798306, PMID:18818522, PMID:18923929, PMID:18978813, PMID:18989156, PMID:19012332, PMID:19052714, PMID:19101993, PMID:19127094, PMID:19127115, PMID:19147582, PMID:19160491, PMID:19165225, PMID:19171880, PMID:19224462, PMID:19336573, PMID:19367287, PMID:19367569, PMID:19378321, PMID:19405127, PMID:19416725, PMID:19454241, PMID:19462533, PMID:19468865, PMID:19509155, PMID:19521721, PMID:19523860, PMID:19556618, PMID:19558493, PMID:19671856, PMID:19681600, PMID:19711436, PMID:19714488, PMID:19714490, PMID:19717094, PMID:19756158, PMID:19759556, PMID:19763152, PMID:19786980, PMID:19806023, PMID:19834951, PMID:19850740, PMID:19877175, PMID:19881536, PMID:19909015, PMID:19913028, PMID:19930417, PMID:19933256, PMID:19958544, PMID:20010306, PMID:20013323, PMID:20017945, PMID:20025891, PMID:20028212, PMID:20113312, PMID:20118236, PMID:20127978, PMID:20128691, PMID:20182602, PMID:20195489, PMID:20198344, PMID:20234365, PMID:20301488, PMID:20307669, PMID:20308654, PMID:20364130, PMID:20407015, PMID:20421238, PMID:20436704, PMID:20443084, PMID:20449797, PMID:20455025, PMID:20471942, PMID:20478780, PMID:20504876, PMID:20505364, PMID:20506564, PMID:20516128, PMID:20520810, PMID:20522432, PMID:20538734, PMID:20575032, PMID:20634494, PMID:20638924, PMID:20658636, PMID:20689556, PMID:20693561, PMID:20805372, PMID:20878954, PMID:20932800, PMID:20967502, PMID:20972454, PMID:20978130, PMID:21056402, PMID:21056685, PMID:21059199, PMID:21080251, PMID:21115975, PMID:21118481, PMID:21159183, PMID:21187651, PMID:21192060, PMID:21225465, PMID:21232794, PMID:21288114, PMID:21305319, PMID:21319261, PMID:21339461, PMID:21343334, PMID:21345075, PMID:21348412, PMID:21348641, PMID:21356188, PMID:21380628, PMID:21445056, PMID:21464421, PMID:21470402, PMID:21483000, PMID:21484931, PMID:21488255, PMID:21512767, PMID:21514416, PMID:21519010, PMID:21520333, PMID:21522129, PMID:21528875, PMID:21535297, PMID:21546086, PMID:21552135, PMID:21561095, PMID:21601526, PMID:21619694, PMID:21621601, PMID:21626334, PMID:21637529, PMID:21665182, PMID:21666498, PMID:21672450, PMID:21674059, PMID:21747090, PMID:21760960, PMID:21760996, PMID:21761402, PMID:21763698, PMID:21900752, PMID:21901162, PMID:21904608, PMID:21934104, PMID:21953469, PMID:22006311, PMID:22040862, PMID:22052707, PMID:22090360, PMID:22109999, PMID:22110706, PMID:22114072, PMID:22170717, PMID:22178617, PMID:22186996, PMID:22187033, PMID:22188361, PMID:22198284, PMID:22203015, PMID:22228431, PMID:22233476, PMID:22265402, PMID:22319594, PMID:22354696, PMID:22356895, PMID:22373952, PMID:22406018, PMID:22427690, PMID:22495821, PMID:22507745, PMID:22540896, PMID:22551440, PMID:22571758, PMID:22652532, PMID:22653678, PMID:22672556, PMID:22698404, PMID:22703879, PMID:22710932, PMID:22713868, PMID:22722193, PMID:22729912, PMID:22744426, PMID:22768918, PMID:22797305, PMID:22811390, PMID:22829111, PMID:22844452, PMID:22847613, PMID:22851211, PMID:22862161, PMID:22866089, PMID:22877736, PMID:22887876, PMID:22899716, PMID:22915647, PMID:22919068, PMID:22923379, PMID:22923433, PMID:22949826, PMID:22983585, PMID:22989750, PMID:22992668, PMID:22999923, PMID:23031740, PMID:23117049, PMID:23124483, PMID:23149933, PMID:23161690, PMID:23165212, PMID:23172776, PMID:23175693, PMID:23196062, PMID:23200980, PMID:23246812, PMID:23255406, PMID:23259501, PMID:23263379, PMID:23264849, PMID:23265383, PMID:23297687, PMID:23315175, PMID:23334666, PMID:23334668, PMID:23340