 Gene Ontology Annotations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Component
 |
Welcome {{ username}}
Message Center
{{ messageCount }} Messages
Watched Genes
{{$index + 1}}. {{ watchedObject.symbol }} (RGD ID:{{watchedObject.rgdId}})
Watched Ontology Terms
{{gene.symbol}}: {{ gene.description }}
Save List to My RGD
| Create Name: | |
| Description: |
|
| Save what matters to you |
| {{ loginError }} |
| Sign in with your RGD account |
| Create New Account | Recover Password |
{{ watchLinkText }}
Select categories you would like to watch. Updates to this gene will be send to {{ username }}
Analyze GeneStrainQTL List |
 Gene Annotator (Functional Annotation) unavailable |
 Gene Annotator (Annotation Distribution) unavailable |
 Variant Visualizer (Genomic Variants) unavailble Variant Visualizer (Genomic Variants) unavailable |
Gene Annotator (Functional Annotation) |
Gene Annotator (Annotation Distribution) |
Variant Visualizer (Genomic Variants) |
 InterViewer (Protein-Protein Interactions) unavailable |
 Gviewer (Genome Viewer) unavailable |
 Variant Visualizer (Damaging Variants) unavailble Variant Visualizer (Damaging Variants) unavailable |
InterViewer (Protein-Protein Interactions) |
GViewer (Genome Viewer) |
Variant Visualizer (Damaging Variants) |
 Gene Annotator (Annotation Comparison) unavailable |
 OLGA (Gene List Generator) unavailable |
 |
Gene Annotator (Annotation Comparison) |
OLGA (Gene List Generator) |
Excel (Download) |
 MOET (Multi-Ontology Enrichement) unavailable |
 GOLF (Gene-Ortholog Location Finder) unavailable |
|
MOET (Multi-Ontology Enrichement) |
GOLF (Gene-Ortholog Location Finder) |
Cellular Component
Gene-Chemical Interaction Annotations
|
|
|
Gene Ontology AnnotationsBiological Process
|
Cellular Component
|
|
References - curated| 1. | GOA_HUMAN data from the GO Consortium |
| 2. | RGD automated import pipeline for gene-chemical interactions |
References - uncurated| PubMed | 12477932 14702039 16169070 16949367 16964240 19295130 19596235 20360068 21145461 21873635 24778252 25544563 26167880 26186194 26496610 26972000 27432908 28514442 29117863 30166453 |
Genomics
Comparative Map Data| DCAF10 (Homo sapiens - human) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Dcaf10 (Mus musculus - house mouse) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Dcaf10 (Rattus norvegicus - Norway rat) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Dcaf10 (Chinchilla lanigera - long-tailed chinchilla) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DCAF10 (Pan paniscus - bonobo/pygmy chimpanzee) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DCAF10 (Canis lupus familiaris - dog) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Dcaf10 (Ictidomys tridecemlineatus - thirteen-lined ground squirrel) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DCAF10 (Sus scrofa - pig) |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Position Markers| WI-10169 |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RH69970 |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RH91564 |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RH18370 |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RH65217 |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RH102323 |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MGC10765__7658 |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| WI-20545 |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SHGC-36380 |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RH44792 |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SGC30269 |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| D10S16 | No map positions available. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GDB:434012 |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| L18426 |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ECD04345 |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| D8S2279 |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| D10S16 |
