![]() |
Cellular Component
Molecular Function

![]() |
Create Name: | |
Description: |
![]() |
Save what matters to you |
{{ loginError }} |
Sign in with your RGD account |
Create New Account | Recover Password |
Analyze GeneStrainQTL List |
![]() Gene Annotator (Functional Annotation) unavailable |
![]() Gene Annotator (Annotation Distribution) unavailable |
![]() Variant Visualizer (Genomic Variants) unavailble Variant Visualizer (Genomic Variants) unavailable |
Gene Annotator (Functional Annotation) |
Gene Annotator (Annotation Distribution) |
Variant Visualizer (Genomic Variants) |
![]() InterViewer (Protein-Protein Interactions) unavailable |
![]() Gviewer (Genome Viewer) unavailable |
![]() Variant Visualizer (Damaging Variants) unavailble Variant Visualizer (Damaging Variants) unavailable |
InterViewer (Protein-Protein Interactions) |
GViewer (Genome Viewer) |
Variant Visualizer (Damaging Variants) |
![]() Gene Annotator (Annotation Comparison) unavailable |
![]() OLGA (Gene List Generator) unavailable |
![]() |
Gene Annotator (Annotation Comparison) |
OLGA (Gene List Generator) |
Excel (Download) |
![]() MOET (Multi-Ontology Enrichement) unavailable |
![]() GOLF (Gene-Ortholog Location Finder) unavailable |
|
MOET (Multi-Ontology Enrichement) |
GOLF (Gene-Ortholog Location Finder) |
![]() Biological Process Term | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | arachidonic acid metabolic process | | NAS | | 2290271 | (PMID:10085124) | UniProtKB | PMID:10085124 | calcium-mediated signaling | | NAS | | 2290271 | (PMID:10085124) | UniProtKB | PMID:10085124 | glycerophospholipid catabolic process | | IDA | | 2290271 | (PMID:10085124) | UniProtKB | PMID:10085124 | glycerophospholipid catabolic process | | IBA | PANTHER:PTN000076790 more ... | 2290271 | (PMID:21873635) | GO_Central | PMID:21873635 | inflammatory response | | NAS | | 2290271 | (PMID:10085124) | UniProtKB | PMID:10085124 | IRE1-mediated unfolded protein response | | TAS | | 2290271 | | Reactome | Reactome:R-HSA-381070 | parturition | | NAS | | 2290271 | (PMID:10085124) | UniProtKB | PMID:10085124 | phosphatidic acid biosynthetic process | | TAS | | 2290271 | | Reactome | Reactome:R-HSA-1483166 | phosphatidylcholine acyl-chain remodeling | | TAS | | 2290271 | | Reactome | Reactome:R-HSA-1482788 | phosphatidylethanolamine acyl-chain remodeling | | TAS | | 2290271 | | Reactome | Reactome:R-HSA-1482839 | phosphatidylglycerol acyl-chain remodeling | | TAS | | 2290271 | | Reactome | Reactome:R-HSA-1482925 | phosphatidylserine acyl-chain remodeling | | TAS | | 2290271 | | Reactome | Reactome:R-HSA-1482801 | phospholipid metabolic process | | TAS | | 2290271 | | Reactome | Reactome:R-HSA-1483115 | |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
1. | GOA_HUMAN data from the GO Consortium |
2. | Pipeline to import KEGG annotations from KEGG into RGD |
3. | Pipeline to import SMPDB annotations from SMPDB into RGD |
4. | RGD automated import pipeline for ClinVar variants, variant-to-disease annotations and gene-to-disease annotations |
5. | RGD automated import pipeline for gene-chemical interactions |
PubMed | 8889548 9705332 9875225 10085124 10358058 10737800 11181995 11741884 12477932 16344560 16617059 17562024 19913121 20056178 20167866 20628086 21873635 28030848 |
PLA2G4B (Homo sapiens - human) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pla2g4b (Rattus norvegicus - Norway rat) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pla2g4b (Chinchilla lanigera - long-tailed chinchilla) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PLA2G4B (Canis lupus familiaris - dog) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pla2g4b (Ictidomys tridecemlineatus - thirteen-lined ground squirrel) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PLA2G4B (Sus scrofa - pig) |