422, PMID:23355100, PMID:23359294, PMID:23403321, PMID:23406775, PMID:23409989, PMID:23469205, PMID:23484829, PMID:23525797, PMID:23531339, PMID:23538418, PMID:23555315, PMID:23570263, PMID:23580068, PMID:23612572, PMID:23612969, PMID:23624782, PMID:23625637, PMID:23630318, PMID:23639785, PMID:23665223, PMID:23667202, PMID:23667851, PMID:23713777, PMID:23733769, PMID:23792586, PMID:23887774, PMID:23894400, PMID:23897043, PMID:23950206, PMID:23967324, PMID:23973262, PMID:23981578, PMID:24009708, PMID:24033266, PMID:24038938, PMID:24076587, PMID:24113472, PMID:24122735, PMID:24198462, PMID:24218030, PMID:24256616, PMID:24278325, PMID:24307375, PMID:24326041, PMID:24336192, PMID:24373500, PMID:24381225, PMID:24382691, PMID:24384472, PMID:24395441, PMID:24448499, PMID:24451277, PMID:24487276, PMID:24487413, PMID:24501221, PMID:24549055, PMID:24556621, PMID:24573247, PMID:24590827, PMID:24594805, PMID:24603336, PMID:24630730, PMID:24641375, PMID:24651012, PMID:24651015, PMID:24663046, PMID:24665023, PMID:24677579, PMID:24682512, PMID:24700732, PMID:24702488, PMID:24724063, PMID:24728327, PMID:24729566, PMID:24733378, PMID:24763289, PMID:24764719, PMID:24766216, PMID:24797764, PMID:24803582, PMID:24810334, PMID:24813712, PMID:24814347, PMID:24835218, PMID:24835311, PMID:24853176, PMID:24868540, PMID:24884479, PMID:24896186, PMID:24908601, PMID:24916180, PMID:24929325, PMID:24936644, PMID:24940547, PMID:24952744, PMID:25034526, PMID:25047674, PMID:25056374, PMID:25074920, PMID:25119136, PMID:25122428, PMID:25123297, PMID:25149524, PMID:25157968, PMID:25169539, PMID:25184754, PMID:25186627, PMID:25226867, PMID:25234657, PMID:25293557, PMID:25294809, PMID:25299233, PMID:25303977, PMID:25318351, PMID:25326637, PMID:25339039, PMID:25339994, PMID:25348012, PMID:25365311, PMID:25374282, PMID:25428789, PMID:25433984, PMID:25452441, PMID:25460562, PMID:25490274, PMID:25490678, PMID:25503501, PMID:25504633, PMID:25512523, PMID:25516983, PMID:25525159, PMID:25527155, PMID:25544776, PMID:25564201, PMID:25584008, PMID:25584637, PMID:25587027, PMID:25589003, PMID:25612911, PMID:25619955, PMID:25634010, PMID:25634208, PMID:25637381, PMID:25669829, PMID:25691460, PMID:25741868, PMID:25742471, PMID:25757876, PMID:25762628, PMID:25787918, PMID:25794615, PMID:25846456, PMID:25856671, PMID:25860607, PMID:25881545, PMID:25886176, PMID:25896519, PMID:25923920, PMID:25925845, PMID:25927356, PMID:25945745, PMID:25952993, PMID:25980754, PMID:25981898, PMID:26000489, PMID:26010451, PMID:26014290, PMID:26024390, PMID:26029016, PMID:26086041, PMID:26094658, PMID:26181206, PMID:26200271, PMID:26205489, PMID:26206375, PMID:26225655, PMID:26230955, PMID:26270727, PMID:26332594, PMID:26367797, PMID:26425688, PMID:26447779, PMID:26452166, PMID:26467025, PMID:26475379, PMID:26484312, PMID:26497680, PMID:26527317, PMID:26534844, PMID:26554828, PMID:26556299, PMID:26572807, PMID:26580448, PMID:26585234, PMID:26619011, PMID:26628864, PMID:26641009, PMID:26659639, PMID:26681051, PMID:26681312, PMID:26681682, PMID:26690524, PMID:26696550, PMID:26718964, PMID:26743472, PMID:26781615, PMID:26786923, PMID:26787237, PMID:26818906, PMID:26822237, PMID:26837699, PMID:26845104, PMID:26878390, PMID:26911350, PMID:26976419, PMID:27022024, PMID:27034505, PMID:27059324, PMID:27077130, PMID:27091190, PMID:27101868, PMID:27146902, PMID:27150160, PMID:27153395, PMID:27157322, PMID:27179933, PMID:27189670, PMID:27194209