|
miRNA Target Status
Confirmed Target Of
Predicted Target Of
| The detailed report is available here: |  | Full Report | | CSV | | TAB | | Printer |
miRNA Target Status data imported from miRGate (http://mirgate.bioinfo.cnio.es/). For more information about miRGate, see PMID:25858286 or access the full paper here. |
||||||||
Expression
Sequence
Nucleotide Sequences| RefSeq Transcripts | NM_001286810 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
| NM_024345 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| XM_005251577 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| XM_005251578 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| XM_017015128 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| XM_017015129 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| XR_002956808 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| XR_002956809 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| XR_002956810 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| XR_929331 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| GenBank Nucleotide | AK023620 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
| AK026854 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| AK074532 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| AK309712 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| AK315756 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| AL138752 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| AL533994 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| BC003520 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| BC011959 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| BC108686 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| BC139834 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| CB045943 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| CD299973 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| CH471071 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| HY015327 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
Reference Sequences
| RefSeq Acc Id: | NM_001286810 ⟹ NP_001273739 | |||||||||||||||||||
| RefSeq Status: | VALIDATED | |||||||||||||||||||
| Type: | CODING | |||||||||||||||||||
| Position: |
|
|||||||||||||||||||
| Sequence: |
ACTCATCCCCAGGCACGCGGCCACCGGTCACTGACAACTACAGACCGACTCTGCCACCCAGATChide sequence |
| RefSeq Acc Id: | NM_024345 ⟹ NP_077321 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq Status: | VALIDATED | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Position: |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence: |
CCGGAAGTGGCAGCTGAACAGGGGCACTGAGGTGTCGGCCGGCGGGGCAGTGGCCCGGAGCGGGhide sequence |
| RefSeq Acc Id: | XM_005251577 ⟹ XP_005251634 | |||||||||
| RefSeq Status: | ||||||||||
| Type: | CODING | |||||||||
| Position: |
|
|||||||||
| Sequence: |
GGTGGGGTTAGGCCGCTGCACGCCGGAAGTGGCAGCTGAACAGGGGCACTGAGGTGTCGGCCGGhide sequence |
| RefSeq Acc Id: | XM_005251578 ⟹ XP_005251635 | ||||||||||||||
| RefSeq Status: | |||||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||||