|
RH91785 |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SHGC-58472 |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RH102897 |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
D15S711E |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
WI-13757 |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
D1S1423 |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
D5S1597E |
|
The detailed report is available here: | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer |
miRNA Target Status data imported from miRGate (http://mirgate.bioinfo.cnio.es/). For more information about miRGate, see PMID:25858286 or access the full paper here. |
RefSeq Transcripts | NG_029927 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
NM_001114633 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
GenBank Nucleotide | AC020659 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
AK124489 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
AK299419 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
AK310651 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
BF372565 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
BM982475 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
BQ004235 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
BX648318 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
CA488226 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
CH471125 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
CU447449 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
DA250544 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
RefSeq Acc Id: | NM_001114633 ⟹ NP_001108105 | |||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq Status: | VALIDATED | |||||||||||||||||||||||||||||
Type: | CODING | |||||||||||||||||||||||||||||
Position: |
|
|||||||||||||||||||||||||||||
Sequence: |
ACCAATTGGGACATCACATCCCTGGCTCTGGGTTAGAAAGCTGACAGTCCTTGATCCTGTGGCChide sequence |
Protein RefSeqs | NP_001108105 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
GenBank Protein | BAG61401 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
EAW92522 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
P0C869 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
RefSeq Acc Id: | NP_001108105 ⟸ NM_001114633 |
- UniProtKB: | P0C869 (UniProtKB/Swiss-Prot) |
- Sequence: |
MAVAEVSRTCLLTVRVLQAHRLPSKDLVTPSDCYVTLWLPTACSHRLQTRTVKNSSSPVWNQSFhide sequence |
Name | Type | Condition(s) | Position(s) | Clinical significance |
NM_005090.3(JMJD7-PLA2G4B):c.2294-18C>T | single nucleotide variant | Malignant melanoma [RCV000070761] | Chr15:41846185 [GRCh38] Chr15:42138383 [GRCh37] Chr15:39925675 [NCBI36] Chr15:15q15.1 |
not provided |
NM_001114632.1(JMJD7):c.891C>A (p.Asp297Glu) | single nucleotide variant | Malignant melanoma [RCV000070760] | Chr15:41837096 [GRCh38] Chr15:42129294 [GRCh37] Chr15:39916586 [NCBI36] Chr15:15q15.1 |
not provided |
NM_016642.3(SPTBN5):c.10626C>T (p.Phe3542=) | single nucleotide variant | Malignant melanoma [RCV000070762] | Chr15:41851809 [GRCh38] Chr15:42144007 [GRCh37] Chr15:39931299 [NCBI36] Chr15:15q15.1 |
not provided |
GRCh38/hg38 15q15.1(chr15:41697762-42489559)x3 | copy number gain | See cases [RCV000140056] | Chr15:41697762..42489559 [GRCh38] Chr15:41989960..42781757 [GRCh37] Chr15:39777252..40569049 [NCBI36] Chr15:15q15.1 |
uncertain significance |
GRCh37/hg19 15q15.1-26.3(chr15:41745084-102354798)x4 | copy number gain | See cases [RCV000447123] | Chr15:41745084..102354798 [GRCh37] Chr15:15q15.1-26.3 |
pathogenic |
GRCh37/hg19 15q11.2-26.3(chr15:20733395-102511616)x4 | copy number gain | See cases [RCV000447765] | Chr15:20733395..102511616 [GRCh37] Chr15:15q11.2-26.3 |
pathogenic |