, PMID:27210295, PMID:27223487, PMID:27242894, PMID:27267833, PMID:27276561, PMID:27276934, PMID:27297285, PMID:27328919, PMID:27374712, PMID:27391063, PMID:27443514, PMID:27443517, PMID:27449771, PMID:27463065, PMID:27484708, PMID:27489289, PMID:27493922, PMID:27496084, PMID:27501770, PMID:27516001, PMID:27523101, PMID:27533082, PMID:27545002, PMID:27616075, PMID:27619989, PMID:27621308, PMID:27622479, PMID:27626311, PMID:27657329, PMID:27662657, PMID:27663983, PMID:27680515, PMID:27683180, PMID:27714481, PMID:27724982, PMID:27726232, PMID:27741277, PMID:27785980, PMID:27834926, PMID:27866339, PMID:27895058, PMID:27911860, PMID:27923552, PMID:27959731, PMID:27978560, PMID:28025407, PMID:28091804, PMID:28125078, PMID:28135145, PMID:28152038, PMID:28199989, PMID:28202063, PMID:28222664, PMID:28230820, PMID:28234344, PMID:28255015, PMID:28279309, PMID:28288110, PMID:28349240, PMID:28369373, PMID:28408749, PMID:28452373, PMID:28453743, PMID:28472496, PMID:28475293, PMID:28476805, PMID:28477316, PMID:28477317, PMID:28486781, PMID:28492532, PMID:28499267, PMID:28503720, PMID:28528518, PMID:28573494, PMID:28649645, PMID:28664506, PMID:28681140, PMID:28724667, PMID:28744014, PMID:28772286, PMID:28819011, PMID:28826481, PMID:28843361, PMID:28861920, PMID:28902083, PMID:28915717, PMID:28961279, PMID:28975465, PMID:29025599, PMID:29056573, PMID:29070607, PMID:29079597, PMID:29126202, PMID:29170254, PMID:29225734, PMID:29247016, PMID:29300620, PMID:29324801, PMID:29338689, PMID:29348365, PMID:29360161, PMID:29365323, PMID:29416011, PMID:29470806, PMID:29478780, PMID:29489754, PMID:29522266, PMID:29667044, PMID:29752822, PMID:29753700, PMID:29769598, PMID:29770616, PMID:29774081, PMID:29785153, PMID:29936259, PMID:29945567, PMID:29946497, PMID:29955864, PMID:29958926, PMID:29979965, PMID:30076369, PMID:30087429, PMID:30092803, PMID:30107858, PMID:30128536, PMID:30181807, PMID:30190792, PMID:30212483, PMID:30216591, PMID:30224644, PMID:30256826, PMID:30287823, PMID:30297838, PMID:30306255, PMID:30311369, PMID:30327374, PMID:30352134, PMID:30374176, PMID:30450585, PMID:30588330, PMID:30607672, PMID:30630526, PMID:30709381, PMID:30709875, PMID:30720243, PMID:30840781, PMID:30883245, PMID:31016814, PMID:31081129, PMID:31105275, PMID:31159747, PMID:31235699, PMID:31422574, PMID:31775759, PMID:32566746, PMID:1631137 RGD:2290542 NCBI chr11:69,580,348...69,591,873
Ensembl chr11:69,580,359...69,591,873
JBrowse link
G Vamp2 vesicle-associated membrane protein 2 ISO ClinVar Annotator: match by term: Li-Fraumeni syndrome ClinVar PMID:20522432, PMID:21056402, PMID:23172776, PMID:26681312, PMID:28492532 NCBI chr11:69,088,528...69,092,381
Ensembl chr11:69,088,490...69,092,384
JBrowse link
G Wrap53 WD repeat containing, antisense to Trp53 ISO ClinVar Annotator: match by term: Li-Fraumeni syndrome ClinVar PMID:9242456, PMID:17683073, PMID:18511570, PMID:20522432, PMID:21056402, PMID:23172776, PMID:24033266, PMID:25741868, PMID:25762628, PMID:26681312, PMID:28492532 NCBI chr11:69,561,754...69,580,250
Ensembl chr11:69,561,758...69,580,255
JBrowse link
Li-Fraumeni syndrome 1 term browser
Symbol Object Name Qualifiers Evidence Notes Source PubMed Reference(s) RGD Reference(s) Position
G Chek2 checkpoint kinase 2 ISO ClinVar Annotator: match by term: Li-Fraumeni syndrome 1 ClinVar PMID:25741868, PMID:28492532 NCBI chr 5:110,839,800...110,874,140
Ensembl chr 5:110,839,979...110,874,145
JBrowse link