| Position: |
|
||||||||||||||
| Sequence: |
GGGGCGGGGGCGTTGATCATGTTTCCCTTTGGGCCCCATAGCCCTGGAGGGGACGGATCGGCCGhide sequence |
| RefSeq Acc Id: | XM_017015128 ⟹ XP_016870617 | |||||||||
| RefSeq Status: | ||||||||||
| Type: | CODING | |||||||||
| Position: |
|
|||||||||
| Sequence: |
GTGGGGTTAGGCCGCTGCACGCCGGAAGTGGCAGCTGAACAGGGGCACTGAGGTGTCGGCCGGChide sequence |
| RefSeq Acc Id: | XM_017015129 ⟹ XP_016870618 | |||||||||
| RefSeq Status: | ||||||||||
| Type: | CODING | |||||||||
| Position: |
|
|||||||||
| Sequence: |
TTTTTGAGGCAGGCAGGCGGGGCCCCACTTGCTCGCCTTCAGGACTTGGGCTCTGTGAAGGAGAhide sequence |
| RefSeq Acc Id: | XR_002956808 | |||||||||
| RefSeq Status: | ||||||||||
| Type: | NON-CODING | |||||||||
| Position: |
|
|||||||||
| Sequence: |
GTGGGGTTAGGCCGCTGCACGCCGGAAGTGGCAGCTGAACAGGGGCACTGAGGTGTCGGCCGGChide sequence |
| RefSeq Acc Id: | XR_002956809 | |||||||||
| RefSeq Status: | ||||||||||
| Type: | NON-CODING | |||||||||
| Position: |
|
|||||||||
| Sequence: |
GTGGGGTTAGGCCGCTGCACGCCGGAAGTGGCAGCTGAACAGGGGCACTGAGGTGTCGGCCGGChide sequence |
| RefSeq Acc Id: | XR_002956810 | |||||||||
| RefSeq Status: | ||||||||||
| Type: | NON-CODING | |||||||||
| Position: |
|
|||||||||
| Sequence: |
GTGGGGTTAGGCCGCTGCACGCCGGAAGTGGCAGCTGAACAGGGGCACTGAGGTGTCGGCCGGChide sequence |
| RefSeq Acc Id: | XR_929331 | |||||||||
| RefSeq Status: | ||||||||||
| Type: | NON-CODING | |||||||||
| Position: |
|
|||||||||
| Sequence: |
GTGGGGTTAGGCCGCTGCACGCCGGAAGTGGCAGCTGAACAGGGGCACTGAGGTGTCGGCCGGChide sequence |
Protein Sequences| Protein RefSeqs | NP_001273739 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
| NP_077321 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| XP_005251634 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| XP_005251635 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| XP_016870617 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| XP_016870618 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| GenBank Protein | AAH03520 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
| AAH11959 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| AAI08687 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| AAI39835 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| BAB15574 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| BAC11043 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| EAW58261 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| EAW58262 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| EAW58263 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| Q5QP82 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
Reference Sequences
| RefSeq Acc Id: | NP_077321 ⟸ NM_024345 |
| - Peptide Label: | isoform a |
| - UniProtKB: | Q5QP82 (UniProtKB/Swiss-Prot) |
| - Sequence: |
MFPFGPHSPGGDGSAGAGAEEPTPHEGQAAATGPPSPLHPGADATHPPPPARSPRRPGAPSLSPhide sequence |
| RefSeq Acc Id: | XP_005251634 ⟸ XM_005251577 |
| - Peptide Label: | isoform X1 |
| - UniProtKB: | Q5QP82 (UniProtKB/Swiss-Prot) |
| - Sequence: |
MFPFGPHSPGGDGSAGAGAEEPTPHEGQAAATGPPSPLHPGADATHPPPPARSPRRPGAPSLSPhide sequence |
| RefSeq Acc Id: | XP_005251635 ⟸ XM_005251578 |
| - Peptide Label: | isoform X2 |
| - Sequence: |
MFPFGPHSPGGDGSAGAGAEEPTPHEGQAAATGPPSPLHPGADATHPPPPARSPRRPGAPSLSPhide sequence |
| RefSeq Acc Id: | NP_001273739 ⟸ NM_001286810 |
| - Peptide Label: | isoform b |
| - UniProtKB: | Q5QP82 (UniProtKB/Swiss-Prot), A0A0A0MQT4 (UniProtKB/TrEMBL) |
| - Sequence: |
MLSRSHRSVLTVACEQTEVLLFDPISSKHIKTLSEAHEDCVNNIRFLDNRLFATCSDDTTIALWhide sequence |