GRCh37/hg19 15q15.1-21.2(chr15:41689327-52446981)x1 | copy number loss | See cases [RCV000448968] | Chr15:41689327..52446981 [GRCh37] Chr15:15q15.1-21.2 |
pathogenic |
GRCh37/hg19 15q11.2-26.3(chr15:22770422-102429112)x3 | copy number gain | See cases [RCV000510717] | Chr15:22770422..102429112 [GRCh37] Chr15:15q11.2-26.3 |
pathogenic |
GRCh37/hg19 15q11.2-26.3(chr15:22770422-102429112) | copy number gain | See cases [RCV000512019] | Chr15:22770422..102429112 [GRCh37] Chr15:15q11.2-26.3 |
pathogenic |
Single allele | duplication | not provided [RCV000677926] | Chr15:31115047..102354857 [GRCh37] Chr15:15q13.2-26.3 |
pathogenic |
GRCh37/hg19 15q15.1(chr15:42079854-42426833)x3 | copy number gain | not provided [RCV000683684] | Chr15:42079854..42426833 [GRCh37] Chr15:15q15.1 |
uncertain significance |
GRCh37/hg19 15q11.1-26.3(chr15:20071673-102461162)x3 | copy number gain | not provided [RCV000751156] | Chr15:20071673..102461162 [GRCh37] Chr15:15q11.1-26.3 |
pathogenic |
GRCh37/hg19 15q11.1-26.3(chr15:20016811-102493540)x3 | copy number gain | not provided [RCV000751155] | Chr15:20016811..102493540 [GRCh37] Chr15:15q11.1-26.3 |
pathogenic |
Database | Acc Id | Source(s) |
AGR Gene | HGNC:9036 | AgrOrtholog |
COSMIC | PLA2G4B | COSMIC |
Ensembl Genes | ENSG00000243708 | ENTREZGENE, UniProtKB/Swiss-Prot |
Ensembl Protein | ENSP00000396045 | UniProtKB/Swiss-Prot |
ENSP00000416610 | ENTREZGENE, UniProtKB/Swiss-Prot | |
ENSP00000456919 | UniProtKB/TrEMBL | |
Ensembl Transcript | ENST00000452633 | UniProtKB/Swiss-Prot |
ENST00000458483 | ENTREZGENE, UniProtKB/Swiss-Prot | |
ENST00000569354 | UniProtKB/TrEMBL | |
Gene3D-CATH | 2.60.40.150 | UniProtKB/Swiss-Prot |
GTEx | ENSG00000243708 | GTEx |
HGNC ID | HGNC:9036 | ENTREZGENE |
Human Proteome Map | PLA2G4B | Human Proteome Map |
InterPro | Acyl_Trfase/lysoPLipase | UniProtKB/Swiss-Prot |
C2_cPLA2 | UniProtKB/Swiss-Prot | |
C2_dom | UniProtKB/Swiss-Prot | |
C2_domain_sf | UniProtKB/Swiss-Prot | |
cPLA2_C2 | UniProtKB/Swiss-Prot | |
LysoPLipase_cat_dom | UniProtKB/Swiss-Prot | |
KEGG Report | hsa:100137049 | UniProtKB/Swiss-Prot |
hsa:8681 | UniProtKB/Swiss-Prot | |
NCBI Gene | 100137049 | ENTREZGENE |
OMIM | 606088 | OMIM |
Pfam | cPLA2_C2 | UniProtKB/Swiss-Prot |
PF00168 | UniProtKB/Swiss-Prot | |
PLA2_B | UniProtKB/Swiss-Prot | |
PharmGKB | PA33364 | PharmGKB |
PROSITE | PLA2C | UniProtKB/Swiss-Prot |
PS50004 | UniProtKB/Swiss-Prot | |
SMART | PLAc | UniProtKB/Swiss-Prot |
SM00239 | UniProtKB/Swiss-Prot | |
Superfamily-SCOP | SSF52151 | UniProtKB/Swiss-Prot |
UniGene | Hs.198161 | ENTREZGENE |
UniProt | H3BSX5_HUMAN | UniProtKB/TrEMBL |
P0C869 | ENTREZGENE, UniProtKB/Swiss-Prot | |
UniProt Secondary | B4DRT9 | UniProtKB/Swiss-Prot |
O95712 | UniProtKB/Swiss-Prot | |
Q19KD5 | UniProtKB/Swiss-Prot | |
Q19KD6 | UniProtKB/Swiss-Prot | |
Q59GF9 | UniProtKB/Swiss-Prot | |
Q8TB10 | UniProtKB/Swiss-Prot | |
Q9UKV7 | UniProtKB/Swiss-Prot |
Date | Current Symbol | Current Name | Previous Symbol | Previous Name | Description | Reference | Status |
---|---|---|---|---|---|---|---|
2016-01-05 | PLA2G4B | phospholipase A2 group IVB | phospholipase A2, group IVB (cytosolic) | Symbol and/or name change | 5135510 | APPROVED | |
2011-09-01 | PLA2G4B | phospholipase A2, group IVB (cytosolic) | PLA2G4B | phospholipase A2, group IVB (cytosolic) | Symbol and/or name change | 5135510 | APPROVED |
![]() |
More on PLA2G4B | |
![]() |
Alliance Gene |
![]() |
NCBI Gene |
![]() |
Ensembl Gene |
![]() |
JBrowse: hg19 hg38 |
![]() |
HGNC Report |
![]() |
NCBI Genome Data Viewer |
CRRD Object Information | |
CRRD ID: | 1318557 |
Created: | 2005-01-12 |
Species: | Homo sapiens |
Last Modified: | 2019-11-26 |
Status: | ACTIVE |
![]() |
![]() |
![]() |
![]() |
RGD is funded by grant HL64541 from the National Heart, Lung, and Blood Institute on behalf of the NIH.