G Trp53 transformation related protein 53 ISO ClinVar Annotator: match by term: Li-Fraumeni syndrome 3
ClinVar Annotator: match by term: Li-Fraumeni syndrome 1
ClinVar Annotator: match by term: Sarcoma family syndrome of Li and Fraumeni
ClinVar Annotator: match by OMIM:151623
OMIM
ClinVar
PMID:920706, PMID:1349175, PMID:1394133, PMID:1559227, PMID:1562462, PMID:1565143, PMID:1565144, PMID:1581912, PMID:1591732, PMID:1631137, PMID:1644930, PMID:1683921, PMID:1686725, PMID:1737852, PMID:1933902, PMID:1975675, PMID:1978757, PMID:1999338, PMID:2259385, PMID:7565304, PMID:7599045, PMID:7706467, PMID:7707106, PMID:7732013, PMID:7783166, PMID:7796267, PMID:7799951, PMID:7887414, PMID:7966399, PMID:7969167, PMID:7981076, PMID:8012986, PMID:8023157, PMID:8080050, PMID:8099841, PMID:8102535, PMID:8134126, PMID:8134127, PMID:8164043, PMID:8198984, PMID:8203469, PMID:8242752, PMID:8308926, PMID:8352280, PMID:8401536, PMID:8423216, PMID:8425176, PMID:8479749, PMID:8527048, PMID:8550239, PMID:8633021, PMID:8649785, PMID:8675009, PMID:8700525, PMID:8710380, PMID:8718514, PMID:8825920, PMID:8829627, PMID:9020384, PMID:9047394, PMID:9067756, PMID:9207066, PMID:9218725, PMID:9242456, PMID:9285560, PMID:9364015, PMID:9470817, PMID:9525742, PMID:9546439, PMID:9569035, PMID:9569050, PMID:9572492, PMID:9598730, PMID:9607760, PMID:9627118, PMID:9667734, PMID:9704930, PMID:9764816, PMID:9825943, PMID:9865903, PMID:9891044, PMID:10229196, PMID:10389749, PMID:10408787, PMID:10411893, PMID:10432928, PMID:10435620, PMID:10477429, PMID:10484981, PMID:10486318, PMID:10497279, PMID:10519380, PMID:10519384, PMID:10554037, PMID:10557074, PMID:10567903, PMID:10706125, PMID:10753186, PMID:10797439, PMID:10802655, PMID:10854221, PMID:10864200, PMID:10922393, PMID:10949938, PMID:11040944, PMID:11051239, PMID:11051241, PMID:11101847, PMID:11139324, PMID:11222779, PMID:11315715, PMID:11358831, PMID:11370630, PMID:11391594, PMID:11403041, PMID:11429700, PMID:11429705, PMID:11479205, PMID:11481490, PMID:11494139, PMID:11590071, PMID:11600572, PMID:11715068, PMID:11753428, PMID:11782540, PMID:11793474, PMID:11896595, PMID:11900253, PMID:11920959, PMID:12007217, PMID:12019170, PMID:12067251, PMID:12509279, PMID:12524418, PMID:12567188, PMID:12610779, PMID:12619118, PMID:12672316, PMID:12726864, PMID:12826609, PMID:12885464, PMID:12901974, PMID:12909720, PMID:12917626, PMID:14559903, PMID:14612556, PMID:15004724, PMID:15037740, PMID:15121773, PMID:15173255, PMID:15221755, PMID:15355915, PMID:15381368, PMID:15390294, PMID:15489903, PMID:15541116, PMID:15548685, PMID:15580553, PMID:15607980, PMID:15607981, PMID:15654279, PMID:15722483, PMID:15741269, PMID:15756275, PMID:15781620, PMID:15851479, PMID:15925506, PMID:15951970, PMID:15964795, PMID:15977174, PMID:15982667, PMID:16000567, PMID:16007150, PMID:16033918, PMID:16061860, PMID:16199549, PMID:16258005, PMID:16322298, PMID:16337994, PMID:16401470, PMID:16437140, PMID:16489069, PMID:16494995, PMID:16508005, PMID:16522644, PMID:16534790, PMID:16543939, PMID:16551709, PMID:16596195, PMID:16633321, PMID:16644204, PMID:16682957, PMID:16736287, PMID:16818505, PMID:16821082, PMID:16861262, PMID:16964264, PMID:17015838, PMID:17224268, PMID:17289876, PMID:17301252, PMID:17308077, PMID:17311302, PMID:17318340, PMID:17417627, PMID:17427234, PMID:17436385, PMID:17530187, PMID:17535973, PMID:17540308, PMID:17541742, PMID:17567834, PMID:17599946, PMID:17606709,