| RefSeq Acc Id: | XP_016870617 ⟸ XM_017015128 |
| - Peptide Label: | isoform X3 |
| - Sequence: |
MFPFGPHSPGGDGSAGAGAEEPTPHEGQAAATGPPSPLHPGADATHPPPPARSPRRPGAPSLSPhide sequence |
| RefSeq Acc Id: | XP_016870618 ⟸ XM_017015129 |
| - Peptide Label: | isoform X4 |
| - Sequence: |
MRMRLTPDCSKMLISTSSGYLLILHDLDLTKSLEVGSYPILRARRTTSSSDLTTSSSSSGPRVShide sequence |
Promoters| RGD ID: | 6807522 | |||||||||
| Promoter ID: | HG_KWN:63176 | |||||||||
| Type: | CpG-Island | |||||||||
| SO ACC ID: | SO:0000170 | |||||||||
| Source: | MPROMDB | |||||||||
| Tissues & Cell Lines: | CD4+TCell, CD4+TCell_2Hour, Lymphoblastoid | |||||||||
| Transcripts: | ENST00000352264, OTTHUMT00000052485, UC010MLZ.1 | |||||||||
| Position: |
|
| RGD ID: | 7215105 | |||||||||
| Promoter ID: | EPDNEW_H13298 | |||||||||
| Type: | initiation region | |||||||||
| Name: | DCAF10_1 | |||||||||
| Description: | DDB1 and CUL4 associated factor 10 | |||||||||
| SO ACC ID: | SO:0000170 | |||||||||
| Source: | EPDNEW (Eukaryotic Promoter Database, http://epd.vital-it.ch/) | |||||||||
| Experiment Methods: | Single-end sequencing. | |||||||||
| Position: |
|
Clinical Variants| Name | Type | Condition(s) | Position(s) | Clinical significance |
| GRCh38/hg38 9p24.3-q34.3(chr9:193412-138179445)x3 | copy number gain | Global developmental delay [RCV000050347]|Developmental Delay and additional significant developmental and morphological phenotypes referred for genetic testing [RCV000050348]|Developmental delay and additional significant developmental and morphological phenotypes referred for genetic testing [RCV000050348]|See cases [RCV000050348] | Chr9:193412..138179445 [GRCh38] Chr9:204193..141073897 [GRCh37] Chr9:194193..140193718 [NCBI36] Chr9:9p24.3-q34.3 |
pathogenic |
| GRCh38/hg38 9p24.3-13.1(chr9:204193-38815478)x3 | copy number gain | Developmental Delay and additional significant developmental and morphological phenotypes referred for genetic testing [RCV000050357]|Developmental delay and additional significant developmental and morphological phenotypes referred for genetic testing [RCV000050357]|See cases [RCV000050357] | Chr9:204193..38815478 [GRCh38] Chr9:204193..38815475 [GRCh37] Chr9:194193..38805475 [NCBI36] Chr9:9p24.3-13.1 |
pathogenic|conflicting interpretations of pathogenicity|conflicting data from submitters |
| GRCh38/hg38 9p24.3-13.1(chr9:204193-38741440)x3 | copy number gain | Developmental Delay and additional significant developmental and morphological phenotypes referred for genetic testing [RCV000051106]|Developmental delay and additional significant developmental and morphological phenotypes referred for genetic testing [RCV000051106]|See cases [RCV000051106] | Chr9:204193..38741440 [GRCh38] Chr9:204193..38741437 [GRCh37] Chr9:194193..38731437 [NCBI36] Chr9:9p24.3-13.1 |
pathogenic |
| GRCh38/hg38 9p24.3-13.1(chr9:203993-38815619)x3 | copy number gain | Developmental Delay and additional significant developmental and morphological phenotypes referred for genetic testing [RCV000053703]|Developmental delay and additional significant developmental and morphological phenotypes referred for genetic testing [RCV000053703]|See cases [RCV000053703] | Chr9:203993..38815619 [GRCh38] Chr9:203993..38815616 [GRCh37] Chr9:193993..38805616 [NCBI36] Chr9:9p24.3-13.1 |
pathogenic |
| GRCh38/hg38 9p24.3-q34.3(chr9:193412-138114463)x3 | copy number gain | Developmental Delay and additional significant developmental and morphological phenotypes referred for genetic testing [RCV000053746]|Developmental delay and additional significant developmental and morphological phenotypes referred for genetic testing [RCV000053746]|See cases [RCV000053746] | Chr9:193412..138114463 [GRCh38] Chr9:214367..141008915 [GRCh37] Chr9:204367..140128736 [NCBI36] Chr9:9p24.3-q34.3 |
pathogenic |
| GRCh38/hg38 9p24.3-13.1(chr9:220253-38815419)x3 | copy number gain | Developmental Delay and additional significant developmental and morphological phenotypes referred for genetic testing [RCV000053747]|Developmental delay and additional significant developmental and morphological phenotypes referred for genetic testing [RCV000053747]|See cases [RCV000053747] | Chr9:220253..38815419 [GRCh38] Chr9:220253..38815416 [GRCh37] Chr9:210253..38805416 [NCBI36] Chr9:9p24.3-13.1 |
pathogenic |
| GRCh38/hg38 9p24.3-q34.3(chr9:193412-138179445)x3 | copy number gain | Developmental Delay and additional significant developmental and morphological phenotypes referred for genetic testing [RCV000053748]|Developmental delay and additional significant developmental and morphological phenotypes referred for genetic testing [RCV000053748]|See cases [RCV000053748] | Chr9:193412..138179445 [GRCh38] Chr9:266045..141073897 [GRCh37] Chr9:256045..140193718 [NCBI36] Chr9:9p24.3-q34.3 |
pathogenic |
| GRCh38/hg38 9p24.3-q34.3(chr9:193412-138124532)x3 | copy number gain | Intrauterine growth retardation [RCV000053745]|See cases [RCV000053745] | Chr9:193412..138124532 [GRCh38] Chr9:204193..141018984 [GRCh37] Chr9:194193..140138805 [NCBI36] Chr9:9p24.3-q34.3 |
pathogenic |
| GRCh38/hg38 9p24.3-q34.3(chr9:204193-138179445) | copy number gain | See cases [RCV000133791] | Chr9:204193..138179445 [GRCh38] Chr9:204193..141073897 [GRCh37] Chr9:194193..140193718 [NCBI36] Chr9:9p24.3-q34.3 |
pathogenic |
| GRCh38/hg38 9p13.3-13.1(chr9:33225730-38529813)x3 | copy number gain | See cases [RCV000133829] | Chr9:33225730..38529813 [GRCh38] Chr9:33225728..38529810 [GRCh37] Chr9:33215728..38519810 [NCBI36] Chr9:9p13.3-13.1 |
pathogenic |
| GRCh38/hg38 9p13.3-13.1(chr9:35623500-38815474)x3 | copy number gain | See cases [RCV000134038] | Chr9:35623500..38815474 [GRCh38] Chr9:35623497..38815471 [GRCh37] Chr9:35613497..38805471 [NCBI36] Chr9:9p13.3-13.1 |
pathogenic |
| GRCh38/hg38 9p24.3-q21.11(chr9:13997-68401065)x3 | copy number gain | See cases [RCV000135344] | Chr9:13997..68401065 [GRCh38] Chr9:13997..71015981 [GRCh37] Chr9:3997..70205801 [NCBI36] Chr9:9p24.3-q21.11 |
pathogenic |
| GRCh38/hg38 9p24.3-q21.12(chr9:193412-70630731)x3 | copy number gain | See cases [RCV000136152] | Chr9:193412..70630731 [GRCh38] Chr9:220253..73245647 [GRCh37] Chr9:210253..72435467 [NCBI36] Chr9:9p24.3-q21.12 |
pathogenic |
| GRCh38/hg38 9p24.3-q21.13(chr9:193412-74615913)x3 | copy number gain | See cases [RCV000135954] | Chr9:193412..74615913 [GRCh38] Chr9:204193..77230829 [GRCh37] Chr9:194193..76420649 [NCBI36] Chr9:9p24.3-q21.13 |
pathogenic |
| GRCh38/hg38 9p24.3-q21.11(chr9:204104-66233120)x4 | copy number gain | See cases [RCV000137888] | Chr9:204104..66233120 [GRCh38] Chr9:204104..47212321 [GRCh37] Chr9:194104..47002141 [NCBI36] Chr9:9p24.3-q21.11 |
pathogenic|conflicting data from submitters |
| GRCh38/hg38 9p24.3-q34.3(chr9:193412-138124524)x3 | copy number gain | See cases [RCV000138783] | Chr9:193412..138124524 [GRCh38] Chr9:204090..141018976 [GRCh37] Chr9:194090..140138797 [NCBI36] Chr9:9p24.3-q34.3 |
pathogenic |
| GRCh38/hg38 9p24.3-q21.11(chr9:204104-67549861)x3 | copy number gain | See cases [RCV000139208] | Chr9:204104..67549861 [GRCh38] Chr9:204104..66516698 [GRCh37] Chr9:194104..66256518 [NCBI36] Chr9:9p24.3-q21.11 |
pathogenic |
| GRCh38/hg38 9p24.3-13.1(chr9:204104-38768294)x3 | copy number gain | See cases [RCV000139126] | Chr9:204104..38768294 [GRCh38] Chr9:204104..38768291 [GRCh37] Chr9:194104..38758291 [NCBI36] Chr9:9p24.3-13.1 |
pathogenic |
| GRCh38/hg38 9p24.3-q34.3(chr9:193412-138159073)x3 | copy number gain | See cases [RCV000138962] | Chr9:193412..138159073 [GRCh38] Chr9:204104..141053525 [GRCh37] Chr9:194104..140173346 [NCBI36] Chr9:9p24.3-q34.3 |
pathogenic|conflicting data from submitters |
| GRCh38/hg38 9p22.2-q21.11(chr9:18344605-68257015) | copy number gain | See cases [RCV000140448] | Chr9:18344605..68257015 [GRCh38] Chr9:18344603..68995221 [GRCh37] Chr9:18334603..68285041 [NCBI36] Chr9:9p22.2-q21.11 |
pathogenic |
| GRCh38/hg38 9p24.3-q22.1(chr9:203861-88130444)x4 | copy number gain | See cases [RCV000141904] | Chr9:203861..88130444 [GRCh38] Chr9:203861..90745359 [GRCh37] Chr9:193861..89935179 [NCBI36] Chr9:9p24.3-q22.1 |
pathogenic |
| GRCh38/hg38 9p24.3-q34.3(chr9:203861-138125937)x3 | copy number gain | See cases [RCV000141876] | Chr9:203861..138125937 [GRCh38] Chr9:203861..141020389 [GRCh37] Chr9:193861..140140210 [NCBI36] Chr9:9p24.3-q34.3 |
pathogenic |
| GRCh38/hg38 9p21.1-q21.11(chr9:31426827-68257015)x3 | copy number gain | See cases [RCV000141663] | Chr9:31426827..68257015 [GRCh38] Chr9:31426825..68330127 [GRCh37] Chr9:31416825..67819947 [NCBI36] Chr9:9p21.1-q21.11 |
pathogenic |
| GRCh38/hg38 9p21.1-13.1(chr9:28975663-38787483)x3 | copy number gain | See cases [RCV000142317] | Chr9:28975663..38787483 [GRCh38] Chr9:28975661..38787480 [GRCh37] Chr9:28965661..38777480 [NCBI36] Chr9:9p21.1-13.1 |
likely pathogenic |
| GRCh38/hg38 9p24.3-q21.31(chr9:193412-79877816)x3 | copy number gain | See cases [RCV000143012] | Chr9:193412..79877816 [GRCh38] Chr9:204104..82492731 [GRCh37] Chr9:194104..81682551 [NCBI36] Chr9:9p24.3-q21.31 |
pathogenic |
| GRCh38/hg38 9p24.3-13.1(chr9:203861-38381642) | copy number gain | See cases [RCV000143411] | Chr9:203861..38381642 [GRCh38] Chr9:203861..38381639 [GRCh37] Chr9:193861..38371639 [NCBI36] Chr9:9p24.3-13.1 |
pathogenic |
| GRCh38/hg38 9p24.3-q34.3(chr9:203862-138125937)x3 | copy number gain | See cases [RCV000143476] | Chr9:203862..138125937 [GRCh38] Chr9:203862..141020389 [GRCh37] Chr9:193862..140140210 [NCBI36] Chr9:9p24.3-q34.3 |
pathogenic |
| GRCh38/hg38 9p24.3-q34.3(chr9:193412-138179445)x3 | copy number gain | See cases [RCV000148113] | Chr9:193412..138179445 [GRCh38] Chr9:204193..141073897 [GRCh37] Chr9:194193..140193718 [NCBI36] Chr9:9p24.3-q34.3 |
pathogenic |
| GRCh38/hg38 9p24.3-13.1(chr9:204193-38815478)x3 | copy number gain | See cases [RCV000148159] | Chr9:204193..38815478 [GRCh38] Chr9:204193..38815475 [GRCh37] Chr9:194193..38805475 [NCBI36] Chr9:9p24.3-13.1 |
pathogenic |
| GRCh38/hg38 9p11.2-q34.3(chr9:193412-138159073)x3 | copy number gain | See cases [RCV000139207] | Chr9:193412..138159073 [GRCh38] Chr9:68420641..141053525 [GRCh37] Chr9:67910461..140173346 [NCBI36] Chr9:9p11.2-q34.3 |
pathogenic |
| GRCh37/hg19 9p24.3-13.1(chr9:163131-38763958)x3 | copy number gain | See cases [RCV000240201] | Chr9:163131..38763958 [GRCh37] Chr9:9p24.3-13.1 |
pathogenic |
| GRCh37/hg19 9p24.3-11.2(chr9:213161-47212321)x4 | copy number gain | See cases [RCV000240048] | Chr9:213161..47212321 [GRCh37] Chr9:9p24.3-11.2 |
pathogenic |
| GRCh37/hg19 9p24.3-13.1(chr9:213161-39092820)x3 | copy number gain | See cases [RCV000239869] | Chr9:213161..39092820 [GRCh37] Chr9:9p24.3-13.1 |
pathogenic |
| GRCh37/hg19 9p24.3-q34.3(chr9:163131-141122114)x3 | copy number gain | See cases [RCV000240081] | Chr9:163131..141122114 [GRCh37] Chr9:9p24.3-q34.3 |
pathogenic |
| Single allele | complex | Glioma [RCV000754871] | Chr9:23524426..87359888 [GRCh37] Chr9:9p21.3-q21.33 |
likely pathogenic |
| GRCh37/hg19 9p24.3-13.1(chr9:203861-38472979)x3 | copy number gain | not provided [RCV000848175] | Chr9:203861..38472979 [GRCh37] Chr9:9p24.3-13.1 |
pathogenic |
| GRCh37/hg19 9p24.3-q13(chr9:203861-68188391)x4 | copy number gain | See cases [RCV000449165] | Chr9:203861..68188391 [GRCh37] Chr9:9p24.3-q13 |
pathogenic |
| GRCh37/hg19 9p24.3-q34.3(chr9:62525-141006407) | copy number gain | See cases [RCV000449375] | Chr9:62525..141006407 [GRCh37] Chr9:9p24.3-q34.3 |
pathogenic |
| GRCh37/hg19 9p24.3-q34.3(chr9:203861-141020389)x3 | copy number gain | See cases [RCV000447207] | Chr9:203861..141020389 [GRCh37] Chr9:9p24.3-q34.3 |
pathogenic |
| GRCh37/hg19 9p24.3-13.1(chr9:32396-39140211) | copy number gain | See cases [RCV000447246] | Chr9:32396..39140211 [GRCh37] Chr9:9p24.3-13.1 |
pathogenic |
| GRCh37/hg19 9p24.3-q13(chr9:203861-67983174)x4 | copy number gain | See cases [RCV000446521] | Chr9:203861..67983174 [GRCh37] Chr9:9p24.3-q13 |
pathogenic |
| GRCh37/hg19 9p24.3-q21.11(chr9:203861-69002883)x3 | copy number gain | See cases [RCV000448569] | Chr9:203861..69002883 [GRCh37] Chr9:9p24.3-q21.11 |
pathogenic |
| GRCh37/hg19 9p24.3-q34.3(chr9:203864-141020389)x3 | copy number gain | See cases [RCV000448978] | Chr9:203864..141020389 [GRCh37] Chr9:9p24.3-q34.3 |
pathogenic |
| GRCh37/hg19 9p24.3-q21.11(chr9:13997-70919878)x4 | copy number gain | See cases [RCV000448242] | Chr9:13997..70919878 [GRCh37] Chr9:9p24.3-q21.11 |
pathogenic |
| GRCh37/hg19 9p24.3-13.1(chr9:203861-38787480)x3 | copy number gain | See cases [RCV000510864] | Chr9:203861..38787480 [GRCh37] Chr9:9p24.3-13.1 |
pathogenic |
| GRCh37/hg19 9p24.3-11.2(chr9:204193-44259464)x4 | copy number gain | Syndromic hydrocephalus due to diffuse villous hyperplasia of choroid plexus [RCV000677299] | Chr9:204193..44259464 [GRCh37] Chr9:9p24.3-11.2 |
likely pathogenic |
| GRCh37/hg19 9p24.3-q21.33(chr9:203861-88189913)x3 | copy number gain | See cases [RCV000512431] | Chr9:203861..88189913 [GRCh37] Chr9:9p24.3-q21.33 |
pathogenic |
| GRCh37/hg19 9p24.3-q34.3(chr9:203862-141020389) | copy number gain | See cases [RCV000512392] | Chr9:203862..141020389 [GRCh37] Chr9:9p24.3-q34.3 |
pathogenic |
| GRCh37/hg19 9p24.3-13.1(chr9:203861-38787480)x3 | copy number gain | not provided [RCV000683172] | Chr9:203861..38787480 [GRCh37] Chr9:9p24.3-13.1 |
pathogenic |
| GRCh37/hg19 9p24.3-q13(chr9:203861-68262804)x3,4 | copy number gain | not provided [RCV000683174] | Chr9:203861..68262804 [GRCh37] Chr9:9p24.3-q13 |
pathogenic |
| GRCh37/hg19 9p24.3-q13(chr9:203861-67983174)x4 | copy number gain | not provided [RCV000683173] | Chr9:203861..67983174 [GRCh37] Chr9:9p24.3-q13 |
pathogenic |
| GRCh37/hg19 9p24.3-q21.12(chr9:203861-72717793)x3 | copy number gain | not provided [RCV000683176] | Chr9:203861..72717793 [GRCh37] Chr9:9p24.3-q21.12 |
pathogenic |
| GRCh37/hg19 9p24.3-q21.11(chr9:203861-70985795)x4 | copy number gain | not provided [RCV000683175] | Chr9:203861..70985795 [GRCh37] Chr9:9p24.3-q21.11 |
pathogenic |
| GRCh37/hg19 9p24.3-q34.3(chr9:203861-141020388)x3 | copy number gain | not provided [RCV000845900] | Chr9:203861..141020388 [GRCh37] Chr9:9p24.3-q34.3 |
pathogenic |
| GRCh37/hg19 9p24.3-q34.3(chr9:10590-141122247)x3 | copy number gain | not provided [RCV000748055] | Chr9:10590..141122247 [GRCh37] Chr9:9p24.3-q34.3 |
pathogenic |
| GRCh37/hg19 9p24.3-q34.3(chr9:10590-141107672)x3 | copy number gain | not provided [RCV000748053] | Chr9:10590..141107672 [GRCh37] Chr9:9p24.3-q34.3 |
pathogenic |
| GRCh37/hg19 9p24.3-q34.3(chr9:46587-141066491)x3 | copy number gain | not provided [RCV000748063] | Chr9:46587..141066491 [GRCh37] Chr9:9p24.3-q34.3 |
pathogenic |
| GRCh37/hg19 9p24.3-q34.3(chr9:10590-141114095)x2 | copy number gain | not provided [RCV000748054] | Chr9:10590..141114095 [GRCh37] Chr9:9p24.3-q34.3 |
pathogenic |
| GRCh37/hg19 9p24.3-13.1(chr9:214309-39156958) | copy number gain | not provided [RCV000767644] | Chr9:214309..39156958 [GRCh37] Chr9:9p24.3-13.1 |
pathogenic |
| GRCh37/hg19 9p24.3-q13(chr9:203861-67986965)x3 | copy number gain | not provided [RCV000845815] | Chr9:203861..67986965 [GRCh37] Chr9:9p24.3-q13 |
pathogenic |
| GRCh37/hg19 9p13.3-q13(chr9:34542635-68210033)x3 | copy number gain | not provided [RCV000849826] | Chr9:34542635..68210033 [GRCh37] Chr9:9p13.3-q13 |
pathogenic |
Additional Information
External Database Links| Database | Acc Id | Source(s) |
| AGR Gene | HGNC:23686 | AgrOrtholog |
| COSMIC | DCAF10 | COSMIC |
| Ensembl Genes | ENSG00000122741 | ENTREZGENE, UniProtKB/Swiss-Prot |
| Ensembl Protein | ENSP00000242323 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
| ENSP00000366953 | ENTREZGENE, UniProtKB/Swiss-Prot | |
| Ensembl Transcript | ENST00000242323 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
| ENST00000377724 | ENTREZGENE, UniProtKB/Swiss-Prot | |
| Gene3D-CATH | 2.130.10.10 | UniProtKB/Swiss-Prot |
| GTEx | ENSG00000122741 | GTEx |
| HGNC ID | HGNC:23686 | ENTREZGENE |
| Human Proteome Map | DCAF10 | Human Proteome Map |
| InterPro | DCA10 | UniProtKB/Swiss-Prot |
| WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| WD40_repeat | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| WD40_repeat_CS | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| WD40_repeat_dom | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| WD40_repeat_dom_sf | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| KEGG Report | hsa:79269 | UniProtKB/Swiss-Prot |
| NCBI Gene | 79269 | ENTREZGENE |
| PANTHER | PTHR14588 | UniProtKB/Swiss-Prot |
| Pfam | WD40 | UniProtKB/Swiss-Prot |
| PharmGKB | PA165585713 | PharmGKB |
| PROSITE | WD_REPEATS_1 | UniProtKB/Swiss-Prot |
| WD_REPEATS_2 | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| WD_REPEATS_REGION | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| SMART | WD40 | UniProtKB/Swiss-Prot |
| Superfamily-SCOP | SSF50978 | UniProtKB/Swiss-Prot |
| UniGene | Hs.118394 | ENTREZGENE |
| UniProt | A0A0A0MQT4 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
| DCA10_HUMAN | UniProtKB/Swiss-Prot, ENTREZGENE | |
| UniProt Secondary | A4VCJ5 | UniProtKB/Swiss-Prot |
| Q32NE2 | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| Q8N2Q5 | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| Q96ET5 | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| Q9BTQ5 | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| Q9H5P6 | UniProtKB/Swiss-Prot |
 |
| More on DCAF10 | |
|
Alliance Gene |
|
NCBI Gene |
|
Ensembl Gene |
|
|
JBrowse: hg19 hg38 |
|
HGNC Report |
|
NCBI Genome Data Viewer |
| CRRD Object Information | |
| CRRD ID: | 1352348 |
| Created: | 2005-03-08 |
| Species: | Homo sapiens |
| Last Modified: | 2019-11-26 |
| Status: | ACTIVE |
